Cognaticolwellia beringensis: B5D82_16815
Help
Entry
B5D82_16815 CDS
T05628
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
cber
Cognaticolwellia beringensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cber00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cber02000
]
B5D82_16815
Transporters [BR:
cber02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B5D82_16815
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
OMP_b-brl
OmpA_membrane
TSP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP49285
UniProt:
A0A222GBL6
LinkDB
All DBs
Position
3996171..3997304
Genome browser
AA seq
377 aa
AA seq
DB search
MVVLSSKRQFMALVLLVAMSFSSQAEKDCKVLEGDYCWYVSGALGLTLLEPYENNSGWQT
FDDKDKGYKLYGGFVFNEHWFAELSYSNLGEALFRHKNPGINDTLKVEYSGVAAQAGYWL
MPVNNDWNAFVRAGLAKMDSSSNLEREHEQLNNFQVVFSAGIQWRFIDQWMTRLEIDSYD
KDSLFIGLSISRFFGESEAKRTVTRTQPKTNPNLSPTPKALLTNPATVVTRTENPDKDGD
GILNTADQCPDSVKGLVVNERGCPVPFNITIQFASNSSGVDAKIQQEIDSLAAQLRLYRN
AKVTLEGHTDWRGKQAQNQPLSLARAQTLAYALMQATGLPESAFTVVGHGELKPVDTNNT
EAGRFNNRRVEINIEGN
NT seq
1134 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtagtactcagcagtaaacgccagtttatggcgttagttttattagtggcgatgagt
ttctctagtcaagctgaaaaggattgtaaggtactagaaggtgactattgttggtatgtg
tctggtgctttaggtttgactttgcttgaaccttacgaaaataattctggttggcaaacg
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gatgcaaaaattcagcaagaaattgactcattggctgctcaattgcgtttatacagaaat
gcaaaagttacgcttgaaggtcacactgattggcgaggaaaacaagcccaaaatcaaccg
ttgtcgctagcacgagcacaaactttagcttatgcgctaatgcaagcaaccggtctccct
gagtctgcctttacggtagtaggtcatggtgaacttaaacctgttgataccaataacact
gaagcaggaagatttaacaatcgtcgggtagaaattaatattgaagggaattaa
DBGET
integrated database retrieval system