Corylus avellana (European hazelnut): 132183017
Help
Entry
132183017 CDS
T09426
Name
(RefSeq) putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01510 isoform X1
Organism
cave
Corylus avellana (European hazelnut)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
AEP1
Eplus_motif
HTH_13
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132183017
NCBI-ProteinID:
XP_059452387
LinkDB
All DBs
Position
ca5:complement(36225073..36228035)
Genome browser
AA seq
817 aa
AA seq
DB search
MKPYRTNALQALASLRVCPPPNPPVNVENFIDARIIKTGFNPETCRSNFLVKNILERGEL
SQAREVFDQMPHKNTFSTNMMISGYVKSGNLSYARELFDGMVERTAVTWTILIGGYSKCN
QFREAFKIFSEMCRWGTEPDYVTFATLLSGCSDSETANEVVQVHAQIIKWGHGSTLMVCN
SLVDAYCKIYRLDFACQLFQEMSERDSVTLNALITGFSRDGLNEDAIKLFMEMQHFGFKP
SDFTFAAVLCAVIGLDDIVLGQQVHAFVVKTNNVWNVFVGNALLDFYSKHGRVLEARKLF
DEMPELDCVSYNVIITSYAWDGQPKESLGLFRELQFTRFDRRQFPFATLLSIAANTSDLE
MGRQIHSQTIVLTADSEVQVGNSLVDMYAKCDRFEEAKKIFANLAHKSTVPWTAMISGYV
QKGLHEEGLKLFNEMHRNNVSADQATFASILSASANLASLSLGKQLHSFVVRSGFLSNVY
CGSAVVDMYAKSGSLKDALQSFQEMPDRNPVTWNALISAYAQNGDGEGTLKSFDQMIQSG
FQPDSVSFLSVLTACSHCGLVDEALQYFKSMTQVYKLAPRGLHYASIVDVLCRSGQFDEA
EKLMAEMPFEPDEIMWSSVLNSCRIHKNQELAKKAAAQLFNMADLKDAAPYVNMSNIYAA
AGQWDSVGMVKKAMRERGVKKAPAYSWVEIKHKIHVFSANDKSHPQMGEIMRKIDMLVKQ
MEKEGYKPDTSCVLHNVDEEIKIESLKSHSERLAIAFALISTPEGSPILVMKNLRACTDC
HAAIKLISKIVAREITVRDSSRFHHFRGGFCSCEDYW
NT seq
2454 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaccatatagaacaaacgcacttcaagcccttgcttctttaagagtgtgtccacct
ccaaatccgcctgtaaatgttgaaaattttatcgatgcccgtattattaagacgggtttc
aatccggaaacatgccgttctaatttcctggtcaagaatattctagaaagaggtgaattg
tcccaagcgcgtgaggtgtttgatcaaatgcctcataaaaatacattctcaacaaacatg
atgatttcaggttatgtgaaatcaggcaacctttcttatgctagagagttgtttgatgga
atggttgaacgtacagcagtgacatggacaatcttaattggtggatactcgaagtgtaat
caatttcgagaagcatttaagattttttctgagatgtgtaggtgggggacggagccggat
tatgtgacctttgctactctcctatccggatgtagcgactcggagaccgcaaatgaagta
gttcaagttcatgcccaaatcatcaaatggggacatggttcgactctcatggtttgcaat
tccttggttgatgcttactgcaaaatatatcgcttagattttgcttgtcaactctttcag
gaaatgtctgagagagattctgtcactttgaatgcattgataacagggttctcaagagat
gggttgaatgaagacgcaataaagctctttatggagatgcaacattttggcttcaagcct
tcagattttacttttgccgcggttctatgtgcggttattgggttagacgacatagtactt
gggcagcaagttcatgcttttgtggtgaagaccaacaatgtttggaatgtgtttgtgggg
aatgctttgcttgatttctactcgaagcatggtcgtgtgcttgaggcaaggaaactcttt
gacgagatgccagagttggattgtgtttcatacaatgtaatcatcaccagttatgcatgg
gatgggcaaccgaaagagtctcttggtcttttccgggaattacagtttactcgatttgat
cggaggcaattcccttttgcaaccttgttgagcatagcagccaatacttcggacttggaa
atgggtcgacaaattcattcccagactattgtgttaacagcagattcagaagttcaggtt
ggaaattctttagttgacatgtatgccaaatgtgatagatttgaggaagccaaaaagata
tttgcaaatttagcccacaaaagcacagttccatggactgccatgatctcaggttatgtt
cagaagggactacatgaagaaggcctaaaactgttcaatgagatgcatagaaacaatgta
agtgctgaccaggccacttttgcaagcatcttgagtgcttcagcaaatttagcttcactc
tcactagggaaacagttacactcatttgtagttagatcaggatttctatcaaatgtatat
tgtggaagtgcagtcgtagatatgtatgccaaaagcggttccttaaaagatgcacttcaa
agtttccaagaaatgcctgataggaacccagtcacttggaatgccctgatctcagcttac
gcacaaaatggagatggtgaaggcactcttaagtcatttgatcagatgatccagtcaggt
ttccaaccggattccgttagcttcctgagtgtcttaactgcttgcagccactgtgggctc
gttgatgaagcattacaatacttcaaatccatgactcaagtttacaaacttgctcccaga
ggattacactatgcgtcaatagttgatgtgttgtgtcggagtggacagtttgatgaagcg
gagaagttgatggcggaaatgccattcgagcctgatgagattatgtggtcatcagttctt
aattcttgtagaattcataaaaatcaagaattggctaagaaagcagcagcccaacttttc
aatatggcagacctcaaggatgctgctccttatgttaacatgtccaatatctatgcagca
gcaggtcagtgggatagtgttgggatggtgaagaaggcaatgagggagcgaggagttaaa
aaggcccctgcttatagctgggttgaaatcaaacataagattcatgtattctcagcgaat
gacaagtcccacccacagatgggggagatcatgagaaagattgatatgctggtgaagcag
atggagaaggaaggatacaagcctgacacaagctgtgtactccacaatgtggatgaggag
atcaaaatagagtctctcaaaagccacagtgaacgcttagcaattgcatttgctctgatc
agcacaccagaagggtcgcccatactggtgatgaagaatctacgagcttgtacagactgt
catgctgcaatcaagctgatttcaaagattgttgcaagggagattacagtcagggattca
agcaggttccatcattttagaggggggttttgctcctgtgaggactattggtga
DBGET
integrated database retrieval system
