Candidatus Paracaedimonas acanthamoebae: IM40_05895
Help
Entry
IM40_05895 CDS
T03240
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03305
proton-dependent oligopeptide transporter, POT family
Organism
caq
Candidatus Paracaedimonas acanthamoebae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
caq00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
IM40_05895
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PTR2
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIL13144
LinkDB
All DBs
Position
complement(1139865..1141292)
Genome browser
AA seq
475 aa
AA seq
DB search
MRLSKLQLFNQYPAGFTPLFFTQMLFNFGFYGFKSLFLLYAIDSLALKEQEAITFFSAFM
SLSYATSLIGGILADKIIGARNSLLIGGSLCCISILLLIFTPKSTVYISMALLSVGVGCY
KPNFSTMLSMLFKDAQDSRKDNAFTTLYIAMNVGSFMGPIACSFMSSLYGWQYGLMFIVL
GFLGGTLLFFKHGQLFKNFSARFKGGYVGRTIILLIFVAYVIYHLLRYQVYFHGLMGIIM
SASVISFGFFFYRANSEERRGLLKAILYIILFTFFCALYEQCGSSLILFFERFVDRQIFN
LTIPPSSLLSLNPILVLMLGIIIPFVAITFPSKKSALEGFTKFSIGFFLTSLSFGILSTA
AYQGHIPISILWMLSAIILETLGELMIVPIGFSNISKLVPQRHIGFMMGLWLMAISYGHY
LAGLMANYSLNTAEGKFIYTLGNFSQFFMKLSIFPLIIAVFLAACIFYAKSKKKI
NT seq
1428 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgactttctaaacttcaattatttaatcaatacccggcaggatttacaccccttttt
ttcactcaaatgctttttaattttggtttttatgggtttaagtctttattcttattatat
gctatagattcactcgctctgaaagagcaagaagcaattacctttttctctgcttttatg
tctctctcgtatgcaacttcactaattggggggatccttgcagataaaattataggggct
agaaattccctccttattggaggaagcctttgctgtatttctatcttattgttaatcttc
actcctaaatctacggtctatatttctatggcattattaagtgtaggggtgggctgttat
aaacctaacttttctaccatgctttctatgcttttcaaagatgcgcaagattcacgtaaa
gataatgctttcactactttatacattgcaatgaacgttggtagttttatggggccaatt
gcttgtagctttatgagcagcttatatgggtggcagtatggattgatgttcattgtctta
ggttttctaggtgggaccttattattctttaaacatggacagctttttaaaaacttttct
gcaaggtttaaaggtggttatgtaggaagaacaataatcctcttaatttttgtagcttat
gtaatttatcatctacttaggtatcaagtttattttcatggattgatggggatcattatg
agcgcaagtgttattagctttggatttttcttttacagagcaaattctgaagaaaggcgg
ggtctcttaaaagcaatactgtatattattttatttacctttttttgtgctttatatgag
caatgtggtagctctttaattttgttttttgaacgttttgttgatcgacaaatttttaat
ttaactattcctccttcaagccttctttcactaaatcctatattagtcctaatgttagga
ataatcataccttttgttgcaataacatttccaagcaaaaaatcagccttagaagggttt
actaaattttctataggatttttcttaacaagtctgagctttggtatcttatcaacagcg
gcttatcaggggcatataccaatctcaatattatggatgttatccgcaattattctcgaa
acactaggagaactaatgattgttccgattggattttcaaatatatcaaaactagttcct
cagagacatattggattcatgatgggcctttggcttatggcaatttcttatggtcattat
ttagcagggctcatggcgaattattcccttaatactgcagaggggaaatttatatatacc
cttggaaacttctctcagttctttatgaaactttctatttttcctttaataattgctgtt
ttcttagctgcttgtatattttatgcgaaatcaaaaaagaagatatga
DBGET
integrated database retrieval system