Clostridium botulinum B Eklund 17B (NRP): CLL_A2990
Help
Entry
CLL_A2990 CDS
T00696
Symbol
sbcC
Name
(GenBank) exonuclease SbcCD, C subunit
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
cbk
Clostridium botulinum B Eklund 17B (NRP)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbk00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cbk03400
]
CLL_A2990 (sbcC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cbk03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
CLL_A2990 (sbcC)
Archaeal homologous recombinant proteins
CLL_A2990 (sbcC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SbcC_Walker_B
AAA_29
AAA_27
SMC_N
CENP-F_leu_zip
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD23233
UniProt:
B2TPL9
LinkDB
All DBs
Position
complement(3081604..3085137)
Genome browser
AA seq
1177 aa
AA seq
DB search
MRPIELRVKGLNSFIEEQKIDFNKLTERGFFGIFGPTGSGKSTILDGITLALYGQVSRKS
SNYINTNCDSLNVSFKFQISGIEKKIYVVSREFKRDNKTGNPRTSKAKIIDKTNEIEEVL
ADKAQKVTEKCEEIIGLGLEDFTRTVVLPQGKFSEFLKLEGKSRREMLERLFNLQKYGNI
LSVKLSREISKEKTESNLITGELKGYDEISSEKLNLKNEELECARNQLSNANNELKEIEK
KYKSSEEIWNLQFELNSYKEKEKVLNYKSSEIEEDKIKLKLAEAALKVNPYVLAYENTLN
EGNETQKEKERLEINFKKLKVEKENSEKKLLEITEKKDKEIPELKLREQKINDVIEEKNK
LDVLDKEIEEISSKVQVLREKYKKEKNNSLIIEDSIKNTTINIKELEEKFESLKIDDELK
AKIQDGLLITEKYNLFKKSISNNKNKLTNINKEIENLKVNFYELQKIYKVKSNSLNKNKD
ELENLIKYCPGNQEDLLILQKNLTNCNEKWEKFNQYSDEIKKSKLLTEELEELLKKDKDK
KSSIDNELLDLKEKYKKCEIENLAFKIRMNLKNGEACPVCGSLEHGTKSKSKLIDDGIVN
QLNNKINDYEINLKVLEQDITIYNTKINSEEEKITEKNLQIENLGEEFKNVVPKDLENQF
NRLKKDLENYNSKKEMLENTLIQLKEENHKLENDSERISTLIKEKETQVNVINEELAIDI
EELNNTKGKLNIIIRETNVSDFNKKSEEIVNIEKEREILSKKIKEFRINLETLIKEKDKL
QENLNLITEEGTDARTSLNEKNKNREEKIKIIKDKLEKEFNLIDDSNNIDENKLFMLLDS
IKKEIECIEKEFKSIHELKDIICIKYENCNEKFISIVAKENQIIKRCEIEKENLNKNLKS
ENFESIEEVKANIIGFNDIEILKAKIEKYKEDLSKIKGAIENSVKKLNNREVTEQQWIII
QNSVKEKKLEFESLNEMKIKLEEECKFIDNKLKELKDLLIKKEKIDHKLALLDDLDKLFK
GKKFVEFVAITQLKYISMEASKKLKEITNGTYGLEVDENGKFIIRDYKNGGAERDASTLS
GGETFLTSLALALALSSQIQLKGTAPLELFFLDEGFGTLDDNLLEVVMGSLEKLHNDKLK
IGIISHVESIKNRVPVKLILTPAESGKGGSKVKIERS
NT seq
3534 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaccaattgaacttagggttaaaggattaaatagctttatagaagagcaaaagata
gattttaataagttgactgaaaggggattttttgggatctttggacctacaggtagtggg
aaatcaactattttagatggaataacattagctttatatggacaggtttcaagaaaaagc
tctaactatataaatactaattgtgattcattaaatgtaagttttaaatttcaaatatca
ggtatagaaaagaaaatatatgttgtaagtagagaatttaaacgtgataacaaaactggt
aatccaagaacttcaaaggctaaaataattgataaaactaatgaaatagaagaagtttta
gctgataaagctcaaaaagtaactgaaaaatgtgaagaaataataggtcttggattagag
gattttactagaacagttgtattaccacaaggtaaatttagtgaatttttaaaacttgaa
ggaaaaagtagaagagagatgcttgaaagattgtttaatcttcaaaagtatggaaatatt
ctttcggtaaaattatctagagaaataagtaaagaaaaaacagaaagtaatcttataact
ggagaattaaaaggttatgatgaaatcagtagtgaaaaacttaatttaaaaaatgaagaa
ctagaatgtgctagaaatcaattaagtaatgcaaataatgaattaaaagagatagagaaa
aaatataaatctagtgaggaaatttggaatttacaatttgaattaaactcttataaagaa
aaagaaaaagttttaaattataaatctagtgaaatagaagaagataaaattaagcttaaa
cttgcggaagctgcattaaaggttaatccatatgtattagcatatgaaaatactttaaat
gaaggcaatgagactcaaaaagaaaaagagagattagaaataaactttaaaaaactgaag
gttgaaaaagaaaattcagaaaaaaaattattagaaattacagaaaaaaaagataaagaa
ataccagaattaaaattaagagaacaaaaaataaatgacgtaatagaagaaaaaaataag
ttggatgttttagataaagaaatagaagaaatttcttcaaaggttcaagtattaagagaa
aaatataagaaagaaaagaataatagtttaattatagaggatagtattaaaaatacaact
attaatatcaaggaattggaagaaaaatttgaaagcttaaaaatagatgatgagttaaaa
gctaagattcaagatggtcttctaatcactgaaaaatataatttatttaaaaaaagtatt
agcaataataaaaataaattaactaatataaataaagaaatagaaaatttaaaagtgaat
ttttatgagttacaaaaaatatataaagtaaagtctaattcattaaataaaaacaaggat
gaattagaaaatttgattaaatactgtccaggtaatcaggaagatttattaatacttcaa
aaaaatctaactaactgtaatgaaaagtgggaaaaattcaatcaatattctgatgaaata
aaaaaatctaaattattaactgaagaattagaggaattattaaaaaaagataaagataaa
aaatctagtattgataatgaattattagacttaaaagaaaaatacaaaaaatgtgaaata
gaaaatttagcttttaaaataagaatgaatttaaaaaatggagaagcatgtccggtatgt
gggtcattagaacatggtacaaaaagcaaaagtaagttaatagatgatggtatagtaaat
caattaaataataaaattaatgattatgaaattaacttaaaagtattggaacaagatata
acaatatataatactaaaatcaactctgaggaagagaaaattacagaaaaaaatcttcaa
atagaaaatttaggagaagagtttaaaaacgtagtacctaaagacttagaaaatcaattt
aataggttgaaaaaagatttagaaaactataattcaaaaaaagaaatgttagaaaataca
cttatacaactaaaagaagagaatcataaattagaaaatgatagtgaaagaatatcaact
ctaataaaggaaaaagagacacaagtaaatgtgataaatgaagaattagctattgatata
gaagaacttaacaatacaaagggaaaattaaatattattataagagaaactaatgtaagt
gattttaataaaaagagtgaagagatagttaatatagaaaaagaaagagaaattttatca
aagaagataaaagaatttagaatcaatcttgaaactttaattaaagaaaaggataaactg
caagaaaatttaaatttaattactgaagaaggaacggatgcgcgtacatcattaaatgaa
aaaaataaaaatagagaagaaaaaataaaaataataaaagataagttagaaaaagaattt
aatttaattgatgattcaaacaatattgatgaaaacaagttgtttatgttattagattct
ataaaaaaagaaatagagtgtatagaaaaagaatttaaatcaattcatgaattgaaagac
ataatttgtattaaatatgaaaattgtaatgaaaaatttatttcaatagtagctaaggaa
aatcagattataaagagatgtgaaatagaaaaagaaaatttaaataaaaatttaaaaagt
gaaaattttgaatctatagaagaagtaaaagcaaatatcattggatttaatgatattgaa
atattaaaggcaaagatagaaaaatataaagaagatttatctaaaatcaaaggagcgata
gagaactcagttaaaaaattaaataatagagaagttacagaacaacaatggataatcatt
caaaatagtgtaaaagaaaagaaactagaatttgaatcattaaatgaaatgaaaattaaa
ttggaagaagaatgtaaatttatagacaataaacttaaagagcttaaggatttattaatt
aaaaaagaaaagattgatcataaattagctttgctagatgatttagataaattatttaaa
ggcaagaagtttgtagagtttgttgctattactcaattaaaatatatttcaatggaagca
tctaaaaaattaaaggaaataactaatggaacttatggattggaagtagatgaaaacgga
aaatttataataagagattataaaaatggaggtgctgaaagagatgcatctaccttatca
ggaggcgaaacatttttaacatcactagctttagcattagcgttatcatcacaaatacag
cttaagggaacagcaccattagaattgtttttcctagacgaaggatttggaacattggat
gataacttattagaagtagtaatgggctcactagaaaaattgcataatgataaattaaaa
ataggtataatcagtcatgttgagtctattaaaaatagagtgcctgtaaagttaatactt
actccagcagaatcaggaaaagggggtagtaaggtaaagattgaacgaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
