Clostridium botulinum A Hall: CLC_0415
Help
Entry
CLC_0415 CDS
T00575
Name
(GenBank) putative diguanylate cyclase
Organism
cbh
Clostridium botulinum A Hall
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
CHASE4
HAMP
PAS_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABS36360
LinkDB
All DBs
Position
complement(405531..408209)
Genome browser
AA seq
892 aa
AA seq
DB search
MKLYKKSLAIILLIFLVSIIITSILSKTYIMKKFNNIEIKYNVYKTEHLLKLINKDIQNM
YNLNKDYAMWDDTYKFINDKNDNYIQTILKGSSIFKKFNIDLILFVNKNNDVVFEQYYNK
NKKLNKKDINYLSSIATSNIKNTHPIKGLTKFDDSLFLITSSPITDSLNSKTPNGAMIFI
KFLPKENINKIYGNNTNFQIIDFKNLYPVIYKKNNIFMIEHNDHLLESYGLIRDIFNNNT
FMLKLNINRDIYFTAKENIKFFIFVIFILGIFMSILLIKILNELVLKKVHSIEKTLNYVA
ETADLSVRLDTTGNDEITSLNKNFNNMFDMLETSKEKIIENHKKYNYLFSSVITNFSYNK
IIKNKDSDIVDFKVVEINNYFSELLNTDKENIIGENISSFIPSILNENPILIKSIKKISS
VGGKETLEEIYIEELRKWFSAVVYSMEVDYFALLLTDITENKKDKEKILGLAYYDSLTGL
SNRKKIIETINKTINNYENEKFAVLFIDLDHFKSINDTLGHDVGDYVLEKVSARFKMLLS
PKHKIGRLGGDEFIIVQNITSISDAEKLACKICTTLNHSIKYKEDDLFIGASIGISIYPE
DGKDTSTLMKNADAAMYAAKKNGGYKYEVYSRSMNERALDDLILENRLRRALEKNELLVY
FQPIYHLKTSKIIAMESLVRWKFDNKIISPNQFIPLAKNIGEIANIDNWVLNKACSQCNL
WQKQNNKPLYVSVNISFKQMKDKNFVDNVLNILRTTKLKPSYLCLEITEDEAMEDVDLSI
KTLEALKRHGIKISLDDFGTGYSSLSYVTKLPIDNIKIDKSIIKNIHKDNKSLQIVKSII
LMSKSLDINIIAEGVETIEQLEILQELGCDFIQGFYISEPLPIKTFQSKFIR
NT seq
2679 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaattatataaaaagtccttggccataatattattgatttttttagtatccataatt
attactagtattttatcaaaaacttatatcatgaaaaagtttaataacatagagattaaa
tataatgtatataaaactgagcacttattgaaattaataaataaagatattcaaaatatg
tataacttaaataaagattatgctatgtgggatgacacttataaatttataaatgataaa
aatgataattatatacaaactattttaaaaggaagtagcatttttaaaaaatttaatatt
gatttaatattatttgtaaataaaaataatgatgtagtatttgaacaatattataataaa
aataaaaaattaaataaaaaggatataaattatctttcttctattgctacttctaatata
aaaaatactcatcctattaaaggtttaacaaaatttgatgattcattatttttaataaca
tcttcacctattacagatagtttaaattctaaaacccctaatggtgccatgatatttatt
aaatttttgcccaaagaaaatattaataaaatttatggtaataatactaattttcaaatt
atagattttaaaaacttatatcctgttatttataaaaaaaataacatatttatgattgaa
cataatgatcatttacttgaaagctatggtctaataagagatatatttaataataatacc
tttatgttgaagctaaatataaatagagatatttactttactgcaaaagaaaatatcaaa
ttttttatatttgttatatttattttaggtatttttatgagtatacttcttataaaaatt
ttaaatgaattagtccttaaaaaagttcattcaatagaaaaaactttaaattatgtagct
gaaactgctgatttgtctgtacgattagatactacaggaaatgatgaaataacaagttta
aataaaaactttaacaatatgtttgatatgttagaaacatcaaaagaaaaaattatagaa
aatcacaaaaaatataattatcttttttctagtgttataactaacttctcctataacaaa
ataataaagaataaagattctgatattgtagactttaaagtagtagaaataaataactat
tttagtgaattattgaatacagataaggaaaatataattggagaaaatatatcttctttt
attccctctattttaaatgaaaatccaattttaataaaatccataaaaaaaatctcttct
gtagggggcaaagagactttggaagaaatttatatagaggagttaagaaaatggttttct
gcagtagtttatagtatggaggtagattattttgctttacttctaacagatataactgaa
aataaaaaggataaagaaaagattttaggactagcttattatgattctcttactggtctc
tcaaataggaaaaaaattatagaaactataaataaaactataaataactatgagaatgaa
aagtttgctgttttatttatagatttagatcatttcaagtctataaatgatactttaggt
catgatgtaggcgattacgttttggaaaaagtttctgctagatttaagatgttactaagc
cctaaacataaaattggtagactaggtggagatgaatttataattgtacaaaatataaca
tccatcagtgatgctgaaaaattagcttgtaaaatatgtacaactctaaatcattcaata
aaatataaagaagatgatttatttattggtgctagcattggtataagtatctatccggag
gatgggaaagatacttctacactaatgaaaaatgcagatgctgcaatgtatgcggccaaa
aaaaatggtggatacaaatatgaagtatattctagaagcatgaatgagagagccctagat
gatttaattctagaaaatagattaagacgtgccttagaaaaaaatgaattactagtatat
tttcagcctatttatcacctaaaaacatctaaaattatagcaatggaatctttagttaga
tggaaatttgataacaaaattataagtcctaatcaatttattccactagctaaaaatatt
ggcgaaatagctaatatagataattgggtactaaataaagcttgttctcagtgtaattta
tggcaaaagcaaaataataaacccttatatgtatctgtaaatatatcttttaaacaaatg
aaagataaaaattttgtagataatgttttaaatatacttagaactactaaattgaaacct
agttacttatgtctggaaataacagaggatgaagctatggaagatgtagacttaagtatt
aaaactttagaagcattaaaaagacatggaataaaaatatccttagatgattttggtact
ggttattcatccttaagttatgttaccaaattacctatagataatattaaaatagataaa
agtattataaaaaatattcataaagataataaaagtttacaaatagtaaaatctataata
cttatgtctaaaagtttagatataaatattattgcagaaggtgttgaaacaattgaacaa
ctagaaattcttcaagaactgggttgcgattttattcaaggtttttatatttctgaacca
ttacctataaaaacttttcaaagtaaatttatccgatga
DBGET
integrated database retrieval system