Corylus avellana (European hazelnut): 132164730
Help
Entry
132164730 CDS
T09426
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
cave
Corylus avellana (European hazelnut)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132164730
NCBI-ProteinID:
XP_059431269
LinkDB
All DBs
Position
ca10:18853086..18862480
Genome browser
AA seq
1062 aa
AA seq
DB search
MLSEIGRRPMVGGNEGSFDDDLEKEIGLLLREQRGRQDVDDLERELNLYRSGSAPPTVEG
SLSAVGGLFGGGSGGGEGGSAFSEFTASKNGNGFASEEELRSDPAYLSYYYSNVNLNPRL
PPPLLSKEDWRYAQRMKGGSSVLGGIGDRRKVNRTDDGGGRSLFSMPPGFNTRKQEGELE
SDKGRGSAEWGGDGLIGLPGLGLGSKQKSLAEIFQDDLGRPSPVTGLPSRPASRNAFDEN
VETLGSAEAELAHLRRELKTSDALRSGTNVQGSSVVQNMGPPSSYTYAAVLGASLSRSNT
PDPQLVARAPSPCPTPIGGGRAGASEKRGITSPNSFNGVSSSITESADLVAALSGMNLST
NGVLDDENRLPSQIEQDVDNQQNYMFGLHGSQNHIKQHPYLKKSESAHLHMPSAKVSYSD
SGKSNGPGSDLNSSSSDRHVELQKSALSSNNSFLKGSTNGGGGLTAQYQNVDGTNSSFTN
YGLNSYNINPALASMMANQLGNQLGTGNLPHLFENVAAASAMGAPGMDSRVLAGGLPSGA
AASEAHNLGRMGNQMAGSAVQAPFVDPMYLQYLRSSEYAAQYAALNDPSMDRNYLGNSYM
NLLELQKAYLGALLSPQKSQYGVPLGSKSGGSNHHGYYGNPAFGVGMSYPGSPMAGSVIP
NSPVGPGSPIRHNELNMRFPSGMRNLAGGIMGPWHLDAAGMNMDESFASSLLEEFKSNKT
KCFELSEIGGHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTDEKNMVYQEIMPQALALMTDVFGNYV
VQKFFEHGLPTQRRELANKLFGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIRMVEELDGNV
MRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEDAIHFIVSTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCNDPK
TQSKVMDEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKFASN
VVEKCLTFGGPTERQLLVIEMLGSTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELIL
SRIKVHLSALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIAAQSPHPA
NT seq
3189 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgagtgaaataggaaggagaccgatggttggaggtaacgagggatcgtttgatgat
gacttggagaaggagatagggttgttgctccgcgaacagcgtggtcgtcaagacgtcgat
gatcttgagcgcgagcttaatttgtatagaagtggctcagctcctccaactgtggagggt
tcattgagtgcagttggcgggttgtttggtggtggcagcgggggaggcgaaggtggtagt
gccttttcggagtttactgcaagtaagaatgggaatggttttgcgtctgaggaggagctg
aggtctgatccagcttatctttcgtactattactcgaatgtgaatctgaaccctcggctt
ccgcctcctttgctttcgaaggaggattggaggtatgcacaaaggatgaaaggggggagt
tcagtgttgggtgggattggagataggcggaaagtgaataggaccgatgatggtggcggt
aggtcgttgttttccatgccgccaggttttaacacgaggaaacaagagggtgagcttgag
tccgacaagggacgtggctctgcagaatggggtggtgatggactgattggtttgccaggt
ttgggactcggaagcaaacaaaagagcctcgctgaaatctttcaggatgacttggggcgt
ccatctcctgttactggacttccatctcgtccagccagtcgtaatgcttttgatgaaaat
gttgaaacgctaggatccgctgaagcagagctagctcatttgcgccgtgaattgaaaact
tctgatgctttacgatctggtacaaatgttcagggctcatctgttgtccaaaatatgggg
cctccttcttcatatacttatgctgctgttctaggagcttccttgtcaagaagcaacact
ccagatccacaacttgttgctagggctcctagcccttgccctactcctattggaggaggc
agagctggcgcatctgaaaaaagaggcattactagtccgaactcattcaatggtgtctca
tctagcatcactgagtctgcagatctggtagctgctttatctggcatgaacttgtcaaca
aatggtgtgctggatgatgaaaaccgtttgccatcccagattgaacaggatgtagacaat
caacaaaattatatgtttggtttacatggtagtcagaatcatatcaagcaacatccatac
ctaaagaagtcggaatctgcgcatttacatatgccttctgcaaaagtatcttactctgat
tcgggtaagagtaatgggcctgggtcagacctgaacagctcgtcctctgataggcatgtg
gaactgcagaaatctgctctttcttcaaataattcattcttaaaaggatctactaatggt
ggaggtggcttaactgctcagtatcagaatgtagatggtacaaattcatcatttactaac
tatggtttgaatagttacaacataaatccagctttggcttccatgatggctaaccaactt
ggaaaccaacttggaactggtaatctgccacacttgtttgaaaatgttgctgcagcatct
gctatgggagcccctgggatggactcgagagttcttgcaggaggcttgccttctggagct
gctgcatctgaagcacataatcttggtagaatgggtaaccaaatggcagggagtgctgtt
caggcaccatttgttgatccaatgtatcttcagtacttgaggtcatctgagtatgcggca
cagtatgctgctctcaatgatccctctatggataggaactacttaggtaactcatacatg
aatttacttgagctccagaaggcttatctgggggctcttctttcccctcagaagtctcag
tacggtgttccgttaggcagtaaatctggtgggtctaatcatcatggttattacggaaat
cctgcatttggtgtcggcatgtcttatcctggaagtccaatggcaggttctgttattcct
aactctccagttggacctggtagtcctataaggcataatgagctgaacatgcgttttcct
tctggcatgaggaacttagcagggggtatcatgggaccctggcaccttgatgccgctgga
atgaacatggatgaaagctttgcgtcctcacttctggaagagtttaagagcaataaaact
aagtgtttcgaactttctgaaattggtggtcacgttgttgaattcagtgcggatcagtat
gggagccgatttattcaacagaaacttgaaacagctacaacagatgagaaaaacatggtt
tatcaggaaatcatgccccaagctcttgctttaatgactgatgtttttggtaattatgtt
gttcagaagttttttgagcatggacttccaacccagagaagggaattggccaacaagctt
tttggtcatgtactgacacttagccttcaaatgtatggttgtcgagtgatccagaaggca
atagaagttgttgatctggaccagaagatcagaatggttgaagagcttgatggaaatgtc
atgcgctgtgttcgtgatcagaatgggaaccacgtcattcagaaatgtattgaatgtgtt
ccggaagatgcaattcactttattgtctcaacattctttgatcaagttgtcaccctttcc
acccatccatatggttgtcgggtgatacagagagtactagagcactgcaatgacccaaag
acgcaaagtaaagttatggatgagattttaggagctgttagcatgctggcacaggatcag
tatggcaactatgttgttcagcacgtgctggagcatggaaaacctcatgaacgttctgct
attatcaaagaattagctggaaagatagttcaaatgagtcaacagaaatttgcctccaat
gttgtggagaagtgtttaacttttggtggtcctactgaacgtcagttactagttattgag
atgcttggttctactgatgaaaatgagccgcttcaggcaatgatgaaagatcagtttgca
aactatgttgtacaaaaagtgctggagacatgtgatgatcagcagcgtgagctgatactg
tcacgaataaaagttcatttgagtgcattgaaaaagtacacttacggaaagcatattgtt
gcgcgtgtagagaaacttgttgctgctggggaaaggagaattgctgctcagtctccacac
cctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system
