KEGG   Coffea arabica (coffee): 113691078
Entry
113691078         CDS       T11342                                 
Name
(RefSeq) ABC transporter C family member 10-like
Organism
carb  Coffea arabica (coffee)
SSDB
Motif
Pfam: ABCC10_N ABC_tran ABC_membrane SMC_N AAA_29 AAA_23 MMR_HSR1 AAA_22 AAA_16 DUF87 Dynamin_N DO-GTPase2 RsgA_GTPase MeaB Mg_chelatase TrwB_AAD_bind
Other DBs
NCBI-GeneID: 113691078
NCBI-ProteinID: XP_027065067
UniProt: A0A6P6SHQ3
LinkDB
Position
5c:32951464..32959117
AA seq 1479 aa
MVDLWSIFCGASDCTDSSRKFCGANLVSAALSSTCINHALIISFDVLLLIVFLAIFFSRT
SSKFPWMHAQTRAISGLQLISATFNGLLGLLYLCVGIWMLVRELRKTHGALPLHWWLLLT
FHGSTCLLVGLTVSLRGKVFSQAPLRLLSILVFLFSGIACGFSLVTAILDKEVSFRMGLY
ILSLIGACLLLLCTYKGYKNEDSTENDLRAPLNGVASGKGQLDSVGCVTPFEKAGFISKM
SFLWLNPLMKRGKEKTLEDEDIPNLREEDRAESCYLLFMDIYNKRKQVDRLAQPSVLKTI
LICHWREIFTSGFFAFLKIVTVSAGPLLLQAFIQVAEGKESFEYEGYVLAVLLFISKNLE
SLSQRQWYFRSRLVGVKVRSLLTAAIYKKQLRLSNTAKLMHSSGEIMNYVTVDAYRIGEF
AFWFHQTWTTGLQLIFALLIVYRAVGLATIASLAVIVLTVLCNTPLAKLQHKFQSKLMVA
QDDRLKAISEALINMKVLKLYAWESHVKKVIENLRQVEEKWLSAVQLCKAYNSFLFWSTP
VLVSATTFGACYFLGIPLYASNVFTFVATLRLVQDPIISIPDVIGVVIQAKVSFNRIVKF
LEAPELDVANVRQLCLGENTSRNIIIRSASLSWEENSLKPSLRNINLEVRPGKKVAICGE
VGSGKSTLLAAILGEVPVTCGTVRVHGTIAYVSQSAWIQTGSIRDNILFGSPMDYQRYQQ
TLEKCSLVKDFELLPHGDLTEIGERGVNLSGGQKQRIQLARALYQNADIYLLDDPFSAVD
AHTATSLFNDYVMGALTGKTVLLVSHQVDFLPAFDCVLFMSDGEILNAAPYHQLLACSKE
FQSLVDAHKETAGSERISEVTSSPSYKTPNKEIHKTYSDKGSKASAGDQLIKQEEREVGD
TGFRPYIQYLNQNKGFLFFSLAAFSNLTFVIGQISQNSWMAANVDNPEVSTLKLIVVYLV
IGFSSTFLLLSRSLSTVVLGLQSSKSLFFQLLNSLFRAPMAFYDSTPLGRILSRVSVDLS
IVDLDVPFNLIFAVVATLNFYSSVVVLTVFTWQILVVSIPLVYLAIRLQRYYFASAKELM
RINGTTKSFVANHLAESLAGCMTIRAFEQEERFFVKNLELLDTNASPFFHNFAANEWLIQ
RLETVSATVLASSALCMVLLPPGTFSSGFVGMALSYGLSLNMSLVYSIQNQCTLANYIIS
VERLNQYMHIPSEAPEVIECNRPPTNWPIVGKVEIQGLQIKYRSDGPLVLRGISCTFEGG
HKIGIVGRTGSGKTTLIGALFRLVEPVGGRIVVDGIDICTIGLHDLRSRFGIIPQDPTLF
NGTVRYNLDPLGQHPDPEIWEVLEKCQLKDAIQEKEEGLGSLVVEDGSNWSMGQRQLFCL
GRALLRRSKILVLDEATASIDNATDMILQKTIRAEFADCTVITVAHRIPTVMDCTKVLAI
SEGKLAEYDEPMELMKREGSLFGKLVKEYWSHYRSAGLQ
NT seq 4440 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtggatctttggagtatattttgcggggcatctgattgtactgacagcagtaggaag
ttttgcggtgctaatttagtctctgcagcactgtcctccacgtgtattaatcatgccttg
atcatttccttcgatgttttgctcttaattgtgttcctagccatttttttctccagaacc
tcgtcaaaattcccatggatgcatgcgcaaactcgtgctatttcaggattgcagttgata
tctgccactttcaatggtcttcttggacttttatatttgtgtgtggggatttggatgttg
gtaagagagttacggaaaacccacggtgcattgcctctccattggtggttgttgctaact
ttccatgggtcgacgtgcttattagtgggtttaactgtgagccttaggggaaaggttttt
tcacaagcgcctttgaggctgttgtccattcttgtattcttgttttcgggaattgcttgt
gggttctctcttgtgactgccattctcgataaagaggtgtcatttaggatggggttatac
atattgtctttgataggagcatgtttactgttgttgtgcacctacaaaggttacaaaaat
gaggacagcactgaaaatgatcttagggcccccttaaatggcgtggccagtggaaaaggc
caacttgattctgttggctgtgtcactccatttgagaaagctggatttatcagtaaaatg
tcatttttgtggttgaatccattgatgaaaaggggaaaggagaagactttggaggatgaa
gacatacccaacttgcgtgaggaagatcgagcagagtcctgctacttgctgtttatggat
atatataacaaacggaaacaagttgatcgactagcccaaccatcagtgttgaagacaatc
ttaatatgccactggagggagatcttcacatcagggttttttgcatttctgaaaatagtt
accgtctctgctggtcctcttctactacaagccttcattcaggttgcagaaggaaaagag
agttttgaatatgaaggttatgtcttggctgttttgctttttatctcaaagaacttggaa
tctttgtcccaaagacagtggtatttcagaagcagactagtaggtgtgaaagtaaggtcc
ttgttaacggcagccatttataagaagcaactaagactatccaatactgccaagttgatg
cactcaagtggtgagataatgaactatgttacagtggatgcctaccggattggagaattt
gctttctggtttcatcagacgtggacaacgggtcttcagctcatctttgcacttttaatt
gtctaccgtgctgtggggcttgctacaattgcatccttggcggtaatagttcttaccgtt
ctttgtaatactccccttgcaaaattacagcacaaattccaatctaagcttatggtggca
caagatgacaggctaaaggctatttcagaggcacttatcaatatgaaggttttgaaatta
tatgcatgggaaagccatgtcaagaaggttattgagaatctaaggcaggttgaagaaaaa
tggttgtcagctgttcagctgtgtaaagcatataatagctttcttttttggtcaacccct
gtactcgtctctgctacaacattcggggcttgctatttccttggtattccactatatgca
agcaatgttttcacatttgtggcaacattacgactggttcaggaccctattatatctatt
cctgatgttattggagtagtcattcaagctaaggtttcttttaacaggattgtgaagttt
ctcgaggcacctgaattggatgtagcaaatgtgaggcagctatgccttggagaaaacaca
agtcgaaacattattataagatctgcttctctctcgtgggaagagaattcattgaaaccc
tctcttagaaacataaatctggaggttagacctggtaagaaggttgctatatgtggggag
gtgggctcaggtaagtcaacccttctagctgcaattcttggagaggttccagttacctgt
ggaactgttcgagtgcatggaactattgcctatgtttcccaatcagcatggattcagact
ggaagtattcgagacaatattttatttgggtctccaatggattaccagagataccaacaa
acattagaaaaatgttcattggtaaaagattttgagttgctccctcatggtgatctcact
gaaattggagaaaggggagttaatctcagcggtggacagaagcagcggattcaactagca
cgggctttatatcagaatgctgacatatatctactcgatgatcccttcagtgctgttgat
gcacacactgccacaagcttattcaatgattatgtcatgggagctctaactgggaagact
gtcttacttgtaagccatcaagttgattttcttcctgcatttgattgtgttctgtttatg
tcagatggcgagattctcaatgcggctccctatcatcagttactagcctgtagtaaagaa
tttcagagtttggttgatgcacacaaagagactgcaggttctgagaggatttcagaagtt
acttcctccccaagttataaaactcctaacaaagaaatccacaagacatacagtgacaaa
ggttctaaagcatcagcaggtgatcagttgatcaagcaagaagagagagaagtcggggac
actggctttaggccttacattcagtatttaaatcagaacaaaggcttcttgttcttttct
ttggctgctttctctaatcttactttcgtgattggtcagatatcacagaactcttggatg
gctgcaaatgttgacaatcctgaagttagcacgctgaaactaattgtagtctacttggtc
attgggttttcgtcaacatttcttctgctcagtagatctctgagcacagttgttttgggt
ctgcaatcttcaaaatcattattttttcagctattgaattctcttttccgcgcgcccatg
gcattttatgactctacgcctttgggaaggatattaagccgggtctcggttgatctgagc
attgttgatctcgatgttccatttaacttgatttttgctgttgtagcaactttgaatttt
tactctagtgttgtggtgctaaccgtattcacctggcaaattttggttgtctcgatacca
ctggtctacttggctattcggttacagagatactactttgcctctgctaaagagctaatg
cgtattaacggcacaaccaagtcttttgttgcaaatcatcttgctgaatctttggcaggg
tgcatgacaatcagagctttcgaacaagaagagcgtttctttgttaagaacctagaactt
cttgacacaaatgccagccctttcttccacaattttgcagctaatgagtggctgattcaa
cgattggagacagtcagtgccacagttcttgcctcttcagctctctgcatggttttactt
cctcctggaacttttagctccggatttgtcggaatggctttgtcctatggtctttcatta
aacatgtcccttgtgtattccatccaaaaccagtgtactctggcaaattatataatttct
gtggagaggcttaaccaatacatgcacataccaagtgaagctcctgaagtcatagaatgt
aatcgaccgccaaccaattggccaatagtgggtaaagtagagattcaaggtttgcagatc
aagtatcgttctgatggcccacttgttcttcgtgggatcagctgtacattcgaaggaggg
cataaaattggtattgttggacgaactggtagtgggaagactactctgattggtgctctc
tttcgtctggtggagccagttggtggaagaatcgtagtagacggaatcgacatctgtaca
attggactccatgacttgaggtcacgttttgggattataccacaggatcctactcttttc
aatggaactgtgagatacaacttagatcctttggggcaacaccctgatccggaaatatgg
gaggttcttgagaagtgtcaactcaaagacgctattcaggagaaagaagaaggcctcggc
tccttggttgtggaagatggatcaaactggagcatggggcagaggcaattgttctgtctt
ggccgtgctctactgagaagaagcaagatattggttcttgatgaagcaactgcatcaata
gacaatgctactgacatgattttacagaaaactatcagggcagaatttgctgattgcacg
gtgatcacggtggctcacagaataccaacagtgatggactgtactaaggttttggctatt
agtgaggggaaacttgcggagtatgatgaaccaatggagttgatgaaaagagaaggttca
ctgtttggcaagctcgtgaaggaatattggtctcattatcgctctgcaggattacagtga

DBGET integrated database retrieval system