Campylobacter blaseri: CBLAS_1170
Help
Entry
CBLAS_1170 CDS
T06820
Name
(GenBank) LbR_YadA-like and YadA_anchor domain-containing protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
cbla
Campylobacter blaseri
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbla00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cbla02000
]
CBLAS_1170
Transporters [BR:
cbla02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CBLAS_1170
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_stalk
YadA_anchor
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF86343
LinkDB
All DBs
Position
complement(1159080..1164467)
Genome browser
AA seq
1795 aa
AA seq
DB search
MNKSYRHIYKDGVGWVAVAENASSVNSGKKSVVVGNSSNKFKTFNSFFENRNFLVKSLLL
GALTLTPFSLNAAWIDAADSNGVIAGEKFDTKWSSGATLTLKAGNGVKIEKTGATSTTSD
QTYTFSLDSSSLDINYTTANGTKQSTTLSKGFTFKGDDNLNITAGADGKLNFTLAQALKN
ITSITNGTQTYNFNSTGSNYQDNDVVRYSQIKDIKPIHYFSVNSTGGGNYNNDGATGSNA
IAIGKNAKAAGNNSLAIGPDAIANKNFVTAIGNGAGFRTTQGESSVYLGQNAGSNGNHFV
HGQRSWGSIYIGQDAGTEVTGDASIGIGSTAGWKHTGSQNIFMGDSAKPLKEGQNAYSYT
FGNRNLIFGNQYIDKKVKEAESGKADYINDVIVIGTLAKAEKSQGIAIGSSRKDKVTGAY
AKGKRSIAIGVSEDESKKGAQALGDDSIALGTESYAKGETSIAIGRDSNVTGKQSISIGY
KNQVLGEKSGAFGDPSVVTGNGSYSFGNDNNISSDGSFIFGNNNTIAQNDTFVVGSKVTT
TQANSVVLGNESTDRAATAETSATVGGITYGSFAGVGSEGNGVVSVGDTGKERQIINVAA
GKISKDSTDAINGSQLYTTNNVVSNVGNTLVSKILGGNAEIEKTGENAGQLQMSDIGGTG
KDTIDDAIKAAKTEVKAGKQVTVTDAPDKTDGHTIYTVNATKTTLAKKADGKVEVTGGTD
VDGLLAYEIDLTQATKDDIQKGVDADTEVKKGLFFTGDNGSETGKISLGDKIALTGDTNI
ITNATGKSIAFSLNKDLTGITSIGGATGQGKITFGDNNVINANGGKITNVGAPTDGGDVT
NKTYVDSVRTEVTSNDKSVTVKQTGNEHGKLVYDLKVDTDKIAETTRLAYKANGKDDNKE
IVTLEKGLNFINGSNTVASIDKDGVVKYDLNDATKTIINNATNKDLNNLTNAGNTIISNI
ANKAVEVKEGSNVHITSSKDKDNGDGTKTTTYIVAADKSIVSVENTLKLDKNTTTEKDGA
ITTDYKLDLSQATKDSLAKADSAIQSFKVQANSEAAKDVTNGQTIKFINGSNINIIQDER
NFTFALNKELTGINSIGGGTGSGSTITFGDKTIDVNGSKITNVGAPTDGGDVTNKTYVDS
VRTEVKSTNGSVTVAQVGNKDGKLVYDLKVDTASIATNTKLAYKANSGTKNSVSLADGLN
FVNGKNTIASVGADGNVTFGLKDDITLSSVTTGDTKVDTNGITITNTTDANKTVSLTDKG
LNNGGNVISNVASALDKSGKQLKDLDASNADDKKILSSAATVGDLTKLKTNVTNNITNVS
NILGDNKYVDGNGSLTEDGKLALRTNNADGRKTTENTNIIQAINNLNSQGTRFFHVNSDV
NAIGAERPVDDNDSSAGSYGSISIGIRADVGDSAKHSISIGTDSNVTGKSSIAIGYGNQV
KGNHSGAFGDPTVVTGDNAYSIGNNNKIDHNNTFVLGNKVTSKTANSVILGNLSTDRAAT
SETKATVASIDGKTSITYGNFAGKGSMDNGVVSVGAAGNERQVINVAAGKISKDSTDAIN
GSQLFATNQVIGNVAGSIKNILGGDANVTSDGDITMNDIGGTGATTIDGAIRSIKSGGTN
LIDGKPASSKPKDKASAVANGKGSTAVGYGSVADGKNSVALGAGSNDGGRENTVSVGSKG
NERTISNVAPGKLGTDAVNLNQLNQGLAGVYSDINKYKDSANAGIASAIALGMLPQSNIP
GKGLLSLGTGYHNGESAISIGISKVSDNAKWIFKGGVSYNSEKDVSAGASVGFHF
NT seq
5388 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaatcatatagacacatatataaagatggtgtaggttgggtagcagtggctgaa
aacgcatcatcagtaaattcaggtaaaaagagcgtagtagtaggtaatagctctaataaa
tttaaaacttttaacagtttttttgaaaatagaaattttttagtaaaatccttgctttta
ggagctttaacactaactccattttcgttaaatgctgcgtggattgatgcagcagacagc
aatggggtaatagcaggagaaaagtttgatacaaaatggagtagtggtgcgacattaacc
ctaaaggctggtaatggtgtgaaaattgaaaaaacaggagcaacctctacaactagcgat
caaacttacacctttagcttagattcttctagtcttgacattaattatacaacagctaat
gggactaaacaaagcacaaccttaagtaaaggcttcacctttaaaggagatgataactta
aacataacagcaggagctgacggcaaacttaactttactctagcacaagctttaaaaaac
atcacttccataacaaatggaactcaaacatataattttaatagtaccggttcaaactat
caagataatgatgtagtaagatacagtcaaatcaaagatataaagcctattcactacttt
agtgtaaactcaacaggcggtggcaactataacaatgatggtgcaactggcagtaacgcc
attgccattggtaaaaatgctaaagcagctggtaacaattcgctagccataggccccgac
gctatcgctaataaaaatttcgttacagctattggtaatggagcaggatttagaacaact
caaggagagtctagtgtttacttagggcaaaatgctggttcaaatggtaaccattttgtc
catggtcaacgatcatggggctctatctatataggtcaagacgcagggacagaggtaaca
ggtgatgcaagcataggtatcggctcaacagcaggatggaagcatacaggttcacaaaat
atctttatgggagattcggctaaacctttaaaagaagggcaaaatgcttattcttatact
tttggtaacagaaatttaatctttggaaatcaatatatagataaaaaagttaaagaagct
gaaagtggtaaagcagattatatcaacgatgttattgttataggaacacttgcaaaagct
gaaaaatctcaaggtattgctatcggttcaagtagaaaagataaggtcacgggtgcttac
gcaaaagggaagcgctctatcgccattggtgtaagtgaagatgaaagcaaaaaaggcgcg
caagcattaggtgatgactcaatagcactgggcacagaaagttatgcaaaaggcgaaact
tcaatagctattggtagagattcaaatgtaactggaaaacaatcaatctctatcggttat
aaaaaccaagtattgggtgagaaatccggtgcatttggtgacccatcagtggttactggc
aatggctcttactcttttggtaacgataacaacatttcaagcgatggctcatttatcttt
ggtaacaacaacactatcgctcaaaatgatacctttgtagttggtagtaaagtaaccaca
actcaagcaaatagtgtggttttaggtaatgaatctacagaccgtgccgccactgctgaa
accagtgccactgtaggtggtattacctacggtagctttgcaggcgtaggctctgagggt
aatggcgtagttagtgtgggtgatacaggaaaagaaagacagattataaatgttgctgcg
ggtaaaatttcaaaagatagcacagacgcaattaacggctcacaactttatacaactaat
aatgttgttagtaatgtaggaaataccttagtaagtaaaattttaggtggcaatgccgaa
attgaaaaaacaggagaaaatgctggacaacttcaaatgagtgatattggtggcacgggt
aaagatactatcgatgacgccataaaagctgcaaaaactgaagttaaagcaggcaaacaa
gtgactgtcactgatgcgcctgataaaacagacggtcacaccatctacaccgttaacgct
accaaaaccactttagctaaaaaagcagatgggaaagttgaagtaacaggtggaacagat
gtagatggtctacttgcttatgagattgatttaacacaagcaacaaaagatgatattcaa
aaaggtgttgatgctgatacagaggttaaaaaaggtttattttttacaggagataacggt
agtgaaacaggtaagattagtttaggtgataaaattgctctaacaggtgatactaatatt
ataactaatgctactggaaaaagtattgcattctctttaaataaagatttaacaggtatc
acttcaataggtggagcaactggacaaggtaaaataacttttggtgataataatgttatt
aatgctaatggtggaaagattactaatgtaggagctccaacagatggtggagatgtaaca
aataaaacctatgttgattctgtaagaacagaggttacatcaaatgataagagtgtaaca
gtaaaacaaactggaaatgaacacggtaaattagtttatgatttaaaagttgatacagat
aagatagccgaaactactagactggcatataaagctaatggaaaagatgataataaagaa
attgtaactttagaaaaaggtttaaattttataaatggtagtaatactgttgctagtatt
gataaggatggggttgtaaagtatgatttaaatgacgctactaaaactattattaacaat
gcaaccaataaagatttaaacaatttaacaaatgcgggcaatactattataagtaatatt
gcaaataaagctgttgaggttaaagagggttcaaatgttcacattacttcatcaaaagac
aaagataatggcgatggcacaaaaaccacaacttatatagttgcagctgataaatctata
gtctcagtagaaaacacattaaaattagataaaaacacaactacagagaaagatggagct
ataacaactgattataaattagatttatctcaagccaccaaagatagccttgcaaaagca
gatagtgcaattcagtcatttaaggttcaagcaaatagtgaagctgcaaaagatgttaca
aatgggcaaactattaaatttataaatggtagcaatataaatataattcaagatgaaaga
aattttacttttgcactaaataaagaattaacaggtattaactcaattggtggtggaacc
ggaagcggttctactataacatttggagataaaactatagatgttaatggttctaagatt
actaatgtaggagctccaacagatggcggagatgtaacaaataaaacctatgttgattct
gtaagaacagaggttaaatcaactaatggtagtgtaacagtagcgcaagttggaaataaa
gacggtaaattagtttatgatttaaaagttgatacagctagcatagcaactaataccaaa
ctagcctataaagctaatagtggaactaaaaactctgtatctttagctgatggtttaaat
tttgtaaatggtaaaaatactattgcttctgttggagctgatggtaatgtaacatttggc
ttaaaagatgatatcactttaagtagtgttactacaggtgatacaaaagtggatactaac
ggtatcactataactaatacaacagatgctaataaaacagtatctttaacagataagggg
ctaaataatggtggtaatgttatatcaaatgttgctagtgctttagataaatctggcaaa
caattaaaagacttagatgcttctaatgctgatgataaaaagatattaagcagtgctgca
acagttggggatttaacaaaattaaaaactaatgttactaataatataactaatgttagc
aatattcttggcgataataagtatgttgatggcaatggttcattaaccgaagatggtaaa
ttagctcttagaacaaacaatgctgatggaagaaagacaactgaaaatacaaacatcata
caagctattaataatttaaatagtcaaggaacaagatttttccatgttaatagtgatgtt
aatgctataggagctgagagaccagtagatgacaatgactctagtgctggttcatatggt
tctatatctataggcataagagctgatgttggagatagtgcaaaacattcaatctctatt
ggaacagattcaaatgttacaggaaaaagttcaatcgctataggttatggaaaccaagtt
aaaggaaaccactctggtgcatttggagatcctacagtagttactggtgataacgcttac
tctattggtaataataataaaatagaccataataatacttttgtattaggaaataaagtt
acaagcaaaacagcaaatagtgttatattaggtaatctttcaacagatcgtgccgccact
agtgaaacgaaagccacagttgcgagcattgatggaaaaacatctataacttatggtaac
tttgcaggtaaaggctctatggataacggcgtagttagtgtgggtgctgctggaaatgaa
agacaagttataaatgtagctgcgggtaaaatttcaaaagatagcacagacgcaattaac
ggctcacaactatttgcaacaaatcaagttataggaaatgtagcaggtagtattaaaaat
attcttggtggagatgctaatgttacatctgatggtgatattactatgaatgatattggt
ggaacaggagctactactattgatggtgctattagatctattaaatcaggcggtactaat
ttaatagacggaaaaccagcttcaagtaaacctaaagacaaagcatcagcagttgcaaat
ggaaaaggtagtacagctgttggttatggaagtgtagctgatggtaaaaactcagttgct
ttaggtgctggttcaaatgatggtggtagagaaaatactgtttctgttggctcaaaaggc
aatgaaagaaccataagcaatgttgctcctggtaaattaggaactgatgcagttaatctt
aatcaattaaatcaaggtcttgctggtgtttatagtgatataaataaatacaaagatagt
gcaaatgcaggtatagcaagtgccattgctttaggaatgttaccacagtcaaacatacct
ggtaaaggattgctttctttaggaacagggtatcataatggagaatctgctatatctata
ggtatatcaaaagtatctgataatgctaaatggatatttaaaggcggagttagctataac
tctgaaaaagatgtttcagctggtgcttctgtagggtttcatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
