Coffea arabica (coffee): 113737415
Help
Entry
113737415 CDS
T11342
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
Organism
carb Coffea arabica (coffee)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113737415
NCBI-ProteinID:
XP_071900822
UniProt:
A0ABM4U0L9
LinkDB
All DBs
Position
3e:15842833..15848426
Genome browser
AA seq
1341 aa
AA seq
DB search
MWLRWGDPARGRLLLVALAILAVSVVVSADPYSSPPPPPYDYKSPPPPSPSPPPPYEYKS
PPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPSPPPPTYEYKSPPPPSPSPPPYEYKSPPPPPYEYKSPP
PPSPSPPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPKPPPYE
YKSPPPPSPSPPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPPPYEYKSPPPPSPSPAPYEYKSPP
PPPYEYKSPPPPSPSPAPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSPSPPPY
EYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPAPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPAPYEYKSPPPPPY
EYKSPPPPSPSPPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPS
PPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPKPPPYEYKSPPPPSPSPPPYEYKSPPPPPYEYKSPP
PPSPKPPPYEYKSPPPPSPSLPPYEYKSPPPPPYEYKSPPPPSPSPPPPYEYKSPPPPSP
SPPPPYEYKSPPPPSPSPLPPYHYVSPPPPYYYNSPPPPYNYSSPPPPEKSLPPYYYHSP
PPPVKSPHPPYYYTSPPPPVKPPHPPYYYISPPPPMKPPHPPYYYTSPPPPVKSPHPPYY
YTSPPPPPMKPPHPPYYYNSPPPPVKPPHPPYYYTSPPPPVKSPHPPYYYTSPPPPPMKP
PHPPYYYNSPPPPVKPPHPPYYYTSPPPPPMKPPHPPYYYNSPPPPMKPPHPPYYYNSPP
PPMKPPHPPYYYTSPPPPMKPPHPPYYYTSPPPPVPYHPHPHHPMLVKVVGKVYCYRCYD
WDYPKKSHDKKHLKGAVVEVTCKVGDKKIVAYGKTKINGKYSVTLEGFDYGKYGAKACMA
KLHMAPKDSKCNIPTNLHWGKTGAELRVKSKTDYEVVLYAKPFAYAPKTPYEECEKPKPT
PAPYHYISPPPPTYVYKSPPPPPPTYLYKSPPPPVKPPPKPYYYVSPPPPTYVYKSPPPP
PPTYLYKSPPPPVKPPPKPYYYVSPPPPTYVYKSPPPPPPTYLYKSPPPPVKPPPKPYYY
VSPPPPTYVYKSPPPPPPTYLYKSPPPPVKPPPKPYYYVSPPPPEKSPPPPYQYISPPPP
EKSPPPPYQYISPPPPEKSPPPPYHYISPPPYQYISPPPPEKSPPPPYHYISPPPPEKSP
PPPYHYVSPPPPSPSPHPYYYKSPPPPSPSPHPYYYKSPPPPSPSPHPYYYKSPPPPSPS
PLPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPEKSPPPPYVYTSPPPPSPSPPPPYHYISPPP
PEKSPPPPVYTYASPPPPTHY
NT seq
4026 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggcttcgatggggcgaccccgccaggggtcgtctgttgctagtggcattggccatt
ttggctgtttcagtggtggtctcagcagacccttattcttcacccccacctcctccttat
gattacaagtcacctcctccaccttcaccttctccaccaccaccttatgagtacaagtct
cctccaccaccatcaccttctccaccaccaccatatgagtacaagtctccgccaccaccc
tccccttcaccacctccaccaacatatgagtacaagtctccaccaccaccctctccttca
cctccaccatatgaatacaagtctcctcccccaccaccatatgaatataagtctcctccc
ccaccctctccttcacctccaccatatgaatacaagtctcctcccccaccaccatatgag
tataagtctccaccaccgccctctccttcacctccaccatatgaatacaagtctcctccc
ccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccctctcctaaacctccaccatatgag
tacaagtctccaccaccaccctcaccttcacctccaccatatgaatacaagtctcctccc
ccaccaccatatgaatacaagtctcctccaccaccctctccttcacctccaccatatgag
tacaagtctcctccaccaccctctccttcacctgcaccatatgaatacaagtctcctcca
ccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccctctccttcacctgcaccatatgaa
tacaaatctcctccaccaccaccatatgagtataagtctcctcccccaccttcaccctct
ccacctccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccctctccttcacctccaccatat
gaatacaagtctcctccaccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccctctcct
tcacctgcaccatatgaatacaagtctcctccaccaccaccatatgagtacaagtctcca
ccgccaccctctccttcacctgcaccatatgaatacaagtctcctcccccaccaccatat
gagtacaagtctccaccgccaccctctccttcacctccaccatatgaatacaagtctcct
ccaccaccaccatatgagtacaagtctccaccgccaccctctccttcacctccatatgaa
tacaagtctcctccaccaccaccatatgagtacaagtctccaccgccaccctctccttca
cctccaccatatgaatacaagtctcctcccccaccaccatatgagtacaagtctccacca
ccaccctctcctaaacctccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccctcaccttca
cctccaccatatgaatataagtctcctcccccaccaccatatgagtacaagtctccacca
ccaccctctcctaaacctccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccctcaccttca
cttccaccgtatgaatacaagtctcctcccccaccaccatatgaatataagtctcctccc
ccaccttcaccttctccacctcccccatatgagtacaagtctccaccaccaccgtcaccc
tcaccacctccaccatacgaatacaaatctcccccaccaccatcaccatcccctctacct
ccctaccattatgtttcaccacctccaccatattactataattcacctccaccgccatac
aactacagctctcctccaccaccagagaagtctcttccaccttactactaccattcacct
ccaccaccagtgaaatcaccccatccaccttactactacacttccccaccaccaccagtg
aagcctccacatccaccgtactactatatttctccaccaccaccaatgaagcctccacat
ccaccatactactacacttctcctccaccaccagttaagtcaccacatccaccatactac
tacacttctcctccaccaccaccaatgaagcctccacatccaccatactactataattct
ccaccaccaccagtgaagcctccacatccaccatactactacacttctcctccaccacca
gttaagtcaccacatccaccatactactacacttctcctccaccaccaccaatgaagcct
ccacatccaccatactactataattctccaccaccaccagtgaagcctccacatccacca
tactactacacttctcctccaccgccaccaatgaagcctccacatccaccgtactactac
aattctccaccaccgccaatgaagcctccacatccaccatactactacaattctccacca
ccgccaatgaagcctccacatccaccatactactacacttctccaccgccgccaatgaag
cctccacatccaccatactactacacttctccaccaccaccagttccttaccacccccac
cctcaccaccccatgctcgttaaggtagttggaaaagtttactgctacagatgctacgac
tgggactacccaaagaaatcccatgacaagaaacatctcaaaggagctgtagtagaggtt
acgtgcaaggttggtgacaagaagattgtggcatatggaaaaactaagattaatggaaag
tacagcgtcacacttgaagggtttgattatggcaaatatggagctaaggcatgcatggct
aagctgcacatggcgccaaaggattccaaatgcaacattccaaccaatctccactggggc
aaaacgggtgctgaactcagagtcaagtccaagactgactatgaagtcgtgctctacgca
aaaccatttgcttatgctcccaagactccttatgaggaatgtgagaagcccaagccaact
cctgctccttaccactacatatctcctccgccaccaacttatgtctataaatcaccacca
cctccaccaccaacttacctatacaagtcaccgccaccaccggtgaaacctccaccaaag
ccgtattattacgtctccccaccaccaccaacttatgtctataaatcaccaccacctcca
ccaccaacttacctatacaagtcaccgccaccaccagtgaaacctccaccaaagccgtat
tattacgtctccccaccaccaccaacttatgtctataaatcaccaccacctccaccacca
acttacctatacaagtcaccgccaccaccagtgaaacctccaccaaagccgtattattac
gtctccccaccaccaccaacttatgtctataaatcaccaccacctccaccaccaacttac
ctatacaagtcaccgccaccaccggtgaaacctccaccaaagccgtattattacgtctcc
ccaccaccaccggaaaaatctccaccaccaccttatcagtacatctccccaccaccaccg
gaaaaatctccaccaccaccttatcagtacatctccccaccaccaccggaaaaatcccca
ccaccaccttatcactacatctccccaccaccttatcagtacatctccccaccaccgccg
gagaaatctccaccaccaccttatcactacatctccccaccaccgccggagaaatctcca
ccaccaccttatcattacgtctccccaccaccaccatctccatcccctcatccctactac
tacaaatctcccccaccaccatctccatcccctcatccctactactacaaatctccccca
ccaccatctccatcccctcatccctactactacaaatctcccccaccaccatctccatca
ccactccctccttactactacaagtccccaccaccaccatcgccatctcctccaccacct
tactactacaagtccccaccaccgccggagaaatcacccccaccaccctatgtctacaca
tcccctcctcccccttcaccatctccacctcctccataccactacatctcacctccccca
cccgaaaaatcacctcctccaccagtctacacttatgcttctcccccacccccaactcac
tactga
DBGET
integrated database retrieval system