Clostridium botulinum B1 Okra: CLD_0368
Help
Entry
CLD_0368 CDS
T00671
Name
(GenBank) putative cell wall-binding protease
Organism
cbb
Clostridium botulinum B1 Okra
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
aBig_2
CW_binding_2
Transglut_core
DUF553
Big_9
Cadherin_5
BAAT_C
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA45857
UniProt:
B1IDE0
LinkDB
All DBs
Position
478499..481906
Genome browser
AA seq
1135 aa
AA seq
DB search
MKKFKRALASSTILALVLQTNIIGGNVQAYDGQVKRFEGNNRYETAAKLAAFNWTKSDNI
VLVSGEGYADALSASVLAKRLNAPIILTNSNNLNDNARKTIEKLKAKNIYVIGGEASVSS
KIRSELKNNYKLIELKGKDRFETNLNVAEQLVKLGVDASEVMVVNGRDGFSDALSAAPIA
AANGQILLIVSKDDGNTATEFIQKHNSKSIVIGTKNVVSDKIYNNIGASRRVDGGANRFE
TNLKILKEFNVKVDTHLYIANSTGKGYADALVASVLAGKFSAPLILTDTKDSKDTEKALK
YIKDNIKGMTEVNAVGGKVVIPQSITEDINKYIKKKPELKPDKPEPKPDKPEPKPDKPEP
KPNKPEPKPDKPEPRPDKPEPKPDKPEPKPENKAPIATRTLNKSTYNITKSKSEITVNLK
DLNNDGDQSDIAFKDPDGDKLTYTATIDGENKDKAEVTVKDSNITIKTKQEFKGQVKITV
IASDGKKSVSDFFKVNVDNIDNKEKIKTINANLVEKEKAKLNLGDLNNIIGDLNLPVKGE
NGVEIAWKSTNVNIINNAGKVTRPKATEGDAVITLTAILSKGEAKDTKDFVVTVKAKEFT
DEELVDISLKDLKLEGNLNSVIDNIKLPIRDEKNKVSIEWKSSNNNILSNTGVVKRTNKD
ENITLTAVLKRGTIKKNKEFNIIVKANEAKTEDNLKLISDSLKIDNINSIEKDINLETSL
DGANIIWKSSNEAIIDNTGKVKRPIVGRPDANVVLTATISKDEKSVTKEFNVIVKAEKQL
VANNKQEFDEIIKKAVIDCEPTINISLPSFNSNNNEYNFDNYQNLMVEIGGMDFGKPGIS
GSYKNDGTGWKIEINFKYKKDISEIKRQKEATMAEVKRIVKSIIKPDMTDFEKELALHDY
IVRTADYNTVNYKNGINALEDHTAYGVLVDHIGVCESYAKAMSLLLEEVGIECKYVTGVS
VHDGKAGGGHAWNMVKLDNEWYNLDATWDDPVSDRNGAESVNKNTNSMATVNHTYFNIPD
SIFNKDHKRGNFEQNYPACTATKYSYNNMDVDEYTADGKLIKKVTTKDELDAEILKALKE
KNSALSLRIKGFKMTQKELSAELEKVANNNSVGALKWITSSPDEYHVNYTIQWTN
NT seq
3408 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttaaaagagctttagctagttcaaccattctagctttagttttgcaaact
aatattattggtggtaatgtacaagcttatgatggacaagtaaagagatttgagggaaat
aatagatatgaaacggctgctaagttagctgcttttaattggacaaagtctgataatatt
gtacttgtatctggtgaaggatatgcagatgctttaagtgcttctgtgcttgctaaaaga
ttaaatgcaccaataattttaactaattcaaataatttaaatgataatgcaagaaaaact
atagaaaaattgaaggctaaaaatatttacgttataggtggagaggcatctgtatcttct
aaaataagaagcgaactcaaaaataattataaattaatagaattaaaaggtaaggatagg
tttgaaactaatttaaatgtggcagaacagttggttaaattaggagtagatgctagcgaa
gtaatggtggtaaatggtagagatggtttttctgatgctttatcagcagctcctattgca
gcagctaatggacaaatacttttaatagtatctaaggatgatggaaatacagctacagaa
tttatacaaaagcataattcaaaatctatagtaataggaactaaaaatgttgtatctgat
aaaatttataataatattggagctagtagaagagttgatggcggtgctaatagatttgaa
acaaatttaaaaatattaaaagaatttaatgttaaagttgatactcatttatatatagct
aattccacaggcaaaggttatgcagatgctttagtagcttctgtattagcaggaaaattt
agtgcaccattaatcttaactgatacaaaagattcaaaggatacagaaaaggctttaaaa
tatataaaagataatattaaaggaatgacagaagtaaatgctgttggtggaaaagttgtt
atacctcaaagtataacagaggatataaataaatatataaagaaaaaaccagaactaaag
ccagataagccggaaccaaaaccagataaaccagagccaaagccagataaaccagagcca
aaacctaataagccagaaccaaaaccagataagccggaaccaagaccagataaaccagag
ccaaaaccagataaaccagaaccaaaaccagaaaataaagctcctatagcaacgagaact
ttaaataaaagtacatataatataactaaaagtaaatcggaaattacagttaatcttaag
gatctaaataatgatggagatcaatctgatatagcttttaaagatcctgatggagataaa
ttaacttatactgctacaatagatggagaaaacaaagataaagcagaggtaaccgttaaa
gatagtaatataactataaaaacaaaacaagaatttaaaggccaggttaaaataactgtt
attgctagtgatggtaaaaaatccgtatctgatttctttaaagttaatgtggataatata
gataataaagaaaaaattaaaacaattaatgctaatttagttgaaaaagaaaaggctaaa
ttaaatttaggagatttaaataatataataggagatttaaacttacctgtcaaaggagaa
aatggggtagaaatagcttggaaatctactaatgtaaatataataaacaacgcaggcaag
gttacaagaccaaaggcaacagaaggggatgctgtaataactttaacagctattttatca
aagggggaagctaaggatacaaaggattttgttgtaactgttaaagctaaagaattcaca
gatgaagaacttgtggatatttcattaaaagatttaaaattagaaggtaatcttaattct
gtaattgataatataaaattacctataagagatgaaaaaaataaggtaagtatagaatgg
aaatcaagtaataataatattctttcaaatacaggtgtagttaaaagaacaaataaagat
gaaaatataactttaacagctgtattaaaaagaggaactataaaaaagaataaggaattt
aatattatagttaaggctaacgaagctaaaacagaggataatttaaaattaataagtgat
tctttaaaaatagataacataaatagtatagaaaaggatattaacttagaaacttcttta
gatggagctaatataatatggaagtctagcaatgaagctataatagataatacaggaaaa
gtcaaaagaccaatagtaggtaggccagatgccaatgtagttttaacagctactataagt
aaagatgaaaagagcgtaactaaagaatttaatgtaattgttaaagcagaaaaacaatta
gtagctaataataagcaagagtttgatgaaataataaaaaaggcagtaatagattgtgaa
ccaactataaatattagtttgccaagctttaattccaataacaatgaatataattttgat
aattatcaaaatttaatggttgaaataggtggaatggattttggtaagccaggcatatca
ggaagttacaaaaatgatggaacaggatggaaaatagaaataaattttaaatataaaaaa
gatataagtgaaatcaaaagacaaaaagaagcaacaatggcagaagtaaaaaggattgta
aaatctataataaaacctgatatgactgactttgaaaaagagcttgcacttcatgattat
atagttagaaccgcagattataatacagtaaactataaaaatggtataaatgctttagaa
gatcatactgcttatggtgtattagtagatcatattggagtgtgcgaaagttatgcaaag
gcaatgagtttactactagaagaagtaggaattgaatgcaaatatgttacaggagtttct
gtgcatgatggcaaagctggtggtggacatgcatggaatatggttaaattagataatgaa
tggtacaacttagatgctacatgggatgatccagtttctgatagaaatggtgctgaaagt
gtaaataaaaatactaattctatggcaacagttaatcacacttattttaatattcctgat
agtatttttaataaagatcacaaaagaggaaattttgaacaaaattatccagcatgcaca
gctacaaaatattcatataataatatggatgtagatgagtatacagcagatggaaaatta
attaaaaaagttacaactaaggatgaattggatgcagaaattttaaaagctttaaaagag
aagaactcagcattaagtttaagaattaaaggatttaaaatgacgcaaaaagaattgagt
gctgaattagagaaagttgcaaataataatagtgtaggtgcattgaagtggataacaagc
tcaccagatgaatatcatgttaactatactatacaatggaccaattaa
DBGET
integrated database retrieval system