Cognaticolwellia beringensis: B5D82_18730
Help
Entry
B5D82_18730 CDS
T05628
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
cber
Cognaticolwellia beringensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cber00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cber02000
]
B5D82_18730
Transporters [BR:
cber02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B5D82_18730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP49618
UniProt:
A0A222GCL3
LinkDB
All DBs
Position
complement(4444500..4447337)
Genome browser
AA seq
945 aa
AA seq
DB search
MREFTKIKKAISLAILGSIITMPALAFEEQETSEVERISVTGSRILREGAIAPSPVTVIS
GADLLNTGAINIGEALNELPALANTYSLANSGRFIGTAGLNILDLRNMGTDRTLVLVDGK
RHVSSAAGSASVDTNTIPSSWVERVEIITGGASAVYGADAVTGVVNFILKKNIEGLDVSA
TKGFSEEGPYKNSKYTFSYGQNFGNDRGNAAFAVEYVEQNRFSSLDREQLRTPYTDLRNP
NQTEENKDSLDFPDKIYTPNAGHYFINNAGVFSAGNDIYSFNRDGTPRKVFVGDNVDGIR
CADCDVFNLGQFTDIQPKFDRLNLNFKVNYDVTDDHNVYFSAKYAKVEAEDQGQPAFGFF
NSLNRIKRDNAFVGAELGQLMDDNGLVSISPNRMLTDLGVRIEEDERETKRFVVGAEGYL
SDDWSYDVSAVYGVTDHTRVNLNNLIRANYANALDSVIDTNGNAVCRSAEARADGCVAVD
ILGFGAPSQAAADYINTTSVGSSKIEQTVVGGSVSNGALFDMPAGPVGFAAGLEYRKEES
VTEEPENAIGTFFNALGEDKGSFNVREAFVELSVPLLTDLPLMEDLRIETAARFADYSTI
GNATSWKAGLDWTVGYGLRIRSTYSEALRAPNIGEIFGAASETFFNVDDACRQENLDDLA
NKTTRASNCAALGIPVDFNSDYDSASIRGSQSGNKDIREEKSESTTIGFVYQPEFLEGAS
LTVDYWKIELTDAISSTGAQDIIDRCVDSETGIDNQYCNLITRDASTHEITLLQRSVLNL
AGQEAAGIDFELGYDFELAGGNLKSTLIGTYLKERKTYPFQDDPSDFTENAGTTGESKWQ
ANLLIGYTNGNWNGTWKTRYLQDVSLYTEQELEDNPNPSSLMSFPSYVVSDLTVGYNFDN
GLSLKAGVDNLFNKDLPIGTSGTGSGSAGYDNIGRFYYTQISFSM
NT seq
2838 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagaatttacaaaaattaaaaaagctatttctctagctattttgggcagcataatt
actatgcctgctttagcttttgaagagcaagaaaccagcgaagtagagcgcatttcagtt
acgggttcacgtattttacgtgaaggtgctattgcaccatcacctgtaactgtaattagt
ggtgcagatttactgaataccggtgctattaacattggtgaagcattaaatgaactacca
gcattagcaaatacttattcactcgctaactctgggcggtttattggtactgcaggttta
aatattttagatctacgtaacatggggactgaccgtacattagttttagttgatggtaaa
cgccacgtatctagtgctgcaggttcagcttctgttgataccaacactattccaagttca
tgggtagagcgtgtggaaattattactggcggtgcatctgctgtatacggcgcggatgca
gtaacaggtgtagttaactttattttaaagaaaaacattgaaggtttagacgtaagtgct
actaaagggttttctgaagaaggtccatacaaaaactcaaagtatacgttctcttatggc
caaaactttggtaatgaccggggtaatgctgcatttgcagttgaatatgtagaacaaaat
cgattcagcagccttgatcgtgaacaattaagaacaccatatacagacttaagaaatcca
aatcaaacagaagaaaataaagactctctagattttccggataaaatttatacacctaat
gctgggcattattttattaataatgccggtgtctttagtgcaggtaatgatatatacagc
ttcaaccgtgacggtacgcctcgtaaagtgtttgtaggtgataatgttgatggtattaga
tgtgctgattgtgatgtatttaatttagggcagtttactgatattcaacctaaattcgat
cgtttgaacttaaattttaaagttaattatgatgttactgatgatcacaacgtttacttc
agtgcaaaatatgcaaaagttgaagcggaagatcaaggtcaaccggcttttggtttcttt
aatagtttaaataggataaaacgtgataatgcctttgttggtgctgaacttggtcaattg
atggatgataatggtttagttagtattagccctaaccgtatgttaactgatttgggcgtt
cgtatcgaagaagatgagcgtgaaactaaacgttttgttgtcggtgctgaaggctatctt
tctgacgattggagctatgatgtttcagccgtttatggggtcactgaccatacacgtgta
aatcttaataatcttattcgagcaaattatgctaatgcgttagactcagtaattgataca
aatggtaatgctgtttgtcgcagcgctgaagctcgtgctgatggatgtgtagccgtagat
attttaggttttggtgcaccatctcaagcggctgctgattatattaatacgacttcagtg
ggtagtagtaaaattgagcaaactgttgttggtggttcagtaagtaatggcgcattattt
gatatgccagctggcccagttggttttgctgcaggtttagagtatcgaaaagaagagagt
gtaactgaagagccagagaatgctataggtacattctttaatgctttgggtgaggacaaa
ggctcattcaatgtaagagaagcatttgttgagctatcagtaccactgttgacagactta
cctttaatggaagatttaaggatagagactgctgctcgttttgctgattatagcactatt
ggtaatgccactagttggaaagcaggccttgattggactgtaggttacggcttacgcatt
cgatcaacatactctgaagcactaagagcgccaaatattggcgaaatttttggtgcagca
agtgaaacattctttaatgtagatgatgcatgtagacaagaaaaccttgacgacttagca
aataaaacaacacgtgcaagtaactgtgctgctttaggcattcctgtagattttaattct
gattatgactcagcgtctattcgcggatcacagtctggtaataaagatataagagaagag
aaatcggaaagtacaacgattggttttgtctaccaaccagaattccttgaaggtgcgtct
ttaactgtcgattattggaaaattgaattaacagatgcaatttctagtacaggtgcgcag
gatattattgatcgttgtgtagattcagaaacaggtattgataatcaatattgtaatttg
atcacccgtgatgcatcaactcatgaaattactttactacaacgctcagtacttaactta
gctggtcaagaagctgctggtattgactttgaacttggttatgattttgaacttgcgggc
ggtaatcttaaaagtacgttaattggtacatatttgaaagaacgtaaaacttaccctttc
caagatgatccgagcgactttacggaaaatgctggtactactggtgaatctaagtggcaa
gctaacttattaattggttatacaaatggtaactggaacgggacatggaaaactcgttac
ttacaagatgtgagtttatatacagaacaagagttagaagataaccctaacccaagtagt
ttaatgagtttcccaagttatgttgtttctgatctgactgtaggttataactttgacaat
ggcctaagcttaaaagctggtgtggataatctatttaataaagacttgcctatcggcact
agcggaactggttcaggttcagctggctatgataatattggacgtttctactacacacaa
atctcattttcgatgtag
DBGET
integrated database retrieval system
