Capnocytophaga sp. H2931: CGC52_08715
Help
Entry
CGC52_08715 CDS
T05889
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
capq
Capnocytophaga sp. H2931
Pathway
capq02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
capq00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CGC52_08715
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Big_9
Cadherin_5
Ig_7
Cadherin_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATA75489
LinkDB
All DBs
Position
2044968..2053964
Genome browser
AA seq
2998 aa
AA seq
DB search
MLWAQGNPPATLPTPSGDCDPYFDGLIKQTKASVFSPIESGSNAVIYLDNSRMATGVTYF
AINKTTGMWFAGSYDTTLFMVTIPVGVLTQNTTFEVHAIAGGCSFKVVDDVTFEVKPTTE
VHLQTRVRDEYCDNSGGIYYQMMGDSNDNYNFYHKLSTQTAFQTATADRNDLQTVQGGKT
YVIRAELKTNPTTFYEKTINVGNLKVPNPPGIEYAVTAQPLLCAPNTGRAIVNITKGVAF
PFTFQITNGPVTRPEQASNVFENLPAGNYTMYVKDACGQGRTLSFRINGELFSIGPIGGY
SYVSPTDECGRGLVRLQRGIKMAREHWHADAIPYPMTVSYTLTSPSGTSYAMTRTFNNRT
ELTTYAWYDHNQASIYFGHNLSGRQNFFGDGVQIPYEVGEWEHSIQVTTACGVRNLGSLK
ENTSSRVQTFYQFSEIKQSYDPCGKNRISVRADYLFKDAYIVLDEAPAGFDPIAAGFTKN
HRFGGKYYKFVRLDHRYVHIVSHPHLLLGNYKFTYVYADCGSELQKEITVTDLQNPAGVP
NASYFYSTYYCENQSYGIGFLEAGGAGAPQKIRITGFTPAPGTSGTFAVPQEYDYDQWTT
IVSGRRVLHSLPFGKYTLSAIGFECQQDVVDKVVEIKTPTPDPKVRFSTITGCKVRIELY
DAVNDSYQRSYWLQGYDEAQARWVNMIDPNASPYGDIISNGKENRTKDLNHNNYKLYTRY
RVVELTGTVGLLSACPKVIGEYEAPSELPVLVDIVGATCGANQYEIMVVASGGTPPFTYK
VLSRSVGGSLDTSFVPITNTTGKFTITETNPSASYKFAVEDVCNQETKDVEIRNMTPFVI
TTDRTEYCQGTSATLSVPDLSLAYTYEWFREDDPSTILSHSPTLQVSNLQATDFAHKYKL
RVAPKDASFTLCIPAEYEVQLTGSTASVPVLTGDATNVVLCASELNGKTSYDVRTNLFAT
VHNNATASGHTNAVIREISGMYPVSQDGLMALHKNMIPVLEGQTFTFTYTISNACGLEAT
KTATLTVKRNIKPEDLTYVNHNAFRVCDADLTNWVTFGATNFNALAEYIKTYNAARTTDL
IEFFSDPQGNTPVHQLDFTTESVKIIYYKINRADYCSSVARIRIDKFSTYKKPDGTDDPR
LVDLTYDTCANGVTVQDVRARLQQIFGHRSTPKVYLIRIVGGVETSSELPDNYALTTSEV
YRYRMEDGGCPSSWRNITLNFNQTNIVTQPVSHIVCSGEQVVLTALGASTSPPTAGKMIY
KWFESTYNGTIGATQVHAQTLNRGEVSTYTPSTASMGAKYYFVEVTVENVCNVPMYTNIV
KVEVKGMTASVPTVTTLSSVQCGEDVKYTFVGVPNEEVHYTVNGVASTITLPTSGVYTHM
VSAATTTQVLRVVSVSNASGCPTTPTTGNVYTVTVNDLPTPTINVVTATCGNSGSAIIAN
YDPTLTYTFSGSGVTHTGTTITGFAFGTTYTMTVSNGTCTKATSFVVNTTCTIDAVEDDF
GIVEANTTTTGSILDNDKLGTASATTADVDIKNVVSPHAGITIATTDGKVSVANNVASGV
YTLTYTICEKVNGTPCDTATVSITVKNINADNDDFEVSAGGNTGSVLNNDKYDGEFLSST
VSVTLTPIGTLPSGISLDPITGIVRVASGTPSGNYSFNYKICSKVVPSLCDDATVTIRVK
NSIIADNDDLGPVVSGGTTTQTVISNDKLNGTPVVIGTGVGQVTLTPIITPTGITIDATN
GKVTVGTNVSSGVYTLTYKICENGATLDNCDDATVTVTVQNGIVAEDDDLGPVVSGGTTT
QTVISNDKLNGTPVVIGTGVGEVTLTPLITPTGITIDATNGKVTIGTNVSSGVYTLTYKI
CENGATPDNCDDATVTITVQNNIIADNDNLGTVVSGGTTTQTVISNDKLNGTPVVIGTGV
GQVTLTPLITPTGITIDATNGKVTIGTNVSSGVYTLTYKICENGATPDNCDDATVTVTVQ
NSIVADDDDLGAVVSGGTTTQTVITNDKLNGTPVVIGTGVGEVTLTPIITPTGITLNGDG
KVTVGTNVSSGVYTLTYKICENGATPDNCDDATVTITVENSIVADDDDLGTVVSGGTTTQ
MVITNDRLNGTPVVIGTGTGEVTLTPIVTPTGITIDATNGKVTIGTNVSSGVYTLTYKIC
ENGATPDNCDEATVTITVENSIVADNDDLGPVVSGGTTTQTVISNDKLNGTPVVIGTGVG
QVTLTPLITPTGITIDATNGKVTIGTNVSSGVYTLTYKICENGATLDNCDDATVTITVQN
SIVAADDDLGPVVSGGTTTQTVISNDKLNGVPVVIGTEVGKVTLTPLITPTGITLNGDGK
VTIGTNVSSGVYTLTYKICENGATPDNCDEATVTLTVIAPSVSTITANSDTFTSTTAGGE
TVGSVFTNDDLNGLTPNSGTVSVTLLTDGGLTGVVINTDGKLLIPSTTATETKTYTLTYS
ICEKDGVGNATSNCANSTIEIVIPVVPSVLNITANTDTFTVTTSTNTQIVGNVLDNDRLG
TNTPTTSDVTITVTSTPTGTIVPNLDPVTGDVTVPSGTPTGTYTIGYSICTKSGTITCDT
ATVTVIVTSVTTPTVITATDDPVTVTTIESGTVVNVLDNDRLGTKTPTTSDVTITVTSTP
TGAIVPNLDPVTGDVTVPSGTPTGTYTIGYRICTKSGTITCDTATVVITVTAVTTPTVVT
ATDDVVTVMTTQSGTVGNVLDNDRLGTNTPTTSDVTITVTSTPTGTIVPNLDPSTGNVTV
PSGTPTGTYVIGYEICTKSVTITCDTATVTIVVTEVTTPTTPVVAKDDVEQTVVDTPVTV
KVVSNDEHVPTQGTLTIVTQPKNGTVVINDNGTTNDPSDDEVVYTPSRGYAGVDSFEYEL
CDTMGNCSIAKVTITVLDEVIPYNAISVNGDGLNDYFHIQGIERYPNNTVRIYNRWGVKV
FETKGYDNVNRVFRAISNGRVTIEAAEKLPQGTYYYIIEYTDNNNKKHTKGSWLYIKK
NT seq
8997 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctatgggctcagggaaatcctcctgcgacgttaccaacgccttccggagattgtgac
ccgtattttgatggactgattaaacagactaaggcaagtgtgttttcacccattgaatcg
ggtagtaatgcggttatctatttggataactcgcgtatggctaccggtgtaacctatttt
gccataaacaaaaccacaggaatgtggtttgcaggtagttatgatactacgctatttatg
gttaccattcctgtgggggttcttactcagaataccacttttgaagtacacgccattgca
ggtggttgtagtttcaaggtagtagatgatgttacttttgaggtaaaaccaaccacggag
gtacatttgcaaacccgtgtgcgcgatgagtattgcgataattcggggggaatttactac
caaatgatgggcgatagcaacgacaactataatttttatcacaagttgtccacgcaaacc
gcttttcaaaccgctaccgcagacagaaacgacttgcaaaccgtacaaggtggaaaaacc
tatgttattcgtgctgagttgaaaaccaatcccactacgttttatgaaaaaaccataaac
gtaggcaatttaaaagtgcctaacccaccagggattgagtacgccgtcacggcacaacct
ttgctttgtgctcctaatacaggtcgagccattgtaaacattaccaaaggagtggcattc
ccgtttacttttcagattacgaatggtcctgtaacccgacccgaacaagccagcaacgtg
tttgaaaacctacctgcggggaattacacaatgtacgtaaaagacgcttgcgggcaaggg
cgtaccctaagttttaggataaatggagaactcttttcaataggacctattggagggtat
tcttatgtatcccccacagacgagtgtgggcgagggcttgttaggctacaacgagggata
aaaatggcaagggaacattggcatgctgatgccattccctatccgatgacggtttcttat
acgctgacttcccccagcggaacatcgtatgcgatgacacgtacctttaataatagaacc
gaattaaccacttatgcgtggtatgaccataatcaagcgagtatctattttgggcataat
ctatcaggtaggcaaaatttctttggtgatggagtgcaaattccgtatgaagttggtgaa
tgggagcatagcattcaagtaacgaccgcctgcggggtacgtaatttgggttctcttaaa
gagaatacaagttccagagtgcaaacgttttaccaattttcggaaattaaacaaagctat
gacccttgtggtaaaaaccgcattagtgtccgagctgattacctttttaaggacgcatac
atagtattggacgaagctcccgcagggtttgaccccatcgccgcagggtttacaaaaaat
catcgttttggagggaaatattacaaatttgttcggcttgaccatcgttatgtacacata
gtaagccatccgcatttgttgttaggaaattataaattcacctacgtatatgcggattgt
ggctctgaacttcaaaaggaaattaccgtaaccgatttgcaaaacccagcgggtgtgcct
aatgcaagttatttttatagcacctattattgtgaaaatcaaagttatggtatcggattt
ttagaagcaggtggtgcaggagctccccagaaaatacgtatcacgggctttaccccagca
ccaggcacttcgggtacgtttgccgttccccaagagtacgattatgaccaatggacaaca
atagtcagtggaagacgcgtacttcacagcctaccttttggtaaatatactctatcggca
atcggttttgaatgtcagcaagatgtggttgataaggtagtagaaataaaaaccccaacg
cccgaccccaaggtacgtttttcaacgataacagggtgtaaagtacgtattgaactttat
gatgcggtcaatgatagttaccaacgctcctattggttgcaaggctatgatgaggcacaa
gcccgttgggtaaatatgattgaccctaatgcaagtccttacggagatattatttcaaat
ggaaaggaaaatagaaccaaggatttaaatcataacaactataagctctatacccgttat
cgggtggtggaactcaccggcacggtggggcttctctctgcgtgtccgaaagtgataggc
gaatacgaagccccttcggagttgcctgttttggtagatattgtaggggctacctgtggg
gcaaatcagtatgaaattatggtggttgccagtggtggaacgcctcctttcacttacaag
gtgttgagcagaagtgtaggaggatccttggatacttcttttgtgcctattacgaatacc
acagggaagtttaccatcacggaaaccaatccttcggcttcgtacaaatttgcggtggaa
gatgtctgcaatcaggaaaccaaagatgtagaaatccgaaatatgaccccgtttgtcatc
accaccgaccgcaccgagtactgccaaggtacttcggctaccctttccgtacccgattta
tcgttagcttatacttatgaatggttccgtgaagacgacccaagcaccattttatcccat
tcaccaaccttgcaggtgagcaatctacaagctactgattttgctcataagtacaaatta
agagtagctccgaaagatgcgtctttcactttgtgtatccctgcggaatatgaagtgcag
ttaacgggcagtaccgcatcagttcctgtactgacaggtgatgctaccaatgtggtgttg
tgtgcttctgaactcaacggaaaaacttcttatgatgtgcgtaccaatttatttgccaca
gtgcataacaatgcgacagcttcgggccataccaacgctgttatccgagaaatttcaggt
atgtacccggtttcacaagacgggcttatggcgttgcataagaatatgatacccgtattg
gaaggacaaacctttacctttacctatacaatttccaacgcttgtggtttggaggctacc
aaaaccgctactttaacggttaaacgaaatatcaagcccgaagaccttacctacgtaaat
cacaatgcttttagggtttgtgatgcagatttgaccaattgggtaacttttggggctacg
aattttaacgctttggcggaatatataaaaacctataatgcggcacgaaccaccgacttg
attgagttttttagcgacccacaaggtaatactcctgtccatcaattggattttacaact
gaaagtgttaaaataatttattacaaaataaatagagcagattattgttcaagcgtagca
cggattaggattgataaattttcaacatataaaaaacctgatggcaccgatgacccgcgt
ttggtggatttgacctatgacacttgtgccaacggagtaacagtacaagatgtaagagca
aggctacaacaaattttcggacatcgttcgactccaaaggtttatctaattcgtatagta
ggcggtgtagaaacttcatcagaattgcctgataattatgctcttaccacttccgaagtg
tatcgctatcgtatggaagatggtggttgcccttcatcgtggagaaacatcaccttgaat
ttcaatcaaactaatattgttacacaacccgtgtcacatatcgtttgttcgggtgagcag
gtggtgttaacggctttaggggcttcaacctcaccaccaaccgcaggtaagatgatttac
aaatggtttgaaagcacctacaacggaacgataggagctacccaagtacacgctcaaacg
ctcaataggggagaggtgtcaacctatacgccatctacggcaagtatgggtgcaaaatac
tacttcgtggaggtaaccgttgaaaacgtttgtaacgtacctatgtatacgaatattgta
aaggtagaagttaaaggaatgacggcttctgtgccaacagtaactactttatcatcagtt
caatgtggtgaggacgtcaaatacactttcgtaggagtacccaatgaagaagtgcattat
acagtaaatggagtagcttcaaccatcactttacctacaagtggcgtttatacgcatatg
gtaagtgctgccaccaccacccaagtgctacgtgtggtttcagtgtctaatgcttcgggt
tgtccaacaacacccactacggggaatgtttacaccgttaccgtaaacgatttgccaacc
ccaaccataaatgtcgttacggccacttgcggaaatagtggttcagcaatcattgctaat
tatgaccctacgcttacctatacgtttagtggttcaggggtaacccatacagggacaacc
attacaggttttgcttttggaactacatatacgatgacggtttccaacggaacttgtact
aaggcgacctcttttgtggttaatactacgtgtaccattgatgcagtagaggatgatttt
ggtattgtagaagcgaatacaaccactaccggaagtattttagataacgataagttggga
acggcttcggcaactacggctgatgtagatattaagaacgtggttagtccgcacgccgga
ataaccattgctacaacagatggtaaagtgagtgtggctaataacgtggcatcaggcgta
tatacgcttacttataccatttgcgaaaaagtaaatggtacaccttgcgatacggcaact
gtaagcataacggttaaaaacatcaatgctgataatgatgattttgaggtgtcggcggga
ggcaatacgggtagtgtgctaaacaacgacaaatatgatggagaatttttgtcttcaacg
gtgagtgtaaccttaactccaataggaacgttaccatcagggataagtttagaccctatt
acaggaatagttcgtgtagcttcgggaacgccaagtggtaattatagctttaattacaaa
atttgttcaaaagtagtaccttctttatgtgatgatgctacggtaactattagggttaaa
aactccataatcgctgataacgatgatttaggaccggtagtatcgggaggtaccactacg
caaacggttattagtaacgataagcttaatggtacgcctgtggttataggcacaggagta
ggtcaggtaacccttacaccaatcattaccccaacgggcattacgatagatgctactaac
ggaaaagtaacggtaggaacgaatgtttcgagtggagtttatacgttgacctataaaatt
tgtgagaatggagcgacccttgataattgtgatgatgctacggtaacggtaaccgttcaa
aacggcatagtcgccgaagatgatgatttaggaccggtagtatcgggaggtaccactacg
caaacggttattagtaacgataagcttaatggtacgcctgtggttataggcacaggtgtg
ggtgaggtaacgcttactccgcttattaccccaacgggcattacgatagatgctactaac
ggaaaagtaacgataggaacgaatgtttcgagtggagtttatacgttgacgtataaaatt
tgtgagaatggagcgacccctgataactgcgatgatgctacggtaacgatcacggttcaa
aacaacataatcgctgataacgataatttaggtacagtagtatcgggaggtaccactaca
caaacggttattagtaatgataagcttaatggtacgcctgtggttataggcacaggagta
ggtcaggtaacgcttactccgcttattaccccaacgggcattacgatagatgctactaac
ggaaaagtaacgataggaacgaatgtttcgagtggagtttatacgttgacctataaaatt
tgtgagaatggagcgactcctgataactgcgatgatgctacggtaacggtaaccgttcaa
aacagcatcgtagctgatgatgatgatttaggagcggtagtatcgggaggtacgactacg
cagacggttattactaacgataagctcaatggtacgcctgtggttataggcacgggtgtg
ggcgaggtgacccttacaccaatcattaccccaacgggcattacgttgaatggtgatgga
aaagtaacggtaggaacgaatgtttcgagtggagtttatacgttgacctataaaatttgt
gagaatggagcgacccctgataattgtgatgatgctacggtaacgatcacggttgaaaac
agcatcgtagctgatgatgatgatttaggaacggtagtatcgggaggtaccactacgcag
atggttattactaacgatagattaaatggtacgcctgtggttataggcacaggtacgggt
gaggtaacgcttactccaatagttactccaacgggcattacgatagatgctactaacgga
aaagtaacgataggaacgaatgtttcgagtggagtttatacgttgacctataagatttgt
gagaatggagcgacccctgataattgtgatgaagctacggtaacgatcacggttgaaaac
agcatcgtagctgataacgatgatttaggaccagtagtatcgggtggtacgactacgcaa
acggttattagtaacgataagctcaatggtacgcctgtggttataggcacaggagtaggt
caggtaacgcttactccgcttattaccccaacgggcattacgatagatgctactaacgga
aaagtaacgataggaacgaatgtttcgagtggagtttatacgttgacctataagatttgt
gagaatggagcgacccttgataattgtgatgatgctacggtaacgatcacggttcaaaac
agcatcgtagctgctgatgatgatttaggaccggtagtatcggggggtacgactacgcag
acggttattagtaatgataagctcaatggtgtacctgtggttataggcacagaagtaggt
aaggtaacccttactccgcttattaccccaacgggcattacgttgaatggtgacggaaaa
gtaacgataggaacgaatgtttcgagcggagtttatacgttgacctataaaatttgtgag
aatggagcgacccctgataattgtgatgaagctacggtaacgcttacggttatagctcca
agcgtatcaactattacagcaaattcggatacattcacttcaacgaccgcaggtggagaa
actgtgggtagtgtctttacaaatgatgatttgaacggattgacaccaaatagcggtacg
gtaagtgtaacgttattgactgatggaggactcacaggagtggtgattaatactgatggt
aaattattgataccatcgacaacagctaccgagaccaagacatacacattgacatattca
atctgtgagaaagatggtgtaggtaatgctacttccaattgtgcgaattcaacgatagag
attgtgattcctgtcgtgccaagcgtattaaatatcactgcgaataccgatacgtttaca
gttaccacttcgaccaatacgcaaatagtaggaaatgtgttggataatgataggcttggt
actaacacaccaacaacatctgatgtaacgataacggtaacgtcaaccccaactggaaca
atcgtaccgaacttagaccctgtaacaggagatgttacggtaccgtcaggtactccaacc
ggaacgtatacgataggttatagcatctgtacaaaatcaggaacgattacgtgcgacaca
gctacggtaactgtaatagttacttcggtaacaacccctacggtaatcacggctactgac
gaccctgtaactgtaacgactatagaaagtggaacagtggtgaacgtgttggataatgat
aggcttggtacaaaaacgccgacaacatctgatgtaacgataactgtaacgtcaacccca
acaggagcgatagtaccgaacttagaccctgtaacaggagatgttacggtaccatcaggt
acaccaacgggaacgtatacgataggttatagaatctgtacaaaatcaggaacgattacc
tgcgacacagctactgtagtaataacagttacagcggtaacgacccctacagtagtcact
gctactgatgatgtagtcactgtaatgaccactcaaagtggaacagtaggaaacgtattg
gataacgataggcttggtactaacacaccaacaacatctgatgtaacgataactgtaacg
tcaaccccaacgggaacaatcgtgccgaacttagacccatcgacaggaaatgttacggta
ccatcaggtacgccaacgggaacgtatgttataggttatgaaatctgtacgaaatcagta
acgattacatgcgatactgctacagtaacgatagtagttacagaggtaacaactccaacg
acacctgtagtagcgaaagatgatgttgaacagacggtagttgatacacctgttacggtt
aaagtagtatctaatgatgagcatgtgcctacgcaaggaaccttgactattgttacgcaa
cctaaaaacggaacggttgttatcaatgacaatggaacgactaatgatccgtcggatgat
gaggttgtttacacacctagtcgaggttatgcaggggtagacagtttcgagtatgagctt
tgcgatacgatgggtaactgttctatagctaaggtaacgataacggtgttggatgaagtt
ataccttataatgctatttctgtgaatggagatggattgaatgattacttccatattcaa
ggtatagagagatatcctaataatacggttcgtatttacaatcgttggggagttaaggta
tttgagacgaagggctatgataatgttaatagagtattccgagcgatttcaaacggacga
gtaacgattgaagctgctgagaaattgccacaaggtacgtattactatatcattgaatac
accgataacaacaacaagaaacatacgaaaggaagttggttgtatattaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system