Clostridium botulinum Ba4: CLJ_B0495
Help
Entry
CLJ_B0495 CDS
T00895
Symbol
addB
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
cbi
Clostridium botulinum Ba4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cbi03400
]
CLJ_B0495 (addB)
Enzymes [BR:
cbi01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CLJ_B0495 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cbi03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
CLJ_B0495 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACQ52452
UniProt:
A0A3F2ZXW4
LinkDB
All DBs
Position
510963..514406
Genome browser
AA seq
1147 aa
AA seq
DB search
MSLRFIYGRAGSGKSQYCLNSIKKRIEEDIDRPLILLVPEQFSFQAEKNLIEVLDEKTGF
KTQVLSFKRMAYRVFNEVGGITAKHMNESGKSMLLYNIIEDNKSNLKVFKKAAKRQGFIT
TISDIITEFKRYNITPEIILNNLENIEEDNLKYKMEDLALIFSQFETRLHKNYIDNEDDL
TILGEKLNKSKQFDNAEIWIDEFSSFSPQEYSVLEKLLLKSYRINITLCTDYLNQGGFVD
TTDVFSPIKNTENKLLQIIEDNNIKLDKPIALKCDPCSRFKNSIEFQHLEKNMFSFPYKE
YKNETKDICMLKTLNQFTEIENTAKDIIKLCRDKGCRFKDIAVITGDLEGYENIISSVFL
QYNIPFFIDKKREINNNPIIVLILSALEVLSKNWTYESVFRYLKTGLLDINNEEMDILEN
YVLANGIKGYQWTNDRFWEHKSFSNYGLEDQVEKELLAKINDIRYKAMEPIVSLNKNFKS
IDRAKEFCEVLYEFLCSINLPDKIQSMIEDFRAEGEVEKASEYNQIWNIVMEVLDQIVEV
IGEEKVSLKEFFKILQTGFSEYEIGLIPPTLDQVIVGSITRLRSHNINILYIVGVNDGIF
PAPLKEEGILSDADREFLSDKGLEIAKDTKSIAFEEQFLVYSTLTTPSKYLRLSYPIADG
EGKTLRPSIIISRIKKIFTNICEENDIVKLNGEEEELKNISSAKPTFNYLISNLRKDVEG
VKIDNIWGDTYKWYLENEFWIEKLNRLIKGFDYTNQSKYIETKKIRNLYGKPLKMSVSRV
EKFSQCPFAYFVQYGLKAKDRKIFNLSYPDLGILMHGVLEKFSQKLEKQGLEWDTMDLNW
AEEEIDKLINEELDNKSLDILNSSKRYEYVTKSVKKILRRSIWLIGEHIKRGNFKPSYYE
LSFDIDGDYPPIAMELHSGEVVNLIGRVDRVDLLQKDGATYLKIIDYKSGIKEFKLSDVY
YGLQLQLLIYLDAILTELAERSEINGEPGALLYLKLDDPIVKNTVDMSDKEIEKSIIKNL
KMKGLILNDPNVIRDMDNIISGISDIIPVMLKKDGEVSEGRSSVATKEEFETLRKYVRYT
IIEICEEMLEGNIEIKPYKKKDGSSCDYCIYSSVCKFDTEIRGNKYNILIDKKDEEVWEA
IKKKLEC
NT seq
3444 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttaagatttatatatggaagggctggcagtggaaaaagtcaatattgtttaaat
agtataaaaaagagaatagaagaagatatagatagaccacttatattattggtaccagaa
caattttcttttcaagcggaaaaaaatttaatagaagtattagatgaaaaaactggattt
aagacacaggtattaagttttaaaagaatggcttatagggtctttaatgaagtgggaggt
ataactgccaaacatatgaatgaatccggtaaaagtatgcttttatacaatataattgaa
gataataaaagtaatctaaaagtattcaaaaaagctgctaaaaggcaagggttcattact
acaatttcagatattataacagaatttaagagatataatataactcctgaaattatatta
aataatttagagaatattgaagaagataatttgaaatataaaatggaagatttagctttg
atattttctcagtttgaaacaagattacataaaaattatatagataatgaagatgattta
actatattgggggaaaaattaaataaaagtaagcaatttgataatgcagaaatatggata
gatgaattttcaagtttttctcctcaagagtattctgtattagaaaaattacttttaaaa
tcctatagaataaatataactttatgtacagattatttaaatcaaggcggatttgttgat
actacagatgtgttttctcctattaaaaatacagaaaataaattgctacaaataatagaa
gataataatataaaattggataaacccatagcacttaagtgtgacccttgttctaggttt
aagaatagtatagaatttcagcatttagagaaaaatatgttttcttttccttataaagag
tataaaaatgaaacaaaagatatctgtatgcttaaaactttaaatcaatttacagaaata
gaaaataccgcaaaggatattataaaactttgtagagataaaggttgtagatttaaggat
atagcagtaattacgggagatttggaaggatatgaaaatataataagttctgtatttttg
caatataatattccattttttatagataaaaaaagagaaataaataataatccaataata
gtattaatactttctgctctagaggttttatctaaaaattggacttatgaatcagtattc
agatatttaaaaactggacttttggatattaataatgaagaaatggatattttagaaaac
tatgtgcttgctaacggtattaaaggatatcaatggactaatgataggttttgggaacat
aaatcctttagcaattatggattagaagatcaggtcgaaaaagagctactagctaaaata
aatgatataagatataaagctatggaacccattgtatcccttaataaaaattttaaaagt
atagatagagcaaaagagttttgtgaagtattatatgaatttttatgtagtataaatcta
ccagataaaatacagagcatgatagaagattttagagcagagggtgaagtagaaaaagct
agtgaatacaatcaaatatggaatatagttatggaagttttagatcaaatagtggaggtt
ataggtgaagaaaaagtatctttaaaagaattttttaagatacttcaaacaggattctca
gaatatgaaataggacttattccacctacattagatcaagtaatagtgggaagtataaca
agacttagaagccacaatataaatatattgtatatagtaggggtaaatgatggtatattt
ccagcaccattaaaggaagaaggaattttaagtgatgctgatagagaatttctatcagat
aagggcctagaaatagctaaggacactaaaagtatagcctttgaggagcaatttttagta
tattccacattaacgactccaagtaaatatttaagattaagctatcctatagcagatgga
gagggaaaaactttaagaccatctataattatatcaaggataaagaaaatatttactaat
atatgtgaagaaaatgatatagtgaaactcaatggtgaagaagaggaactaaaaaatata
tcctctgcaaaaccaacctttaattatctaatatctaatttaagaaaggacgtagagggg
gtaaaaatagataacatatggggagatacttataaatggtacttggaaaatgaattttgg
attgaaaaattaaatagattaataaaaggttttgattatacaaatcaaagtaaatatata
gaaacaaaaaaaataagaaatttatatggtaaaccattgaaaatgagtgtatctagggta
gaaaaattttctcaatgtccctttgcttattttgtacaatatggattaaaggctaaagat
agaaagatatttaatctaagctatccggatttaggaatattaatgcatggtgtattagaa
aagttttcacagaaattagaaaagcaagggctagagtgggatactatggatttaaattgg
gcagaagaagaaattgataagttaattaatgaggaattggataataaatctttagacata
ttaaatagttcaaaaagatatgaatatgtaaccaaaagtgtaaaaaagattttaagaaga
tctatatggcttataggagaacatataaaaagaggaaattttaaaccaagttattatgaa
ctatcttttgatatagatggagattatcctcctatagcaatggaacttcactctggagaa
gttgtaaatttaataggtagagtagatagagtagaccttttgcaaaaagatggagctact
tacttaaaaataatagattataaatctggtataaaggagtttaaattatctgatgtttat
tatggattacaattgcaacttttaatatatttagatgctatacttacagaattagcagaa
agatctgagataaacggagaaccaggagcccttttatatttaaaattagatgatcctata
gtaaaaaatactgtagatatgagtgataaggaaattgaaaaaagtataataaaaaatttg
aaaatgaagggtttaatcttaaatgaccctaatgttataagagatatggataatataata
tctggtatatcagatattatacccgttatgcttaaaaaggatggagaggtatcagaaggc
agatcctcagtagctacaaaagaggagtttgaaacattaagaaaatatgtaagatataca
ataattgaaatttgcgaggaaatgttagagggaaatatagaaataaaaccatataaaaag
aaggatggatcttcttgtgattattgtatatattcttcagtttgtaaatttgatacagaa
ataagaggaaacaaatataatatattaatagataaaaaagatgaagaagtatgggaggct
attaagaaaaaattagaatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system