Coffea arabica (coffee): 113711670
Help
Entry
113711670 CDS
T11342
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
carb Coffea arabica (coffee)
Pathway
carb03015
mRNA surveillance pathway
carb03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
carb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
113711670
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
113711670
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
carb03041
]
113711670
Spliceosome [BR:
carb03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
113711670
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113711670
NCBI-ProteinID:
XP_027090649
UniProt:
A0A6P6UJD6
LinkDB
All DBs
Position
1e:49979143..49984201
Genome browser
AA seq
466 aa
AA seq
DB search
MYGQQGDGSGPPPMGGGGYGGNGSSGGYGGGGYGGSGGGGGGGYGSSGGGDGGYGGSGGG
YGGGGGRGGGRGGGGGGRGGGGYGGNMQNRGGGGGYQGGDRGGGGGYQGGDRGGRGGGGG
RGGGRGGGSGRDGDWRCPNPSCGNLNFARRDKCNKCGALPPAGAGDRGDRGGGNYNRDGN
NAGYGNNRGGRGGGSRGSGYGHGREDSGYSQGRGDGGYGQGRDDGGFGQSPVVAPSYGGH
GGNYAPPPSSFGGNPNYAQDAVPPPSSYSGGPSSYPPSYGAPPGGYDGGYGGGPRNLGGG
YGGAPAEAPVKVKQCDENCGDACDNSRIYISNLPPDVTIEELQELFGSIGQVARIKQKRG
YKDQWPWSIKLYTDDQGKNKGDAVLSYEDPSAAHSAGGFFNNHDLRGYAISVAMAEKSAP
KPASQHGYGGGGRGGYGGDRRRDNYRDGGGSGPDRNYHGGNRSRPY
NT seq
1401 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaacaaggcgacggatctggtccaccgcctatgggcggaggaggttatgga
ggtaacggaagctctggaggatacggaggcggaggctacggtggctctggaggaggagga
ggaggaggctacggtagctctggaggaggagatggtggttatggaggaagcggtggagga
tacggtggcggcggtggccggggaggcggtagaggtggtggtggtggaggcagaggaggt
ggtggttacggcggtaatatgcagaatcgaggtggtggtggtggataccaaggaggagat
cgtgggggtggtggtggctaccaagggggggaccgcggaggtcgtggtggaggtggcggt
agaggaggtggccgcggtggtggaagtggcagagatggggactggcgttgtcctaaccca
agctgtgggaatttgaactttgctagaagagataagtgtaacaaatgtggtgcactccct
cctgctggtgctggtgaccgtggtgacagaggtggtggtaattataatagagatggcaat
aatgcaggatatggaaataatcgaggtgggagaggtggaggcagtagaggcagtggctac
ggtcatggaagagaggatagtggttatagtcaaggaagaggtgatggaggttatggtcaa
ggaagagatgatggtggttttggtcagagccctgttgtagctccttcttatggtggacat
ggtggtaactatgcaccaccacctagcagttttggtggaaaccctaattatgctcaagat
gctgttcctccaccttcaagctatagtggggggccttcttcatatcctccatcatatggt
gctccacctggtggctatgatggaggctatggaggtggtccacggaatctgggtggtgga
tatggtggtgctccagctgaagctcctgttaaagtgaagcagtgtgatgaaaactgtggg
gatgcgtgtgacaactcgagaatttacatttcaaatttgcctccagatgtgaccattgaa
gaacttcaagaactttttggaagcattggacaagttgcaaggatcaaacaaaagcgaggt
tataaagatcagtggccctggagtataaaactgtacacagatgaccaaggaaaaaacaaa
ggagatgcagttttatcttatgaagatccttctgcagcacactctgctggtggctttttc
aataatcatgatctacgaggttatgcaatcagtgtggctatggctgagaaatctgcacca
aaacctgcctcacagcatggatatgggggaggtggtagaggcggttatgggggtgataga
cgtagagacaactacagagatggtggaggttctggtccggatagaaattatcatggagga
aaccgttcacgcccttattag
DBGET
integrated database retrieval system
