KEGG   Clostridium botulinum F Langeland: CLI_0511
Entry
CLI_0511          CDS       T00563                                 
Symbol
addB
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
  KO
K16899  ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
cbf  Clostridium botulinum F Langeland
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cbf00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:cbf03400]
    CLI_0511 (addB)
Enzymes [BR:cbf01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     CLI_0511 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:cbf03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     CLI_0511 (addB)
SSDB
Motif
Pfam: ADDB_N PDDEXK_1 ATPase_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABS41873
UniProt: A7GAI7
LinkDB
Position
519450..522902
AA seq 1150 aa
MSLRFIYGRAGSGKSQYCLNSIKNRIEEDIDRPLILLVPEQFSFQAEKNLIEVLDEKTGF
KTQVLSFKRMAYRVFNEVGGITAKHMNESGKSMLLYNIIEDNKNNLKVFKKAAKRQGFIT
TISDIITEFKRYNITPEIILNNLENIEGDNLKYKMEDLALIFSQFETRLHKNYIDNEDDL
TILVEKLNKSKQFDNAEIWIDEFSSFSPQEYSVLEKLLLKSYRINITLCTDYLNQGRFVD
TTDVFSPIKNTENKLLQIIEDNNIKLDKPIALKCDPCARFKNSAELQHLEKNMFSFPYKE
YKNETKDICMLKTLNQFTEIENTAKDIIKLCIDKGCRFKDIAVITGDLEGYENIISSVFL
QYNIPFFIDKKREINNNPIIVLILSALEVLSKNWTYESVFRYLKTGLLDINNEEMDILEN
YVLANGIKGYQWTNDKPWEHKSFSNYELEDQALKELLAKINDIRYKAMEPIVTLNKNFKS
IDKAKEFCEVLYEFLCNINLPDKIQNMIEDFKVEGEIEKASEYNQIWNIVMEVLDQIVEV
IGEEKISLKEFFKILQTGFSEYEIGLIPPTLDQVMVGSITRLRSHNINTLYIVGVNDGIF
PSPLKEEGILSDDDREFLGDKGLEIAKDTKSIAFEEQFLVYSTLTTPSKYLRLSYPIADG
EGKTLRPSIIISRIKKIFANICEENDIVKLNGEEEELKNISSAKPTFNYLISNLRKDVEG
VKIDNIWGDTYKWYLENEFWIEKLNRLIKGFDYTNQSKYIETKKIRNLYGKPLKISVSRV
EKFSQCPFAYFVQYGLKAKDRKIFNLSYPDLGIFMHSILEKFSHELEKKGLEWDTMDLNW
AEEEIDKLINEELDNKSLDILNSSKRYEYVTKSVKKILKRSIWLIGEHIKRGNFKPSYYE
LSFDIDGDYPPIAMELHSGEVINLIGRVDRVDLLQKDGATYLKIIDYKSGIKEFKLSDVY
YGLQLQLLIYLDAILTELAERSGINGEPGALLYLKLDDPIVKNTVDMSDEEIEKSIIKNL
KMKGLILNDPNVIRDMDNIISGISDIIPVMVKKDGGVSEGRSSVATKEEFETLRKYVRYT
IIEICEEMLEGNIEIKPYKKKDGSSCDYCIYSSVCKFDTNIRGNKYNILIDKKDEEVWDA
IKKKLEYKNI
NT seq 3453 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcttaagatttatatatggaagggctggcagtggaaaaagccaatattgtttaaat
agtataaaaaatagaatagaagaagatatagatagaccgcttatattattggtaccggaa
caattttcttttcaagcggaaaaaaatttaatagaagtattagatgaaaaaactgggttt
aagacacaggtattaagttttaaaagaatggcttatagggtctttaatgaagtgggaggt
ataactgccaaacatatgaatgaatccggtaaaagcatgcttttatacaatataattgaa
gataataaaaataatctaaaagtattcaaaaaagctgctaaaaggcaaggcttcattact
acaatttcagatattataacagaatttaagagatacaatataactcctgaaattatatta
aataatttagagaatattgaaggagataatttgaaatataaaatggaagatttagctttg
atattttctcagtttgaaacaagattacataaaaactatatagataatgaagatgattta
actatattggtggaaaaattaaataaaagtaagcaatttgataatgcagaaatatggata
gatgaattttcaagtttttctcctcaagagtattctgtattagaaaaattacttttaaaa
tcctatagaataaatataactttatgtacagattatttaaaccaaggcagatttgttgat
actacagatgtgttttctcctattaaaaatacagaaaataaattgctacaaataatagaa
gataacaatataaaattggataaacccatagcacttaagtgtgacccttgtgctaggttt
aagaatagtgcagaacttcagcatttagagaaaaatatgttttcttttccttataaagag
tataaaaatgaaacaaaagatatctgtatgcttaaaactttaaatcaatttacagaaata
gaaaacaccgcaaaggatattataaaactttgtatagataaaggttgtagatttaaggat
atagcagtaattacgggagatttagaaggatatgaaaatataataagttctgtatttttg
caatataatattccattttttatagataaaaaaagagaaataaataataatccaataata
gtattaatactttctgctctagaggttttatctaaaaattggacttatgaatcagtattt
agatatttaaaaactggacttttagatattaataatgaagagatggatattttagaaaac
tatgtgcttgctaacggtattaaaggatatcaatggactaatgataaaccttgggaacat
aaatcctttagcaattatgaattagaagatcaggctctaaaagagctactagctaaaata
aatgatataagatataaagctatggaacctattgtaactcttaataaaaatttcaaaagt
atagataaagcaaaagaattttgtgaagtattatatgaatttttatgtaacataaatcta
ccagataaaatacagaatatgatagaagattttaaagtagagggtgaaatagaaaaagct
agtgagtacaatcaaatatggaatatagttatggaagttttagatcaaatagtggaggtt
ataggtgaagaaaaaatatccttaaaagaattctttaagatacttcaaacaggattttca
gaatatgaaatagggcttattccacctaccttagatcaagtaatggtgggaagtataaca
agacttagaagtcacaatataaatacattgtatatagtaggggtaaatgatggcatattt
ccatcaccattaaaggaggaaggaattttaagtgatgatgatagagagtttttaggagat
aagggcttagaaatagctaaggacactaaaagtatagcctttgaggagcaatttttagta
tattctacattaactactccaagtaaatatttgagattgagttatcctatagcagatgga
gagggaaaaactttaagaccatctataatcatatcaaggataaagaaaatatttgctaat
atatgtgaagaaaatgatatagtaaaactcaatggtgaagaagaagaactaaaaaacata
tcctctgcaaaaccaacttttaattatctgatatctaatttaagaaaggatgtagagggg
gtaaaaatagataacatatggggagacacttataaatggtacttggaaaatgaattttgg
attgaaaaattaaatagattaataaaaggatttgattatacaaatcaaagtaaatatata
gaaacaaaaaaaataaggaatttatatggcaaaccattgaaaataagtgtatctagagta
gagaaattttctcaatgtccctttgcttattttgtacaatatggattaaaggctaaggat
agaaaaatatttaatttaagttatccagatctagggatatttatgcatagcatattagaa
aaattttcacatgaattagaaaaaaaagggctagagtgggatactatggacttaaattgg
gcagaagaagaaattgataagttaattaatgaggaattggataataaatctttagacata
ttaaatagttcaaaacggtatgaatatgtaacaaaaagtgttaagaaaattttaaaaaga
tctatatggcttataggagaacatataaaaagaggaaattttaaaccaagttattatgaa
ctatcctttgatatagatggagattatcctcctatagcgatggaacttcactctggagaa
gttataaatttaataggtagagtagatagggtagaccttttgcaaaaagatggagctact
tacttaaaaataatagattataaatctggtataaaggaatttaaattatcggatgtttat
tatggattacaattgcaacttttaatatatttagatgctatacttacagaattagcagaa
agatctgggataaacggagaaccaggagcacttttatatttaaaattagatgatcctata
gtaaaaaatactgtagatatgagtgatgaagaaattgaaaaaagtataataaaaaattta
aagatgaagggcttaattttaaatgaccctaatgttataagagatatggataatataata
tctggtatatcagatattatacctgttatggttaaaaaggatggaggagtatcagaaggt
agatcctctgtagctacaaaagaagagtttgaaacattaagaaaatatgtaagatataca
ataattgaaatttgcgaggaaatgttagagggaaatatagaaataaaaccatataaaaag
aaggatggatcttcttgtgactattgcatatattcttcagtttgtaaattcgatacaaat
ataaggggaaataaatataatatattaatagataaaaaagatgaagaagtatgggatgct
attaaaaagaaattagaatataaaaatatttaa

DBGET integrated database retrieval system