KEGG   Cognaticolwellia beringensis: B5D82_12500
Entry
B5D82_12500       CDS       T05628                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cber  Cognaticolwellia beringensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cber00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:cber02000]
    B5D82_12500
Transporters [BR:cber02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   B5D82_12500
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: ASP48514
UniProt: A0A222GAW1
LinkDB
Position
2947048..2949633
AA seq 861 aa
MSTTFRTGTLALAVGLALGTAPSFAAGFEETSKVKAKDVERIAVVGSRSAPRSVADSPVP
IDIVGGDELGKNASSDMLDMLQAAVPSFNVRQQPISDAASFIRPVNLRGLSSDSTLILLN
GKRRHRASVIAFQGGGVNDGAQGPDVSVIPSVALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIAGVMNFV
LKDDADGGSLSVKQGSYYEGDGDSTIVDGNIGLPFTKDGFVNLSFQLKESDATSRSVQRP
DAQALIDAGNTNVASPAMTWGNPKIEDDITLFGNVGLDLGDDKEFYMFGNYSSRTGTGGY
YYRNPQNRGGVFTDENGDLLVGAMDGNAGACPNIAITAADVRTQQDYIDGVANNDNCWAF
NELLPGGYTPQFTGDINDTSLVMGTRGEIKGGFLDQAMYDISGSVGRNKSTYTLVDTVNP
SMGALNADQPGLSFEAGSYIQLEKSFNADLVKGIDMGLSEPVNFATGLEWRQESFEIVSG
EQASWKQGPLATQGFSVGSHGFAGFSPEAQGINKRQSIAAYIDVEAYITEDFLLGAALRY
EDFSSFGNTTNYKLTAQYQLNDELSFRASHSTGFRAPTVGQANVVNTQTSLVNGELIQSA
TFPPTHPVSAELGGVELQPEESVSYALGMVYQSGDFFMTVDAYNIEVSDRVAQTDKVFIT
PAHVAALQGKYPSPELLLNGSITFFANDFDTTTKGVDIVANYGMELLEGDTKFSLAYNFN
ATEVDDPGLFTSGFKVRRLEEGIPEHRATFTVAQNWENVSMFVRANYFGEWFATHADEPD
EFSSYGWSETVGSSYTIDASVSYFLNDSWTLSVGANNLFDKEAQELQKDGGAYGVVSGKY
YESGPYDYNGGYYYVKAAYKF
NT seq 2586 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctacaacattccgtacaggcactttagcccttgctgttggcttagctcttggtaca
gcccctagctttgccgcaggttttgaagaaacatcgaaagtaaaagcaaaagatgtagag
cgcattgccgtcgttggctctcgttctgccccacgttcagtagctgattctccagtgcca
attgatattgttggtggtgatgagcttggtaagaatgcttcaagtgacatgctagacatg
ttacaagcagctgtaccatcatttaacgttcgtcaacaacctatctcagatgcggcatcg
tttattcgtcccgttaacctacgtggcctttcatctgattcaacattaattttattaaat
ggtaagcgtcgtcatcgtgcttctgttattgccttccaaggtggtggtgttaacgatggt
gctcaaggtcctgatgtttcagttattcctagtgttgccttaaaacaagttgaagtatta
cgagatggtgctgccgcacagtatggttctgatgctattgctggtgtaatgaactttgta
cttaaagatgacgctgatggcggttcactttctgttaaacaaggttcttactacgaaggt
gacggcgactctactattgttgacggtaacattggtttacctttcaccaaagatggtttt
gttaacctttcttttcaattaaaagaatctgatgctactagtcgaagtgtacaacgccct
gacgcacaagctttaattgacgcaggtaatactaatgtagcaagccctgcaatgacttgg
ggtaatccaaaaattgaagacgatattacattatttggtaatgttggtcttgatttaggt
gacgataaagaattttacatgtttggtaactattcaagccgaacgggtactggcggttat
tattatcgtaacccacaaaaccgtggtggtgtattcaccgacgaaaacggtgacttatta
gtgggtgctatggatggtaatgctggtgcatgtccaaacatcgctattacagctgctgat
gttagaactcaacaagattacattgacggtgttgctaacaacgataattgttgggcattt
aatgaactactgcctggtggttacacgccgcaatttactggtgatattaacgatacttca
ttagtgatgggtacacgtggtgaaattaaaggcggcttcttagatcaagctatgtatgat
atcagcggctcagttggtcgtaataaatcaacttatactttagttgacacagttaaccct
tcaatgggtgcgttgaatgccgatcaaccaggtctttcgtttgaagcgggttcttatatt
caattagagaagtcttttaatgctgatttagtaaaaggcattgacatgggcttatcagag
ccagtgaattttgcaactggtcttgaatggcgtcaagagagttttgaaattgtgtcaggt
gagcaagcttcatggaagcaaggtccactagcaactcaaggttttagtgtgggttctcat
ggttttgctggtttttctcctgaagcacaaggtattaataaacgccaaagtattgcagct
tacatcgatgttgaagcatacattactgaagactttttattaggtgctgcattacgttat
gaagatttctcttcatttggtaataccactaactataaattaacagcgcaatatcaactt
aatgatgagttatctttcagagcttctcatagtaccggtttccgtgcaccaacagttggt
caagccaacgtggtaaatacgcaaacatcattggttaatggcgagctaattcagtcagca
actttcccaccaacccaccctgtttcggcagagctaggtggtgttgagcttcaacctgaa
gagtcagtaagttatgcattaggtatggtttaccaaagtggtgatttcttcatgacagtt
gatgcttataatattgaagtatcagaccgtgtagcacaaactgataaagtatttattaca
ccagcacatgtagctgcattacaaggtaagtacccaagccctgaattactactaaatggt
tcaattactttctttgctaatgattttgacactacaactaaaggtgttgatattgttgct
aactacggtatggagttattagaaggtgacactaagtttagtcttgcttataacttcaat
gctactgaagtagatgacccaggtttgtttacatctggctttaaagtacgtcgtttagaa
gaaggtattcctgagcatcgtgcaacgtttacagtagctcaaaactgggaaaacgttagt
atgtttgtacgtgccaactacttcggtgaatggtttgcaacacatgctgatgaacctgat
gagttcagctcatacggttggtcagaaactgtaggttcttcttacactattgatgcttca
gttagctacttcttaaacgatagctggacattatcagtaggtgctaacaacttattcgac
aaagaagcacaagagcttcaaaaagatggtggcgcttacggtgtagttagtggtaagtac
tacgaaagtggtccatacgactataatggtggttactactacgttaaagccgcatataag
ttttaa

DBGET integrated database retrieval system