KEGG   Clostridium botulinum A3 Loch Maree: CLK_3628
Entry
CLK_3628          CDS       T00670                                 
Symbol
addB
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
  KO
K16899  ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
cbl  Clostridium botulinum A3 Loch Maree
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cbl00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:cbl03400]
    CLK_3628 (addB)
Enzymes [BR:cbl01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     CLK_3628 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:cbl03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     CLK_3628 (addB)
SSDB
Motif
Pfam: ADDB_N PDDEXK_1
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACA55502
UniProt: B1KUY8
LinkDB
Position
523045..526488
AA seq 1147 aa
MSLRFIYGRAGSGKSQYCLNSIKKRIEEDIDRPLILLVPEQFSFQAEKNLIEVLDEKTGF
KTQVLSFKRMAYRVFNEVGGITAKHMNESGKSMLLYNIIEDNKNNLKVFKKAAKRQGFIT
TISDIITEFKRYNITPEIILNNLENIEEDNLKYKMEDLALIFSQFETRLHKNYIDNEDDL
TILVEKLNKSKQFDNAEIWIDEFSSFSPQEYSVLEKLLLKSYRINITLCTDYLNQGRFVD
TTDVFSPIKNTENKLLQIIEDNNIKLDKPIALNCDPCARFKNSIELQHLEKNMFSFPYKE
YKNETKDICMLKTLNQFTEIENTAKDIIKLCRDKGCRFKDIAVITGDLEGYENIISSVFL
QYNIPFFIDKKREINNNPIIVLILSALEVLSKNWTYESVFRYLKTGLLDINNEEMDILEN
YVLANGIKGYQWTNDKPWEHKSFSNYELEDQVEKELLAKINDIRYKAMEPIISLNKNLKN
KERAKEFCEVLYEFLCSINLPDKIQNMIEDFRAEGEVEKASEYNQIWNIVMEVLDQIVEA
IGGEKISLKEFFKILQTGFSEYEIGLIPPTLDQVIVGSITRLRSHNINILYIVGVNDGIF
PAPLKEEGILSDDDRQFLGDKGLEIAKDTKSIAFEEQFLVYSTLTTPSKYLRLSYPIADG
EGKTLRPSIIISRIKKIFTNICEENDIVKLNGEEEELKNISSAKPTFNYLISNLRKDIEG
VKIDNIWGDIYKWYFENEFWIEKLNRLVKGFDYTNQSKYIETKKIRNLYGKPLKISVSRV
EKFSQCPFAYFVQYGLKAKDRKIFNLSYPDLGIFMHSILEKFSHELEKKGIDWDTMDLNW
AEEEIDKLINEELDNKSLDILNSSKRYEYVTKSVKKILKRSIWLIGEHIKRGNFKPSYYE
LSFDIDGDYPPIAMELHSGEVVNLIGRVDRVDLLQKDGATYLKIIDYKSGTKEFKLSDVY
YGLQLQLLIYLDAILTELAERFGIDGEPGALLYLKLDDPIVKNIVDMSDKEIEKSIIKNL
KMKGLILNDPNIIKDMDNIISGISDIIPVMVKKDGGVSEGRSSVATKEEFETLRKYVRYT
IIEICEEMLEGNIEIKPYKKKDGSSCDYCIYSSVCKFDTEIRGNKYNILIDKKDEEVWEA
IKKKLEC
NT seq 3444 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcttaagatttatatatggaagggctggcagtggaaaaagccaatattgtttaaat
agtataaaaaagagaatagaagaagatatagatagaccacttatattattggtaccagaa
caattttcttttcaagcagaaaaaaatttaatagaagtattagatgaaaaaactgggttt
aagacacaggtattaagttttaaaagaatggcttatagggtctttaatgaagtgggaggt
ataactgccaaacatatgaatgaatccggtaaaagcatgcttttatacaatataattgaa
gataataaaaataatctaaaagtattcaaaaaagctgctaaaaggcaaggattcattact
acaatttcagatattataacagaatttaagagatataatataactcctgaaattatatta
aataatttagagaatattgaagaagataatttgaaatataaaatggaagatttagctttg
atattttctcagtttgaaacaagattacataaaaattatatagacaatgaagatgattta
actatattggtggaaaaattaaataaaagtaagcaatttgataatgctgaaatatggata
gatgaattttcaagtttttctcctcaagagtattctgtattagaaaaattacttttaaaa
tcctatagaataaatataactttatgtacagattatttaaaccaaggcagatttgttgat
actacagatgtgttttctcctattaaaaatacagaaaataaattgctacaaataatagaa
gacaacaatataaaattggataaacctatagcacttaattgtgacccttgtgcgaggttt
aagaatagtatagaacttcagcatttagagaaaaatatgttttcttttccttataaagag
tataaaaatgaaacaaaagatatctgtatgcttaaaactttaaatcaatttacagaaata
gaaaacactgcaaaggatattataaaactttgtagagataaaggttgtagatttaaggat
atagcagtaattacgggcgatttagaaggatatgaaaatataataagttctgtatttttg
caatataatattccgttttttatagataaaaaaagagaaataaataataatccaataata
gtattaatactttctgctctagaggttttatctaaaaattggacttatgaatcagtattc
agatatttaaaaactggacttttggatattaataatgaagaaatggatattttagaaaac
tatgtgcttgctaatggtattaaaggatatcaatggactaatgataaaccttgggaacat
aaatcctttagcaattatgaattagaagatcaggttgaaaaagagctattagctaaaata
aatgatataagatataaagctatggaacctattatatcccttaataaaaatttaaaaaat
aaagagagagcaaaagagttttgtgaagtattatatgaatttttatgtagtataaaccta
ccagataaaatacagaacatgatagaagattttagagcagagggtgaggtagaaaaagct
agtgaatacaatcaaatatggaatatagttatggaagttttagatcaaatagtggaggcc
ataggtggagaaaaaatatccttaaaagaattttttaagatacttcaaacaggattttca
gaatatgaaataggacttattccacctacattagatcaagtaatagtgggaagtataaca
agacttagaagtcacaatataaatatattgtatatagtaggggtaaatgatggtatattt
ccagcaccattaaaggaagaaggaattttaagtgatgatgatagacagtttttaggagat
aagggtctagaaatagctaaggacactaaaagtatagcctttgaggagcaatttttagta
tattccacattaactactccaagtaaatatttaagattaagctatcctatagcagatgga
gagggaaaaaccttaagaccatctataattatatcaaggataaagaaaatatttactaat
atatgcgaagaaaatgacatagtgaagctcaatggtgaagaagaggaactaaaaaatata
tcctctgcaaaaccaacctttaattatctaatatctaatttaagaaaggatatagagggg
gtaaaaatagataacatatggggagatatttataaatggtactttgaaaatgaattttgg
attgaaaaattaaatagattagtaaaaggttttgattatacaaatcaaagtaaatatata
gaaacaaaaaaaataaggaatttatatggtaagccattgaaaataagtgtatctagagta
gagaaattttctcaatgtccttttgcttattttgtacaatatggattaaaggctaaggat
agaaaaatatttaatttaagttatccagatttggggatatttatgcatagcatattagag
aaattttcacatgaattagaaaaaaaagggatagattgggatactatggacttaaattgg
gcagaagaagaaattgataagttaattaatgaggaattggataataaatctttagacata
ttaaatagttcaaaaagatatgaatatgtaaccaaaagtgtaaaaaagattttaaaaaga
tctatatggcttataggagaacatataaaaagaggaaattttaaaccaagttattatgaa
ctatcctttgatatagatggggattatcctcctatagcaatggaactccattctggagaa
gttgtaaatttgataggtagagtagatagagtagaccttttgcaaaaagatggagctact
tatttaaaaataatagattataaatctggtacaaaagaatttaaattatcggatgtttat
tatggattacaattgcaacttttaatatatttagatgctatacttacagaattagcagaa
agatttgggatagatggagaaccaggagcacttttatatttaaaattagatgatcctatc
gtaaaaaatattgtagatatgagtgataaggagattgaaaaaagtataataaaaaatttg
aaaatgaagggattaattttgaatgatcctaatattataaaagatatggataatataata
tctggcatatcagatattatacctgttatggttaaaaaggatggaggagtatcagaaggt
agatcctctgtagctacaaaagaagagtttgaaacattaagaaaatatgtaagatataca
ataattgaaatttgcgaggaaatgttagaggggaatatagaaataaagccatataaaaag
aaggatggatcctcttgtgattattgtatatattcttcagtttgtaaatttgatacagaa
ataagaggaaacaaatataatatattaatagataaaaaagatgaagaagtatgggaggct
attaagaaaaaattagaatgttaa

DBGET integrated database retrieval system