Clostridium botulinum A Hall: CLC_1108
Help
Entry
CLC_1108 CDS
T00575
Name
(RefSeq) BNR/Asp-box repeat-containing protein
Organism
cbh
Clostridium botulinum A Hall
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
SdrD_B
TRAP_beta
CarboxypepD_reg
NPCBM_assoc
CarbopepD_reg_2
CARDB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5399726
NCBI-ProteinID:
YP_001386975
UniProt:
A5I0P9
LinkDB
All DBs
Position
1132856..1136017
Genome browser
AA seq
1053 aa
AA seq
DB search
MATISGRVVFDRDRSATINAGDSGIANVPVVLQNTATDVRLVVLTDTNGNYSFINVPNGD
YRIVQFFGTPGGVPTPGDFNNAVVGPVPVGTNPPISFASDPPPGSTNLDSLTPDTLLVTV
TGVDLTNENFLDGPVIYTPIQNILDPCVSVSNVNLINVADNGTFGLFPPGTPANTGAPVE
PYPGVTSDFTYVLPDPTKFTPIGGEYTVQNIMTNAMSNEIGAWWRIADHTTGNETGRMMV
VNGFNPGAIFFRDVVSVQPNTNYLFSSWILNLFKVIGYPNPELGVRILASNGDVLYSATL
WAQIPVNTNAPEWKQIGTVINSQNNTSLTVEFLSEGPEVIGNDYAIDDVALNEVQVPLFT
PVKTISTPVANVGETVTYTVTLENTCTSPLTNVFFKDNIPNGLLFVAGSVIVNGVSEGSF
DPNVGFTIPNIPGGSTATITFDAVVNAVPTPNPALNTATINYSYTPVEGGIENNFTVDSN
TVPLEVRAVVADVGVIKTGSPNPVMSGETLTYTIDVSNLGPGDAQNVVLTDTIPPEITGA
EFSTDGGVTFSPWPGSFNIGTLLNQETRTILIRGTVASVAPGFITNTAEVTSTTPDPNLS
NNTSTSVIEVNESTEEADVGVFKSVGLNPVPAGEVVVFPIRVSNFGPADAQNIVLTDTIP
PEITGAEFSEDGGSTFSPWTGSLVIETLLNGETRDILIRGTVSPTAAGIISNTATVTSTT
PDPNPSNNTSTVDVEVLAPVVADVSVVKTASPNPVMAGELLTYTINVTNFGPSSAENVVL
TDVISPEITGAEFSTNGGETFSPWPGSLNIGTLPASKTKTILIRGIVSPTATGIISNTAT
VTSTTPDPNPNNNTSTVEVEVIPVVLGEADVSVVKTASPNPVAPGEADVSVVKTASPNPV
APEEADVSVVKTAITKRVRPGDTVVYTIVVSNAGPAAAQNAVVTDTIPPEIIRPEVSING
GLTFSPWPGSFDIGTLPAGASITIIIRGKVVSSSTKCKCITTITNTAKVTSTTPDPNLNN
NTSTVTIKVCRCFKVCCKCCCCNKCKCDCKNEY
NT seq
3162 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacaatatcaggtagagttgtattcgaccgagatagaagtgctacaattaatgct
ggggattcaggtatagctaatgtacccgtggtattacaaaataccgctacagatgttaga
cttgtagttcttacagatactaatggaaattattcatttataaatgtcccaaatggtgat
tatagaattgtacaattctttggaacacctgggggcgttccaacaccaggagatttcaat
aacgcagtagttggacctgtcccagttggaacaaatcctccaataagctttgcgagcgat
cctccaccaggttcaactaatttagattctttaactccagatacacttctagtaactgtt
acaggagtagatttaacgaatgaaaatttccttgatggcccagttatatatacacctata
caaaatatactagatccatgtgtgtcagtttcaaatgtaaatcttattaatgttgctgat
aatggaacatttgggcttttccctccaggtactcctgctaatacgggtgctccagttgaa
ccttacccaggtgtaacctcagattttacctatgtattaccggatccaactaagtttaca
cctattggtggtgaatatacagtacaaaacattatgactaatgcaatgagtaatgaaata
ggtgcttggtggcgtattgcagaccatactacaggtaatgaaacaggaagaatgatggtg
gtaaatggttttaatccaggggctattttttttagagatgtagtttcagtacagcctaat
acaaactatttatttagttcttggattctaaatttatttaaagtaataggatatccaaat
cctgagctgggcgtacgaatacttgcttcaaatggtgatgtactatatagtgcaacattg
tgggctcagattcccgttaatacaaatgctccagaatggaaacaaataggtactgtaatc
aattcacaaaataacacaagcttaacggtagaatttttaagtgaaggtccagaggttatt
ggaaatgattatgctatagatgatgtagcattaaacgaagttcaggttcctctatttaca
cctgtaaaaactattagtacccctgttgcaaatgttggggaaacggtaacctatacagtg
acattagaaaatacttgtactagtcctttaacaaatgtattttttaaagataacatacca
aatggattattatttgtggctggtagcgtaatagttaatggagtatcagagggatcattc
gatcctaatgttggattcactataccgaatattccaggaggctctactgctactataact
tttgatgctgtagttaacgctgttccaacccctaatccagctcttaatacagcaacaata
aactattcttatacacctgtagaaggaggaatagaaaataattttactgttgattccaat
actgtaccacttgaagttagggctgtagtagcagatgttggagttataaaaacaggaagt
ccaaacccagtaatgtcaggagagactttgacatatacaattgatgtatcaaatcttgga
ccaggagatgcccaaaatgttgttttaacagatactattccacctgaaataacaggagca
gaattctcaacggatggaggagtaacctttagtccatggccaggaagttttaatatagga
acattgttaaatcaggaaacaagaactattttaataagaggaacagtagcctcagtagct
ccaggtttcataactaatactgcagaggtaacatcaacaacaccagatcctaatctaagt
aataacacatcaacatcagttatagaagttaacgaatctacagaagaagcagatgttgga
gtttttaaatcagtaggactgaatccggtacctgcaggagaggtggtagtttttccgatt
agagtatcaaattttggaccagcagatgcccaaaatattgttttaacggatactatccca
cctgaaataacaggagcagaattctcagaagatggaggatcaacctttagtccatggaca
ggaagtcttgttatagaaacattattaaatggtgaaacaagagatattttaataagagga
acagtgtcaccaacagctgcagggattataagcaatactgcaactgtaacatcaacaaca
ccagatcctaatccaagcaataacacatcaacagtagatgtagaagttctcgctcctgta
gtagcagatgtttcagttgtaaaaacagcaagcccaaacccagtaatggctggagagctt
ttgacctatacaattaatgtaacaaactttgggccatcctctgctgaaaatgttgtttta
acggatgttatttcacctgaaataacaggagcagaattctcaacaaatggaggagaaacc
tttagtccatggccaggaagtcttaatataggaacattaccagctagtaaaacaaaaact
attttaataagaggaatagtttcaccaacagctacagggattataagtaatactgcaact
gtaacatcaacaacaccagatcctaatccaaataataacacatccacagtagaggtagaa
gttatcccggttgttttaggagaagcagatgtttcagttgtaaagacagcaagtccaaat
ccagtagcgccaggagaagcagatgtttcagttgtaaagacagcaagtccaaatccagta
gcgccagaagaagcagatgtttcagttgtaaaaacagcaatcacaaagcgagtaaggcca
ggagatacggtagtttatacaattgtagtgtccaatgcaggaccagcagctgcccaaaat
gctgtggtaacggatactattccacctgaaattataagaccagaagtttcaataaatgga
ggattaacatttagtccatggccaggaagttttgatataggaacattaccagccggagct
tcaataactataataataagaggtaaagtagtatcatcaagcacaaaatgtaaatgtata
actactataactaataccgcaaaagtaacttcgacaacaccagatccaaatctaaataat
aacacatcaactgttactataaaggtctgcagatgttttaaagtttgttgtaaatgttgt
tgctgtaataaatgtaaatgtgattgtaagaacgaatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
