Clostridium botulinum A ATCC 3502: CBO0426
Help
Entry
CBO0426 CDS
T00533
Symbol
addB
Name
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
cbo
Clostridium botulinum A ATCC 3502
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cbo03400
]
CBO0426 (addB)
Enzymes [BR:
cbo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CBO0426 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cbo03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
CBO0426 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
ATPase_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAL81979
UniProt:
A5HYX0
LinkDB
All DBs
Position
508161..511613
Genome browser
AA seq
1150 aa
AA seq
DB search
MSLRFIYGRAGSGKSQYCLNSIKNRIEEDIDRPLILLVPEQFSFQAEKNLIEVLDEKTGF
KTQVLSFKRMAYRVFNEVGGITAKHMNESGKSMLLYNIIEDNKNNLKVFKKAAKRQGFIT
TISDIITEFKRYNITPEIILNNLENIEGDNLKYKMEDLALIFSQFETRLHKNYIDNEDDL
TILAEKLNKSKQFDNAEIWIDEFSSFSPQEYSVLEKLLLKSYRINITLCTDYLNQGRFVD
TTDVFSPIKNTENKLLQIIEDNNIKLDKPIALNCDPCARFKNSAELQHLEKNMFSFPYKE
YKNETKDICMLKTLNQFTEIENTAKDIIKLCIDKGCRFKDIAVITGDLEGYENIISSVFL
QYNIPFFIDKKREINNNPIIVLILSALEVLSKNWTYESVFRYLKTGLLDINNEEMDILEN
YVLANGIKGYQWTNDKPWEHKFFSNYELEDQVEKELLAKINDIRYKAMEPIVTLNKNFKS
IDKAKEFCEVLYEFLCNINLPDKIQNMIEDFKVEGEIEKASEYNQIWNIVMEVLDQIVEV
IGEEKISLKEFFKILQTGLSEYEIGLIPPTLDQVMVGSITRLRSHNINTLYIVGVNDGIF
PSPLKEEGILSDDDRKFLGDKGLEIAKDTKSIAFEEQFLVYSTLTTPSKYLRLSYPIADG
EGKTLRPSIIISRIKKIFTNICEENDIVKLNGEEEELKNISSAKPTFNYLISNLRKDVEG
AKIDNIWGDTYKWYLENEFWIEKLNRLIKGFDYTNQSKYIETKKIRNLYGKPLKISVSRV
EKFSQCPFAYFVQYGLKAKDRKIFNLSYPDLGIFMHSILEKFSHELEKQGLEWDTMDLNW
AEEEIDKLINEELDNKSLDILNSSKRYEYVTKSVKKILKRSIWLIGEHIKRGNFKPSYYE
LSFDIDGDYPPIAMELHSGEVVNLIGRVDRVDLLQKDGATYLKIIDYKSGAKEFKLSDVY
YGLQLQLLIYLDAILTELAERSGINGEPGALLYLKLDDPIVKNTVDMSDEEIEKSIIKNL
KMKGLILNDPNVIRDMDNIISGISDIIPVMVKKDGGVSEGRSSVATKEEFETLRKYVRYT
IIEICEEMLEGNIEIKPYKKKDGSSCDYCIYSSVCKFDTNIRGNKYNILIDKKDEEVWDA
IKKKLEYKNI
NT seq
3453 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttaagatttatatatggaagggctggcagtggaaaaagccaatattgtttaaat
agtataaaaaatagaatagaagaagatatagatagaccgcttatattattggtaccggaa
caattttcttttcaagcggaaaaaaatttaatagaagtattagatgagaaaactgggttt
aagacacaggtattaagttttaaaagaatggcttatagggtctttaatgaagtgggaggt
ataactgccaaacatatgaatgaatccggtaaaagcatgcttttatacaatataattgaa
gataataaaaataatctaaaagtattcaaaaaagctgctaaaaggcaagggttcattact
acaatttcggatattataacagaatttaagagatataatataactcctgaaattatatta
aataatttagagaatattgaaggagataatttgaaatataaaatggaagatttagctttg
atattttctcagtttgaaacaagattacataaaaactatatagataatgaagatgattta
actatattggcggaaaaattaaataaaagtaagcaatttgataatgcagaaatatggata
gatgaattttcaagtttttctcctcaagagtattctgtattagaaaaattacttttaaaa
tcctatagaataaatataactttatgtacagattatttaaaccaaggcagatttgttgat
actacggatgtattttctcctattaaaaatacagaaaataaattgctacaaataatagaa
gacaacaatataaaattggataagcctatagcacttaattgtgacccttgtgctaggttt
aagaatagtgcagaacttcagcatttagagaaaaatatgttttcttttccttataaagag
tataaaaatgaaacaaaagatatctgcatgcttaaaactttaaatcaatttacagaaata
gaaaacaccgcaaaggatattataaaactttgtatagataaaggttgtagatttaaggat
atagcagtaattacaggagatttagaaggatatgaaaatataataagttctgtatttttg
caatataatattccattttttatagataaaaaaagagaaataaataataatccaataata
gtattaatactttctgctctagaggttttatctaaaaattggacttatgaatcagtattt
agatatttaaaaactggacttttagatattaataatgaagaaatggatattttagaaaac
tatgtgcttgctaacggtattaaaggatatcaatggactaatgataaaccttgggaacat
aaattctttagcaattatgaattagaagatcaagttgaaaaagagctactagctaaaata
aatgatataagatataaagctatggaacctattgtaacccttaataaaaatttcaaaagt
atagataaagcaaaagaattttgtgaagtattatatgaatttttatgtaacataaatcta
ccagataaaatacagaatatgatagaagattttaaagtagagggtgaaatagaaaaagct
agtgagtacaatcaaatatggaatatagttatggaagttttagatcaaatagtggaggtt
ataggtgaagaaaaaatatccttaaaagaattttttaagatacttcaaacaggactttca
gaatatgaaatagggcttattccacctacattagatcaagtaatggtgggaagtataaca
agacttagaagtcacaatataaatacattgtatatagtaggggtaaatgatggcatattt
ccatcaccattaaaggaggaaggaattttaagtgatgatgatagaaagtttttaggagat
aagggcttagaaatagctaaggacactaaaagtatagcctttgaggagcaatttttagta
tattctacattaactactccaagtaaatatttgagattgagttatcctatagcagatgga
gagggaaaaactttaagaccatctataatcatatcaaggataaagaaaatatttactaat
atatgtgaagaaaatgatatagtaaaactcaatggtgaagaagaagaactaaaaaacata
tcctctgcaaaaccaacttttaattatttgatatctaatttaagaaaggatgtagagggg
gcaaaaatagataacatatggggagacacttataaatggtacttggaaaatgaattttgg
attgaaaaattaaatagattaataaaaggatttgattatacaaatcaaagtaaatatata
gaaacaaaaaaaataaggaatttatatggcaaaccattgaaaataagtgtatctagagta
gagaaattttctcaatgtccctttgcttattttgtacaatatggattaaaggctaaggat
agaaaaatatttaatttaagttatccagatttagggatatttatgcatagcatattagaa
aaattttcacatgagttagaaaagcaaggtctagagtgggatactatggacttaaattgg
gcagaagaagaaattgataaactaattaatgaggaattggataataaatctttagacata
ttaaatagttcaaaaagatatgaatatgtaaccaaaagtgtaaaaaagattttaaaaaga
tctatatggctaataggagaacatataaaaagaggaaattttaaaccaagttattatgaa
ttatcctttgatatagatggagattatcctcctatagcaatggaacttcactctggagaa
gttgtgaatttaataggtagagtagatagagtagaccttttgcaaaaagatggagctact
tatttaaaaataatagattataaatccggtgcaaaggagtttaaattatcagatgtttat
tatggattacaattacaacttttaatatatttagatgctatacttacagaattagcagaa
agatctgggataaacggagaaccaggagcacttttatatttaaaattagatgatcctata
gtaaaaaatactgtagatatgagtgatgaagaaattgaaaaaagtataataaaaaattta
aagatgaagggtttgattttaaatgaccctaatgttataagagatatggataatataata
tctggtatatcagatattatacctgttatggttaaaaaggatggaggagtatcagaaggt
agatcctctgtagctacaaaagaagagtttgaaacattaagaaaatatgtaagatataca
ataattgaaatttgcgaggaaatgttagagggaaatatagaaataaaaccatataaaaag
aaggatggatcttcttgtgactattgcatatattcttcagtttgtaaattcgatacaaat
ataaggggaaataaatataatatattaatagataaaaaagatgaagaagtatgggatgct
attaaaaagaaattagaatataaaaatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
