Clostridium botulinum A3 Loch Maree: CLK_1131
Help
Entry
CLK_1131 CDS
T00670
Name
(GenBank) helicase, SNF2/RAD54 family
Organism
cbl
Clostridium botulinum A3 Loch Maree
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
DEAD
SWI2_SNF2
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA56093
LinkDB
All DBs
Position
1914961..1918194
Genome browser
AA seq
1077 aa
AA seq
DB search
MNITSKGLRIAAGEKMYERGLKCYINNQVEYIEADDKNGDLNIRSGVRSSLGKDYYEVSI
KILRGSTYISSNCECKYWGIICKHSVATLIKYINEKDIILKESEKRRKREFIESIKENFL
KEVTIDTKPKDLCVSYKLCIDSAPNERYISLELKVGEDKLYVVKNVRELLKSIIKKQKMV
FGKNFIFNPYMHRFKEKDRKIIDMLLEVYEYDEIAKNINFANISSFLNGKKAYVSETMLK
NFFNIIDKDTIELKLDDENFKEISFIKEDLPLEFSLQREKDKLILRQRGCLPRIISKEYF
FLSDKIYEPSLEQINLYGEFIKGFTREDKIEISFDESFSDDIASYIIPSLKKVSKTLYIE
DGFKERFYQEKLISTVYFDRKDDKVTADIIFTYGDVKLNPFQYNNRLDHKILVRNIEGEK
AVTNLLERFSFKKGIECYELEEEEKLLDFLIEGIEMLQQYAEVYYSEVFKNIKVYNSSNY
KSNVRLNKEDLLEFSFSIEGVDKKELFNIFNAVKQRKKYYRLKNGGFIPLNNNEILNMGS
IIDYLNIKASDFKKDVITLPKFNAVYIDNSLKEKEIDFVGRNKKFKELVNSIRDIKDIDY
DVPKSLQSIMRPYQRFGFKWFKTLASCGFGGILADEMGLGKTLQTIAFIKSEVEENKNKP
MPSLVVCPTSLVYNWEDEIKKFQPDLKCTLISGDKESREESIKAIDTSDIVITSYALIRR
DIDKYEKAKFRYCFLDEAQNIKNPQSLNAQSVKSIKANNYFALTGTPVENSLTELWSIFD
FIMPGYLLNYRRFYAKYESPIVKDKNEEALKELNNHIKPFILRRLKKHVIKELPPKIEHN
IVVNMTEEQKKVYASFAESAKKEFYKEIRERGFNKSKIKILSIITRLRQICCDPSTFIEN
YEGSNGKTETLLDIVNSSINAGHKILLFSQFTSVLKNIAEVFKANNINYLYLDGSTKADV
RGNLVKDFNNGKGDIFLISLKAGGTGLNLTSADIVIHFDPWWNPAVEDQASDRAHRIGQK
KTVEIIRLIAKGTIEEKIYKIQQKKKEIIDKVIDKNLGEEILLSNMAEYEVEELFKF
NT seq
3234 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatattaccagtaaaggccttagaatagccgcaggagaaaaaatgtatgaaagagga
ttaaaatgttatatcaataatcaagtagaatatatagaagctgatgataaaaatggtgat
ttaaatattagatctggagtaagatcttctttaggtaaggattattatgaggtatctata
aagattttaagaggcagtacctatataagtagtaattgtgaatgcaaatattggggaata
atttgcaagcattctgtagctacacttattaaatatataaatgaaaaggatataatttta
aaagaaagcgaaaagagaaggaaaagagaatttatagagagcataaaggaaaatttttta
aaagaagtaactatagatacaaagccaaaagatttatgtgtaagctataaactatgtata
gacagtgccccgaatgaaagatatatatcattagaacttaaagtaggtgaggataagctt
tatgtagtaaaaaatgtgagagaacttttaaagtctattataaaaaagcagaaaatggtt
tttgggaaaaatttcatttttaatccatatatgcatagatttaaagaaaaagataggaag
ataattgatatgctattggaggtatatgagtatgatgaaattgcaaaaaatataaatttt
gctaatataagttcatttttaaatggtaaaaaggcttatgtttcagaaactatgcttaaa
aatttttttaatataatagataaggataccatagaactaaaattagatgatgaaaacttt
aaagagatttcctttataaaggaggatttacctttagagtttagccttcaaagagaaaag
gataaattaattttaagacaaaggggatgtttgccccgtattatttccaaagaatacttt
tttttaagcgataaaatttatgagccttccttagaacaaattaatttatatggagagttt
attaaaggttttactagagaagacaaaatagagataagttttgatgaaagttttagcgat
gatatagcctcttatataattccatctttaaagaaagtaagtaaaactttatatattgaa
gacggatttaaagaaagattttaccaggagaaattaataagtactgtttattttgataga
aaagatgataaagtaacagcagatataatatttacctatggtgatgttaaactaaaccct
tttcaatataataatagattagaccataaaattctagttagaaatatagaaggagaaaaa
gcggttactaatttattagaaagattttcttttaaaaaggggattgagtgttatgaactt
gaagaagaagaaaaacttttagattttttaatagaaggtatagaaatgcttcaacaatat
gcagaagtatattattcagaagtgtttaagaacataaaagtatataattcttctaattat
aaatccaatgtgagacttaataaggaagatcttttagaatttagttttagtatagaagga
gtagataaaaaggagctttttaatatatttaatgcagtaaaacaaagaaaaaaatattat
agattaaaaaatgggggatttataccgttaaataataatgaaattttgaatatgggtagt
ataatagattatttaaatataaaagcttcggatttcaaaaaggatgttataacccttcca
aaatttaatgcagtttatatagataattctcttaaagaaaaagaaatagattttgtagga
agaaataagaagtttaaagaattagtaaatagcataagggatataaaagatatagattat
gatgtccctaaaagtcttcagtctataatgagaccctatcagagattcggatttaagtgg
tttaaaaccttagcaagttgtgggtttggaggaatattagcagatgaaatgggacttggt
aaaactcttcaaactatagcttttataaaatctgaggtggaagaaaataagaataaaccc
atgccttctctagtagtttgtccaacatccctagtttataattgggaagatgaaataaag
aaatttcaaccagatttaaaatgtactctaatatcaggagataaagaatctagagaagaa
agtataaaagctatagacacatcagatatagttataacttcttatgctcttataagaaga
gatatcgataaatatgaaaaagctaaatttagatattgttttttagatgaagcacaaaac
ataaaaaaccctcaatctttaaatgcccaaagtgtaaaaagtataaaagctaataattat
tttgcattaactggaacacctgtggagaattccctaacagagctttggtctatttttgat
tttataatgccaggctatcttctaaactatagaagattttatgctaaatatgaatctcct
attgttaaagataaaaatgaagaagctttaaaagagttaaataatcatataaaaccattt
attcttagaaggctaaaaaaacatgtaataaaggaattaccacctaaaattgagcataat
atagtagttaatatgacagaagagcagaaaaaagtatatgcatcttttgcagaaagtgca
aaaaaagaattttataaagaaataagagaaaggggatttaacaaaagtaaaataaaaata
ttatctataattacaagacttagacaaatttgttgtgatccatctacttttatagaaaat
tatgaaggaagtaatggaaaaacagaaactcttttagatattgtaaatagtagcataaat
gcaggccataagatattgttgttttctcagtttacctctgtattaaaaaatatagcagaa
gtttttaaagcaaataatataaactatctatatttggatggaagtacaaaggctgatgta
agaggaaatctggttaaagattttaataatggtaagggagatatatttttaatttcacta
aaagcaggtggtacaggattaaatttgacctcagcagatatagtaattcactttgatcct
tggtggaatccagctgtagaagaccaagcttcagatagagctcatagaataggtcaaaag
aaaactgtagagattataagacttattgctaaaggaactatagaagaaaaaatatataaa
atacaacaaaaaaagaaagaaatcatagataaggtaatagacaaaaatctaggtgaagaa
attcttttatctaatatggcagagtatgaagttgaagaactttttaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system