Clostridium botulinum A3 Loch Maree: CLK_1164
Help
Entry
CLK_1164 CDS
T00670
Name
(GenBank) leucine rich repeat protein
Organism
cbl
Clostridium botulinum A3 Loch Maree
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRP1-like_beta_prop
LRR_8
LRR_EndoS
LRR_14
Big_4
LRR_9
LRR_LRWD1
PD40
KCTD11_21_C
Bact_surface_Ig-like
LRR_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA53824
LinkDB
All DBs
Position
1956410..1960489
Genome browser
AA seq
1359 aa
AA seq
DB search
MNKKVLIPVVMGAYLCLSPLSVKAEDYYKWDSKVTSDKNKIWTIKLSKKLNGNISGIKDK
VYIKDSKGNKLECNVKIKPNEKILEVLPPKDGYKEKENYYLYIDKSIPSDKNKNLKETVK
MNFYIDGYIEFEDKNLEEEVRKAANPKDRPKGPLTYMDVSGIKELNVHNKNIKSLKGIEY
LKNLTKLDISDNNIKDISCLKGLDSLELLNLYNNNIEDISPINNMEKLKDINLSKNKVKD
ISYLKDLNLHHLDLRDNKIENIEVLKDKTSLQHLYLANNSIKDFLPISNLKNLQILYLSH
NNSSNYDYAKDYYNNLKDKDFKLNIPIEFKDKVFEELVRKEINKPSGYVYPSDLENIKEL
DFHNAHIEKLNGIENMTALEKLNLSGTDIKDISLLKYLTNLREVNISNTSISDITALESS
IYIRYLNLNKTEITTLEVIKKFEHIEKLYVSGTKISTIPNLNSLMELDLSNCNLTSNNFL
SSNFSNLVYLNLSSIKIQGNLLNEINNISILGKLEYLSIANTNVVNIDVLRSLVNLRKLD
ITGCTKIDTQVLNHLSDVEIIGNEIVTFGDKVLEREIRELINNYSEPIYKRQLLSITKLE
LSGRGIVDLQGLESMENLIYLDLSNNEISNIDSIKKLINLKKLVLHKNKIGSIKVIESLT
KLEELDLSNNLIGDITALGGLSQLTRLDLSRNGIVSINSLGGLINLQYLSLYENKISERE
ESLKKLYNLRELYLKNSGVSNFDVTLAYYNNLEKKDFTTNSDFIVFDEKLDSDLAKIIRE
ILGKDENTNIYKSEVDTITDIDLSEDTISKLNISSKLTNTNIINLDGIQYFSNLHSINLR
GHGKLEGLENLMPLRGLIKLDLQGREVNYISLYYINYLTSLKYLYLNNMNLTGDLSFLEN
LTDLRVLDLSRTGISNISILSKLRNLNELYLGGNKITDLSYLENLTNLIKLDLVGNNDIT
SIYALRNLINLRYLTLPITNPKKIQDYSAVASYYYNLTYKNFDLGDSNVIVIKEIRTIEK
EVNKDDKFILPDYVEATMSDGSKERFKVHWKEKSVDTSKPGIYTYIGSVDGYSGGVKLTL
KVNGEIPYGMGNSSSNILNGGFIIRDSEYIYYINRENGSGKIYRNKINGAEDRLLSSNTA
EYLNVYGEYIYYVSNGSIYRIRKDGSEEKLIKEASASYMTVCNDFIYYFDKSKLGIYKVK
IDGTSYSSVVSGGKWRVDSQFVISGEWIYYTNYEDKSSIYKIKIDGTGKEKLNNIPCSQM
SVIGSSIYYVSNGNLYKISIDGSNNSLIYSGNIANINGYSNNIYYIDNNDNETLYKMNLD
GSYRVKLTKKSVKYISILEGEVYYIPSDNEDKISKFYEE
NT seq
4080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaagttcttattccagtagttatgggagcttatctatgcctttcaccacta
tctgtaaaggctgaagattattataaatgggatagtaaagtaacatcagataaaaataaa
atatggacgattaagctttcaaaaaaattaaatggtaacattagtggtataaaagataag
gtttatataaaggattctaaaggaaacaaattagagtgcaatgttaaaataaagccaaat
gaaaaaatcttagaagtattaccacctaaagatggttataaagaaaaagaaaattattat
ctttatatagataaaagtattccttcagataaaaataaaaatttaaaagagactgtgaaa
atgaatttttacatagatggttatatagaatttgaggataaaaatctagaagaagaggta
agaaaagcagcaaatcctaaagatagacctaaaggccctttaacatatatggatgtttca
ggtataaaggaactaaatgttcacaataaaaatataaaaagtcttaaagggatagagtat
ctaaaaaatcttactaaattagatatatcagataataatataaaagatatatcttgttta
aaaggacttgatagtttagaattattaaatttatataataataatatagaagatatatct
cctattaataatatggaaaaactaaaggatataaatttatctaaaaataaagtaaaagac
atatcttatttaaaggatttaaacttacatcatttagatctaagagataataaaatagaa
aatatagaagtcttaaaagataaaacatccttgcaacatttgtatttagctaataatagt
attaaggattttttacctatatctaatttgaaaaatctacaaatattatatttaagtcat
aataatagttcgaattatgattatgctaaagattattataataaccttaaagataaagat
tttaaattaaatatacctatagaatttaaggataaagtctttgaagaattagtgagaaaa
gaaataaataagccttcaggctatgtatatcctagtgatttagaaaatattaaagaatta
gattttcataatgctcatatagaaaaactaaacggtatagaaaatatgacagctttagaa
aagttaaatttaagtggaactgatataaaagatatatctcttttaaaatatttgactaat
ctaagagaggtaaatatatcaaatactagtataagtgatataacagctttagaaagttca
atttatattaggtatttaaatttaaataaaacggaaataactactttagaggttattaaa
aagtttgaacatatagaaaagttatatgtatcaggtacaaagataagtactattccaaat
ttgaatagtttaatggagttggatttatctaattgtaatcttacgagcaataatttctta
tcatcaaattttagtaatctagtttatttaaatttaagcagtataaaaatacaaggtaat
ttattaaatgaaataaataatattagtattttaggaaaacttgaatatttaagtatagcg
aatacaaatgtagttaatatagatgtacttagaagtttagttaatttaagaaaattagat
ataacaggttgtactaaaatagatactcaggttttaaatcatctaagtgatgtagaaata
ataggtaatgaaatagttacatttggagataaagttttagaaagagaaataagagaatta
ataaataattactccgagcctatatataaaagacagcttctttctataactaaattagaa
ctttcaggaagagggatagtagatttacaaggattggagagtatggagaacttaatatat
ttagatttatcaaataatgaaatttctaatatagattctataaaaaaacttataaattta
aaaaaattagtacttcataaaaataaaataggatcaataaaggtaatagaaagccttaca
aaattagaagagttagatttatctaataatttaattggagatataacagctttaggagga
ttatctcaattaactagattagatttatctagaaatggaatagtaagtataaatagttta
ggtggacttataaatttacaatacttatctttgtatgaaaataaaatctcagagcgagag
gaatccttaaaaaaattatataatcttagagaactttatttaaaaaatagtggagtatca
aattttgatgtaacattagcttattataataacttagaaaagaaagattttactactaat
tcagattttatagtttttgatgaaaagcttgatagtgatttagctaaaattattagagag
attttaggtaaggatgaaaatactaatatatataaaagtgaggtagacactataacagat
atagatctaagtgaggacactatatcgaagttaaatataagctctaaactaacaaatact
aatataatcaatttagatggcatacaatatttttctaatttgcattccataaatctaaga
ggtcatggtaaattagaagggttagaaaatttaatgccacttagaggtttaattaaatta
gatttacagggaagagaagtaaattatatttctttatattatattaattatttaacaagt
ttgaaatatttatatttaaataacatgaatttaactggagatttatcatttttagaaaat
cttacagatttaagggtattagatttgtctaggactggaatatctaatataagcatatta
agtaagctaagaaatttgaatgaattatatctaggcggtaataaaataacagatttatct
tatttagagaaccttacaaatttgattaaactagatttagtcggaaataatgatataacc
agcatatatgctttgagaaatttaattaatttaaggtatttaactttaccaataacaaat
cctaaaaaaatacaggattacagtgctgtagcatcatactattataatcttacttacaag
aattttgatttaggtgatagtaatgtaatagttataaaagaaataagaactatagaaaag
gaagttaataaagatgataaattcattcttccagactatgttgaagcgacaatgagcgat
ggctctaaggagcggtttaaagtgcattggaaagaaaaaagtgtagatacatcaaagcca
ggaatatacacttatataggctctgtagatgggtattcagggggagtgaaattaacatta
aaggtaaatggagaaataccttatggtatgggtaattcttctagcaatatattaaatgga
ggatttattataagagatagtgagtatatatattatataaatagagagaatggcagtggt
aaaatatatagaaataaaataaatggagcagaagatagactattatctagtaacactgca
gaatatttgaatgtatatggagaatatatatattatgtaagtaatggtagtatatataga
ataagaaaagatggtagcgaggaaaaactaataaaagaggcatcagcttcctacatgaca
gtgtgcaatgatttcatttattattttgataagagtaaactcggtatatataaagttaaa
atagatggtacaagctatagttctgtggtatctggtggaaagtggagagtggattcacag
tttgtaatatcaggagaatggatatattatactaattatgaagataagtcatctatatat
aaaattaaaatagatggaacaggaaaagaaaaattaaataatataccttgcagtcaaatg
agtgtaataggaagctcaatatattatgtttcaaatggaaatctctataaaatatctata
gatggaagcaataatagcttaatatattcaggaaatatagctaatataaatggatatagt
aacaacatatattatatagataataatgataatgaaacattgtataagatgaacttagat
ggcagctatagggttaaattgactaaaaaatcagttaagtatataagtattttagagggg
gaagtttactatattccttcagataatgaagataaaatatccaaattttatgaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
