Clostridium botulinum BKT015925: CbC4_1474
Help
Entry
CbC4_1474 CDS
T01475
Name
(GenBank) putative alpha amylase, catalytic domain protein
Organism
cbn
Clostridium botulinum BKT015925
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
X25_BaPul_like
CBM_48
Malt_amylase_C
Alpha-amylase_N
AMPK1_CBM
Alpha-amylase_C_2
MDHAR3-like_C
Neopullulanase-like_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEB76153
LinkDB
All DBs
Position
complement(1566289..1569573)
Genome browser
AA seq
1094 aa
AA seq
DB search
MKRFSKKSEIVISALIATFIMQTTVRASTKDNSNDICIGNLGHNSVNVSGNVTKNVQIKT
EKPNNIIKESINLNKDGTLTFKYYNSNAKYVYLSYDMINKHNEKRAMIKNKDNVWEITLR
LSDEKKDYLYNFIVDGEVILDPSNLNKEKDNEGNIRSKYSFKGFNGRKITLPGSIQGAIG
ESNWDPTDKQGKSTFGYDGNGNYKLILKNVPAGNYEYKIAMGNWNENYGLNGINDGSNIK
INNPKVQDIVFWYNDDSHRVINSLTYKDKEIYLKGDKLPQNIKLLDSEYSGIYSAVINLE
KGNYTNMKIVFDNKEIPIKNICIKDNIKRVKITFDPTTGMSFNNLSNKELNKNEIYFNSR
DIKYKNKFGAVKKDESVIFSIKTLKDDVSEVKMIVEDYNKQKKILELKKLGKFDENHDKW
TVNTKFTNIGIYKYYFIISNGSKTVAYCDDGLLGEGKVSEVHNILPYEVNVFSKDFKTPD
WMKNAIVYQIFPDRFLNGNKNNDKSRLDSRGNTMYEFYEDWYAIPENPNLEFNEEGSVKK
DYKGTKGDGIFCNEIYGGDLIGIRKKLDYLKALGVNTLYLNPIASSISNHRYDTTDYKEI
DSILGNIEDFKELSKEAKKRNMHIILDGVFNHVSDDSVYFDRYGKYIKSGKPIGAYVYWS
KIYDKMNLEKISQKQAEIEVINELKNQGITDIHYKDWFKVSNNKIKPGTKDEHYEYEGWA
GYDSMPVIKSPKGSEYNIKTWADEIIDGKDSIARYWLKQGSNGWRLDVANEVSDETWRKF
RNAVKAEGDNVIIGEIWNDSSKYLLGDMYDSVMNYRFRNCVLGFLRDGKSAKEIQNELEY
IREQYPKEAFDVMLNLVDSHDTERILCSLDGMVKDKNDNVIPLKVSEKAKKLQRLVPYIQ
MTYPGAPCIYYGDEMAMLGAKDPDDRRGMNWGKGDKQAVEVYATLSNIRNIYEVLRNGNV
KNIESNNDDILCYERYNITDKSLVVINRGEKFEKIELNLSDFKDGEIMYDAITGEKYEIK
GGKINLKINPMSGIVFVNEYKKFKLNNINLKEAYDPQFVVNNHDDEVNNNISINKFLNIK
EILRSIIDVISGMI
NT seq
3285 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagattttcaaaaaaatcagaaatagttatctcggcattaatagctacatttatt
atgcaaactacagttagagctagtactaaggataatagtaatgatatctgtatagggaat
ttgggacacaattctgtaaacgtttccggtaacgttaccaagaatgttcaaataaaaact
gaaaaacctaataacataataaaagaaagtataaatttaaataaagatggtacattaaca
ttcaaatattataattcaaatgcaaaatatgtttatttatcttacgacatgataaataaa
cataatgaaaaaagagctatgattaaaaataaagacaatgtttgggaaataaccttaaga
ttaagtgatgaaaaaaaagattatttatataattttatagttgatggtgaagtgatatta
gatccttcaaatttgaataaagaaaaggataatgagggaaatataagatctaaatatagt
tttaaaggatttaatggaagaaaaataactcttcctggaagcatacaaggagctattgga
gaatcaaattgggatcccactgataaacaagggaaaagtacttttggctatgatggtaat
ggaaactataagttgatattaaaaaatgtaccagcaggtaattatgaatataagatagcg
atgggaaattggaatgaaaactatggcttgaatggtataaatgatggtagcaatattaaa
ataaataatcctaaagttcaagacatagtattttggtataatgacgatagtcatagagta
attaattcattaacatataaagataaagaaatatacttaaaaggagataaacttcctcaa
aatataaaattattagatagtgagtatagcggtatttattccgctgtaattaatttagaa
aaaggtaattatactaatatgaagattgtatttgataataaagaaattcctattaagaat
atatgtataaaggataatataaaaagagtgaaaattacttttgatcctacaacaggaatg
agtttcaataatttatctaataaagaattaaataaaaatgaaatttattttaattctaga
gatattaagtataagaataaatttggtgctgtaaaaaaagatgagagtgtaatatttagt
ataaaaacattaaaagatgatgtttctgaagttaaaatgatagttgaagattataataaa
caaaagaaaattttagagttaaaaaagttaggaaaatttgatgaaaatcacgataagtgg
acagtgaacactaagtttacaaatatagggatatacaaatattatttcattatatctaat
ggttctaaaacagttgcatattgcgatgatggtttgttaggagagggaaaggtaagtgaa
gtgcataatatattaccttatgaagtaaatgtatttagcaaggattttaaaactcctgat
tggatgaaaaatgctattgtgtatcaaatattcccagatagatttttaaatggaaataag
aataatgataaatcaagacttgattctagaggaaatacaatgtatgaattttatgaagat
tggtatgctatacctgaaaatcctaatttagagtttaatgaagagggcagtgtaaaaaag
gattataaagggacaaagggtgatggcatattttgcaatgagatatatggaggagattta
ataggaattagaaaaaaactagactatttaaaggctttgggagttaatacattatattta
aacccgattgcatcatctatttctaatcatagatatgatactacggattataaagaaatt
gattcaatattagggaacatagaagattttaaggaactctcaaaagaggctaaaaaaaga
aacatgcatataattttagatggggtttttaatcatgtatcagatgattcggtatatttt
gatagatatggaaagtatataaaatctggaaagccaataggtgcatatgtgtattggtca
aaaatttatgataaaatgaatttagaaaaaatatctcaaaaacaagctgagattgaagta
attaatgaattaaaaaatcaaggaataacagatattcattataaagattggtttaaagtt
agtaataacaaaataaaaccaggcactaaagatgaacattacgaatatgaaggatgggca
ggatatgattctatgccagttatcaaatcccctaagggttctgaatataatattaaaact
tgggctgatgaaataattgatggaaaagattctatagctagatattggttaaaacaaggt
tctaatggatggaggctagatgttgcaaatgaggtgtctgatgagacatggagaaaattt
agaaatgcagtaaaagcagagggtgacaacgttataatcggtgaaatatggaatgatagt
tcaaaatatttgttaggtgacatgtatgactcagttatgaactatagatttagaaattgt
gttttaggatttttaagagatggaaaaagcgctaaagaaattcaaaatgaattagaatat
attagagaacaatatccaaaagaagcttttgatgtaatgttaaatctagtagattcacat
gataccgagagaattttgtgttctttagatggaatggtaaaagataaaaatgataatgtt
ataccccttaaagtaagcgaaaaagctaaaaaattacaaagattggttccgtatatacaa
atgacgtatccaggtgctccttgtatatattatggagatgagatggccatgcttggggca
aaggatccagatgatagaagaggaatgaattgggggaaaggtgataagcaagcagtagag
gtatatgcaaccttgtcaaatattagaaatatttatgaagttttaagaaatggaaatgta
aaaaatatagagtcgaataatgatgatatcttatgttatgaaagatataatattacagat
aaatctttagtagttataaatagaggagaaaaatttgaaaaaattgagttaaatttatca
gattttaaagatggagagattatgtatgatgcaataactggagaaaaatatgagattaaa
ggtggtaaaattaatttaaaaataaatccaatgagtggtattgtttttgtaaatgaatat
aaaaagtttaaattaaataatatcaatttaaaagaagcatatgatccccaatttgtagta
aataatcatgatgatgaagtaaataacaatataagtataaataaatttttaaatataaaa
gaaatattaaggtctattattgatgttattagcggaatgatatag
DBGET
integrated database retrieval system
