Coffea arabica (coffee): 113736202
Help
Entry
113736202 CDS
T11342
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
carb Coffea arabica (coffee)
Pathway
carb03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
carb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
113736202
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
carb03019
]
113736202
Messenger RNA biogenesis [BR:
carb03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
113736202
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
113736202
NCBI-ProteinID:
XP_027118859
UniProt:
A0A6P6WU12
LinkDB
All DBs
Position
3e:complement(5285599..5289598)
Genome browser
AA seq
454 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLKDYFGKYGDVLQTVVMRDKVSGKPRGFGFVVFADPNVL
DGVLQDRHVIDGRTVEAKRALSREEQQISKVGNANTGRSFGGGGGGNTRTKKIFVGGLPP
TLTDEAFRQYFESYGDVTDVVIMFDQQTNRPRGFGFISFDSEEAVDRVLHKTFHDLNGKQ
VEVKRALPKDANPGGSGRAMGGGGGGYQGYGASGGNSNSYESRMDSNRYMQSQNTGGGYP
PYGSSGYNTTGYGYGPTNNGMGYGGYGNFGGANPGYGGPAAAAAYGNPNVPNAGYGSGPP
GAPRNTWNSQGSSGYGNVGYGNAPWGASNTSGGGLGGAGAAAGHSPSGAAGYGNQGYGYG
GYGTNDGAYGNPATYGGGGRAGGTPNSNSSAGNGAGDLQAGAGGYMGGGYGDTSGNAGYA
GWRSDPSQASGNYGGQAGYGGGYGGAPTRQAQQQ
NT seq
1365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctatttataggagggatttcatgggaaacatcagaggag
aaattgaaggactattttggcaaatacggtgacgtattgcagactgtagtgatgcgggat
aaagtttctggcaagcccagaggatttgggtttgtggtttttgcagatcccaatgttctt
gatggggttcttcaagataggcatgtcattgatggccgcactgttgaggctaagagagct
ttatcaagagaggaacaacagatctctaaagttggaaacgctaatactgggaggagcttt
ggtggtggtggtggtggaaatactaggacaaagaagatatttgttggaggattacctccg
actttaactgatgaggcttttcgtcagtattttgaatcttatggtgatgttactgatgtg
gtaatcatgtttgaccagcaaacgaaccgaccccgtggatttggatttatttcttttgac
tctgaggaagctgttgatagggtcttgcacaagacatttcatgatttaaatggtaagcaa
gtggaagtgaagcgcgctcttccaaaggatgctaatcctggtgggagtggccgtgccatg
ggtggcggtggtggaggttaccagggatatggtgcatccggtggtaattcaaattcttat
gagagccgaatggattccaacaggtacatgcaatctcaaaacacaggagggggatatcca
ccttacggatcttctggatataatactactggttatggatatggtcctaccaataatggt
atgggttatggaggctatggaaattttggaggtgctaatcctggatatggtggccccgct
gctgctgctgcttatggaaacccaaatgtgcctaatgctggttatggaagtggtccacca
ggtgcaccaaggaacacgtggaactctcagggatcctctggatatggaaatgtaggctat
ggaaatgctccctggggtgcttctaacactagtggtggtggcctaggtggtgctggagct
gctgctggacattctcccagtggagctgcgggatatggaaatcaaggttacggttatgga
ggatatggtacaaatgatggggcttatggtaacccggctacttatggtggtggcgggcgt
gcagggggtactccaaatagtaattcctcagctggaaatggtgctggagatctacaagct
ggtgctgggggttatatgggaggtggctatggtgatacatctgggaatgctgggtatgca
ggatggaggtcggacccctcacaagcttctggcaattatggaggccaagctgggtatggt
ggaggctatggtggtgcaccaactcggcaagctcagcagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
