Catenovulum adriaticum: OLW01_02865
Help
Entry
OLW01_02865 CDS
T08659
Symbol
rapA
Name
(GenBank) RNA polymerase-associated protein RapA
KO
K03580
ATP-dependent helicase HepA [EC:5.6.2.-]
Organism
catt
Catenovulum adriaticum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
catt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
catt03021
]
OLW01_02865 (rapA)
Transcription machinery [BR:
catt03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
Other transcription-related factors
RNA polymerase-associated proteins
OLW01_02865 (rapA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RapA_C
Tudor_RapA
Tudor_1_RapA
Helicase_C
SNF2-rel_dom
ResIII
DEAD
UvrD-helicase
AAA_34
Flavi_DEAD
NAT10_TcmA_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAJ70774
UniProt:
A0ABY7AR12
LinkDB
All DBs
Position
642823..645747
Genome browser
AA seq
974 aa
AA seq
DB search
MSEFALGQRWISDSESDLGLGTIVAMNGRRISMLFPATGEQREYVMDSAPLTRVSFNPGD
KVESAEGWSLTVAQVVTEDGVNIYLGQRDDNSEVAQLIETRLNHHLKFNKPQDRLFTGQI
DRNDWYSLRYDSLRLQHKYQTHPLVGLAGARTSLIPHQLHIAKEAGQRIAPRVLLSDEVG
LGKTIEAGMIIHQQILTGRSSRVLILLPESLQYQWLVEMLRRFNLKFAIFDEERCAEYQA
DDENPFETEQLIIAPMALLSESESRLSQALTAHWDLVVVDEAHHLKWSQDEVSDQYAAVE
KLASVSAGLLLLTATPDQLGHESHFARLRLLDPDRFHSYQAFVDEESGYQAIADLAKTLV
SEEDLTAQEIEQLGQIQSINIDDNAAQLNNKEPEIRQIARQKCLKGLIDQHGTGRVLFRN
TRASVKGFPKRCVLPVKLDLPQEYKAACDWWLNRNADAISQNQVDEKLVAPLLTPEFLYE
SAINDEIEWWRVDPRVDWLSEQVKENKTDKFLIICARASTALTLEQAIRVKHGINASVFH
EGMSIVERDRAAAWFADQDEGCQLLICSEIGSEGRNFQFARHLVLFDLPLNPDLLEQRIG
RLDRIGQKNDIQIHLPYFEGSASETIFKWQHYGINAYAQTCPAGIHVYEQQKEFLLSILG
QNNHNDDDLAPLIEKAKVQVETLNQQMEQGRDILLEINSKGFDGEAIAEQIEKIDDDTEL
VAFMLQVFDVYGVSQDDKGDRCLAVNPTDHMLEPHFPELGDGGMTVSFERDAALAREDVR
FISWDHPMVQGCFEMINAGEIGNNTVSLLNNKALPEGTYLVELIYVVETSAPKQLQPGRF
LPPTPVRILLDKAGNNLAANVSFDNLNKQLKPVGRQVGSQLATALQVQVHELIVKAQSIA
ESACGELIEQAVESIKQNLGDEYQRLESLQKVNPNIRAIELESLAQQQSELVEHIQQARV
KFDALRLVVVSHQA
NT seq
2925 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgaatttgcattagggcaacgttggattagtgattcagaatctgatttaggctta
ggaactatagttgccatgaatggccgtcgaatttctatgttatttcctgcaactggagaa
caaagagaatacgtgatggacagtgcgcctttaacgcgagtgagctttaatccgggagat
aaagttgaaagcgccgaaggctggagcctgacggttgcacaagttgttactgaagatggg
gttaatatttatcttggtcaaagggacgataacagcgaagtggctcaattaattgaaacc
cgcttaaaccatcaccttaaatttaacaaaccacaagaccgattatttaccggacaaatt
gatcgtaatgactggtatagccttagatatgattcgctacgattacaacacaaataccaa
acgcatcctttagtaggacttgctggtgcaaggacatcgctaattccacatcaacttcat
attgctaaagaagcaggccagcgtatagcgccgcgtgttttgttatctgacgaagttgga
ctgggtaaaacgattgaggctgggatgattatccatcagcaaattttaaccggtcgttct
tcacgtgttcttattttattacctgagtcattacaatatcagtggttggttgagatgttg
cgcagattcaatcttaaatttgcgatatttgatgaagagcgttgcgcagaataccaagcc
gacgatgaaaacccatttgaaacagagcaattaattatcgcgcctatggcgttgttaagt
gaatctgaaagccgtttatcacaagctttaacagcccactgggatttagtggtggtagat
gaagcgcatcatttaaaatggagtcaagacgaggtaagcgatcaatatgcagcagttgaa
aaactagccagcgtatccgccgggttgttgttgctaaccgcaacacctgatcaactaggt
catgaaagtcattttgctcggcttaggttgttagacccagatcgctttcatagctatcaa
gcatttgttgatgaagaatctggttatcaagcgatagctgatttagctaaaaccttggtg
tcagaagaagatttaactgcacaagaaattgagcagctcgggcaaatacaatcaattaat
attgatgacaacgcagcacaattaaataataaagagcccgaaattcgccaaatcgctcgt
caaaaatgcttaaaaggcctaattgaccaacatggcacgggtcgagtgttgtttagaaat
acacgagcttcagttaaaggttttccaaagcgttgtgttttacctgttaaattagatctt
ccgcaagaatacaaagcagcttgtgattggtggttaaatcgcaatgcagacgcgatttca
caaaatcaagttgacgaaaagttagtagcgcctttattaacgcctgaatttttatatgaa
agcgctattaacgacgaaattgaatggtggcgggtggatcccagagttgactggttaagt
gaacaggtaaaagagaataaaacagataaatttttaattatttgtgcgagagcctctacc
gccttaacattagaacaagcaattcgtgtaaaacatggtattaatgcgtctgtatttcat
gaaggcatgagcatagttgaacgagaccgagctgcggcttggtttgctgatcaagatgaa
ggttgccagttactcatttgttcagaaattggctctgaaggtcgaaactttcaatttgca
cgtcacttagttttgtttgatttaccacttaaccctgatttacttgagcagcgaataggt
cgattagaccgaattggccaaaaaaatgatattcaaatacatttgccttattttgaagga
agcgctagtgaaactatttttaaatggcaacactatggcattaatgcttatgcgcaaacc
tgtccagcaggcattcatgtatatgaacagcaaaaagaatttttgttgtctatactgggc
caaaataatcataacgatgatgacctagcgcctttaattgaaaaagctaaagttcaagtt
gaaactttaaatcagcaaatggagcagggccgagatatattacttgagattaactcaaaa
ggttttgatggtgaggccattgccgagcaaattgaaaaaatcgatgacgataccgaactg
gtcgcttttatgttgcaggtatttgatgtttacggtgtttcgcaagacgataaaggcgat
cgatgcttagcagttaacccaacagatcatatgctcgaacctcattttcctgaattaggc
gatggtggtatgacagtaagttttgaacgcgatgcggcgcttgcacgtgaagatgtgcgt
tttattagctgggatcatccaatggttcaaggctgttttgaaatgattaacgcaggtgaa
ataggtaataacactgttagtttactaaacaataaagcattgcctgaaggcacttattta
gttgagcttatttacgtggttgaaaccagcgccccaaaacaattacagccgggtcgtttt
ttaccgccaacaccagtgcgcattttgctagataaagcgggtaacaacttagccgctaat
gtcagttttgataacttaaacaagcagctaaaacctgtgggtcggcaagtgggatctcaa
ttggcaacggcactgcaagtgcaggtgcacgagttaatcgttaaagcacagagtatagct
gaatcggcttgtggtgaattaattgaacaagcggtagagtctatcaaacaaaacttaggt
gatgaatatcaaaggcttgaatcattacagaaagttaatccgaatattcgggccattgag
ttagagtcacttgctcaacagcaaagtgagctggttgaacatattcaacaagctagggtt
aaatttgatgcgttaaggctagttgtagtgagtcatcaagcataa
DBGET
integrated database retrieval system
