KEGG   Clostridium beijerinckii NCIMB 8052: Cbei_2588
Entry
Cbei_2588         CDS       T00547                                 
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat
Organism
cbe  Clostridium beijerinckii NCIMB 8052
SSDB
Motif
Pfam: Collagen CBM96 Disaggr_repeat TGFb_propeptide
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABR34744
UniProt: A6LWL4
LinkDB
Position
3005110..3012345
AA seq 2411 aa
MPTAILVPIADAYISLLNPNTNFGFSSLLFTGRFVQPNDLFRSLLKFNLTGSLPSGSIIT
NASLNLFVFRKDLPDAVLSPQTVSVFTNASDFSEDTVTWNNAPAINPTIYSTNVTDADVG
MYISINITNLVIDWVNNPATNFGLTLTGIENIIDTIIGYFSKEWAVETQRPFLSIEFSSS
ATGSTGPTGDTGATGATGDTGVTGSTGATGITGHTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTG
ATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTG
ATGSTGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATG
DTGVTGPTGDTGITGPTGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITG
PTGATGTTGDTGATGSTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGVTGSTG
ATGITGPTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITG
PTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGVTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTG
VTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTG
DTGVTGPTGDTGITGATGVTGATGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTG
DTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDAGITGPTGNTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTG
ATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGITGPTGDTG
VTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTG
DTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITGPTG
GIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGATGVTGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTG
VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTG
DTGITGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITG
PTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTG
VTGATGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGATGSTG
DTGVTGSTGTTGITGATGDTGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGITGPTGDTGVTG
STGDTGVTGATGDTGVTGDTGVTGPTGDTGITGSTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTG
VTGPTGDTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTG
DTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGTTGITGATGDTGITG
PTGDTGVTGSTGDTGVTGATGDTGVTGDTGATGSTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGATGITG
PTGGIGITGPTGDTGVTGSTGETGITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTGVTGPTGDTG
VTGATGDTGVTGSTGATGITGPTGDTGVTGSTGDTGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTG
DTGVTGSTGDTGITGPTGDTGATGTTGDTGITGPTGDTGATGPTGDTGITGPTGDTGVTG
PTGDTGVTGPTGDTGATGDTGLTGPTGDTGVTGPTGDTGATGPTGDTGVTGSTGTTGITG
ATGDTGITGPTGDTGVTGATGDTGVTGPTGDTGATGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGDTG
ATGSTGDTGITGPTGDTGVTGPTGDTGITGATGVTGPTGDTGVTGATGDTGVTGSTGATG
ITGPTGDTGVTGPTGDTGVTGSTGDTGVTGSTGDTGATGPTGDTGVTGPTGNTGATGTTG
DTGITGPTGDTGVTGVTGSTGATGITGSTGATGATGITGSTGSTGATGATGVTGSTGSTG
ATGATGITGSTGSTGATGATGITGSTGSTGATGSTGVTGSTGSTGATGATGVTGVTGPTG
APQLAFTDAGGTLAASITIGTETSVVSTNISTTTGQNVKVDFAVGIQVVTTANFSIAFQL
RLYSNGTLVASREVERVISSAGTQRFPVSNTYVDTATTTGTTTYDVRLVFLTATNVASAT
AINRYLNCIAF
NT seq 7236 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcctactgcaattcttgtccctattgcagatgcttatatatcattgttaaatccaaac
acgaactttggattttcgagtcttttatttacagggagatttgttcagcctaatgaccta
tttagaagtttattaaaatttaatttaactgggtctcttccatccggaagtattataaca
aatgcttccttaaatttattcgtttttagaaaagatttacctgatgctgttttatcccca
caaaccgttagcgtatttacaaatgcaagcgatttttctgaagatacagttacgtggaat
aatgcgccagcaataaatccaacaatttattctacaaatgttactgatgcagatgtcggt
atgtatataagtattaatataactaatttagtgattgattgggtaaataacccagcaaca
aattttggtttaacattaactggtatcgaaaatataattgacactattataggatatttc
tcaaaagagtgggcagtcgaaactcaaagaccattccttagcatagaattttcatcaagt
gcaacaggatctactggacctacaggtgacaccggagcaactggagctacaggtgatact
ggagtcacaggatctactggtgcgactggaattaccggacatactggagacacaggagta
accggatctacaggtgacactggagtaaccggccctactggagacactggagttactgga
gctacaggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaattaccggtcctact
ggcgatactggagtaacaggtcctacaggcgacaccggagtaactggatctacaggtgat
actggaataaccggacctactggcgatactggagttaccggacctaccggtgatactgga
gcaactggatctacaggagatactggaattaccggacctacaggcgacaccggagtaacc
ggatctacaggtgacactggagttacaggatctactggagagactggaattaccggccct
actggagacactggagtaacaggacctactggtgatactggaataactggagctacagga
gatactggagtcacaggacctacaggtgataccggaattaccggccctactggagacact
ggagtcacaggttctactggtgcgactggaataaccggacctactggagacacaggagta
actggagctacaggtgatactggagttaccggtcctactggcgatactggaataaccggc
cctactggagcaacaggaactacaggcgatactggagcaacaggatctactggagacaca
ggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggacctaccggtgatactggagca
acaggccctactggagacactggagtaaccggccctactggagtcacaggttctactggt
gcgaccggaattaccggacctactggcgatactggagtaactggagctacaggtgatact
ggaataaccggacctactggcgatactggagtaacaggaactacaggtgatactggaatt
accggtcctactggtgatactggagcaacaggccctacaggtgatactggaattaccggt
cctactggcgatactggagcaacaggccctacaggtgacactggaataaccggtcctact
ggagacactggtgcaactggagttacaggtgatactggaattaccggacctaccggtgat
actggagcaaccggacctactggtgataccggagtaacaggacctactggtgataccgga
gtaacaggatctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatactggaataacc
ggacctactggagacactggagttaccggtcctactggcgatactggagtaacaggatct
actggagacactggagtaactggagctacaggtgatactggaattaccggacctactgga
gacacaggagtaacagggcctactggtgatactggaataactggagctacaggagtaact
ggagctacaggtgatactggagttaccggacctactggcgatactggagttaccggacct
actggagacacaggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggacctaccggt
gatactggagcaacaggatctacaggtgataccggagcaaccggccctactggagacacc
ggagttactggacctacaggagatgctggaataaccggacctaccggcaacactggagta
actggagctacaggagatactggaattaccggtcctactggagacacaggagtaactgga
gctacaggtgatactggagttaccggacctaccggtgatactggagcaacaggatctaca
ggtgataccggagcaaccggtcctactggagacacaggagtaactggagctacaggtgat
actggagttaccggacctactggcgatactggaattaccggacctaccggtgatactgga
gttaccggacctaccggtgatactggagcaactggatctacaggagatactggagtaact
ggatctacaggtgacactggagtcacaggttctactggtacgactggaattaccggagct
acaggagatactggaataaccggacctactggagacactggagtaacaggatctactgga
gacacaggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggtgatactggagcaact
ggatctacaggagatactggagcaactggatctacaggagatactggagtaactggatct
acaggtgacactggagtcacaggttctactggtgcgactggaattaccggccctactgga
ggcattggaattaccggacctacaggtgacactggagttacaggatctactggagagact
ggaattaccggccctactggagacacaggagtaacaggacctactggtgatactggaata
actggagctacaggagctactggagtcacaggacctacaggtgatactggcgtaacagga
cctactggcgatactggagtaacaggacctacaggtgacactggagttactggagctaca
ggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaataaccggacctacaggagat
accggagtaacaggatctactggagacaccggagttactggacctacaggcgacacagga
gttactggagctacaggtgatactggagttactggtcctactggcgatactggagtaaca
ggatctacaggtgatactggaattaccggccctactggagacactggagcaacaggaact
acaggtgatactggaattaccggtcctactggcgatactggagcaacaggccctacaggt
gacactggaataaccggtcctactggcgatactggagttaccggacctaccggtgatact
ggagcaactggatctacaggagatactggagtaactggatctacaggtgacactggagtc
acaggttctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatactggaataaccgga
cctactggagacactggagtaacaggatctactggagacacaggagtaactggagctaca
ggtgatactggagttaccggtgatactggagtcacaggacctacaggtgacactggaata
accggatctactggagacacaggagtcacaggacctacaggtgatactggcgtaacagga
cctactggcgatactggagtaacaggacctacaggtgacactggagttactggagctaca
ggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaataaccggacctacaggagat
accggagtaacaggatctactggagacaccggagttactggacctacaggcgacacagga
gttactggagctacaggtgatactggagttactggtcctactggcgatactggagtaaca
ggatctacaggtgatactggaattaccggccctactggagacactggagcaacaggacct
acaggtgatactggaattaccggacctaccggtgatactggagcaactggatctacaggt
gacactggagtcacaggttctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatact
ggaataaccggacctactggagacactggagtaacaggatctactggagacacaggagta
actggagctacaggagatactggaataaccggacctactggagacactggagtaacagga
tctactggagacacaggagtaactggagctacaggtgatactggagttaccggtgatact
ggagtcacaggacctacaggtgacactggaataaccggatctactggagacacaggagtc
acaggacctacaggtgatactggcgtaacaggacctactggcgatactggagtaacagga
cctacaggtgacacaggagttactggagctacaggtgatactggagtcacaggttctact
ggtgcgactggaataaccggacctacaggagataccggagtaacaggatctactggagac
accggagttactggacctacaggcgacacaggagttactggagctacaggtgatactgga
gttactggtcctactggcgataccggagtaacaggatctacaggtgatactggaattacc
ggccctactggagacactggagcaacaggaactacaggtgatactggaattaccggtcct
actggcgatactggagcaacaggccctacaggtgacactggaataaccggtcctactggc
gatactggagttaccggacctaccggtgatactggagttaccggacctaccggtgatact
ggagcaactggatctacaggagatactggagtaactggatctacaggtgacactggagtc
acaggttctactggtacgactggaattaccggagctacaggagatactggaataaccgga
cctactggagacactggagtaacaggatctactggagacacaggagtaactggagctaca
ggtgatactggagttaccggtgatactggagcaactggatctacaggagatactggagta
actggatctacaggtgacactggagtcacaggttctactggtgcgactggaattaccggc
cctactggaggcattggaattaccggacctacaggtgacactggagttacaggatctact
ggagagactggaattaccggccctactggagacacaggagtaacaggacctactggtgat
actggcgtaacaggacctactggcgatactggagtaacaggacctacaggtgacactgga
gttactggagctacaggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactggaataacc
ggacctacaggagataccggagtaacaggatctactggagacaccggagttactggacct
acaggcgacacaggagttactggagctacaggtgatactggagttactggtcctactggc
gatactggagtaacaggatctacaggtgatactggaattaccggccctactggagacact
ggagcaacaggaactacaggtgatactggaattaccggtcctactggcgatactggagca
acaggccctacaggtgacactggaataaccggtcctactggcgatactggagttaccgga
cctaccggtgatactggagttaccggacctaccggtgataccggagcaaccggcgatact
ggacttactggacctacaggtgatactggagttaccggacctactggagacacaggagca
accggacctactggtgataccggagtaacaggatctactggtacgactggaattaccgga
gctacaggagatactggaataaccggacctactggagacacaggagtaactggagctaca
ggtgatactggagttaccggacctactggcgatactggagcaacaggatctacaggtgat
accggagcaacaggccctactggagacactggagttactggacctaccggtgatactgga
gcaactggatctacaggagatactggaattaccggccctactggagacacaggagtaaca
ggacctactggtgatactggaataactggagctacaggagttactggacctacaggcgac
accggagttactggagctacaggtgatactggagtcacaggttctactggtgcgactgga
ataaccggacctactggagacactggagttactggacctactggcgatactggagtaact
ggatctacaggtgacacaggagtaacaggatctactggagacacaggagcaacaggccct
acaggtgataccggagtaacaggacctaccggcaacacaggagcaaccggaactacaggt
gacactggaataaccggacctacaggcgacaccggagtaactggagtcacaggttctact
ggtgcgactggaataaccggatctactggtgcaaccggagctaccggaattacaggttcc
actggatctactggcgcaactggagctactggagttacaggttccactggatctactggt
gcaaccggagctaccggaattacaggttccactggatctactggcgcaaccggagctacc
ggaattacaggttccactggatctactggtgcaaccggttctaccggagttacaggttct
accggatctactggcgcaaccggagctactggagttaccggtgtaactggacctactggc
gcaccgcaactagccttcaccgatgctggcggtacacttgctgcttctattactattggc
actgaaacctcagtagtaagtacaaatataagtacgacaactggtcagaatgttaaagtt
gattttgcagttggcattcaggtagttactactgcaaatttttccatagccttccaatta
agactatacagtaatggtactttggttgcgtccagagaagttgagcgagtaatttcaagt
gctggaactcagcgtttccctgttagtaacacttacgttgacacagcaacgacaacagga
acaacgacctatgacgtaagacttgtttttctaacagctactaatgtcgcttctgccact
gcaattaatagatatttaaactgtatagctttctaa

DBGET integrated database retrieval system