Corylus avellana (European hazelnut): 132175775
Help
Entry
132175775 CDS
T09426
Name
(RefSeq) putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g68930
Organism
cave
Corylus avellana (European hazelnut)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
DYW_deaminase
E_motif
PPR_3
PPR_long
TPR_17
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132175775
NCBI-ProteinID:
XP_059443813
LinkDB
All DBs
Position
ca1:20227102..20238755
Genome browser
AA seq
743 aa
AA seq
DB search
MAASSNYYCALLKLCCEARKGTHAKKLHCNIIKTLIDPETFLSNNLMNTYSKLGNIEYAR
RVFDQMPHPNPFSWNTLLSAYSKWGHLTEMQLIFDRMPNQDGVSWNSLISGYACYGSLFQ
SVKVYKLMLKDGAVNLNRITFSTMLILSSNQGCVNLGRQIHGQIVKFGFQSYVFVVSPLV
VMYSKMGLIYDAKQVFDEMPERNVVTYNTMITGLLRSGMIEDSKRLFWGMKERDSVSWTT
MITGLTQNGLGREAIDMFREMRLEGLDMDQFTFGSVLTACGGLLALEEGKQIHAYIIRTD
HKNNVFVGSALVDMYCKCKSIKSAETVFVRMTSKNVVSWTAMLVGYGQNGYSEEAVRIFC
NMQKYGIEPDEFTLGSVISSCANLASLEEGAQFHAHAVVSGLISFITVSNALVTLYGKCG
SIGDSCRIFNDMEIKDEVSWTALVSGHAQFGEANETIDLFERMLAQGLKPDGVTFIGVLS
ACSRAGFVEKGHHYFESMIKEHGITPIADHYTCMIDLISRAGRLEEAKTFIDKMPDHPDA
IGWATLLSSCRFHGNMEIGKWAAERLVELEPQNPASYVLLSSMYAAKGKWDNVAQLRRGM
RAKGVRKEPGCSWIKYKNRVHIFSADDQSSPFSDEIYSELERLNCKMIEEGYVPDMRSVL
HDVEESEKIKMLSHHSEKLAIAFGLIFVPPGLPIRVFKNLRVCGDCHNATKYISKITQRE
ILVRDAARFHLFKDGTCSCGDFW
NT seq
2232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggcgtcctctaactactactgtgccttactcaaactctgctgcgaagcccggaag
ggaacccatgctaagaagctccactgcaacataatcaaaaccttgatagacccagaaacc
tttctatcaaacaacctcatgaacacctacagtaaactaggcaacatagaatatgcgcgc
cgcgtgttcgatcagatgccccacccaaaccccttctcctggaacaccctcctttccgct
tattcgaaatggggtcatctcacggaaatgcaattaatctttgatcgaatgccaaatcaa
gatggggtttcgtggaattcgcttatttctgggtacgcgtgttatggttctctttttcag
tcggtgaaggtttataagctgatgttgaaggatggagcagttaatttgaatcggattacg
ttttcgactatgcttatactgtcatcgaatcaggggtgtgttaatttaggcagacagatt
catgggcaaatagtgaaatttggtttccagtcgtatgtctttgtggttagtcctttagtg
gtcatgtactcgaaaatggggttaatttatgatgcaaagcaggttttcgatgagatgcct
gaaaggaatgtggttacgtataatactatgatcacgggccttttgcgaagtgggatgatt
gaagattcaaagcggttattttggggtatgaaggaaagagattcggtttcatggacaacc
atgataacaggacttactcagaatgggttgggcagagaagcgatagatatgtttagagaa
atgaggttggaaggtttagatatggatcaatttacttttggtagtgtgttgactgcttgt
gggggtctgcttgccctggaagaaggcaagcagattcatgcttatataattaggactgat
cataagaataatgtgtttgttggtagtgctcttgttgacatgtattgcaaatgtaaaagc
ataaaatctgccgaaacagtttttgtgagaatgaccagtaagaatgttgtatcatggact
gcaatgctagtgggttatggtcaaaacgggtacagtgaagaagctgttaggattttttgc
aatatgcagaaatatgggattgagccagatgagtttacactggggagtgtaattagctca
tgtgcaaacttagcaagcttagaagagggtgcccaatttcatgctcatgctgttgtttct
ggcttgatctcttttattacagtttccaatgcgcttgttacgctgtatggtaaatgtgga
agcattggagattcctgtcggatattcaatgatatggaaattaaggatgaagtctcgtgg
actgcattggtttcagggcatgcccaatttggagaagccaatgagacgattgatctgttt
gaaagaatgttggctcaaggtttgaagcctgatggagttactttcattggggtcctttca
gcttgcagtagagcaggatttgtggagaaaggacatcactattttgaatcaatgataaaa
gaacatggaataacaccgattgcagatcattacacttgcatgattgaccttattagccga
gctggaagattggaagaagcaaaaacttttatagataagatgcctgaccatcctgatgca
attggttgggccaccttgcttagctcctgtagattccatggtaacatggaaatagggaaa
tgggcagctgagagacttgtggaattagagccccagaacccagcgagctatgtcttgctc
tcaagcatgtatgctgcaaaagggaaatgggacaatgtggcccaattaagaagaggaatg
agagctaagggagtgaggaaggagccgggatgtagttggatcaaatataagaacagggtg
cacatattttcagcagatgaccaatcaagtccattttcagatgagatatattctgagctt
gagagattaaattgcaaaatgatagaggaggggtatgttccagatatgaggtctgttctt
catgatgttgaggagtcagagaagataaagatgcttagccaccatagtgagaagcttgct
attgcctttgggttgatttttgtccctcctggccttcccatacgagtgtttaaaaacctt
agggtctgcggggattgccacaatgccacaaaatatattagtaagataacccagagagag
attcttgttagagatgctgcccgattccatttatttaaagatggaacatgttcgtgtgga
gatttctggtga
DBGET
integrated database retrieval system
