Clostridium botulinum F 230613: CBF_1759
Help
Entry
CBF_1759 CDS
T01865
Name
(GenBank) leucine rich repeat protein
Organism
cbm
Clostridium botulinum F 230613
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
DUF5050
LRR_8
Big_4
LRR_9
KCTD11_21_C
Bact_surface_Ig-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADF99470
LinkDB
All DBs
Position
1902786..1906865
Genome browser
AA seq
1359 aa
AA seq
DB search
MNKKVLIPVVMGAYLCLSPLSVKAEDYYKWDSKVTSDKNKIWTIKLSKKLNGNISGIKDK
VYIKDSKGNKLECNVKIKPNEKILEVLPPKDGYKEKENYYLYIDKSIPSDKNKNLKETVK
MNFYIDGYIEFEDKNLEEEVRKAANPKDRPKGPLTYMDVSGIKELNVHNKNIKSLKGIEY
LKNLTKLDISDNNIKDISCLKGLDSLELLNLYNNNIEDISPINNMEKLKDINLSKNKVKD
ISYLKDLNLHHLDLRDNKIENIEVLKDKTSLQHLYLANNSIKDFLPISNLKNLQILYLSH
NNSSNYDYAKDYYNNLKDKDFKLNIPIEFKDKVFEELVRKEINKPSGYVYPSDLENIKEL
DFHNAHIEKLNGIENMTALEKLNLSGTDIKDISLLKYLTNLREVNISNTSISDITALESS
IYIRYLNLNKTEITTLEVIKKFEHIEKLYVSGTKISTIPNLNSLMELDLSNCNLTSNNFL
SSNFSNLVYLNLSSIKIQGNLLNEINNISILGKLEYLSIANTNVVKIDVLRSLVNLRKLD
ITGCTKIDTQVLNHLSDVEIIGNEIVTFGDKVLEREIRELINNYSEPIYKRQLLSITKLE
LSGRGIVDLQGLESMENLIYLDLSNNEISNIDSIKKLINLKKLVLHKNKIGSIKVIESLT
KLEELDLSNNLIGDITALGGLSQLTRLDLSRNGIVSINSLGGLINLQYLSLYENKISERE
ESLKKLYNLRELYLKNSGISNFDVTLAYYNNLEKKDFTTNSDFIVFDEKLDSDLAKIIRE
ILGKDENTNIYKSEIDTITDIDLSEDAISKLNISSKLTNTNIINLDGIQYFSNLHSINLR
GHGKLEGLENLMPLRGLIKLDLQGREVNYISLYYINYLTSLKYLYLNNMNLTGDLSFLEN
LTDLRVLDLSRTGISNISILSKLRNLNELYLGGNKITDLSYLENLTNLIKLDLVGNNDIT
SIYALRNLINLRYLTLPITNPKKIQDYSAVASYYYNLTYKNFDLGDSNVIVIKEIRTIEK
EVNKDDKFTLPDYVEATMSDGSKERFKVHWKEKSVDTSKPGIYTYIGSVDGYAGEVKLTL
KVNGEIPYGMGNSSSNILNGGFIIRDSEYIYYINRENGSGKIYRNKINGAEDRLLSSNTA
EYLNVYGEYIYYVSNGNIYRIRKDGSEEKLIREASASYMTVCNDFIYYFDKSKLGIYKVK
IDGTSYSSVVSGGKWRVDSQFVISGEWIYYTNYEDKSSIYKIKIDGTGKEKLNNIPCSQM
SVIGSSIYYVSNGNLYKISIDGSNNSLIYSGNIANINGYGNHIYYIDNNDNETMYKMNLD
GSYRVKLTKKSVKYISILEGEVYYITSDNEDKISKFYEE
NT seq
4080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaagttcttattccagtagttatgggagcttatctatgcctttcaccacta
tctgtaaaggctgaagattattataaatgggatagtaaagtaacatcagataaaaataaa
atatggacgattaagctttcaaaaaaattaaatggtaacattagtggtataaaagataag
gtttatataaaggattctaaaggaaacaaattagagtgcaatgttaaaataaagccaaat
gaaaaaatcttagaagtattaccacctaaagatggttataaagaaaaagaaaattattat
ctttatatagataaaagtattccttcagataaaaataaaaatttaaaagagactgtaaaa
atgaatttttacatagatggttatatagaatttgaggataaaaatctagaagaagaggta
agaaaagcagcaaatcctaaagatagacctaaaggccctttaacatatatggatgtttca
ggtataaaggaactaaatgttcacaataaaaatataaaaagtcttaaagggatagagtat
ctaaaaaatcttactaaattagatatatcagataataatataaaagatatatcttgttta
aaaggacttgatagtttagaattattaaatttatataataataatatagaagatatatct
cctattaataatatggaaaaactaaaggatataaatttatctaaaaataaagtaaaagac
atatcttatttaaaggatttaaacttacatcatttagatttaagagataataaaatagaa
aatatagaagtcttaaaagataaaacatccttgcaacatttgtatttagctaataatagt
attaaggattttttacctatatccaatttgaaaaatctacaaatactatatttaagtcat
aataatagttcgaattatgattatgctaaagattattataataaccttaaagataaagat
tttaaattaaatatacctatagaatttaaggataaagtctttgaagaattagtgagaaaa
gaaataaataagccttcaggctatgtatatcctagtgatttagaaaatattaaagaatta
gattttcataatgctcatatagaaaaactaaacggtatagaaaatatgacagctttagaa
aagttaaatttaagtggaactgatataaaagatatatctcttttaaaatatttgactaat
ctaagagaggtaaatatatcaaatactagtataagtgatataacagctttagaaagttca
atttatattaggtatttaaatttaaataaaacggaaataactactttagaggttattaaa
aagtttgaacatatagaaaagttatatgtatcaggtacaaagataagtactattccaaat
ttgaatagtttaatggagttggatttatctaattgtaatcttacgagcaataatttctta
tcatcaaattttagtaatctagtttatttaaatttaagcagtataaaaatacaaggtaat
ttattaaatgaaataaataatattagtattttaggaaaacttgaatatttaagtatagcg
aatacaaatgtagttaaaatagatgtacttagaagtttagttaatttaagaaaattagat
ataacaggttgtactaaaatagatactcaggttttaaatcatctaagtgatgtagaaata
ataggtaatgaaatagttacatttggagataaagttttagaaagagaaataagagaatta
ataaataattactccgagcctatatataaaagacagcttctttctataactaaattagaa
ctttcaggaagaggaatagtagatttacaaggattagagagtatggagaacttaatatat
ttagatttatcaaataatgaaatttctaatatagattctataaaaaaacttataaactta
aaaaaattagtacttcataaaaataaaataggatcaataaaggtaatagaaagccttaca
aaattagaagagttagatttatctaataatttaattggagatataacagctttaggagga
ttatctcaattaactagattagatttatctagaaatggaatagtaagtataaatagttta
ggtggacttataaatttacaatacttatctttgtatgaaaataaaatctcagagcgagag
gaatccttaaaaaaattatataatcttagagaactttatttaaaaaatagtggaatatca
aattttgatgtaacattggcctattataataacttagaaaagaaagattttactactaat
tcagattttatagtttttgatgaaaagcttgatagtgatttagctaaaattattagagag
attttaggtaaggatgaaaatactaatatatataaaagcgagatagacactataacagat
atagatctaagtgaggatgctatatcgaagttaaatataagctctaaattaacaaatact
aatataatcaatttagatggcatacaatatttttctaatttgcattccataaatctaaga
ggtcatggtaaattagaagggttagaaaatttaatgccacttagaggtttaattaaatta
gatttacagggaagagaagtaaattatatttctttatattatattaattatttaacaagt
ttgaaatatttatatttaaataacatgaatttaactggagatttatcatttttagaaaat
cttacagatttaagggtattagatttgtctaggactggaatatctaatataagtatatta
agtaagctaagaaatttgaatgaattatatctaggcggtaataaaataacagatttatct
tatttagagaaccttacaaatttgattaaactagatttagtcggaaataatgatataacc
agcatatatgctttgagaaatttaattaatttaaggtatttaactttaccaataacaaat
cctaaaaaaatacaggattacagtgctgtagcatcatactattataatcttacttacaag
aattttgatttaggtgatagtaatgtaatagttataaaagaaataagaactatagaaaag
gaagttaataaagatgataaattcactcttccagactatgttgaagcgacaatgagtgat
ggctctaaggagcggtttaaagtgcattggaaagaaaagagtgtagatacatcaaagcca
ggaatatacacttatataggctctgtagatgggtatgcaggggaagtaaaattaacatta
aaggtaaatggagaaataccttatggtatgggtaattcttctagcaatatattaaatgga
ggatttattataagagatagtgagtatatatattatataaatagagagaatggcagtggt
aaaatatatagaaataaaataaatggagcggaagatagactattatctagtaacactgca
gaatatttgaatgtatatggagaatatatatattatgtaagcaatggtaacatttataga
ataagaaaagatggtagcgaggaaaaactaataagagaggcatcagcttcctatatgaca
gtatgcaatgactttatttattattttgataagagtaaactcggtatatataaagttaaa
atagatggtacaagctatagttctgtagtatctggtggaaagtggagagtagattcacag
tttgtaatatcaggagaatggatatattatactaattatgaagataagtcatctatatat
aaaattaagatagatggaacaggaaaagaaaaattaaataatataccttgcagtcaaatg
agtgtaataggaagctcaatatactatgtttcaaatggaaatctctataaaatatctata
gatggaagcaataatagcctaatatattcaggaaatatagctaatataaatggatatggt
aatcacatatattatatagataataatgataatgaaacaatgtataagatgaatttagat
ggcagctatagggttaaattgactaaaaaatcagttaaatatataagtattttagagggg
gaagtttactatattacttcagataatgaagataaaatatctaagttttatgaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
