Clostridium botulinum A Hall: CLC_0620
Help
Entry
CLC_0620 CDS
T00575
Symbol
potCD
Name
(GenBank) spermidine/putrescine transport system permease protein PotC/spermidine/putrescine-binding periplasmic protein PotD
KO
K11069
spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein
K11070
spermidine/putrescine transport system permease protein
Organism
cbh
Clostridium botulinum A Hall
Pathway
cbh02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbh00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
CLC_0620 (potCD)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cbh02000
]
CLC_0620 (potCD)
Transporters [BR:
cbh02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Spermidine/putrescine transporter
CLC_0620 (potCD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_8
SBP_bac_1
SBP_bac_6
BPD_transp_1
SBP_bac_11
OST3_OST6
DUF4179
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABS38323
UniProt:
A5HZA8
LinkDB
All DBs
Position
635963..637804
Genome browser
AA seq
613 aa
AA seq
DB search
MKSNKGLLSKIYATLVYVFLYLPIFVLVVFSFNKSKLNATFTGFTLDWYKNLINNVQILE
ALKNSLIIAFISTFFAVIIGTLAAIGMYRYKFKGKRAMEGLLYIPVVIPEIVMGISMLAF
FSSLNLPAGLITLILAHITFCISYVIIVVRARLDGFDAALEEAAQDLGATPWQTLTKVTL
PVISPGIISGALLAFTLSLDDVIISFFAAGPDSNTLPLKIFSMVKFGVTPEINALSTVMM
VFTLSMVVIAEGIRRNMLKNKKVKKTLSFIVILLMVTGVGFTIFGNTAKTEKQVLNIFNW
SEFLPQSVIEQFEKEYNVKVNYSTFSSNEEMLAKLMGGNVPYDLVVTSDYAIEIMTKQKL
IQPIDKNNVPNLANIDKNVLDLAFDPKNTYSLPYMWGGNNIVIDKTKITKKITSFDDLWD
SEFKNSMVILDDPRVMIGLALQKNGYSINSKNPKELQKAKEDLIKLMPNVKAFDSESPKT
LLINGEASIGYVWGTEAYLAKLENPNLEVVLTKEGVIPQYDNFVIPKKAKNKKLAEEFIN
FIYKPEISAQVSEEFPYANPNKAAYPLMDKDKLNDIAVYPPREAVEGNELIKDVGETTKL
YDDIWTEIKNSKR
NT seq
1842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagcaataaaggtttattaagtaaaatatatgcaactttagtttatgttttttta
tatttgccaatctttgttttagtagtattttcttttaataagtctaaactaaatgctacc
tttacaggctttacactagattggtacaaaaatttaataaataatgttcaaatattagaa
gcattaaaaaacagcttaataatagcttttataagtacttttttcgcagtaattatagga
actttagctgctataggtatgtatagatataaatttaaggggaaaagggctatggaggga
ctgctttatatcccagtagttatccctgaaatagttatggggatatctatgcttgccttt
ttctcttcccttaatttgcctgcaggacttataactttaatacttgctcacataactttt
tgtatttcttacgttattatagtagttagagctagactagatgggtttgatgctgcacta
gaagaagcagctcaagatttaggtgctacaccttggcaaactttaacgaaggttacacta
cctgtaatatcaccaggaattatatcaggagcactgcttgcttttacactatctttagac
gatgttattataagtttttttgcggcaggaccagatagcaatactttaccacttaaaata
ttttctatggttaagtttggtgtaacccctgaaataaatgcactatccactgtgatgatg
gtatttactttaagtatggtagttatagctgaaggtataagaagaaatatgcttaaaaat
aaaaaagtaaaaaagacactatcctttatagtaatattattaatggttactggggttggc
tttactatttttggtaatacagctaaaacagaaaagcaagtgttaaatatatttaactgg
tcagaatttttaccacagtctgttattgaacagtttgaaaaagaatacaatgtaaaggta
aattattctactttttcctctaatgaagaaatgcttgcaaagttaatgggaggaaatgtg
ccctatgatttagtagttaccagtgattatgctattgaaataatgactaaacaaaaatta
attcaaccaatagacaaaaataatgttccaaacttagctaatatagataaaaatgtactt
gatttagcttttgatcctaaaaatacttatagcttaccttatatgtggggaggcaacaat
atagtaatagataagactaaaataactaaaaaaattacttcttttgatgatctgtgggac
agtgaatttaaaaattctatggtaattttggatgatccaagggtgatgataggattagct
ctacaaaagaatggatattctataaattcaaaaaatccaaaggaacttcaaaaggctaaa
gaggatttaataaaattgatgccaaatgtaaaagcatttgatagtgaatctccaaagact
ttacttataaatggagaagcttctataggatatgtatggggaacggaagcatatcttgct
aaacttgaaaatcctaatttagaagtagttttaacaaaagagggagtaattcctcaatat
gataactttgtaatacctaaaaaggctaaaaataaaaaattagcagaggaatttataaac
ttcatatataaacctgaaataagtgctcaagtgtctgaggaatttccttatgcaaatcca
aacaaggcagcataccctttaatggataaagataaattaaatgatatagctgtttatcca
ccaagagaagcggtagaaggaaatgagcttattaaggatgtaggggaaactacaaaatta
tacgatgacatatggactgaaattaaaaatagtaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
