Ciconia boyciana (Oriental stork): 140643379
Help
Entry
140643379 CDS
T10948
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
cboy Ciconia boyciana (Oriental stork)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
Ig_3
fn3
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Ig_2
ig
Pur_ac_phosph_N
THB
Tissue_fac
CRLF2-like_D2
Receptor_2B4
Ig_J_second
C2-set_2
SusE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140643379
NCBI-ProteinID:
XP_072701146
LinkDB
All DBs
Position
23:6657195..6684958
Genome browser
AA seq
2678 aa
AA seq
DB search
MTSHQAVKSFKKSSVPGVVITQFVDDIPQGCSTPDFEQKPVSQTLQEGKNAIFRAVVKGI
PTPDVKWTRIQGGMDDPAKYETFFNNVTNEFILQINKLTADDSDLYRCFAVNEYGEAACS
AGLRIIQVRFKRKAKYVPVHPADELRKKLQEFRKLLRKRAPAPKPKPLDKEAVWQLLLHA
DRRDYEKICMKYGIVDFRGMLRKLQEIRRDTESEQAELIHSVKNFQHIKVNKDGKATFRL
EMDLKNSNSKIYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRIGKRYTFIVNDVQPEDAGLYQVRVE
DVPVFSTELDAEAIPVRFEQPLSDVHCPEEEDAVFESILRTPCYDAVWLHKTHLLEASEK
HQISVTPDGLTHQLIIKNVVPSDSGMYTLDTGLCSSNAWLIVEYSKGKSRQGERGEREKS
EWLKETLPDKERAKKLRREYVSDEDHLMDTGVEEDGWYRNGQGGSQGHSVDVDGSHRFLG
KDGLRGAHRNGRMGFGQFSGADLDGDSMTNDGSSFGLKGLGGKSGLRPFRGKDSMTGRAD
TGDELGEAGEWYSVDGRDDGMLDAVNIDLDDGEGVGSQHDKDGKLGDTSYRAGFGGVGRL
GAADGSSVLDGLDPDSTGVGDGMRSPYGKDGLPTIVDMNGASIKREGQTGTPYGKDGQTL
DASGHLGQEGRSGLLYGPGGLPARDGVIPGAGGSSIGEVVVFYGPDGQPVGAGVGDAGVA
GAGGIGSPYGKDGLPAGAGIGGAGAGGFGSPYGKDGVPPGAGLGGAGAGGVGSSYGKDGL
PGGAVLGGAGVAGAGGVWSPYGKDGLPVGAGAGSAGVAGTGGVGSPYGKDGLPAGVGLAG
IAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGLVVGAGAGVAGAGGFGSPYGKDGLPAGTGLGGAGIASVG
GVGFPYGKDGLPAGTAAAGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGAGVWGVAGAGAGVAGAGG
VGSPYGKDGLPAGAGAGVAGTGGVGSPYGKDGLPAGVGLAGIAGAGGVGSPYGKDGLPAG
AGIGGAGVAGAGVFGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGVRAGGAGV
AGAGRVGSPYGKDGLPVGAGAAGAGLGGAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGAGGAGVAGVGGV
GSPYGKDGLPAGAGAGGAGVAVAGGVGSPYGKDGLPAGAGLGGLAGTGGFGSPYGKDGLP
PGVGAGGAGIAGAGGVGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVGGVGSPYGKDGLPAGVRAGGAGVA
GAGRVGSPYGKDGLPVGAGAAGAGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVAGAGGVG
SPYGKDGLPAGAGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGL
PAGAGAGGAGAWGVGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGAGGAGV
AGAGGVGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVAGVGGVGSPYGKDGLPVGAGAGVAVAGGVGSPYG
KDGLPVGAGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPAGAGAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGA
GAGGAGVAGAGGVGSPYGKDGLPVGAGAGGAGVAVAGGVGSPYGKDGLPAGAGAGGAGVA
GAGGVGSPYGKDGLPAGAGAGAAHFPFGGEEVMGSRHGRGAMPSRAQGYIGGARGDGFSS
EGGGVSGSAIRSAGSPYGKENGSAGARAGVGGVGGLGDESELHSVRGKEGVEGAVGRGGE
YGLDSHPGKSSMGGETGKGTASHFRGSGNKGLSHDRDSLSGQGDARGKDRDLGQLGSLYG
KNSAFGGSGSKSYNRSVYGRNSGGFGQGSLDYGQMSDLYGGPPSINQRKQEPSLDIKAND
FLKNTESMGKIRRYCLDDLKAPRCHVNKQLLDVRVLKGEPAELSCTVSKDEVTGTWFKDG
LKLKSMDGVFFEKEGLVHKLIIDKVEDIHAGKYRFEGGDIKTEASIFVEDPPQVDKVLLK
NLTNVPTVAKAGQNVKIKIPFKGRLPVRATWLKDRVELVDDKRIRVDKTETFTMLSISSS
ERKDCGDYKVRLKNDSGALEINLKLVVIDKPQPPAGPIKIVESSANDITIQWKPPKDDGG
KPLQSYIVERQQVGKNDWVTLGETPRSCTTFTTNKVEQDTSYYFRVRAVNAEGTSDALES
DEVKAVSKASPGAPDPPEIVSASRDTITISWKAPRKTGTSRIVGYMVQKRKKGTTTWLPV
NNVPIADKKLKMTNLKKGLQYEFRVAAVNAAGIGDASEPSQPVFARDSTKSPGQVQDLKV
SSSDSTSVTLTWKRPEAKDGSDVKGYEVEMRSSNTLNWTKCNTVPIEMTTYTVKGLQAKE
MYFLRVRALNDSGPGEAAELEACIEAAPPVVSPRLLIDDTVKRFLVIKAGNTIRVNIPFE
ASPDPVVTWLKDGLPLPKRATINTKDGTTQLLIGAAEFTDSGTYTVELQNGLGKRETFSF
QVQVTDIPQSPGPIQLEENVPNTVTVTWEPSASEKWESNLYYTVLKRESQKGLWHVVGDL
IYTNKFTFTKLIPGRDYYFRVVAKNDLGASGPSETVQPWRIKKPKVEFQVKQQKYRGVNQ
NQPPRFLAPLKPHVVTTGSECHMTCAVGGHPPPKITWYKDSRDLSNDPTYFCTNSFGVCS
LVVLGVTKHDEGEYMVEATNELGRAFSKAFLTIKGNNL
NT seq
8037 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaagccatcaggcagtaaaatccttcaagaaatcttctgtcccaggagttgttatc
acccagtttgtggatgatattccacaaggatgcagtacacctgactttgagcagaaacct
gtcagccagacattgcaggaaggtaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtatc
ccaacccctgacgtgaaatggacgcgtatacaaggaggaatggatgatcctgccaaatac
gaaacattcttcaataacgttacaaatgaattcattctgcagataaacaaactcactgca
gatgacagtgatttgtatcgttgctttgctgtgaatgaatatggggaagctgcatgctct
gctggcctcaggatcatacaagttcgctttaaaaggaaagcaaaatatgttcctgttcat
cctgctgatgagttaaggaagaagcttcaggaattcaggaagctgctgaggaagcgggcc
ccagcaccaaaaccaaaacccttggacaaagaagcagtctggcaactgttgctgcatgca
gataggagagattatgagaaaatctgtatgaaatatggaattgttgacttccgtgggatg
ctgagaaagctgcaggagataaggagggacacagagagtgaacaagcagagttaatacac
agtgtcaaaaactttcaacacatcaaagtcaacaaagatggaaaagctacgttcagactg
gagatggacctgaagaacagtaacagcaaaatttatctgcttaaggatggtgagaggctc
agatatggaacgggggatgaatacagaaagcactgcctgaggcgaattggaaaaaggtat
actttcattgtcaacgatgtgcagccagaagatgcaggcttgtatcaagtcagagtggag
gacgtacctgttttctcaactgaactggatgctgaagccatccctgtgagatttgagcag
ccgctcagtgatgtgcattgtcccgaggaagaagatgctgtctttgagtctatcctacgc
acgccctgctacgatgctgtgtggctacacaaaacgcacctcctcgaggcaagtgagaag
caccagatctccgtaacacctgatggtctgacccaccagctgattataaaaaacgttgtg
ccctctgacagtggcatgtacacactcgacactggactctgctcctcgaatgcctggctt
attgtagagtattccaaaggaaagagcagacagggtgaaagaggtgaaagagagaaatct
gagtggctgaaagaaacattgccagataaagagagggctaagaaacttcgcagagaatat
gttagtgatgaagatcatcttatggacactggcgtggaagaagatggctggtacagaaat
ggtcaaggcggcagtcaaggccactccgttgatgttgatggaagccatagatttttggga
aaagacgggctacgcggagcccacagaaatggaaggatggggtttgggcagttttctgga
gcagacctagatggggactcaatgacaaatgatggtagtagctttggattaaaaggctta
ggaggcaaaagtggattaaggcctttccgcggcaaggattctatgacaggcagagcagat
actggtgatgaattaggagaagcaggtgaatggtattctgtggatggcagagatgatggt
atgctggatgctgttaacattgacttggatgatggagaaggtgtgggctctcagcatgac
aaggacggtaaattaggcgatactagttacagagctggctttggaggtgttgggagatta
ggtgctgctgatggaagttctgtgttagatggtctcgatcctgattcaaccggagtggga
gatggaatgaggtccccctatggcaaggatggtctgccgactatagttgatatgaatgga
gcaagtataaaaagagagggacaaacagggactccctatggcaaggatggccagacactt
gatgctagcggccatttaggtcaggaaggaaggtctggcttgctgtatggcccaggtggt
cttccagctagagatggggttatacctggtgcaggtggcagttctataggggaagttgtg
gttttctatggtccagatggtcagccagttggagcaggtgttggtgatgctggtgtagct
ggtgcagggggaattgggtctccctatggaaaggatggacttccagctggagcaggcatt
ggtggtgctggtgcagggggatttgggtctccctatggaaaggatggtgtcccacctggg
gctggtcttggtggtgctggtgcagggggagttgggtcttcctatggaaaggatggtctc
ccaggtggggctgttcttggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagtttggtctccc
tatggaaaggatggtctcccagttggggctggtgctggtagtgctggtgtagctggtaca
gggggagttgggtctccttatggaaaggatggtctcccagctggggttggtcttgctggt
atagctggggcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggct
ggtctggttgttggggctggtgctggtgtagctggggcagggggatttgggtctccctat
ggaaaggatggtctcccagctgggactggtcttggtggtgctggtatagctagtgtaggg
ggagttggatttccatatggaaaggatggcctcccagctgggactgctgctgctggagca
ggtgtagctggtgcagggggagttggttctccctatggaaaggatggtctcccagctggg
gctggtgctggtgtatggggagttgctggggctggtgctggtgtagctggtgcaggggga
gttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgctggtgtagctggt
acagggggagttgggtctccttatggaaaggatggtctcccagctggggttggtcttgct
ggtatagctggtgcagggggagttggatctccctatggaaaggatggtctcccagctggg
gctggcattggtggtgctggtgtagctggtgcaggggtatttggatctccctatggaaag
gatggtctcccagttggggctggtgctggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagtt
gggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggagtacgtgctggtggtgctggcgta
gctggtgcaggaagagttggttctccctatggaaaggatggtctcccagttggggctggt
gctgcaggggctggtcttggtggtgctggtgcagggggagttgggtctccctatggaaag
gatggtctcccagctggggctggtgctggtggtgctggtgtagctggtgtagggggagtt
gggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggagctggtgctggtggtgctggtgta
gctgttgcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggt
cttggtggtttagctggtacagggggatttgggtctccctacggaaaggatggtctccca
cctggagtaggtgctggtggtgctggcatagctggtgcaggaggagttgggtctccatat
ggaaaggatggtctcccagttggggctggtgctggtggtgctggtgtagggggagttggg
tctccctatggaaaggatggtctcccagctggagtacgtgctggtggtgctggcgtagct
ggtgcaggaagagttggttctccctatggaaaggatggtctcccagttggggctggtgct
gctggggctggtgctggtgtagctggtgcagggggagttgggtctccatatggaaaggat
ggtctcccagttggggctggtgctggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagttggg
tctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgctggtggtgctggtgtagct
ggtgcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagttggggctggtgct
ggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctc
ccagctggggctggtgctggtggtgctggtgcatggggagttgggtctccatatggaaag
gatggtctcccagttggggctggtgctggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagtt
gggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggagctggtgctggtggtgctggtgta
gctggtgcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagttggggctggt
gctggtggtgctggtgtagctggtgtagggggagttggttctccctatggaaaggatggt
ctcccagttggggctggtgctggtgtagctgttgcagggggagttgggtctccctatgga
aaggatggtctcccagttggggctggtgctggtggtgctggtgtagctggtgcaggggga
gttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgctggtggtgctggt
gtagctggtgcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagttggggct
ggtgctggtggtgctggtgtagctggtgcagggggagttgggtctccatatggaaaggat
ggtctcccagttggggctggtgctggtggtgctggtgtagctgttgcagggggagttggg
tctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgctggtggtgctggtgtagct
ggtgcagggggagttgggtctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgct
ggagctgctcattttccttttggaggtgaagaagtaatgggatctcgccatggcaggggt
gctatgccgagcagagctcaaggatatataggtggagccagaggagatgggttttcctca
gaaggtggtggtgtcagtggctctgcaatacggagtgctggctctccctatggcaaggag
aatgggtcagctggagccagggctggtgtgggtggtgttggggggttgggagatgaaagt
gagttacattcagtccgtggtaaagaaggtgtggagggtgctgttggacgaggtggtgaa
tatggtctggattcacatcctggcaagtcttctatgggaggtgaaactggaaagggcact
gccagtcatttcagaggatcagggaacaaaggtttatctcatgacagagattcactttca
ggtcaaggtgatgccaggggcaaggacagagatttaggacagttaggctccctttatggc
aaaaattctgcctttggagggtcagggagtaaatcctataacagatctgtttatgggagg
aattcaggtgggtttggtcaaggttcattggattatggtcagatgtcagatctttatggt
ggacctccttcaataaaccagagaaaacaggaacccagccttgacattaaagcaaatgat
ttcttgaagaatacagaaagtatgggaaaaataagacgttattgcctagatgatctgaaa
gcaccacgctgtcatgtcaacaaacagttacttgatgtcagagtcctgaaaggggaacca
gctgagctgtcttgcactgtcagtaaagatgaagtgacaggaacctggtttaaagatgga
ttaaagttaaaaagcatggatggagtcttttttgaaaaggaaggtctagtccacaaacta
attattgacaaagtggaagatattcatgctgggaaatacaggtttgaaggtggagatata
aaaaccgaagcttcaatttttgttgaagatcctccacaggttgacaaagttctcctcaaa
aacttaacaaatgttcctactgtggccaaggcagggcagaatgtaaagatcaagatccct
tttaagggccggctgccagtcagagcaacatggctaaaggacagagtggagctagtagat
gacaaaaggattcgtgttgataaaacagagacctttaccatgctgtccatctccagcagt
gagagaaaggactgtggggattacaaagtcaggctgaagaatgacagtggggccttggag
atcaacttaaagcttgtggtaatagacaagccacagccacctgcaggacccatcaaaatt
gtagaaagctctgcaaatgacatcaccattcagtggaagcccccaaaggatgatgggggc
aaaccgctgcaaagctacattgtcgagagacagcaggtagggaagaacgactgggtgact
ttgggagaaacccccaggagctgtactaccttcactactaacaaagtggaacaagacacg
agctactacttcagggtaagagctgtgaatgctgagggaactagtgacgcactggaatca
gatgaagtgaaggctgtcagtaaagcttcacctggtgccccagatccccctgaaattgtc
agtgccagcagagacaccatcacaatatcctggaaagcacctcgtaaaactggcacttcc
cgaattgtgggatacatggttcaaaaacgcaagaagggtaccacgacctggctgcctgtc
aacaatgtgcctatagcagacaagaagctgaaaatgaccaatctcaagaaaggtctgcag
tatgaatttcgtgtggcagctgtcaatgctgctggcataggagatgccagtgaaccgtca
cagcctgtctttgcacgggattccacgaaatctccaggtcaagtgcaggaccttaaagtg
agcagcagtgatagcactagtgtcaccctgacatggaagagacctgaagcaaaagatggg
agtgatgtgaaaggatatgaggtggagatgcggtcttctaacacgctcaactggaccaaa
tgcaatactgttcccatagagatgaccacttacacagttaaaggcctccaagctaaggag
atgtacttcctacgtgtgagagccctcaatgacagtggcccaggagaagccgcagagctt
gaagcttgcattgaagctgctccccctgtagtttctcccaggttactaatagatgacaca
gtgaaaaggttcctggttataaaagcaggaaataccatccgagtgaatattccctttgaa
gcgtctccagatccagtggtgacctggttaaaggatgggcttcctcttccaaagcgggct
acaataaacaccaaagatggtaccactcagctgctgattggagcagccgagttcactgac
agcggcacctacaccgttgagctccagaacgggttagggaaaagagaaacgttcagcttc
caagttcaagttacagatatcccacaatcacctggacctattcaattggaagagaatgtg
ccaaatacagttacagtaacctgggagccatcagcgtctgagaaatgggaaagtaatctc
tactacacagtcctgaaacgtgaatcacagaagggcttgtggcatgtggtgggtgacctg
atctacaccaacaagttcacattcaccaaactgatcccaggccgggactactactttagg
gttgtggcaaaaaatgacttgggagccagtggtccatctgaaactgtgcagccttggaga
attaaaaaaccaaaggttgaatttcaagtcaaacaacagaaatacaggggagttaatcaa
aaccagcccccgagattcctcgccccattgaagcctcatgtggtgactactgggagtgag
tgccatatgacctgtgcggttggaggccatccacctccaaagatcacatggtacaaggac
agtagagacctctccaatgatcctacctatttttgcacaaacagctttggtgtctgctcc
ctggttgtcctaggtgtcacaaaacatgatgaaggagaatatatggtagaagccaccaat
gagttgggccgtgcattcagcaaagccttcctcactattaaaggtaacaatctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
