Cognaticolwellia beringensis: B5D82_11345
Help
Entry
B5D82_11345 CDS
T05628
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cber
Cognaticolwellia beringensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cber00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cber02000
]
B5D82_11345
Transporters [BR:
cber02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B5D82_11345
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP48305
UniProt:
A0A222G8S8
LinkDB
All DBs
Position
complement(2657149..2659494)
Genome browser
AA seq
781 aa
AA seq
DB search
MNIKNQLSSVNLVIKPLALAIACALSTQAFAEEEQTVKEEGKAKAAIERISVTAQKRIST
LQETPIAITAFDSDAIENLGIQDISNVNNIAPNTQVVVPIGSAFNVGVNIRGLGTNEPSL
GVDPKVGIYVDGVYLARNSGAIFSIIDLERMEVLRGPQGTLWGKNTTGGAINMVTKRPSD
EFEFKQKFTVGSDGLFNSTTSIDTGEFNNFTAKFTYMTGEEDGWAKNTFEGAKEKNLGAK
ETDAMRFVLRYTGDDFSVDYSYDKTDGSSVSIPVQVSNVRPHFTDPTVPTLHMGTGTFYG
GNVFAMMAANEFEGGRQESWELNQHGREHVKISGHNLTAEWDFAEHHSFKSISSTRKYSS
DLTDGVNLSGGAYFGAELDATFQPTGNFAPIPAFSYTNQKSQKQSSQEFQFLGELMDGQL
EYVAGYYYFTEEGKEINPWSINIFTGQGANLLFADPLPWGVFYEVDNTAQALFAQVDYHV
TDALNVVMGLRHTKDEKSIVNLAEPDAMLRNNLSAEKEWSKTVGSLVVNYVVDEDLTVYG
KVTQGYAAGTFNSGSVERFSYLNPANGGEANYEGTLTPADPEDTTAYEIGAKAMLLDDRI
MLNTAIFYNDNTNLQVTVIDGGNVRHSLNSGKSKTIGVEFDAKFAATEDLMFTASYGYRD
TEYTDDTFSDLNIFTASLAMSWTMAEFEFGHLSLHADYSMNDEFQFSLIDPNMVADSYNL
LNARVTLSEIQVGDKSNLKVSIFGRNITDEEYQLHGASLGFFDTRSYGAPSSYGVDVVFN
F
NT seq
2346 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatcaaaaatcaattaagtagcgtaaatctagttattaaaccactagcgcttgca
attgcttgtgctctttctacacaagcatttgccgaagaagagcaaacagtaaaagaagaa
ggtaaagcaaaagcggccatagaacgtatttctgtaacggcacaaaaacgtattagtacc
ctacaagaaacccctatcgccataaccgcatttgacagcgatgccatcgaaaacttaggc
attcaagacattagtaatgtaaataacattgcccctaatactcaagtcgtagtgccaatt
ggtagtgcattcaatgtcggtgtcaatattcgtggtttaggtactaacgagccttcttta
ggtgtagaccctaaggttggcatttatgtagatggtgtgtatttagctcgtaattctggg
gcaatatttagtattattgatttagaacgtatggaagtacttcgtggccctcaaggaaca
ctttggggtaaaaacacgacaggtggcgctattaacatggtgaccaaaagaccatcggat
gagtttgaatttaaacaaaaatttaccgttggctctgatggactatttaactctaccact
tcgattgataccggtgaatttaacaattttactgccaagtttacctatatgactggcgaa
gaagacggttgggcgaaaaacacttttgaaggtgccaaagaaaaaaacctcggcgctaaa
gaaacggatgcaatgcgtttcgttcttcgttataccggtgacgatttctcggttgattac
agttacgacaaaacggatggtagttctgtctctattccagtgcaagtgagcaacgtacgc
cctcattttactgaccctactgttcctacgcttcatatgggcacaggtacattttacggt
ggtaatgtctttgctatgatggcagctaatgaattcgaaggcggtcgccaagaaagttgg
gagctaaatcaacatggccgagaacatgttaaaatttcaggccacaacttgacagcagaa
tgggattttgccgaacatcatagctttaaatctatctcttctacccgtaaatattcttct
gacttaaccgacggtgtgaacttaagcggtggcgcatattttggtgcagagcttgatgct
acgttccaaccaacaggtaatttcgcacctattccggccttttcatataccaaccagaaa
tcacaaaagcaaagttcacaggaattccaatttctgggtgaattgatggatggacaacta
gaatatgtcgcaggttattattacttcaccgaagaaggtaaagaaattaacccttggagt
attaatatctttacgggtcaaggcgccaacttgttgtttgcagatcccttaccatggggc
gttttctatgaagtagacaatacggcacaggcattgtttgctcaagttgattatcacgta
actgatgcgttaaatgtagtcatgggtcttcgccacactaaagatgaaaagtctatcgta
aatttagctgagcctgatgctatgttacgtaacaacttatctgctgaaaaagagtggagt
aaaacggttggctctttagtggttaactatgttgttgatgaagatttaaccgtttacggt
aaagtaacccaaggttacgctgccggtacttttaactcaggctcggtagaacgattctct
tatctaaatccagcaaatggcggtgaagcgaactatgaagggacattaacaccagcggat
cctgaagataccactgcttatgagattggcgctaaagccatgctgttagatgaccgcatt
atgcttaacaccgcaattttttataatgacaatactaacttacaagttacggtgattgat
ggcggtaatgtccgtcactcattaaactctggtaagtcgaaaactattggtgtcgaattt
gatgctaagtttgctgccacagaagatttaatgtttaccgcaagctatggttacagagat
actgaatatactgatgatacattctcagaccttaatatttttacggcctcactagcgatg
agttggaccatggctgaattcgagtttggtcatttaagtttgcatgctgattactcaatg
aacgatgaattccaatttagtttaattgacccgaatatggtggcagattcatataatcta
ctgaatgctcgtgtaacattatctgagattcaagtcggtgataaatctaacctaaaagtg
tcaattttcggtcgtaatattaccgatgaagaatatcagcttcatggtgctagccttgga
ttctttgacaccagaagttacggtgctccttcaagctatggtgttgatgtcgtatttaac
ttttaa
DBGET
integrated database retrieval system