Cognaticolwellia beringensis: B5D82_14750
Help
Entry
B5D82_14750 CDS
T05628
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
cber
Cognaticolwellia beringensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cber00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
cber02044
]
B5D82_14750
02035 Bacterial motility proteins [BR:
cber02035
]
B5D82_14750
Secretion system [BR:
cber02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
B5D82_14750
Bacterial motility proteins [BR:
cber02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
B5D82_14750
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
Capsid_NCLDV
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP48918
UniProt:
A0A222GAI7
LinkDB
All DBs
Position
3495802..3499356
Genome browser
AA seq
1184 aa
AA seq
DB search
MKRFLAISLLLIISNVSFSEDIELYVSNDVKLAGNKTQVLIIFDNSGSMGTTLSVNEDYD
PTVTYPAVGNDNSLSERFIYFTKGGADGGSGLPVPDKNNESRRFLDSINSCETARKILAE
TGFYSGHIREYSFKGTSGSWNEIPDNNGANVEVIDCEDDVLKSEPKNIASLPDGYPVNYL
GTKQIPIYHSPLLLTSNVDWSGQYVTLYTDNYLRWHHGETIAQTLTTRMEIAKKSIANVV
KAAPSIDFGLQVFNYNYGDAADHPNGGRVAFGIQQMTNASEAEFLDIVNNKVSSRTWTPL
CESLYEAQQYFAGKNVDFGDDDVDLYFNNGTLAYQKNVPPRDLSIESSGKYISPFSNCSS
KAFVILITDGAPTFDNGADSKIEALTTVDEGKTVNFSGSKFAGNYLAGLAEWMNENDLNT
SLPGRQTVSTYTIGFSEGALDAAPLLKRTAKLGGGDYYPAADSAQLTSALLNALESLEPS
NDSLTSASVAANNFDRTETLNSVYYAMFQPENGPRWQGNLKKYKVVSGNQVGKHSKLALD
ANSGHFSPDVTSFWSPNNAKDGDQVPEGGVADMLRKKTNRVIYSDIGASGTMALLTKTQA
ETSFGGSTALATEMKVHEDDVDTYLNWAKGKNVDDVKLPDGTKPAIRPDVFADPLHSKPL
VVNYGDSIRIVIGTNAGVLHMFEDKGDSVDENWAFMPKEFFKNIKPLRQNYSTAEKIYGV
DGNITSYTQDKNGDGIINGTDKVWIFFGLRRGGSSYYALDISDPSAPSKLWHIDASSTGF
GELGQSWSQPKLGYSKVNVIGSGASAVAAPVLFFGGGYDAAKDTKAPGTPDSKGRAIYMV
DAGTGALKWSLAPGNANTTFSGTDSIPSSIGILDSDGDGLTDRLYTGDTGGNVWRVDMPS
ADPVDTEAPWTVFKLAELGGNTNTTDLRFFNEPSIVRTFISETIEENVTDINGKTTTIVS
HQEKPYDAVLIGSGDRSNPLGIDTSDTFFMIKDEHIKTKSFYSSVEPKAPLALLKSDLYN
YTDNPFDKTLTTQERDKLSIAVSNKSGWFMDLKGSGEKSTAEAIVINGVAFFTTFIPPNL
DPTIVRCEQPNGTGLLYAVDLALGTAVYNWKTNNGTGTGTGEGPPDDAKRSIVISEQFLG
APTLIVVPDAKGETVGNIIVGRKVVNTPFTLQTMRTYLYIKEEQ
NT seq
3555 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagatttctggccataagcctactattaataatatcaaacgtatcttttagtgaa
gatattgagttatacgtaagcaatgacgtaaagcttgctggcaataaaacccaagtactt
attatttttgataactcaggcagtatgggtaccacgctttctgtaaatgaggactatgat
cctacagtaacttatccggctgttggcaatgataattcattaagtgaacgctttatttac
tttacaaaaggtggtgctgatggtggctcaggtttacctgtacctgataaaaataatgag
tcacgtcgctttttagattctatcaatagttgtgaaacagcgagaaaaattttagcagaa
actggcttctattcaggacatatacgcgaatatagctttaaaggcacttcaggtagttgg
aatgaaattcccgataataatggagcaaatgttgaagttattgattgtgaagatgatgtt
ttaaagtctgaacctaaaaacatagctagcttgcctgacggctacccagttaattacctc
gggactaaacaaatccctatttatcatagccctcttcttttgacgtcgaacgttgactgg
tctggtcaatacgtaacactttatacagataattatttacgctggcatcatggcgagact
attgctcaaacattaacaactcgtatggaaatagcgaaaaaaagtatcgccaacgtggtt
aaagcggccccttctatcgactttggtttacaagtgtttaactacaattacggtgatgct
gcagatcacccgaacggtgggcgggttgcttttggtatccaacaaatgaccaatgccagt
gaagctgaatttttagatatagtgaataacaaagtatcttcaagaacatggacgcctctt
tgcgagtcactttatgaggcgcaacaatactttgccggtaaaaatgtagactttggcgat
gatgatgttgatctttatttcaataacggaacactcgcatatcaaaaaaatgtacctccg
agagatctctcaatcgaatcctcaggcaaatatattagcccattctctaattgtagtagt
aaagcttttgttatattaatcacggatggagcaccaacttttgataatggggcagatagt
aaaatagaagcattaacaacagttgacgaggggaaaactgttaattttagtggtagtaag
tttgccggtaattatttagctgggctagctgaatggatgaatgaaaatgatcttaatacg
agtttacccggcagacaaacagtgtcgacatacactatcggctttagtgaaggtgcgctt
gatgctgcgccattattaaaaagaacggctaaattaggtggaggagattattatcctgct
gcagatagcgcgcaactaacctccgcgttattgaatgcactagaaagtttagagccaagt
aatgatagcttaacttcagcatccgttgcagctaataactttgatagaactgaaaccttg
aactctgtttattatgcaatgtttcaacctgaaaatggaccacgttggcaaggtaatctt
aagaaatataaggtggttagtggaaatcaagttggcaaacatagcaagttagcccttgat
gctaatagcggacacttttctccagatgtaacgagcttttggtcgccaaataacgccaaa
gatggagatcaagtaccagaaggcggtgttgctgatatgttacgtaaaaaaactaataga
gttatatacagtgatataggcgctagtggcacaatggctttattaactaaaacacaagca
gaaacatcgtttggtggtagcactgcactagcaacagaaatgaaagttcatgaggatgac
gtcgatacatatttaaattgggcaaaaggtaaaaatgtagatgatgttaaattaccagac
ggtactaagcctgctatacgcccagatgtttttgctgatccgcttcattctaaaccgtta
gttgttaattatggggatagcattcgtattgttatcggtactaacgccggcgtgcttcat
atgtttgaagataaaggcgattctgtcgatgaaaactgggcttttatgccgaaagagttt
tttaagaatattaagccactaagacagaattactcaacagctgaaaaaatttatggtgta
gacggtaatattacttcatatacgcaagataaaaatggtgatggcatcatcaatggtacg
gataaagtgtggatattttttggcttacgtcgcggtggtagttcatattatgcattagat
ataagtgatccaagtgctcctagtaaactttggcatatcgatgcttcgtcaacaggtttt
ggtgaattagggcaatcttggtctcaacccaaactcggttattcgaaggtaaatgttatc
ggctctggtgcaagtgctgtagctgcacccgtattattcttcggtggtggttacgatgca
gctaaagatacaaaagctcctggaactccggattcaaaagggcgtgctatttatatggta
gatgctggtactggtgctctgaaatggagtttagcacctggaaatgcaaatacaactttt
agtggaactgacagtataccatctagtattggtatacttgatagtgacggtgatggttta
actgacaggctttacacaggcgatactggtggtaacgtttggcgtgttgatatgccaagc
gctgatcccgttgacaccgaagccccatggacagtgtttaaattggcagagttaggtgga
aatacaaatactacagacttacggttttttaacgagccgtctatcgtgcggacctttatc
agtgaaactattgaagaaaacgtaaccgatataaatggtaaaacaactactattgtcagt
catcaagagaagccttatgacgctgtgcttattggtagtggagacagatctaacccatta
ggtatcgatacaagtgacacattttttatgattaaggatgaacatattaagactaagtct
ttttatagttcagtcgaaccaaaggccccattagccctcttaaaaagtgatttgtataac
tatacagataacccttttgataaaacacttactactcaagagcgtgataaattatctatt
gcagtgagtaataagtcgggttggtttatggaccttaaaggctcaggagaaaagagtacc
gcagaggccattgtcattaatggcgtcgcttttttcacgacatttattccacctaactta
gacccaactattgtccgttgtgaacaacctaacggcaccggactactatatgcagttgac
cttgctttaggtactgccgtatataattggaagacaaataatggaacaggaacaggaaca
ggcgaaggtccacctgatgatgctaaaagaagtatagtgattagcgagcaatttttaggt
gcgccaacgttaattgtcgtaccagatgctaaaggggagacagttggtaatattattgtt
ggaagaaaggttgtaaataccccttttacgctacaaacgatgagaacttatttgtacatt
aaagaggagcaataa
DBGET
integrated database retrieval system