Corylus avellana (European hazelnut): 132177353
Help
Entry
132177353 CDS
T09426
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cave
Corylus avellana (European hazelnut)
Pathway
cave03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cave00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
132177353
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cave03019
]
132177353
Messenger RNA biogenesis [BR:
cave03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
132177353
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132177353
NCBI-ProteinID:
XP_059445606
LinkDB
All DBs
Position
ca4:complement(26563217..26568539)
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEYFDNYGDVLQTVVMREKTTGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDTHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSAKAGNLNPSRNYGGGGTFRTKKIFVGGLPPT
LSEEGFRQYFESYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDTEEAVDKVLHKNFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGNRSMGGGAGVGGAVGSGYQSYGASGGNPNTYDGRMDSNRYMQPQS
TGGGFTPYGSSGYSAPGYGYGPASNGINYGGYGSYGAANTGYGGPAGAAYGNPNVPNAGY
GSVPPGAPRSSWSTQAPSGYGAMGYGNTAAWGAPSGSTGTASGGPGSAPAGQSPSGATGY
GNQGYGYGGYGGTDGSYGNPGGYGAVGGRSGSVPNNNAGGPGGAELQGSGGGYIGSGYGD
ANGNPGYGNAAWRSDQSQTSGNYGAQVNGPHGAQVGYGGYGSAQARPQQQ
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagctattcataggtgggatttcgtgggagaccacggaggag
aagctgaaggagtacttcgataactacggggacgttttgcagacagtggtgatgagggaa
aagaccaccgggaggcccagaggattcggattcgtggtttttgcagatccttccattctc
gatagggttctccaggacacccacaccattgatggcagaacggttgaggctaagagggcc
ttatcaagagaggagcaacaaacttctgccaaagctggaaatcttaatccttccaggaac
tatgggggtggtggaactttcagaaccaagaagatattcgttggaggattgcctcccact
ttaagtgaagaaggattccgtcagtattttgagtcttatggccatgtaaccgatgtagta
gtcatgtatgaccagaatactggacgacctcgtgggtttgggtttattacctttgacact
gaagaagctgttgataaggttttacacaaaaactttcatgatttgaatggtaagcaagtg
gaagtaaagcgggctcttcctaaagatgcaaatcctggtgggggtaaccgttctatgggt
ggtggggcgggggttggtggtgcagttggtagtggttatcagagctatggggcatctggt
ggcaacccaaatacatatgatggtcgaatggattccaataggtacatgcagccacagagt
actggaggtggttttactccctatggttcctctgggtatagcgcacctggttatgggtat
ggtcctgccagtaatggcatcaattatggcggttatggtagttatggtgctgccaatact
gggtatggtggacctgctggtgcagcatacggaaacccaaatgtccctaatgctggttat
ggtagtgttccacccggtgctcccagaagttcatggagcactcaagctccctctggatat
ggtgccatgggttatggaaatactgctgcttggggtgctccaagtggcagcactggtact
gctagtggtggcccagggtcagcacctgcagggcagtctcccagtggagccactgggtat
gggaatcaaggttatggctatggtgggtatggtggaactgatgggtcttatgggaatcct
ggtgggtatggtgcagttggagggcgttctgggagtgtcccaaataataatgctggtggt
ccaggtggggcggaactacaaggtagtggtggtggctacataggaagtggctatggtgat
gcaaatggaaatccagggtatggaaatgcagcatggagatctgaccaatctcaaacttct
ggaaattatggtgctcaggtgaatggtcctcatggcgcgcaggttggctatggtggttat
gggagtgctcaggcccgacctcaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
