Saccharobesus litoralis: C2869_17265
Help
Entry
C2869_17265 CDS
T05408
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cate
Saccharobesus litoralis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cate00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cate02000
]
C2869_17265
Transporters [BR:
cate02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
C2869_17265
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
OMP_b-brl_3
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB68063
UniProt:
A0A2S0VV54
LinkDB
All DBs
Position
4617977..4620688
Genome browser
AA seq
903 aa
AA seq
DB search
MKQLKLTPITLAVNAALLTGLAYTAPALAAEQTAEEEIEVIAVKGIRASAKANLNTKRFA
DSIVDAITAEDIGKFPDKNVAESLQRVAGVSITRDFGEGEKVSIRGTAPQLNNTLLNGQA
VATTKWWALEPSSRSFNFSLLPSELVSALEVYKSPEAKIDEGAIGGTVILRTRKPLDLDS
GTIYGSAGVRYNDKTESSDPQFSGLFSWKNEDETFGILASIIQQGREQRRDGLEAFGWFD
ATRADTAASVGKSIPGWDYDTNTGKTASWNWGMGSAYFDQERDRLGLNLTAQMRPSDNLD
LTLNIVDSELKQTNTNNNYISSHGWAAYMPCTPWDPASDFELCAGIEDYTLTDPSGVAAL
TKYTIGKNGHGDYQLNQMNESLARVSTLTTQVIDLEANYTGDNYTIHAQVGVTEANGGYD
REDLVNFGHASGSNIEIYDNGLINFSFPTELGGLPTDSYAGFDFRQYRWNSRPEVDKETY
AQADFKYELDGDVISSIEVGVKFRDKEHSQSGVTTETQDYSALIDNADTSKYDGAMSPDL
HSSVANAGTLTRYATIDIDKIRADADKVSGITPTIDYGNVYQLTEDITAAYVQANLDMGE
LKGNVGVRLVNTEVTSAAYELSDNTWFSESSSYSDVLPSLNLSYSLSDDLIIRGAASKTM
SRANYADLAATRTLSANLTGSGGNTELKPYDATNFDLSVEWYFSDEGLLSLALFNKQIDS
FIFNSAEQATLSYDCDQSGSIEPGETCIFTMTRPNNGAEAKNTGIEVSFQMPIGEYFGVV
ANYTYSDAEGKNAAGDTIDLAGNSKNTVNLTGYFENDNISARVAYNQRSSYLTGFTFGGA
NTADAYSQLDASVSYNLTDNWSVTLEGQNLTDSEVFHYQGQKYRPIGLYTFGRSYYVSTS
FNF
NT seq
2712 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaactcaaattaacgccaatcactcttgctgtaaatgcagcattacttaccgga
ctagcatatacagcgccagccttggccgctgaacaaactgcagaagaagaaatagaagtc
attgcagttaaagggatccgcgctagtgccaaagccaacttaaatactaagcgctttgcc
gactcaattgttgatgcgatcaccgcagaagatattggtaaatttccagacaaaaacgtc
gccgaatcattgcaacgtgtagctggtgtatccattactcgtgatttcggtgaaggtgaa
aaagtctctattcgtggtacagcgccacaattaaacaacaccttgttaaacggccaagcc
gtagccacaaccaaatggtgggcactagagccttcttcacgcagctttaacttctcttta
ttaccgtctgaactggtttcagcgttagaagtttacaaatcacccgaagcaaaaatcgac
gaaggtgctattggtggtactgttattttaagaacccgcaaaccgttagatttagattct
ggtacaatttatggctcggccggtgtgcgttacaacgacaaaacagaaagttcagatccg
caattttctgggctttttagctggaaaaacgaagacgaaacctttggtatattagcgtct
attattcaacaaggccgcgaacaacgtcgtgacggtttagaagcctttggttggtttgac
gctacccgcgccgataccgcagcatctgttggtaaatcaattccaggatgggactacgac
accaatacaggtaaaacagcctcatggaactggggcatgggttcagcctactttgaccaa
gagcgtgatcgtttaggcttaaacttaaccgcgcaaatgcgtccatcagacaacttggat
ctcaccttaaatattgttgattctgagctaaaacaaaccaataccaataataactatatt
tcgtcgcacggttgggctgcctatatgccatgtacgccgtgggatccagcctcagacttt
gaattatgtgccggtattgaagactataccctaaccgatccaagtggtgttgccgcatta
accaaatacaccataggcaaaaatggtcatggcgattatcaacttaaccaaatgaatgaa
tccctagctcgtgtttcaaccctaacaacacaagttattgatttagaagcgaattacacc
ggcgataactacaccattcacgcccaagttggggtaacagaagccaacggtggttatgat
cgcgaagatttggttaactttggtcatgcgtcaggttcaaacatcgaaatctacgacaac
ggtttaattaacttctcattcccaactgagttaggtggattgccgaccgactcatacgca
ggttttgacttccgtcagtatcgttggaattctcgccctgaagtagacaaagaaacctat
gctcaagccgattttaaatacgagcttgatggagatgttatctcgtcaattgaagttggg
gttaaattccgtgacaaagaacattcgcaatcgggtgtcacaacagaaactcaagattac
tcagcgttaatcgacaatgcagataccagtaaatatgatggtgcaatgtcacctgactta
catagtagtgtagctaatgcgggtactttaactcgatacgccactattgatatcgacaaa
attcgcgcagatgccgataaagtcagcggcattacacctactattgattacggcaatgta
tatcaattaaccgaagatattacagccgcttatgtgcaagcgaacctagatatgggtgag
ctaaaaggtaatgtcggtgtgcgtttagtgaataccgaggttacgtccgcggcatacgaa
ttaagcgacaatacttggtttagtgaaagctctagctatagtgatgtgctaccgtcatta
aacttatcttacagcttaagtgacgatttaattattcgtggtgcggcgtctaaaaccatg
tcgcgcgccaactacgctgatttagccgccactcgaacacttagcgctaacttaacaggc
agcggcggtaataccgaattaaaaccttacgatgccactaatttcgacttatctgttgaa
tggtatttttcagacgaaggcttgttgtctttagccttgtttaataagcaaattgattca
tttattttcaattcagctgaacaagcaacgcttagctacgactgtgaccaaagcggcagt
attgaaccaggtgaaacctgtattttcactatgactcgtcctaataacggtgcagaagcg
aaaaacacaggtattgaagtcagcttccaaatgccaattggcgaatactttggtgtggta
gctaactacacgtattcagacgccgaaggcaaaaatgcagcaggcgacacgatcgattta
gcgggtaattctaaaaatactgtcaacctaacgggttattttgagaatgataatatttct
gctcgcgttgcttataaccaacgtagtagttatctaactggctttacctttggtggcgcg
aatacggccgatgcttactcacaactagatgcatcagtttcgtataaccttactgataac
tggtcggtaacgttagaaggtcaaaacttaacagactctgaagtcttccattatcaaggt
caaaagtaccgcccaattggtttgtatacctttggtcgcagttactatgttagcaccagt
tttaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system