Clostridium botulinum F 230613: CBF_1119
Help
Entry
CBF_1119 CDS
T01865
Name
(GenBank) putative conserved repeat domain protein
Organism
cbm
Clostridium botulinum F 230613
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
TRAP_beta
SdrD_B
CarboxypepD_reg
NPCBM_assoc
CARDB
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADF98878
LinkDB
All DBs
Position
1191292..1194198
Genome browser
AA seq
968 aa
AA seq
DB search
MATISGRVVFDRDRSATINAGDSGIANVPVVLQNTATDARLVVLTDTNGNYSFINVPNGD
YRIVQSFGTPGGVPTPGDFNNAVVGPVPVGTNPPISFASDPPPGSTNLDSLTPDTLLVTV
TGVDLTNENFLDGPVIYTPIQNILDPCVSVSNVNLINVADNGTFGFFSTGTPANTGAPVE
PYPGVTPDFTYVLPDPTKFTPTGGEYTVQNIMTNAMSNEIGAWWRIADHTTGNETGRMMV
VNGFNPGAIFFRDVVSVQPNTNYLFSSWILNLFKVIGYPNPELGVRILASNGDVLYSATL
GAQIPVNTNAPEWKQIGTVINSQNNTSLTVEFLSEGPEVIGNDYAIDDVALNEVQVPLFT
PVKTISTPVANVGETVTYTVTLENTCTSPLTNVFFKDNIPNGLLFVAGSVIVNGVSEGSF
DPNVGFTIPNIPGGSTATITFDAVVNAVPTPNPALNTATINYSYTPVEGGIENNFTVDSN
TVPLEVRAVVADVGVIKTGSPNPVMSGEPLTYTIDVSNLGPGDAQNVVLTDTIPPEITGA
EFSTDGGVTFSPWPGSFNIGTLLNQETRTILIRGTVASVAPGFITNTAEVTSTTPDPNLS
NNTSTSVIEVNESTEEADVGVFKSVGLNPVPAGEVVVFPIRVSNFGPADAQNVVLTDTIP
PEITGAEFSEDGGSTFSPWTGSLVIGTLLNGETRDILIRGTVSPTAAGIISNTATVTSTT
PDPNPSNNTSTVDVEVLAPVVADVSVVKTASPSPVMAGELLTYTINVTNFGPSSAENVVL
TDVISLEITGAEFSTNGGEAFSPWPGSLNIGTLPASKTRTILIRGIVSPTATGIISNTAT
VISTTPDPNPGNNTSTVDVEVIPVVIAKADVSVAKTASSNPVMAGETFTYTIVVANAGPS
DSENVVLTDIIPPEITGAEFSEDGEVTFSPWPGSLNIGTLSADETRTILIKGTVVTIRLQ
GVISQYCN
NT seq
2907 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacaatatcaggtagagttgtattcgaccgagatagaagtgctacaattaatgct
ggggattcaggtatagctaatgtacccgtggtattacaaaataccgccacagatgctaga
cttgtagttcttacagatactaatggaaattattcatttataaatgtcccaaatggtgat
tatagaattgtacaatcctttggaacacctgggggcgttccaacaccaggagatttcaat
aacgcagtagttggacctgtcccagttggaacaaatcctccaataagctttgcgagcgat
cctccaccaggttcaactaatttagattctttaactccagatacacttctagtaactgtt
acaggagtagatttaacgaatgaaaatttccttgatggcccagttatatatacacctata
caaaatatactagatccatgtgtgtcagtttcaaatgtaaatcttattaatgttgctgat
aatggaacatttgggtttttctcgaccgggactcctgctaatacgggtgctccagttgaa
ccttacccaggtgtaaccccagattttacctatgtattaccggatccaactaagtttaca
cctactggtggtgaatatacagtacaaaacattatgactaatgcaatgagtaatgaaata
ggtgcttggtggcgtattgcagaccatactacaggtaatgaaacaggaagaatgatggtg
gtaaatggttttaatccaggggctattttttttagagatgtagtttcagtacagcctaat
acaaactatttatttagttcttggattctaaacttatttaaagtaataggatatccaaat
cctgagctgggcgtacgaatacttgcttcaaatggtgatgtactatatagtgcaacattg
ggggctcagattcccgttaatacaaatgctccagaatggaaacaaataggtactgtaatc
aattcacaaaataacacaagcttaacggtagaatttttaagtgaaggtccagaggttatt
ggaaatgattatgctatagatgatgtagcattaaacgaagttcaggttcctctatttaca
cctgtaaaaactattagtacccctgttgcaaatgttggggaaacggtaacctatacagtg
acattagaaaatacttgtactagtcctttaacaaatgtattttttaaagataacatacca
aatggattattatttgtggctggtagcgtaatagttaatggagtatcagagggatcattc
gatcctaatgttggatttactataccgaatattccaggaggctctactgctactataact
tttgatgctgtagttaacgctgttccaacccctaatccagctcttaatacagcaacaata
aactattcttatacacctgtagaaggaggaatagaaaacaattttactgttgattccaat
actgtaccacttgaagttagggctgtagtagcagatgttggagttataaaaacaggaagt
ccaaacccagtaatgtcaggagagcctttgacatatacaattgatgtatcaaatcttgga
ccaggagatgcccaaaatgttgttttaacagatactattccacctgaaataacaggagca
gaattctcaacggatggaggagtaacctttagtccatggccaggaagttttaatatagga
acattgttaaatcaggaaacaagaactattttaataagaggaacagtggcctcagtagct
ccaggtttcataactaatactgcagaggtaacatcaacaacaccagatcctaatctaagt
aataacacatcaacatcagttatagaagttaacgaatctacagaagaagcagatgttgga
gtttttaaatcagtaggactgaatccggtacctgcaggagaggtggtagtttttccgatt
agagtatcaaattttggaccagcagatgcccaaaatgttgttttaacggatactatccca
cctgaaataacaggagcagaattctcagaagatggaggatcaacctttagtccatggaca
ggaagtcttgttataggaacattattaaatggtgaaacaagagatattttaataagagga
acagtgtcaccaacagctgcagggattataagcaatactgcaactgtaacatcaacaaca
ccagatcctaatccaagcaataacacatcaacagtagatgtagaagttctcgctcctgta
gtagcagatgtttcagttgtaaaaacagcaagcccaagcccagtaatggctggagagctt
ttgacctatacaattaatgtaacaaactttgggccatcctctgctgaaaatgttgtttta
acggatgttatttcacttgaaataacaggagcagaattctcaacaaatggaggagaagcc
tttagtccatggccaggaagtcttaatataggaacattaccagctagtaaaacaagaact
attttaataagaggaatagtttcaccaacagctacagggattataagtaatactgcaacc
gtaatatcaacaacaccagatcctaatccaggcaataacacatctacagtagatgtggaa
gttatcccggttgttatagcaaaagcagatgtttcagttgcaaaaacagcaagttcgaac
ccagtaatggcaggagagacttttacctatacaattgtagtagccaatgcaggaccatca
gattccgaaaatgttgttttaacggatattattccacctgaaataacaggagcagaattc
tcagaagatggagaagtaacctttagtccatggccaggaagtcttaatataggaacatta
tcagctgatgaaacaagaactattttaataaaaggaacggtagtcaccatcagactacaa
ggggttataagccaatactgcaactag
DBGET
integrated database retrieval system
