Chryseobacterium arthrosphaerae: EGY05_14445
Help
Entry
EGY05_14445 CDS
T05746
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
carh
Chryseobacterium arthrosphaerae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
Por_Secre_tail
Y_Y_Y
WxLIP_HBD
K319L-like_PKD
PKD_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYZ13058
LinkDB
All DBs
Position
complement(3131918..3136780)
Genome browser
AA seq
1620 aa
AA seq
DB search
MKNNTYFSRQHIFRWLLLCWLLVPWALQAQSARITWNSQVGCQEYRGEKGGTDDNGTTYS
FINSSQCLRVCEGSTVTYTVSGQNISYVQWNISGGNSTVSGTGNTQAVVNWGAAGSGAVQ
ATITYTDGTFENQNICIEKINSPVAKFEMKNLKSTVCRNTTIYFENLSYQNGGTEIINYF
WDFGDGTTSTAFEPSHAYVNPGNYTVRLTVTNKCGCSSSIKMPVEVLKSTPVQINCASVV
CEGSIEKYNVQDGCPGKWKVIGGTIVSNNGSEIEVAWDNVDPADGFGYVMYQSECGCPEW
TTIKIPVILKKGKIKGEPIVCTGKQYIYGLPQWPTTSVKWNVSGPAPALLDYNQQRNEVL
FTANQPGNYTLTADYFNTLLSCSGQAYINIVVEAPVQISGGADEICVGTSQSFNANPNVP
VTWKVVTGNSVYTSPPTTGTFSYNFATAGSYTVTATKVGGACESNPIQVKVLPNPQPPTG
PIVGEEKVCPGKPYIFKLNSVDPGVVPVWDVTNGTIQGSNSGASVTIIFNAGASQYVISV
RNKLTSSPVGCLSTPISRTVVPLNLNTITINPNPGPFCPSSTQTFSANLNGITPDSMEWS
FGSSNFGSVVAGQGTANITVNFNEITTTSSSTLKLKITKCGTVRTIEIPIALQPLPVVNF
TNVGKICLGSPLTFTVNQTGITNASSVTFTFANGTTHSAIFNTSGSYTFPNNNYIQNNTG
GNISQTVIVTYAGTNGCNYTPTASASFIVLPETIITISPVYNIVVCDPATMAPYTLTANS
STGLTGISSWQWYRNGAQILGATSNSYTISGPNAIGTYMVQATDINTCVVYSQEVKVKQS
CSTGSGCTGPDPQISFTPKWVECNKITVTDLSYIGTADEIVWESDPILTLDSGQGTAFPV
YKTTMPAAHIVFVRIRFGSCWYAKAVEVQKKYEAKFNESLVCNGSNGYTLKLHNTSTIFN
ITSAISYTFSGGGQPDQYGQTATYTNLAPGTYTFTMTMVAPGFPSCSMTKTITIPPVPSL
SFTSPSKVCVGEVINLTPVGYNPANTYTWLFSNTSIVASGPTTAVAINTSGPTNIKLRIK
TPQGCVFESANAPINVVAANLSGSINPLSVVACVGSSPAITFIPSGAAPSGYIWMNGSQQ
VAGAPNSATFVPTQSGNYWPILISADNCRTEVMSSQLVPVTLKNLPYVNISGKANICAGS
STTLNGIVTDNTLEYQWKKGGVVVIPWSSAAAPIIYNTGALAAGTYVYTLEVRTPGTSGC
MSTKNFTVTVSSPPPAVSITYTLQSCQPYRVKLTASGGAGDYNWSNGMVGQSITVNEGGA
YQVTYTAPSGCKVVANTQVPLSLESLMWVFPTGCYDECLRKNYVIGPKGIFDHHEWQYFG
NNVQSGNNAFINPYYPGSAGTYNLQIDHFGCQYTSGPMNYFPGKDCGVSTECRMEGDLYL
KWDGDHFNVHGIIYNGSGQAVTLTISSGNGVGSYLPSIITIPAGGSYDMNANPLTFYPNV
NYSGWDEILFINGECKFVVKVDGKVGKATERTLEVTSESSLKMIPNPAKERVKISYNTGS
EKLQAKQVTVFDAMGNVKFRKELKASSGEVDVEISGWLQGVYIVIVQTGDTSMQGKLIKN
NT seq
4863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaacacctatttcagtaggcagcacatcttcagatggctactactatgttgg
cttttagtaccatgggcactacaagcacaatcagctcgaattacatggaattcccaggta
ggatgtcaggaataccggggagaaaaagggggtacggatgacaacggtactacctattct
tttatcaattcatcacagtgtctccgggtatgcgaaggaagtacggtcacttatactgta
agcggccagaatatctcgtatgtacaatggaatatctcaggtggaaactcaacggtttcc
ggtaccggaaatacccaggccgtggttaattggggcgctgcaggcagtggcgctgtacag
gcaacgattacgtatacagacggaacttttgaaaaccagaacatctgtatcgaaaaaatc
aacagcccggtggccaagtttgaaatgaaaaacctgaagtctacagtatgccggaataca
acaatctattttgaaaatctttcttatcagaatggcggcacagaaattattaattatttc
tgggactttggggacggtacaacttctacagcctttgagccgtctcatgcttatgtgaat
ccgggaaattatacggtaagattaacggtaactaacaagtgcggctgttcaagcagcata
aagatgccggttgaagtgctcaaatctactcctgtacagatcaactgtgcttcggtagta
tgcgaaggaagtattgagaaatacaatgtacaggacggatgtcccggaaaatggaaagtg
attggcggaaccattgtcagcaacaacggtagtgaaattgaagtagcgtgggataatgtg
gatccggctgatggttttggctatgtaatgtatcaatctgaatgtggctgtcctgaatgg
acaacgattaagatcccggtgattttaaagaaaggtaaaatcaaaggtgagccgatagta
tgtaccggtaaacagtatatctacggtcttcctcaatggcctaccaccagtgtgaaatgg
aatgtatccggaccggcaccagctctgctggactataaccagcaaagaaatgaggttctt
ttcacggctaaccagcctggaaactatacgcttactgcagattatttcaatacattattg
tcttgcagcgggcaggcttatattaatattgtagtggaagcaccggtacagatcagcgga
ggagcggatgaaatctgtgtaggtacatcccagtctttcaatgccaatcctaacgtacct
gttacatggaaagtggttacaggaaactcagtatacacgtctcctcctactacagggact
tttagttataattttgcaacagcgggttcttataccgttacggcaactaaagtgggcggg
gcttgtgaaagcaacccgatacaggtgaaagtattacctaatccacaaccgcctacagga
ccaatcgtaggggaagaaaaagtatgtcctggcaaaccttatatttttaaactgaattcg
gttgatccgggagtggtgcctgtatgggacgtaaccaacggaacaatccaaggtagcaat
tcgggagcttctgtgaccattatatttaatgccggtgcttcacagtatgtaatatcggta
cgtaacaaattgacgagcagtccggtaggatgtctttcgactcctatttcaagaaccgtg
gtaccgcttaatcttaatacgattaccattaatcctaatccggggcctttctgcccgagc
agtacacagaccttcagtgcaaatctgaacggaattacgccggattcaatggaatggagc
ttcggaagttctaatttcggaagtgtcgtagcagggcagggaacagctaatattactgta
aatttcaacgaaattactacaaccagcagctcaaccctgaaattaaaaataacaaaatgc
ggaactgtaagaacgattgaaattccaattgctttacaaccgcttccggtagttaatttt
actaatgttggaaaaatatgtttaggttcacctcttacctttacggttaatcagaccgga
attacgaatgcaagcagtgtaactttcacttttgccaacggaacaacccattctgctata
tttaatacgtccggaagttatactttcccgaataacaattatatacagaacaataccgga
gggaatatttcccagacggttatcgtgacctatgcaggaactaacggatgtaactatact
cctacagcatcagccagctttatagtactgcctgaaacgatcattacgatttctccggta
tataatatcgtggtttgcgatcctgctaccatggctccgtatacccttactgccaacagt
tctacaggacttacaggcattagttcatggcaatggtatagaaatggtgcacaaatacta
ggggctaccagcaattcatatacgatttcaggccctaatgccattggaacctatatggtt
caggctacggatatcaacacctgtgtagtgtattcccaagaggtaaaagtgaaacagtcc
tgctcaaccggtagtggctgtacaggaccagatcctcaaatcagctttacgccaaaatgg
gtagaatgtaacaaaatcaccgtaaccgatctgtcttacataggaactgcagatgagatt
gtatgggaatcagaccctattctgactttggattcaggtcaggggacagctttcccagtg
tataaaaccactatgccggctgcccatatcgtttttgtacgtataagattcgggtcatgc
tggtatgccaaggctgtagaagtacagaaaaagtatgaggctaaatttaatgagagtctg
gtgtgtaacggcagcaacggatatacgctgaagctgcacaatacgtctacaatattcaat
atcacctcggcgatatcatatacattcagcggaggcggacagcctgatcagtacgggcaa
acagctacttatactaaccttgcaccgggtacctatactttcactatgaccatggtggct
cctgggttcccgtcatgcagtatgacgaagactattacgataccgccggttccaagttta
agctttacaagtccttctaaagtatgtgtaggagaagttattaacctgacacctgtcgga
tataatcctgcgaatacctatacatggttgttctccaatacttctatagtggcttcaggt
cctacgactgctgttgctatcaatacaagtggaccgaccaatataaaattaagaatcaaa
actcctcagggatgcgtttttgagtctgccaatgcacctattaatgtagtagcagctaac
ttaagcggaagtattaatccactttctgttgtagcttgtgtaggaagtagcccggcaatt
acatttatcccttccggagctgctccgtcaggctatatctggatgaatggttctcaacag
gtagcaggggctccaaactctgcgacttttgttccgacccagtccggaaactactggccg
atattgatatctgcagacaactgcagaacggaagtaatgagttctcagctggtaccggta
accctgaaaaaccttccatatgtgaatatttcaggtaaagcgaatatatgtgccgggtca
tcaacgaccctgaatggtattgtaacggataatactcttgaataccaatggaaaaaagga
ggtgtggtagtgatcccatggtcttctgctgctgcaccgatcatctataataccggagcg
ttagctgcaggaacttatgtatatactcttgaagtaaggactccgggaacatcaggatgt
atgagcactaaaaacttcactgttacagtgagcagcccgccaccggcagtgtctattact
tatactttacaaagctgtcagccttatagagttaaattaacggcttcaggaggtgccgga
gattataactggagcaacggaatggttggtcagagtatcacagtcaatgaaggaggtgct
tatcaggtaacgtatactgcaccaagcggatgtaaggtggtagcaaatacacaggtacca
ttgagtcttgagagtctgatgtgggtattccctacaggatgctatgatgaatgcttaaga
aagaactatgttataggacctaaaggaatttttgatcaccatgaatggcagtatttcggc
aataatgttcagagtggtaataatgcctttatcaatccgtattatcctggttcggcaggt
acttacaatttacagatcgatcatttcggatgtcagtatacttcaggaccaatgaactat
ttccctggtaaagattgtggtgtatctacagaatgcagaatggaaggtgacctttacctg
aagtgggacggagatcactttaacgttcacggaataatttataatggttcagggcaggcg
gtaacgcttaccatatcaagtggtaacggggttggcagctatctgccatctataattact
attccggcaggaggttcatatgatatgaatgccaatccgctgactttctatccgaatgtt
aactactccggttgggatgagatcttattcatcaacggagaatgtaagttcgttgtgaaa
gtagatggaaaagttggtaaagcaacagagagaacattagaagtaacttctgaatcttct
cttaaaatgataccgaatcctgcgaaggaaagagtgaaaatctcgtataacactggcagt
gaaaaactgcaggctaaacaagttacagtttttgacgccatgggcaatgtcaaattccgt
aaagaactgaaagcatcttccggagaagtagatgtagaaatttcaggctggctgcagggt
gtttacattgtcattgtacagacgggagatacctcgatgcagggtaaactaattaaaaat
tag
DBGET
integrated database retrieval system
