Clostridium beijerinckii NCIMB 8052: Cbei_2588
Help
Entry
Cbei_2588 CDS
T00547
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat
Organism
cbe
Clostridium beijerinckii NCIMB 8052
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
CBM96
Disaggr_repeat
TGFb_propeptide
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR34744
UniProt:
A6LWL4
LinkDB
All DBs
Position
3005110..3012345
Genome browser
AA seq
2411 aa
AA seq
DB search
MPTAILVPIADAYISLLNPNTNFGFSSLLFTGRFVQPNDLFRSLLKFNLTGSLPSGSIIT
NASLNLFVFRKDLPDAVLSPQTVSVFTNASDFSEDTVTWNNAPAINPTIYSTNVTDADVG
MYISINITNLVIDWVNNPATNFGLTLTGIENIIDTIIGYFSKEWAVETQRPFLSIEFSSS
ATGSTGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGHTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTG
ATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTG
ATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG
DTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITG
PTGATGTTGDTGATGSTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGVTGSTG
ATGITGPTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITG
PTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTG
VTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTG
DTGVTGPTGDTGITGATGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTG
DTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTG
ATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTG
VTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTG
DTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITGPTG
GIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGATGVTGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTG
VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTG
DTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITG
PTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTG
VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGSTG
DTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTG
STGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTG
VTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTG
DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITG
PTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITG
PTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG
VTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTG
DTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGPTGDTGATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGSTGTTGITG
ATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTG
ATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATG
ITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTG
DTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGVTGSTGSTG
ATGATGITGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGSTGVTGSTGSTGATGATGVTGVTGPTG
APQLAFTDAGGTLAASITIGTETSVVSTNISTTTGQNVKVDFAVGIQVVTTANFSIAFQL
RLYSNGTLVASREVERVISSAGTQRFPVSNTYVDTATTTGTTTYDVRLVFLTATNVASAT
AINRYLNCIAF
NT seq
7236 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctactgcaattcttgtccctattgcagatgcttatatatcattgttaaatccaaac
acgaactttggattttcgagtcttttatttacagggagatttgttcagcctaatgaccta
tttagaagtttattaaaatttaatttaactgggtctcttccatccggaagtattataaca
aatgcttccttaaatttattcgtttttagaaaagatttacctgatgctgttttatcccca
caaaccgttagcgtatttacaaatgcaagcgatttttctgaagatacagttacgtggaat
aatgcgccagcaataaatccaacaatttattctacaaatgttactgatgcagatgtcggt
atgtatataagtattaatataactaatttagtgattgattgggtaaataacccagcaaca
aattttggtttaacattaactggtatcgaaaatataattgacactattataggatatttc
tcaaaagagtgggcagtcgaaactcaaagaccattccttagcatagaattttcatcaagt
gcaacaggatctactggacctacaggtgacaccggagcaactggagctacaggtgatact
ggagtcacaggatctactggtgcgactggaattaccggacatactggagacacaggagta
accggatctacaggtgacactggagtaaccggccctactggagacactggagttactgga
gctacaggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaattaccggtcctact
ggcgatactggagtaacaggtcctacaggcgacaccggagtaactggatctacaggtgat
actggaataaccggacctactggcgatactggagttaccggacctaccggtgatactgga
gcaactggatctacaggagatactggaattaccggacctacaggcgacaccggagtaacc
ggatctacaggtgacactggagttacaggatctactggagagactggaattaccggccct
actggagacactggagtaacaggacctactggtgatactggaataactggagctacagga
gatactggagtcacaggacctacaggtgataccggaattaccggccctactggagacact
ggagtcacaggttctactggtgcgactggaataaccggacctactggagacacaggagta
actggagctacaggtgatactggagttaccggtcctactggcgatactggaataaccggc
cctactggagcaacaggaactacaggcgatactggagcaacaggatctactggagacaca
ggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggacctaccggtgatactggagca
acaggccctactggagacactggagtaaccggccctactggagtcacaggttctactggt
gcgaccggaattaccggacctactggcgatactggagtaactggagctacaggtgatact
ggaataaccggacctactggcgatactggagtaacaggaactacaggtgatactggaatt
accggtcctactggtgatactggagcaacaggccctacaggtgatactggaattaccggt
cctactggcgatactggagcaacaggccctacaggtgacactggaataaccggtcctact
ggagacactggtgcaactggagttacaggtgatactggaattaccggacctaccggtgat
actggagcaaccggacctactggtgataccggagtaacaggacctactggtgataccgga
gtaacaggatctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatactggaataacc
ggacctactggagacactggagttaccggtcctactggcgatactggagtaacaggatct
actggagacactggagtaactggagctacaggtgatactggaattaccggacctactgga
gacacaggagtaacagggcctactggtgatactggaataactggagctacaggagtaact
ggagctacaggtgatactggagttaccggacctactggcgatactggagttaccggacct
actggagacacaggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggacctaccggt
gatactggagcaacaggatctacaggtgataccggagcaaccggccctactggagacacc
ggagttactggacctacaggagatgctggaataaccggacctaccggcaacactggagta
actggagctacaggagatactggaattaccggtcctactggagacacaggagtaactgga
gctacaggtgatactggagttaccggacctaccggtgatactggagcaacaggatctaca
ggtgataccggagcaaccggtcctactggagacacaggagtaactggagctacaggtgat
actggagttaccggacctactggcgatactggaattaccggacctaccggtgatactgga
gttaccggacctaccggtgatactggagcaactggatctacaggagatactggagtaact
ggatctacaggtgacactggagtcacaggttctactggtacgactggaattaccggagct
acaggagatactggaataaccggacctactggagacactggagtaacaggatctactgga
gacacaggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggtgatactggagcaact
ggatctacaggagatactggagcaactggatctacaggagatactggagtaactggatct
acaggtgacactggagtcacaggttctactggtgcgactggaattaccggccctactgga
ggcattggaattaccggacctacaggtgacactggagttacaggatctactggagagact
ggaattaccggccctactggagacacaggagtaacaggacctactggtgatactggaata
actggagctacaggagctactggagtcacaggacctacaggtgatactggcgtaacagga
cctactggcgatactggagtaacaggacctacaggtgacactggagttactggagctaca
ggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaataaccggacctacaggagat
accggagtaacaggatctactggagacaccggagttactggacctacaggcgacacagga
gttactggagctacaggtgatactggagttactggtcctactggcgatactggagtaaca
ggatctacaggtgatactggaattaccggccctactggagacactggagcaacaggaact
acaggtgatactggaattaccggtcctactggcgatactggagcaacaggccctacaggt
gacactggaataaccggtcctactggcgatactggagttaccggacctaccggtgatact
ggagcaactggatctacaggagatactggagtaactggatctacaggtgacactggagtc
acaggttctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatactggaataaccgga
cctactggagacactggagtaacaggatctactggagacacaggagtaactggagctaca
ggtgatactggagttaccggtgatactggagtcacaggacctacaggtgacactggaata
accggatctactggagacacaggagtcacaggacctacaggtgatactggcgtaacagga
cctactggcgatactggagtaacaggacctacaggtgacactggagttactggagctaca
ggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaataaccggacctacaggagat
accggagtaacaggatctactggagacaccggagttactggacctacaggcgacacagga
gttactggagctacaggtgatactggagttactggtcctactggcgatactggagtaaca
ggatctacaggtgatactggaattaccggccctactggagacactggagcaacaggacct
acaggtgatactggaattaccggacctaccggtgatactggagcaactggatctacaggt
gacactggagtcacaggttctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatact
ggaataaccggacctactggagacactggagtaacaggatctactggagacacaggagta
actggagctacaggagatactggaataaccggacctactggagacactggagtaacagga
tctactggagacacaggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggtgatact
ggagtcacaggacctacaggtgacactggaataaccggatctactggagacacaggagtc
acaggacctacaggtgatactggcgtaacaggacctactggcgatactggagtaacagga
cctacaggtgacacaggagttactggagctacaggtgatactggagtcacaggttctact
ggtgcgactggaataaccggacctacaggagataccggagtaacaggatctactggagac
accggagttactggacctacaggcgacacaggagttactggagctacaggtgatactgga
gttactggtcctactggcgataccggagtaacaggatctacaggtgatactggaattacc
ggccctactggagacactggagcaacaggaactacaggtgatactggaattaccggtcct
actggcgatactggagcaacaggccctacaggtgacactggaataaccggtcctactggc
gatactggagttaccggacctaccggtgatactggagttaccggacctaccggtgatact
ggagcaactggatctacaggagatactggagtaactggatctacaggtgacactggagtc
acaggttctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatactggaataaccgga
cctactggagacactggagtaacaggatctactggagacacaggagtaactggagctaca
ggtgatactggagttaccggtgatactggagcaactggatctacaggagatactggagta
actggatctacaggtgacactggagtcacaggttctactggtgcgactggaattaccggc
cctactggaggcattggaattaccggacctacaggtgacactggagttacaggatctact
ggagagactggaattaccggccctactggagacacaggagtaacaggacctactggtgat
actggcgtaacaggacctactggcgatactggagtaacaggacctacaggtgacactgga
gttactggagctacaggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaataacc
ggacctacaggagataccggagtaacaggatctactggagacaccggagttactggacct
acaggcgacacaggagttactggagctacaggtgatactggagttactggtcctactggc
gatactggagtaacaggatctacaggtgatactggaattaccggccctactggagacact
ggagcaacaggaactacaggtgatactggaattaccggtcctactggcgatactggagca
acaggccctacaggtgacactggaataaccggtcctactggcgatactggagttaccgga
cctaccggtgatactggagttaccggacctaccggtgataccggagcaaccggcgatact
ggacttactggacctacaggtgatactggagttaccggacctactggagacacaggagca
accggacctactggtgataccggagtaacaggatctactggtacgactggaattaccgga
gctacaggagatactggaataaccggacctactggagacacaggagtaactggagctaca
ggtgatactggagttaccggacctactggcgatactggagcaacaggatctacaggtgat
accggagcaacaggccctactggagacactggagttactggacctaccggtgatactgga
gcaactggatctacaggagatactggaattaccggccctactggagacacaggagtaaca
ggacctactggtgatactggaataactggagctacaggagttactggacctacaggcgac
accggagttactggagctacaggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactgga
ataaccggacctactggagacactggagttactggacctactggcgatactggagtaact
ggatctacaggtgacacaggagtaacaggatctactggagacacaggagcaacaggccct
acaggtgataccggagtaacaggacctaccggcaacacaggagcaaccggaactacaggt
gacactggaataaccggacctacaggcgacaccggagtaactggagtcacaggttctact
ggtgcgactggaataaccggatctactggtgcaaccggagctaccggaattacaggttcc
actggatctactggcgcaactggagctactggagttacaggttccactggatctactggt
gcaaccggagctaccggaattacaggttccactggatctactggcgcaaccggagctacc
ggaattacaggttccactggatctactggtgcaaccggttctaccggagttacaggttct
accggatctactggcgcaaccggagctactggagttaccggtgtaactggacctactggc
gcaccgcaactagccttcaccgatgctggcggtacacttgctgcttctattactattggc
actgaaacctcagtagtaagtacaaatataagtacgacaactggtcagaatgttaaagtt
gattttgcagttggcattcaggtagttactactgcaaatttttccatagccttccaatta
agactatacagtaatggtactttggttgcgtccagagaagttgagcgagtaatttcaagt
gctggaactcagcgtttccctgttagtaacacttacgttgacacagcaacgacaacagga
acaacgacctatgacgtaagacttgtttttctaacagctactaatgtcgcttctgccact
gcaattaatagatatttaaactgtatagctttctaa
DBGET
integrated database retrieval system