KEGG   Chryseobacterium balustinum: EB354_14350
Entry
EB354_14350       CDS       T07847                                 
Name
(GenBank) type IV secretion protein Rhs
Organism
cbp  Chryseobacterium balustinum
SSDB
Motif
Pfam: RHS_repeat FG-GAP_3 FG-GAP SpvB
Other DBs
NCBI-ProteinID: AZB30341
UniProt: A0AAX2IK92
LinkDB
Position
complement(3098952..3105692)
AA seq 2246 aa
MKNMKLFYSIIISLLSVAGYSQTILHQTESTTRTVQDPQTVIMAPGFRATSGISNPFVAK
IGPGTENPGGGPSDSGAGAGNPSGTNAPANQSFHDTKGNIEVTKAGQLQYTLAIDIPPGV
KNIAPNISLVYTSGGQNGLAGYNWNITGLNSISRIGKNLEVDGITKGVQLDYSDYYSFNG
QRLILKSGEYGKDGAEYVTEKYSNIKIKSIGNVSGVTWQGPEYWEVTFDDGSQAWYGSAS
PGNSSARTPIDYNIVKSKDINGNLIIYNYILENNIAIISSIEWGGNEMQGTPHFNKIEFV
FGVRPLPETAYIKGIGFSQSKLLESIIVTSNHQQYKKYRVTYKKDLQETAYRYLDKITVF
NSQNEEANPVIFTYEKSMDIPNPNIQTWGFPNVVNHNYATDLFGDFDGDGRLDFMKYHTS
TSANIPQIGIYFYRNFYHVAGGGSPPVYVGNSITQAEFKNAIAVNLKRNNLVNNRQGFVT
WKYINPSGLKYDLELSFYGITENNQIVLYNKKTIPGVNYDYSVGTTQEGVRTTISGLYNV
DFNGDGLSELVLTLNDKTCWRTDINGTEKLPHQCENIKRYIVIDPDESIQNNQWFYELLL
YTDTDNAFVDYKSGDFNGDGVFDLVKIDQNKKPFIITFQKNSQGKYISSTAPFNPTNNTL
LKGIWKDGLAGDYNGDGLSDIMIPESNDSDLWYLYMSTGIDFKEETRVFMRQHKSRTVTK
DNYENITVANPRTFVAFDINNDGKTELIFLQSSRYYQKEYNQDNPSAGVKYRVTSGSGVS
VLATFGGGSNPLYSDQTYGQIVYLNSSNINSFLAPNAADKIGIPVGHSAGAMLKKFALVS
IVPNFEGDLDMDTHKYYDISMEGRIKSISQGNITTDIVYNRLDKTPTPNLYNNTSEVTNY
PYVEIGQVAGMHVVSQLIQNIAADKKLKQDFRYRGLTSNILGRGMIGFRKTARSSWYADG
FENTKIWSGVEIDPINEGIPIKEWSIRTNMESQIFPVDVSENNAQLLSFKSTTYQTDKLL
NGQLVTTFADADKPKVVTAIIPKISKSKDFLSGILTTDNITYGDYYLPLQRISNVNSGYA
ISTSTFEYTHNPTGIGVNYFIGRPKSKTDIAQAYGDTKSAKEENTYENNQLKTLKIWNRD
NTGYLLETYSYDGFGNLTQKTISNSIDPQTQTIKTNYDDKGRFILKKTDNLGLETNTTYN
NWGQILTQTNALGNVLTNTYDNWGKLLKSKINLGGTTTYQYDRDSNSNIIITQYNPDGDI
SKNYTNKLGQNYKTSTKAFGQGQFVSKDTRYDILGRKIRESELYFEGQSPSQWNVLTYDD
TVFPTKVTSTALAKINASDEITSFTGKRLITTASGLTTTIKEDNGYERTNSKTTDALGNV
LSSNDKGGTIQFTFNAAGEQIKAQYAENIVTTKYDAWGRKSEFNDPSNGLYKYEYDGFGQ
PKKIISPKGTKEYAYNNLGQLITQKELSTNDSGQASNKTITYSYDDKGRVISKSGTSKGK
AYSSNVSYDPQGRVLSSSESSNGKYFIQKGITYDDKARVISYEKQLYSSGILTKVQIENV
YSTWNGELYQIKNSLTGTVLWELKETNARGQVSKVKLGAADVNNMYDENGFLTNVNHSSQ
VKTDILQIHYSFDGIKNELRLRTTGGDFSINETFDYDDNNRLINWTNPVTGVKVQNAKLN
VYDAKGRILENDQVGKIKFENSSKIYQPTGMTLNAAGEQNYNNDLIQSVVYNENNDPVFI
DGEKGDVAFQYGLTAMRQRVTYGGNFSEDGDGKFTKFYSSDGSFEVVKDNTTGKEKHILY
IGGTPYESNILYLKNYDESTGSHKFLHKDYIGSILAISDEAGNKLEQRHFDAWGNFTHFK
IGNGAIITDKSLIANSLLLIERGYTSHEHFAEVGIIHMNGRLYDPLLRRFLNADENIQDP
YNTQNYNKYGYVMNNPMMYSDPNGEFWWWAVGAIAGGYLSGVQANNGNWNPRKWNWESTW
SAVLGGAIGGAAVSGALGNISSYAGAIKSFLPGIVSGGLNSAFTGSNFLTGAIGGISYSA
NVFDNKITSTDYFSVHESEVIDEFGEKALTQNEVIEAFQQWKGPYLSYGFKQNVYLAPLG
SIPGNYTLNESGTAFVRKGGGEAGAATVTAYNPVIGGKAVRSTIYIPPNVYSTAQVHSYF
FHEFGHSVINHKYGYKNEWNEKIETSSIEMGTKAHHAIQQSQNSFIIMNNYRKLNLQGIY
GGSYLGIFAPERVLVDLLKNLIIKVK
NT seq 6741 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagaatatgaaattattctattcaataattatatccttactttcggtcgcaggttat
tctcagaccattctgcatcagaccgaaagtacaacgaggacagttcaggatccgcaaact
gttatcatggcacctggttttagagctacttcagggatttcaaatccttttgtggctaaa
ataggacccggtacggaaaatcctggcggcggacctagtgattctggtgcaggagctgga
aatccttcaggaacaaatgctcctgcaaaccaaagttttcacgatactaaaggaaatatt
gaagttaccaaagcaggacaattgcaatatactttagcaattgatattccccccggagtt
aaaaatattgcaccaaacattagtcttgtatatactagtggaggacaaaatggtcttgca
ggctacaattggaatatcacaggattaaactcaatttctaggattggtaaaaatcttgaa
gtagatggtataactaaaggtgttcaactagattattcagattattacagtttcaacgga
cagagattaattcttaagtctggagaatatggaaaagatggtgcggaatatgtaactgag
aaatattccaatatcaaaattaaatcaattggaaatgtgtcaggagttacatggcaaggt
cctgaatattgggaggtgacttttgatgatggttctcaagcttggtacggatctgcttcg
cctgggaatagctctgcgagaacaccaatagattataatattgttaaatcaaaagatatt
aatggtaatttaattatctacaattacattttggagaataatattgcaataataagcagt
attgaatggggtggtaatgaaatgcagggtacaccgcattttaacaaaatagaatttgta
tttggagtaagacctttgcctgaaaccgcttatattaaagggattggtttttctcaatca
aaacttcttgaatctatcattgtaacttcgaatcatcaacaatataaaaaatatcgtgta
acctataaaaaggatttgcaggaaaccgcctacaggtatttggataaaatcacagttttc
aatagtcagaatgaggaagctaatcctgtaattttcacttatgaaaagtcaatggatatt
cctaacccaaacattcaaacttggggatttccaaacgttgttaatcataactatgcaaca
gatctatttggtgattttgacggtgacgggcgtctcgattttatgaaatatcatacttca
acatctgcgaatatacctcagattgggatatacttttatagaaatttttatcatgtggca
ggaggaggctctccacctgtttatgtaggaaattcaataactcaagctgaatttaaaaac
gctattgctgtcaatttaaaaaggaataatcttgttaacaatcgtcagggatttgtaaca
tggaaatatattaatccttccggtttaaagtatgatttagaactatctttttatggaatt
acagaaaataaccagattgtattatataataaaaagaccattcccggtgtaaattatgat
tattctgttggaaccacacaagaaggtgtaagaacaaccattagcggcttatataatgtt
gattttaatggagacggtttaagtgagttggtattaacactcaatgataaaacctgttgg
agaactgatataaatggtactgaaaaactcccacatcaatgtgagaatataaaaagatat
attgtaattgatcctgatgaatcaattcaaaataatcaatggttttatgaattattgctt
tacactgacactgataatgcatttgttgattataaaagcggagactttaatggagatggt
gtttttgatttggtaaaaatcgatcagaataaaaaaccattcataattacttttcaaaaa
aatagtcagggtaaatatatttcatctacagcaccttttaatccgacaaacaatactcta
ttaaagggaatatggaaggatggtttagcaggtgattataatggagatggcttaagcgat
attatgattccggaatcaaatgattctgatctttggtatctgtatatgtcaacagggatt
gatttcaaagaagaaacccgtgtttttatgaggcaacataagagtcgtacggtcactaaa
gataattacgaaaatattacggtggctaatcctagaacttttgtagcttttgatattaat
aatgatggaaagacagagcttatattccttcaatcgtcaagatattatcaaaaagaatat
aatcaagataatccaagtgcaggggtaaagtaccgcgtaacatctggcagtggagtaagt
gttttagcaacttttggaggaggtagcaatcctctttacagtgatcaaacatatggtcaa
atcgtttatcttaattcaagtaatatcaattcttttttagcgccaaatgcagctgataaa
attggaataccagttggtcattcagccggagccatgctaaaaaagtttgcattagtttct
atagtgcctaattttgaaggtgatttggacatggatactcacaagtattatgacatttca
atggaaggtcgtatcaagagtatttcacaaggaaatattactactgatattgtttataat
cgattagataaaacgccaactcctaatttatataataatacttctgaagttacaaactat
ccttatgttgaaattgggcaggtggcaggaatgcatgttgtttctcaactcatccaaaat
attgcagccgataagaagctaaaacaagatttcagatatagagggcttacatccaacatt
cttggaagagggatgataggttttcgcaaaacagcccgctcatcctggtatgctgatggg
tttgaaaatacaaaaatatggtcaggggtcgaaattgatccgataaatgaaggtattcct
attaaagagtggtcgatcagaacaaatatggaatctcagatattccctgtagatgtttct
gagaataacgcacagttactaagctttaaatcgacaacataccagacagataaactcctg
aacggtcagttagtaacaacttttgctgatgctgacaagccaaaagtagtaacggcaata
ataccaaaaatttcaaaatctaaagattttttatcaggaattttaactactgataatatt
acatatggagattattacctaccattgcaaagaatatctaatgtcaacagcggctatgca
ataagtacttctacttttgaatacacccataatcccacaggaataggtgtgaattatttt
ataggtagaccaaagtctaaaactgatattgcacaggcctatggcgacacaaaatcagcg
aaagaagaaaatacctacgaaaataaccaattaaaaactctgaaaatctggaacagagat
aatacgggttatcttttagaaacttacagctatgatggttttggtaatcttacccaaaaa
accatcagcaatagtatagaccctcaaacgcagacaataaaaacaaattatgatgataaa
gggagatttattctaaagaaaacagacaacttaggattagaaaccaatactacttataat
aattgggggcaaattcttactcaaaccaatgctttaggaaatgttcttaccaacacttat
gataactggggtaaacttcttaaatccaaaattaatttaggcggaacaactacttatcag
tatgatagagatagcaattcaaatattattataacccaatataatcctgatggtgatatt
tctaaaaattacaccaataagttaggtcagaattataaaacttccaccaaagctttcgga
cagggacaatttgtttctaaagatacacgatatgatattttaggcagaaaaattagagaa
tctgagctttattttgaggggcaaagtccttctcagtggaatgttttaacctatgatgat
acagtcttcccaactaaagttacttccactgcattggctaaaataaatgcatcggatgaa
attacttcatttacaggtaaacgattaataacaactgcttcagggttgactactaccata
aaagaagataacggctacgaaagaacaaattcaaaaacaaccgatgctttaggcaatgta
ctttcaagcaatgataaaggaggaacaatacaatttacttttaatgccgccggagaacag
attaaagcacagtatgccgaaaatattgttaccacaaaatatgacgcctggggaaggaaa
tctgaatttaatgatccttccaacggattgtataaatatgaatacgatggcttcggacag
cctaaaaaaatcatcagccctaaaggaacaaaagaatatgcatacaataatttagggcag
cttattacacaaaaagaactttccacaaacgatagcgggcaggcaagtaataaaacaatt
acttattcttatgatgataaaggaagagtaatttcaaaatccggaacctcgaaaggaaaa
gcgtatagctctaatgtttcttacgatcctcagggaagagtattgtcttcatcagaaagc
agtaacggtaaatattttattcaaaaaggaattacctatgatgataaagcaagggtgatt
tcgtatgaaaaacaactctactcttccggtattttaacgaaagttcagattgagaatgta
tatagcacctggaatggagaattatatcagattaaaaatagcctcacaggtaccgtgctt
tgggagctgaaagaaaccaatgcaagagggcaggtttcaaaggtaaaattgggagcagcc
gatgttaacaatatgtatgatgaaaatggttttctaaccaatgtgaatcattcatcacag
gtaaaaacagatattctgcaaattcattattcattcgatggcataaagaatgaattacga
ctcagaacaaccggtggagattttagcatcaatgaaactttcgattatgatgacaataac
cgactgatcaactggacaaatcccgtgactggagttaaagtacagaatgcaaaacttaat
gtttatgatgcaaaaggtagaattcttgaaaatgatcaggttggaaaaattaaatttgaa
aattcttccaagatttaccaaccgacagggatgaccctcaatgcagcaggtgagcagaat
tataataatgatttaattcaatctgttgtttataacgaaaacaacgatcctgtatttatt
gatggtgaaaaaggagatgtagcttttcaatatggtttaactgccatgaggcaaagagta
acctatggaggaaatttcagcgaagacggagatggtaagtttaccaaattctacagctca
gacggcagctttgaagtcgtgaaggataataccaccggaaaagaaaaacatattctttat
attggtggaacgccttatgaatctaatattctttatctaaagaactatgatgaatcaaca
ggctctcataaattcctacacaaagattatatcggaagcatcctcgcaatcagtgatgaa
gcaggaaataaacttgagcaaagacattttgatgcttggggcaattttacgcattttaag
attggaaatggagcaattatcaccgataaatcactcattgctaattccttattactaatt
gagaggggatataccagccatgagcattttgcagaagtaggcatcatccacatgaatggt
agattatacgatccattgttgagaagatttttaaatgcagacgagaacatccaggatcct
tacaacacccagaattataataagtatgggtatgttatgaataacccaatgatgtacagc
gatcctaacggagagttttggtggtgggcagttggtgcaattgcaggaggatatttatcg
ggtgttcaggctaacaacggaaattggaatcccagaaaatggaattgggaaagtacatgg
agtgcagtattaggaggggctattggtggtgcagctgtttcaggcgcattagggaatata
tcgagttatgcaggcgcaattaaaagttttttacctggaattgtctcagggggattaaac
tctgcatttacaggttctaacttcttaacgggagcgattggaggaatttcctattcagcc
aatgtatttgataataaaattacatctactgattatttttctgtacatgaaagtgaagta
attgatgaatttggtgagaaagcattgactcaaaatgaagtaatagaagctttccaacaa
tggaaaggcccatacttaagctatggttttaaacaaaatgtatatctagctccgctgggt
tcaattcccgggaattatactctaaatgagagtggaacagcatttgtcagaaaaggagga
ggtgaagctggtgctgcaacagttaccgcttataatcctgtcatcggtggtaaagccgta
cgttctacaatatacattccacctaatgtatattcgactgctcaggtacattcttatttt
tttcatgagtttggtcattctgttatcaaccacaaatatggatacaaaaatgaatggaat
gaaaaaattgaaacctcaagtatagaaatgggtacaaaagcgcatcatgctatccaacag
agtcaaaatagttttattataatgaataattatagaaaattaaatttgcaagggatatat
ggaggtagctacttgggtatatttgctccagaacgtgtacttgtagatttgttgaaaaac
ttaattattaaagtgaaataa

DBGET integrated database retrieval system