Coffea arabica (coffee): 113731008
Help
Entry
113731008 CDS
T11342
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
carb Coffea arabica (coffee)
Pathway
carb03015
mRNA surveillance pathway
carb03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
carb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
113731008
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
113731008
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
carb03041
]
113731008
Spliceosome [BR:
carb03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
113731008
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113731008
NCBI-ProteinID:
XP_071922378
UniProt:
A0ABM4WVT2
LinkDB
All DBs
Position
1e
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MYGQQGDGSGPPPMGGGGYGGNGSSGGYGGGGYGGSGGGGGGGGYGSSGGGDGGYGGSGG
GYGGGGGRGGGRGGGGGGRGGGGYGGNMQNRGGGGGYQGGDRGGGGGYQGGDRGGRGGGG
GRGGGRGGGSGRDGDWRCPNPSCGNLNFARRDKCNKCGALPPAGAGDRGDRGGGNYNRDG
NNAGYGNNRGGRGGGSRGSGYGHGREDSGYSQGRGDGGYGQGRDDGGFGQSPVVAPSYGG
HGGNYAPPPSSYGGNPNYAQDAVPPPSSYSGGPSSYPPSYGAPPGGYDGGYGGGPRNLGG
GYGGAPAEAPVKVKQCDENCGDACDNSRIYISNLPPDVTIEELQELFGSIGQVARIKQKR
GYKDQWPWSIKLYTDDQGKNKGDAVLSYEDPSAAHSAGGFFNNHDLRGYAISVAMAEKSA
PKPASQHGYGGGGRGGYGGDRRRDNYRDGGGSGPDRNYHGGNRSRPY
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaacaaggcgacggatctggtccaccgcctatgggcggaggaggttatgga
ggtaacggaagctctggaggatacggcggcggaggctacggtggctctggaggaggagga
ggaggaggaggctacggtagctctggaggaggagatggtggttatggaggaagcggtgga
ggatacggtggcggcggtggccggggaggcggtagaggtggtggtggtggaggcagagga
ggtggtggttacggcggtaatatgcagaatcgaggtggtggtggtggataccaaggagga
gatcgtgggggtggtggtggctaccaagggggggaccgcggaggtcgtggtggaggtggc
ggtagaggaggtggccgcggtggtggaagtggcagagatggggactggcgttgtcctaac
ccaagctgtgggaatttgaactttgctagaagagataagtgtaacaaatgtggtgcactc
cctcctgctggtgctggtgaccgtggtgacagaggtggtggtaattataatagagatggc
aataatgcaggatatggaaataatcgaggtgggagaggtggaggcagtagaggcagtggc
tacggtcatggaagagaggatagtggttatagtcaaggaagaggtgatggaggttatggt
caaggaagagatgatggtggctttggtcagagccctgttgtagctccttcttatggtgga
catggtggtaactatgcaccaccacctagcagttatggtggaaaccctaattatgctcaa
gatgctgttcctccaccttcaagctatagtggggggccttcttcatatcctccatcatat
ggtgctccacctggtggctatgatggaggctacggaggtggtccacggaatctgggtggt
ggatatggtggtgctccagctgaagctcctgttaaagtgaagcagtgtgatgaaaactgt
ggggatgcgtgtgacaactcgagaatttacatttcaaatttgcctccagatgtgaccatt
gaagaacttcaagaactttttggaagcattggacaagttgcaaggatcaaacaaaagcga
ggttataaagatcagtggccctggagtataaaactgtacacagatgaccaaggaaaaaac
aaaggagatgcagttttatcttatgaagatccttctgcagcacactctgctggtggcttt
ttcaataatcatgatctacgaggttatgcaatcagtgtggctatggctgagaaatctgca
ccaaaacctgcctcacagcatggatatgggggaggtggtagaggcggttatgggggtgat
agacgtagagacaactacagagatggtggaggttctggtccagatagaaattatcatgga
ggaaaccgttcacgcccttattag
DBGET
integrated database retrieval system
