Saccharobesus litoralis: C2869_05050
Help
Entry
C2869_05050 CDS
T05408
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cate
Saccharobesus litoralis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cate00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cate02000
]
C2869_05050
Transporters [BR:
cate02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C2869_05050
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB68922
UniProt:
A0A2S0VXM8
LinkDB
All DBs
Position
1453045..1455843
Genome browser
AA seq
932 aa
AA seq
DB search
MQLPNKKKVAGAVAAILGTVTSSQVIANETQSLETDEVIQVMGIRGSLSKSASIKREASG
VVDAISSEDIGKFPDTNLAESLQRITGVSIDRANNEGNQVTVRGFGPSFNLVTLNGRQMP
NSSVLESQGISRSFNFREIASETVSGVTVNKTGRANVSSGGIGATIDITTAKPFDYDGFK
AFAGVKGIYDTSVEKGDKITPELSGMVSQTFADGKLGVLLSASHSERHSHRDRVGTDGWY
TSAKDSVDKTAIDTTKNPSKTVFIPWTATVEHYDTERERQNAQAVIQFSPMDSLVATLDY
TLSRFEEVSYTNRMAYWFDDPSGKADSNGTLINPFDPDDELNFWAWQYFEKKENDSLGLN
VKWQATDELSFTLDWHDSTSHSNPGGKTAETLANLKNPKYDHDSNDTTPSLGVDIGANFS
GDIPAITIDDSKIPGSAYDKANIVSDLYQLRGYEMENNIQQLHLAGEWENFNTGLLSKVK
FGVQSTEYQVDTFLSQRFDFVSVPLTDLDISFEPLGDTADQFSGTDKLFPLVPKYSVNQF
IDIVEKAGKFNAPNIRTNGITEETTAAYISADLETEVAGMQANINVGARYEQTDITAYSV
AESIVAMNFNHDEELRPVYDGVAARQNLTGDYTRFLPNLDVSLNVTDEVVARVSYGKTIS
RADISAMFPSTTYNARPDGPFRITQGNPSLLPITSDNIDLSLEWYLDDGSYASIGYYRKD
VENFIGSVTTNEEWNNKDGIVLTDPSINPRAGCPDSSVEPNPACLSQASDPAITWEVSRP
ENLQSRTVDGWEFNVQYMFGETGFGSVANYTTVESDETYDRFDFSQTVALTGLSDSANLV
GFYENDQLQIRFAYNWRDEFLMRFQGSEPRFVEAYGQWDMNVSYDINDNISVFFDGINLT
DETVRRYARFEEQVIDAEQYGPRYTFGVRAKW
NT seq
2799 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaattacctaataagaaaaaagtagctggcgcggtcgcggccatactcgggacggta
actagctcacaagtcatcgccaatgaaacacaatcactagaaacagacgaagttattcaa
gtcatggggatccgtggctcgttaagtaagtcagcctcaattaaacgagaagcatccggc
gttgttgatgctatttcctcagaagatattggtaaatttccagatactaacctcgctgaa
tcattgcagcgtattactggggtatctattgaccgagccaataacgaaggtaatcaggtt
accgtacgtggttttggtccgagttttaatttggtaacactaaacggccgtcaaatgcct
aactcttcggttttggaatcgcagggcatttcacgcagttttaactttcgtgaaattgcg
tcggaaaccgtctcgggtgtgactgttaataaaacagggcgagctaatgtgtcttccggt
ggtattggtgcgactatcgatattacgacagcaaagccgtttgattatgacggctttaaa
gcttttgctggtgtaaaaggtatatacgacactagcgtagaaaagggtgacaaaattacg
cctgaattatcaggtatggttagtcaaacctttgctgatggtaaattaggtgtattgttg
tcggcttctcattctgagcgtcatagtcaccgcgatcgtgttggcaccgacggctggtat
acatcggctaaagacagtgttgataaaacagcaattgataccactaaaaacccatcgaaa
acggtatttattccttggaccgcgacagttgaacattatgatacagagcgcgaacggcaa
aatgcgcaggcagttattcaattctcgcctatggatagcctagttgcgacgttagattat
acgttatcgcgttttgaagaagtcagttataccaaccgtatggcttattggttcgatgat
ccaagtggtaaagcggatagcaatggtaccttgattaacccttttgatcctgatgacgag
ctaaatttttgggcgtggcaatactttgagaaaaaagaaaatgattctttaggtttaaat
gttaagtggcaagcaacagatgagttgagctttacccttgattggcatgattcaacatct
cattccaaccctggtggcaaaactgctgaaaccttggctaaccttaaaaaccctaaatat
gatcatgatagcaatgacacaaccccaagcttaggggtggatataggggcgaatttctct
ggtgatattccagccatcacaattgatgacagtaagatccctggcagtgcgtatgacaag
gcgaatatcgtttcggatttatatcagttacgtggttatgaaatggaaaacaacattcag
cagttacatttagctggtgaatgggaaaactttaatacaggcttgttgagtaaagtgaaa
tttggtgtgcaaagcaccgaatatcaagtagatacttttttaagtcagcgttttgatttt
gtctcagtcccgttaactgatttagatatatcgtttgagccattgggtgatacggctgat
caattctcaggaacagataagttattcccgctggtgccaaaatacagtgttaaccagttt
atcgatattgttgagaaagccggtaagtttaatgcgcctaatattcgcactaacggtatt
actgaagaaacaacagcggcttatattagtgctgatttagagaccgaagtcgcgggtatg
caagccaatattaatgtcggagctcgttacgagcaaaccgatattacggcttactcagtg
gctgaaagcattgtcgctatgaattttaaccatgatgaagagttacgtcctgtttatgat
ggtgttgccgcgcgtcaaaatttaacgggtgactatacgcgattcctgcctaacttagat
gtcagtttaaatgtgactgatgaagtggttgctcgtgtttcttatggtaaaacgatttct
cgtgccgacattagcgctatgttcccttccacaacctataacgcgcgtccagacggacct
tttagaattactcaaggcaatccaagcttgttacctattacctcagataatatcgactta
tcgttagagtggtatttagatgacggtagttatgcgtcaattggttactatcgtaaagac
gttgaaaactttattggctctgttaccacgaatgaagagtggaataataaagatggcatt
gttttaactgatccgagtatcaacccaagagcaggctgtcctgattcatctgttgaacct
aatcctgcttgtttgagccaagccagcgacccagctatcacatgggaagtttctcgtcct
gaaaatctacagtctcgtaccgtcgatggttgggaattcaacgtgcaatatatgtttggc
gaaaccggctttggttccgtggcaaactatactacggttgaaagtgacgaaacctatgat
cgctttgatttctcgcaaactgtggcgttaaccggcctaagtgactctgcaaacttagtt
ggcttttatgagaatgaccagttgcaaattcgttttgcttataactggcgcgatgaattc
ttaatgcgattccaaggttctgagccgcgttttgttgaagcctatggccagtgggatatg
aacgttagttacgatattaacgataacatttcggtgtttttcgatggtatcaacctaact
gatgaaacagtacgtcgatacgctcgctttgaagagcaagttattgacgctgagcagtat
ggcccgcgttacacctttggtgttagagctaaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system