Clostridium botulinum BKT015925: CbC4_0962
Help
Entry
CbC4_0962 CDS
T01475
Name
(GenBank) repeat domain protein
Organism
cbn
Clostridium botulinum BKT015925
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
DUF7619
NPCBM_assoc
DUF7507
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEB75642
LinkDB
All DBs
Position
complement(1055065..1064331)
Genome browser
AA seq
3088 aa
AA seq
DB search
MPIIPIFSKNANAAITFTGNALGLSKALNTQDMGTESAIGAYITNNTTSSVSTYPNGTTS
TYSLNSSSAVLNIPSGSTILYAELIWGGSCQVQSEDHTSAVNTTAISFTIPTTPPQAVTI
DSSYTPTPVTRFQPTDSGNATFYIRRANVTSLVQKALSGTYTVSGVIGTTQSLNNSDNSC
GWTLAVSYENSSLPSRYLALYSNIEAIAPNSTTNINITNFKTPTSGTTEGRILLSALRGS
ATDTGDQVLFGANSSSLTPLSGPRNLESNFFGSQINGNDGNLNTSGTFGNRNQDILTATN
ISGGRQSQDITNVNTTSKLTNNQTNAVLQFKAAAREYFVNALGVQIDIDTPIFSNLNITT
NKQIVSIGNTVDYTIAVKNSGTVDAKNVILTNTLPTGLSYKSNTLTIGGTSNSGNPTTGV
SLGAINAGQTIEVKFTADVNAEPTGDTRYINSTKIDYSFDITNDTVTPGTVDTVTKSDTS
TNTIYPQSIVITPTVTKTDKSSNTVEHVVLIGDTVTYTINIHNPDATKPITNVNLTDVLP
SGLTFKTGSVIINGTSQSSANPTTGINITNILPSSDATISFIADVTSNPSSGTSKYVNTA
NVEYSFQAPDSTVLTNTVTATNTIYPFSVIIIPDFRKEDTTSGTINHVVSIGNTVTYTIT
IRNPDATKSLTNITLTDRLPSGLTFKSGSVSINSTPDSSANPTTGIPISDIKPGTTTTVS
FIVDVTGPPTGVKFLYLNTATIEYSFLSPDSTLLTSSATTPNSIYGDSVVITPTITKADK
TSNSIPHIVAINDTVTYTITIHNPSTTKPITNINLTDTLPPGLTFKSGSVTVNSVSQPSA
NPTTGINIPSITANSDATVSFVADVTAAPSSGALKYVNTATAQYSFESPDSTTLTSSVTA
NNTIYPESVVITPTITKADKTSNAANHIVDIGDTVTYTITVHNPDATKSITNINLTDTLP
SGLAFKTGTVIVNSTPDASANPTTGISIPNIDAHSNATVSFVADVTAAPSSGASSYANTA
TAEYTFQSPDFTPLTSSVTANNTIYPASDLIVPTVTKSDTSSNPIAHVATIGDTIEYTIT
IENNNATKSITNVALRDTIPNGLTFKPDSLDVNGSSTPGSSLPPSISLGTINPSSSATVK
FSVTVANPPASNSKYINTAEVDYTFQTTSGASLSNTVTKTNTVYSEDVVITPTITKADKT
SNSIPHIVAINDTVTYTITIHNPSTTKPITNINLTDTLPSGLTFKSGSVTVNSVSQPSAN
PTTGINIPSITANSDATVSFVADVTTAPSGGALKYVNTATAQYSFESPDSTTLTSSVTAN
NTIYPESVVITPTITKADKTSNAANHIVDIGDTVTYTITVHNPDATKSITNINLTDTLPS
GLAFKTGTVIVNSIPDASANPTTGISIPNIDAHSNATVSFVADVTAAPSGGASSYANTAT
AEYTFQSPDSTPLTSSVTANNTIYPASDLIVPTVTKSDTSSNPIAHVATIGDTIEYTITI
ENNNATKSITNVALRDTIPNGLTFKPDSLDVNGSSTPGSSLPPSISLGTINPSSSATVKF
SVTVANPPASNSKYINTAEVDYTFQTTSGASLSNTVTKTNTVYSEDVVITPTITKANKTS
NSIPHIVAINDTVTYTITIHNPSTTKPITNINLTDTLPSGLTFKSGSVTVNSVSQPSANP
TTGINIPSITANSDATVSFVADVTTAPSGGALKYVNTATAQYSFESPDSTTLTSSVTANN
TIYTESVVITPTITKADKTSNATPHVVAVGDTVTYTITLHNPSTTKPITNINLTDTLPSG
LTFKSSSVIVNSIPDTSANPTTGISIPTIAASSNATVSFVADVTTAPSGGALKYVNTATA
QYSFESPDSTTLTSSVTANNTIYTESVVITPTITKTDNTSNAIEHIAAINDTVTYTITLH
NPSTTKPITNINLTDTLPSGLTFKSGSVTVNSIPDTSANPTTGISIPTIAASSNATVSFV
ADVTAAPSSGALKYVNTATAQYSFESPDSTNLTSSVTANNTIYPESVIITPTITKTDNTS
NAIEHIAAINDTVTYTITLHNPSTTKPITNINLTDTLPSGLTFKSGSVTVNSVSQPSANP
TTGINIPSITANSDATVSFVADVTAAPSSGALKYVNTATAQYSFESPDSTTLTSSVTANN
TIYPESVVITPTITKTDKTSNAIEHIVAINDTVTYTITLHNPSTTKPITNINLTDTLPSG
LTFKSGSVTVNSVSQPSANPTTGINIPSITANSDATVSFVADVTAAPSSGALKYVNTATA
QYSFESPDSTTLTSSVTANNTIYPESVVITPTITKTDKTSNAIEHIVAINDTVTYTITLH
NPSTTKPITNINLTDTLPSGLTFKSSSVIVNSIPDTSANPTTGISIPTIAASSNATVSFV
ADVTAAPSSGALKYVNTATAQYSFESPDSTTLTSSVTANNTIYPESVIITPTITKTDNTS
NAIEHIVAINDTVTYTINFHNPDATKPITNVNLTDTLPSGLTFKSGSVTVNSVSQPSANP
TTGISIPTITANSDATVSFVADVTAAPSGGALKYVNTATAQYSFESPDSTTLTSSVTTNN
TIYYDSIVITPNVIKTANTNVASVGNIITYTITAENTSNSTPLTNVTLTDILPSGLSFNS
GSLKINNTPNNGSPIEGISIGNITPNKTTTIEFSATINAKPANRTSYVNTANIAYQFNSP
AGNLSNTVTSTNTIYSSDIVPNPEIIKSSNPKFANVGDVITYTITARNSSPLLNISNANI
KDTLPSGLSYNPSSLTVNGIPNSNSIISGININNLNPNSTTNINYTATVISPPSNNLPYT
NSVTIAYSYVFPDGSNFRDNVTTTNDLYPNNILVKPTLSLSVDKDNVSTGDTINFAILIS
NNNSTPIENPVLTDILPNGLEYVPGTLKIDEVPSSHSLTTGVILPNMHQNSSHTITFSVN
VTTPPNTGIEYTNYTTLNYNFQSSMGNLTNTINSNTVNIINNDVSVKPMAFKNYIYKTTK
NTSIKETLTAANINNSPMAFTMTTAPINGFAAIDEYGTFRYTPKVNFVGTDRFTVSATNN
LGNSTLITVILLVEEFAQSLDYAIRCRK
NT seq
9267 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctattattcctattttttcaaaaaacgctaatgctgctattacattcacaggaaat
gcccttggattaagtaaagctttaaacacccaagatatgggtaccgaaagcgctataggg
gcttatataactaataatactacatctagtgttagtacttatcctaatggtactacatca
acgtattccttaaattcttcatctgctgtattaaatataccttctgggagtactatttta
tatgctgaactaatttggggaggatcatgtcaggtacaaagtgaagatcatacttctgct
gtaaatactactgcaattagttttactattcctacaactccacctcaagcagtgactata
gatagttcttacacccctacccccgtcactagatttcaacctactgattcaggtaatgct
acattttatataagaagagctaatgttacttctcttgtccaaaaggctttatcaggaact
tatacagtaagtggtgtcattggaacaactcaatcattaaataactctgataatagttgt
ggttggactttagcagtttcctatgaaaattcatctcttccatctagatatctagcatta
tatagtaatatagaagccatagctcctaattctactacaaatataaatattaccaatttc
aaaacaccgacttctggaactaccgaaggtaggatattactatcagccttacgtggttca
gccacagatacaggtgatcaagttttatttggtgctaattcatctagtttaacaccttta
tcaggacctcgtaatttagaaagtaacttttttggttctcaaattaacggcaatgatgga
aatttaaatacttcaggaacttttggtaatagaaatcaagatattttaactgcaactaat
atcagtgggggccgccaaagtcaagatattacaaatgtaaatactacaagtaaattaact
aataatcaaactaatgctgttctacaatttaaagctgctgctcgtgaatattttgttaat
gcacttggcgttcaaatagatatagatactcctatatttagtaacttaaatataactact
aacaaacaaattgtatctattggaaatactgtcgactatacaattgctgtaaaaaactct
ggaactgtagatgctaaaaacgtaattttaactaatacactacctactggattatcatac
aaatctaatactttaactattggtggcacttctaattctggtaatcctactacaggtgtt
tctttaggtgctattaatgctggtcaaactatagaagtcaaattcactgctgatgttaat
gcagagccaactggagatactcgatatattaactcaaccaaaatagattatagttttgat
attactaatgatactgtaactcctggtactgtagatactgtaactaaaagtgacacaagt
actaatacaatttatcctcaatccattgttattactcctactgtcactaaaacagataag
tccagtaataccgttgaacatgttgttcttataggtgatactgtaacttataccattaat
attcacaatcctgatgccactaagcctatcactaatgttaatttaacagatgtattgcct
tctggtttaactttcaaaaccggttcagtaattataaatggtacatctcaatcatctgct
aatcctactaccggtattaatattactaacattttacctagtagtgatgctaccatatct
ttcattgcagatgttacctccaatccttcttccggtacttcaaaatatgttaataccgct
aatgttgagtatagctttcaagctcctgactctacagtcctaactaatactgtaacagcc
accaatactatttaccctttttctgttattataatacctgatttcagaaaagaagataca
actagtggtaccattaatcatgttgtttctataggtaatactgtaacctacactatcact
attcgtaatcctgatgctactaaatctctaactaatattactttaactgatcgtttacct
tctggtttaacctttaaatctggttctgtatctattaatagtactcctgattcctctgct
aatcctactactggtattcctatttctgatattaaacctggaactactactactgtttca
tttattgttgatgttactggtcctcctactggagttaagttcttatatcttaatactgct
accattgaatatagtttcttatctcctgactctacacttttaactagttctgctacaaca
cctaattctatctatggagattctgttgttattactcctactattaccaaagctgataaa
actagtaattctattccccatattgtagctataaatgatactgtaacttacaccattacg
attcacaatcctagcactactaaacctattaccaatatcaatttaactgatactcttcct
cctggtttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtgtttctcaaccttctgct
aaccctactactggtattaatattccttctattactgctaatagtgatgctactgtttct
tttgttgctgatgttactgctgctccttctagcggtgctttaaaatatgtaaatactgct
actgcccaatatagttttgaatctcctgattctactactttaactagctctgttacagca
aacaatactatttatcctgaatctgttgtcattactcctactatcaccaaagctgataaa
actagtaatgctgctaatcatattgtagatataggtgatactgtaacttacaccattact
gttcataatcctgatgccactaaatctattaccaatattaatttaactgatactctacct
tctggtttagcatttaaaacaggaactgtaattgttaatagtactcctgacgcatccgct
aatcctactactggtatttctattcctaatattgatgctcatagtaacgctactgtttct
tttgtcgctgatgttactgctgctccttctagtggtgcttcaagttatgctaatactgct
actgctgaatataccttccaatctcctgattttacaccactaactagttcagttacagct
aataatactatttatccagcttctgaccttatagttcctactgttactaaaagtgatact
tctagtaatcctattgctcatgtagctactataggtgatactatagaatacaccattact
attgaaaataataatgcaactaaatctattacaaatgttgccttaagggatactattcct
aatggattaacttttaaaccagattccttagatgttaatggatcttctactcctggttct
agtctacctcctagtatttctttaggtactattaatccttcttcatctgctactgttaaa
ttttcagttactgtagctaaccctccagcaagtaattctaaatatattaatactgctgaa
gttgactacactttccaaactacaagtggagctagtctttctaatactgttactaaaact
aatactgtttattctgaagatgttgttatcactcctactattactaaagctgataaaact
agtaattctattccccatattgtagctataaacgatactgtaacttacaccattacgatt
cacaatcctagcactactaaacctattaccaatatcaatttaactgatactcttccttct
ggtttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtgtttctcaaccttctgctaac
cctactactggtattaatattccttctattactgctaatagtgatgctactgtttctttt
gttgccgatgttactactgccccttctggtggtgctttaaaatatgtaaatactgctact
gcccaatatagttttgaatctcctgattctaccactttaactagctctgttacagctaat
aatactatttatcctgaatctgttgtcattactcctactatcaccaaagctgataaaact
agtaatgctgctaatcatattgtagatataggtgatactgtaacttacaccattactgtt
cataatcctgatgccactaaatctattaccaatattaatttaactgatactctaccttct
ggtttagcatttaaaacaggaactgtaattgttaatagtattcctgacgcatccgctaat
cctactactggtatttctattcctaatattgatgctcatagtaacgctactgtttctttt
gtcgctgatgttactgctgctccttctggtggtgcttcaagttatgctaatactgctact
gctgaatataccttccaatctcctgattctacaccactaactagttcagttacagctaat
aatactatttatccagcttctgaccttatagttcctactgttactaaaagtgatacttct
agtaatcctattgctcatgtagctactataggtgatactatagaatacaccattactatt
gaaaataataatgcaactaaatctattacaaatgttgccttaagggatactattcctaat
ggattaacttttaaaccagattccttagatgttaatggatcttctactcctggttctagt
ctacctcctagtatttctttaggtactattaatccttcttcatctgctactgttaaattt
tcagttactgtagctaaccctccagcaagtaattctaaatatattaatactgctgaagtt
gactacactttccaaactacaagtggagctagtctttctaatactgttactaaaactaat
actgtttattctgaagatgttgttatcactcctactattactaaagctaataaaactagt
aattctattccccatattgtagctataaacgatactgtaacttacactattacgattcac
aatcctagcactactaaacctattaccaatatcaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtgtttctcaaccttctgctaaccct
actactggtattaatattccttctattactgctaatagtgatgctactgtttcttttgtt
gccgatgttactactgccccttctggtggtgctttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgattctaccactttaactagctctgttacagctaataat
actatttatactgagtctgttgttattactcctactattactaaagctgataaaactagt
aatgctactcctcatgttgttgctgtaggagatactgtaacttacactattactcttcat
aatcctagtactactaaacctattaccaatattaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctagctctgtaattgttaatagtattcctgatacgtccgccaaccct
actactggtatttctatccctactattgctgctagtagtaatgctactgtttcttttgtt
gccgatgttactactgccccttctggtggtgctttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgattctaccactttaactagctctgttacagctaataat
actatttatactgagtctgttgttattactcctactatcactaaaactgacaatactagc
aatgccattgagcatattgcagctataaacgatactgtaacttacactattactcttcat
aatcctagtactactaaacctattaccaatattaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtattcctgatacgtccgccaaccct
actactggtatttctatccctactattgctgctagtagtaatgctactgtttcttttgtt
gctgatgttactgctgctccttctagcggtgctttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgactctactaatttaactagttctgtcacagcaaacaat
actatttatcctgaatctgttatcattactcctactatcactaaaactgacaatactagc
aatgccattgagcatattgcagctataaacgatactgtaacttacactattactcttcat
aatcctagtactactaaacctattaccaatatcaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtgtttctcaaccttctgctaaccct
actactggtattaatattccttctattactgctaatagtgatgctactgtttcttttgtt
gctgatgttactgctgctccttctagcggtgctttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgattctactactttaactagctctgttacagcaaacaat
actatttatcctgaatctgttgtcattactcctactatcactaaaactgataaaactagc
aatgccattgagcatattgtagctataaacgatactgtaacttacactattactcttcat
aatcctagtactactaaacctattaccaatatcaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtgtttctcaaccttctgctaaccct
actactggtattaatattccttctattactgctaatagtgatgctactgtttcttttgtt
gctgatgttactgctgctccttctagcggtgctttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgattctactactttaactagctctgttacagcaaacaat
actatttatcctgaatctgttgtcattactcctactatcactaaaactgataaaactagc
aatgccattgagcatattgtagctataaacgatactgtaacttacactattactcttcat
aatcctagtactactaaacctattaccaatattaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctagctctgtaattgttaatagtattcctgatacgtccgccaaccct
actactggtatttctatccctactattgctgctagtagtaatgctactgtttcttttgtt
gctgatgttactgctgctccttctagcggtgctttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgattctactactttaactagctctgttacagcaaacaat
actatttatcctgaatctgttatcattactcctactattaccaaaactgataatactagc
aatgccattgagcatattgtagctataaatgatactgtaacttacactattaattttcat
aatcctgatgccactaaacctattaccaatgttaatttaactgatactcttccttctggt
ttaacctttaaatctggttccgtaactgttaatagtgtttctcaaccttctgctaatcct
actactggtatttctatccctactattactgctaatagtgatgctactgtttctttcgtt
gctgatgttactgctgctccttctggcggtgccttaaaatatgtaaatactgctactgcc
caatatagttttgaatctcctgattctactactttaactagttctgttacaacaaataat
actatttattatgattctattgttattactcctaacgtcataaaaactgctaatactaat
gttgcatctgttggtaatattatcacttataccattactgctgaaaatactagtaactca
actcctcttactaacgtgactttaactgatattcttcctagcggtttatcttttaattct
ggatccttaaaaataaataatactcctaacaatggttctcctatagaaggaatatctata
ggcaatataactccaaataaaacaactactattgaattctctgccactattaatgcaaaa
cctgccaatagaactagttatgttaacactgctaatatagcatatcaattcaatagtcct
gctggaaatctatcaaacactgttacttcaactaataccatatattccagtgatattgtg
cctaatccagaaatcattaaatcttctaatcctaaatttgctaatgtaggtgatgtaata
acttatactataactgctagaaattctagtcctttattaaatatcagtaatgccaatata
aaagatactttaccatcaggattatcttataaccctagctctttaactgtaaatggtatt
cctaattctaactctattatatcaggaataaacattaataatcttaaccctaattctact
accaatatcaactatactgctactgttatatctcctcctagtaataatttaccatatact
aattccgtaactatagcctatagttatgtatttcctgatggttctaactttagagataat
gtaacaactactaatgacttatacccaaataatatacttgtaaaacctacactatctcta
tctgtagataaagataatgtatctactggagatactataaattttgcaatattaatttcc
aataataactctactcctattgaaaatcctgtattaactgatatattaccaaatggtcta
gaatatgttccaggaactctaaaaattgatgaagttccttcatcacattctctaacaaca
ggagttattcttcctaatatgcatcaaaatagttctcatactataacattttcagttaat
gtaactactccacctaatactggtatagaatatactaactatacaactttaaattacaat
tttcagagttctatgggtaacttaactaacactattaatagtaatactgtaaacattatt
aataatgatgtaagtgtcaaaccaatggcttttaaaaattatatatataaaactactaaa
aatacttctattaaagaaactctaactgctgctaacattaataattcccctatggcattt
actatgacaactgctcctattaatggttttgcagctattgatgaatatggaacatttaga
tatactcctaaagtaaactttgtaggaactgatagatttactgtgtctgcaactaataat
ttaggaaactcaactttgataactgtaatcttattagttgaagaatttgctcaatcgttg
gattatgctattcgttgcagaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system