Clostridium beijerinckii NCIMB 14988: LF65_06295
Help
Entry
LF65_06295 CDS
T04773
Name
(GenBank) protoporphyrinogen oxidase
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
cbei
Clostridium beijerinckii NCIMB 14988
Pathway
cbei04518
Integrin signaling
cbei04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbei00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04518 Integrin signaling
LF65_06295
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
LF65_06295
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cbei00536
]
LF65_06295
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
cbei00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
LF65_06295
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
CBM96
Disaggr_repeat
TGFb_propeptide
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMK50403
UniProt:
A0A140DMC8
LinkDB
All DBs
Position
complement(3215032..3218667)
Genome browser
AA seq
1211 aa
AA seq
DB search
MPSVILSPIADAYISLLNPNTNFGFSSLLFTGRFVQPNDLFRSLLKFDLTGSVPSGSTIT
NASLNLFVFRKDLPDAVLSPQTVSVFTNASDFSEATVTWNNAPAINPTMYSTNVTDADVG
MYISINITNLVSDWVNNPATNFGVTLTGIENIIDTIIGYFSKEWPIETQRPFLSIEFLSG
STGGTGATGATGPTGATGPTGATGDTGATGDTGATGDTGDTGTTGGTGATGDTGTTGDTG
ATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGDTGTTGDTGATG
DTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATG
DTGATGATGVTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTG
ATGDTGATGDTGATGDIGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTG
ATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGATGATGDTGATGDTGTTGDTGATGDTG
ETGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGTTGDTGATGDTG
ATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGAGATGDTGATGDTGATGA
TGDTGATGDTGTTGDTGATGDTGETGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGA
TGDTGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGD
TGATGDTGATGDTGATGGTGATGDTGATGDTGATGDTGTTGDTGATGDTGATGDTGATGD
TGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGD
TGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGD
TGATGDTGATGDTGATGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGTTGDTGATGDTGA
TGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGDTGATGATGDTGTTGDTGATGATGPGST
LAPTMASGILPLAVAGSTTILSRDVTVDAGEILKLDSMAEIDLVTAAALVTYSYTIEFEL
FRGATSLATVTINNSDTLTLLVARNLTEVPNLTWTDTPGAGTFTYTIVITITSTNITSAN
AVTRALNITIF
NT seq
3636 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctagtgtaattcttagcccaattgcggatgcatatatatcattgttaaatccaaac
acgaactttggattttcaagtcttttatttacaggaagatttgttcagcctaatgaccta
tttagaagtttattaaaatttgatttaactgggtctgttccatccggaagtactataaca
aatgcttctttaaatttattcgtttttagaaaagatttacctgatgcggttttatcccca
caaactgtcagcgtgtttacaaatgcaagcgatttttctgaagctacagttacgtggaat
aatgcgccagcaataaatccaacaatgtattctacaaatgttactgatgcagatgttggg
atgtatataagtattaatataactaatttagtgagtgattgggtgaataacccagcaaca
aattttggtgtaacattaactggtattgaaaatataattgacactattataggctatttc
tcaaaagagtggccaattgaaacgcaaagaccatttcttagcatagagtttttatccgga
tctacaggaggaactggagctacaggtgctactgggcctacaggagcaactggacctact
ggtgcaactggagacacaggagcaactggtgatactggcgcaactggtgacactggagat
acaggaactactggtggtactggtgcaactggagatactgggactactggtgatactggt
gcaaccggcgataccggagctacaggtgatactggagcaaccggagacactggagcaacc
ggagacactggcgctactggcgataccggagcaactggtgatactggcgcaactggtgac
actggagctacaggtgatactggagatactgggactactggtgatactggtgcaaccggc
gataccggagctacaggtgatactggagcaaccggagacactggagcaaccggagacact
ggcgcgactggtgatactggcgcaactggtgacacaggagcaactggagacactggtgct
actggcgataccggagcaactggtgatactggcgcaactggtgacactggagctacaggt
gatactggtgctaccggagctactggagtaaccggagcaactggcgatactggagctact
ggtgatactggagcaactggagataccggagcaactggtgatacaggagcaactggtgac
acaggagcaactggtgatacaggagcaactggtgacacaggagcaactggagacactggt
gctactggcgatacaggtgctactggagacacaggagcaactggagacataggagctaca
ggtgatactggcgcaaccggagataccggcgcaactggcgatactggtgcaactggtgac
acaggtgcaactggagataccggcgcaactggagacactggtgctacaggtgatactgga
gctacaggtgatactggagctactggagacacaggcgcaactggcgatactggagctaca
ggtgatactggcgcaaccggagataccggcgcaactggtgcaactggtgcaactggtgac
acaggagcaaccggagatacaggaactactggtgatactggagctacaggtgatactggt
gagactggagacacaggagcaactggcgatactggtgcaactggtgataccggagcaact
ggagacacaggagcaactggagacacaggagcaactggtgatactggtgcaactggtgac
acaggagcaaccggagatacaggaactactggtgatactggtgctacaggtgatactggc
gctactggagacacaggagcaactggagacactggtgctacaggtgacacaggagcaact
ggtgatacaggagcaaccggagacacaggagcgactggagataccggcgcaactggagac
actggtgctggagctacaggtgatactggtgctactggagacactggcgcaactggtgca
actggtgacacaggtgcaaccggagatacaggaactactggtgatactggagcgactgga
gatactggtgagactggagacacaggagcaactggcgatactggagctacaggtgatact
ggagctacaggtgatactggtgcgactggagatactggagcaactggagacactggagct
acaggtgatacaggtgatactggagctactggagacacaggcgcaactggcgatactggt
gcaactggtgatacaggagcaaccggcgatactggagctacaggtgatacaggagctaca
ggtgatactggtgctacaggtgatactggtgcgactggagatactggtgcgactggagat
actggagctacaggtgatactggtgcgactggagacactggagctactggaggcacaggc
gcaactggcgatactggtgcaactggtgatacaggagcaaccggagatacaggaactact
ggtgatactggagctactggagacacaggcgcaactggtgatactggcgcaactggtgat
acaggagcaaccggcgatactggagctacaggtgatacaggagctacaggtgatactgga
gctactggagacacaggcgcaactggcgatactggtgcaactggtgatacaggagcaacc
ggcgatactggagctacaggtgatacaggagctacaggtgatactggagctacaggagat
actggagctacaggtgatactggagctacaggtgatactggtgcgactggagatactggt
gcaactggagatactggagctacaggtgatactggtgctacaggtgatactggtgcgact
ggagatactggagctactggagacactggtgcaactggagatactggagctactggagac
acaggcgcaactggtgatactggcgcaactggtgataccggagcaactggagctacaggt
gatactggcgcaaccggagataccggagcaactggcgatactggtgcaactggtgacaca
ggagcaaccggagatacaggaactactggtgatacaggagctacaggagataccggcgca
actggagacactggtgctacaggtgatactggtgcgactggagacactggagctacaggt
gatactggagctactggagacactggcgcaactggcgatactggtgcaacaggtgctact
ggagatacaggaactactggtgataccggagcaactggagcaactggccctggaagcaca
ttagcgcctacaatggcaagtggtatattacctcttgctgtagctggtagtacaaccata
ctttctcgtgatgttactgttgatgctggagaaatattaaaattagattcaatggcagaa
attgatcttgtaacagctgcagcattagtaacctactcttatacaattgaatttgaacta
ttccgtggtgcaacttctcttgcaacagtaacaattaataattctgataccctcactctt
cttgttgccagaaacctaactgaagttcctaatcttacttggactgatactcctggagct
ggaaccttcacttatactattgtaattacaattactagtaccaacattacttccgctaat
gctgttactagagctttaaatataacaattttctga
DBGET
integrated database retrieval system
