Cognaticolwellia beringensis: B5D82_15950
Help
Entry
B5D82_15950 CDS
T05628
Name
(GenBank) alpha-amylase
Organism
cber
Cognaticolwellia beringensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Malt_amylase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP49125
UniProt:
A0A222GB44
LinkDB
All DBs
Position
complement(3788976..3790835)
Genome browser
AA seq
619 aa
AA seq
DB search
MLKNNKVCALLLSTFATLIFAGCGSDKISADTHVEPASVAEVQVKSGQTNTTKQYTTAAD
LPHYLERDVQEEVFYFVMPDRFNNGNIDNDLGSKTQPISAGGFDKTNKGMFHGGDIQGLK
DKLPYLKELGISAIWLTPILRNQAMQADSSGYHGYWVLDFTEIDPHLGSNDDLKDLINSA
HAENIKIYFDIITNHTADVIKYVECHGEDGLQWLVKSDKGCPFKSVEQVASGDNYTTVIP
KGHEQLKTPAWLNDPKYYHNQGDSFWQGESSKRGDFAGLDDIDTNNPEVLAGMIDIFKNL
ITEFKPDGFRIDTVKHVNTDFWADFAPALVNHAQSLGINNFFMFGEVYSFSSKELSEYTT
VGNMQSVLDFGFQGAMVESLIEQKGTSSLATLFANDIDYLDHDSNANQLMNFTGNHDMGR
FAYMLKKSEFNYSEEQMVKRTLLAHAMTYFMRGVPIIYYGDEQGFVGDGGDQASRQDMMP
SLVASYNDDDLLATDATTADDNFDTTHPIYQSFAQYADVFYQYPALRRGEQKTVYQADDN
AIFAITRTLAADNEGTSPAETSSEMLIAFNTSDKPAKASIALEGESYRLVMGKNKLIQSS
KDTHTIEIPALSFAIYEKQ
NT seq
1860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaaaaataacaaagtatgcgcattactattatcgaccttcgctacattgattttc
gccggttgtggcagtgataaaataagcgcagatacacacgttgagcctgcatcagttgca
gaggtacaggtaaaatctgggcaaactaacacgacaaagcaatatacaaccgcagcagat
ctaccgcattaccttgagcgcgatgtgcaagaagaagtgttttattttgttatgccagat
cgctttaataatggcaatatcgataatgacttaggttcaaaaacccaacctatttctgct
ggcggatttgataaaaccaataaaggcatgtttcatggcggtgatattcaagggttaaaa
gataaactaccttatttaaaagaactgggcatttctgccatttggttaacgcctatttta
cgcaaccaagccatgcaagccgacagttcaggctatcacggctactgggtattagatttt
actgaaattgatccacacttgggcagtaacgacgatttaaaagatcttatcaacagtgct
cacgctgaaaacattaaaatctatttcgatattattacaaaccacactgccgatgttatt
aagtacgttgaatgtcatggtgaagatggtctccagtggctagttaaatctgataaaggt
tgcccatttaaatcagtagagcaagtagcgagtggcgataattacactaccgtaatccca
aagggtcacgagcaattaaaaacgccagcttggttaaacgatccaaagtattaccataat
caaggcgactctttctggcaaggcgaaagctcaaaacgtggtgatttcgctggacttgac
gatatcgacaccaacaaccctgaagtacttgccggtatgatcgatatctttaaaaacctg
atcactgaatttaagcctgacggctttcgcattgatactgttaagcatgtaaatactgat
ttttgggctgattttgctccagcgttagttaatcacgcgcaaagtcttggcattaataat
ttcttcatgtttggtgaagtttatagttttagcagcaaagagcttagcgaatataccact
gtcggtaatatgcaatcagtattagattttggctttcaaggtgctatggtagaaagctta
atagaacaaaaaggcacgagctcgttagcgacactttttgccaacgatattgactacctt
gaccatgacagtaacgctaatcagttgatgaactttacaggtaatcatgacatgggtcgc
ttcgcttatatgttgaaaaaaagcgagtttaattacagtgaagagcaaatggttaaacga
actttactggcgcacgccatgacttattttatgcgtggtgtacctattatttattacggt
gacgaacaaggttttgtcggggatggcggtgaccaagcgtctcgacaagatatgatgccc
tcattggttgctagttataatgacgatgacttattagctactgacgctaccaccgctgac
gataactttgatactacgcaccctatttaccaaagtttcgcgcaatacgctgatgttttt
tatcaatatccggcactgcgtcgaggtgagcaaaaaacggtatatcaagccgatgataat
gctatttttgccattactcgtactttagctgctgataatgaaggtacaagtccagctgag
acaagctcagaaatgttaatcgcttttaatacttctgataaaccagcaaaagccagtatt
gctctggaaggtgaaagctatcgactagttatgggtaaaaacaaactaatacaatcgagc
aaagatactcataccattgagattccagcacttagtttcgctatatatgaaaaacaatga
DBGET
integrated database retrieval system
