Congregibacter brevis: R0137_01155
Help
Entry
R0137_01155 CDS
T10793
Name
(GenBank) SdrD B-like domain-containing protein
Organism
cbrv Congregibacter brevis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOJ97196
LinkDB
All DBs
Position
complement(268389..273983)
Genome browser
AA seq
1864 aa
AA seq
DB search
MRSKKHEGLVPNIEPVWGIFRRLLQVGVCISALLASCLAWSQNPDFNVTVNTGPVAPNST
TVFPGELTSLRVTLSNNSIVNPITGVSFNGAFQTFGTAGLVIGEGTSALNGSCGTGTLTV
TPGSSSIVISGVDIPARIDGVAGSGECYVDLSTRAFSTDGSSTTLNLEVAAGAVNADQGV
NATGGPQAITVRAVERPTVSKAFSSDNILVLGGNTRTLTITINNPDSNVGLDDVALTDMF
PNSGLPDAVINGNGAVIEPTGAPATGTCVAGGGTVVLTQGAAAQVAISGVTVAAGGSCTV
EVEVRARQTDGEYQVTPSNVIEASSFSSLQGVMPAQNASASTRVRSPLAINKNFNPSVLA
SGTTGQFTVTLSNNSGAALPVSNFTDNPIGTPNSANVTIASTGAIANSCAGGSASLEGGG
QGFSVGGFAIPANGSCAITVDYTAVNTDPDTPVTYTNSILQGAVSITGQPDIISQERSAT
VIVADRLRVLKARTPSNAAPGEAVEYQVTVQNFSSSVLSNVSLADTLQNGSSLLTGGAFE
PSSACGLSTNGAAQGDTSIDFTITTVPARTGAGSPGECVVSFWVMIDPDATTNTPNVINA
GGVCFNPGGGEVCNQGASNTVTTSLRSPVEFEKTFNTIDVVAEAEGVPVRMRLELRNFAA
EALSDVVFSDTLPQDGPFQQLRIATPANVSNSCGGTLIATAGSTSVSLNNAAVPAYSGSD
PGVCAIEVDVVGPAGSYPNTAEANGNRPNADGSVTALAPLGSAIDDSATVNYSPALQASK
SFTPSSISDGGTSTLEIRFTNVDSTQPITGIAATDVLPSGMVIASPAMAYSNCAGPPVID
APSGGTTVSLSDAVLAPNASCAILVDVEVSGTSNWVNEIPAGAITADNGILNTSPVTATL
LYEPPGVPLISKSINPGTIVPGQSSTLTIDITNGSQDLTGVSVVDWFTEGGIAGATANGM
QIAPAPNASTTCPGGVVTASPGGDNVRLSEANILSGVACSISVQVTSTSVGTITNRIPVG
AIESDQGATNSTSFAESTLSTTSEVGVTKLFTPAVVSADEPSRLRIEFFNGNAAALTDFS
LTDSYPAGLENAADPNPISSCGGLATISFPDTASVSISNGSIGAASGSTAASCFLEVNVV
SSTLGTYDNVIPQNSLTVRGVPVPHPPATSTLQVRERIVVNKAFDDLTLDAGDPNGFTTG
EAVRLPGVSAPLTIRIENPNDIPLTEVRFTDALPDGVTLAIPANVATTCTDGVVTGQANG
QTLALTGASLGAAGDADAICIVTADVFSNVPGVYTNEIPVGDVTSFEGIDNDPGTQSQLV
VSEPPTIGKTFEPPVIAPGTSSTLRLTLGNGNDVAATLTSDLVDSLPATPGAMIVATPSN
ITTDCPGGTGIITAATGASTVRIDSGTVIPPGGCVVSIDVTANDAGDYLNSISVGALQTD
LGPNDMPTEAPLKLSTLGYIAGKVFLDPQTVPNGVFIPGDSMPITGNTIELRSGGSCSGV
LLESSSTDAQGNYLFDELPAGTYSVCQPTQPPSTFNSVTTEGTIVPFGASTGSAGTAANP
TDTSSEITGIVLGDNAGTATEVSGSPDNNFSEVLPASLSGNVYFDQNNDGFFDSDESGIG
GVEITLTGPVTLTTTTAADGSWSFTNLPPGDYTVTEVQPGGWVDGLDAVGTVGGSSVGVN
ANDVNSAITLGPGDAGINYNFGEIAPALLSLSVNAVCVNDVPYVDYSINGFAGVSAPNVT
VRWVTPGARIAEERVNQPGSGRLLWPGASVDASGNGTGWPGWAFTDGQWVEVPDDRRPTM
TLEVEFNPTGTATVSYPPATPACAAQPPGTFRVQSVPVSPRWVLLLLALMLMAVASPKLA
PARV
NT seq
5595 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcagcaagaaacacgaaggccttgtacctaacatcgagcctgtttggggtattttt
cgccgtctactgcaagtgggcgtctgcatatccgcgctactcgcaagttgtcttgcctgg
tctcaaaaccctgatttcaacgttacggttaacaccggtccagttgcgccgaactcaact
acagtctttcccggggagctgactagcttacgagtaactctgagcaacaactccatcgtc
aaccctatcaccggcgtatcttttaacggcgctttccaaaccttcggtactgcggggctg
gtcattggcgaaggtacctcggcgctcaacggcagctgtggcaccggtacgctcaccgtc
acgccaggatcttcgtccatagtgataagcggcgttgacattccggcgcgaattgatggc
gttgccggctctggcgagtgctacgtggacttatccaccagagccttctcgactgatggc
tccagcacaacactcaacctggaggtggcggcgggtgccgttaacgctgatcaaggcgtc
aacgctaccggtgggccccaggccattaccgtacgggcggtggagcgaccgacggtgagt
aaagcgtttagcagtgacaacattctggtgttgggtggcaatactcgaaccctgacgatc
acgatcaataatcccgacagtaacgttggtctcgacgatgtcgcccttactgacatgttc
cccaacagcggtctaccagatgccgttattaatggtaatggcgcagttatagagcccacg
ggtgctcctgctacgggtacctgtgtcgccgggggaggaacagtggttctaacccagggc
gcggcagctcaggtggcaatcagcggcgtcaccgtggcggccggcggcagttgtaccgtc
gaggtggaggttcgggcccgacagacagatggtgaataccaggtaacgccctcgaacgtc
atcgaagcatcgtccttctcaagcctgcagggcgttatgccggcacagaatgcttcggct
tctacgcgagtgcggtcgccgttggcaatcaacaaaaactttaacccctcggtacttgcc
agtgggacgacggggcagtttacggtgacgctcagtaataacagcggcgccgctctgccg
gtaagcaactttacggacaatcccatcggaacgcccaactccgcgaacgtgacgatcgct
agcacaggagcaattgcgaacagctgtgccggcggcagtgcgagcttggaaggcggcgga
cagggcttttctgtgggcggatttgctattccagcaaatggcagctgcgcgatcaccgta
gattacaccgcggtgaataccgatcccgacacacccgtgacttataccaacagtatcttg
caaggggctgtttcaataaccgggcagccggatatcatcagtcaggagcgctccgctacc
gtcattgttgccgaccgcttacgcgtccttaaagcacggacaccctctaacgcggcgccg
ggcgaggcggtggagtatcaagtcactgttcagaacttctcgagttcagtgctaagtaac
gtcagccttgccgacacactacaaaacggatcaagcctgttaaccggtggagcattcgaa
ccgtcttctgcctgtgggttgagcactaacggcgcagcgcaaggcgatacatctatcgat
tttacgataaccacggtcccggctcgaacaggagccggctctcccggggaatgtgtcgtc
agcttttgggtgatgattgaccccgatgctacgaccaatacacctaacgtcattaatgca
gggggtgtgtgttttaacccgggcggtggtgaggtgtgtaatcaaggtgcttcgaacacc
gtcactactagcctgcgttcacctgtggagtttgagaagaccttcaacaccattgacgtt
gtggcagaggccgagggtgtacccgttcgcatgcgattggagttacgtaattttgccgct
gaggccctttccgatgtggtctttagcgacacgttgccccaagacggcccgttccagcag
ctgcgtatcgcgacaccggctaatgtcagcaacagctgtggcggcacgctaatagcgacc
gccggaagcacttcggtctctctaaacaatgctgctgtaccggcttactctggcagtgac
cccggcgtatgtgccatcgaagttgacgtggtgggtcccgcaggtagctacccgaacact
gctgaagccaacggtaatcgtccaaacgctgacggtagtgtgactgcgctcgcgccactg
ggttctgccatagatgatagcgcgacggttaattattcgcccgccttgcaggctagcaag
agctttacgccctccagcatcagcgatggggggacgagtacactggaaattcgtttcacc
aatgtcgatagtactcagcctatcaccggaatagccgcaactgatgtgcttccatcaggg
atggttatagcaagccctgctatggcatacagtaactgcgctgggccgcctgtgatcgat
gcgccgagcggcggcaccacggtatctctcagtgacgcagtattggcgccaaatgcgagc
tgcgcgatcctcgttgatgtggaagttagcggtactagtaactgggtcaatgaaattcct
gcgggtgctattactgcggataacggcatcctcaatacctcaccagtaaccgctacgctg
ctctatgagccacccggggttccccttatttcgaaatcgataaatccaggaacgattgtt
ccggggcagtcttcgacgctgaccatcgatattactaatggcagtcaggatctgacgggt
gtttccgtagttgattggttcactgagggaggaattgccggggctacggctaatggcatg
cagattgcgccggcgccgaatgccagcactacttgccccggaggtgtggtcactgcatct
ccgggcggcgataacgtgcgtttgtccgaggcaaacatcctgtcaggggtcgcctgttcg
atttcagtgcaggtaacgtccacgtcggtgggaaccattactaaccgtattcccgtaggc
gcaattgagtctgatcaaggagcgacgaacagcacttcctttgccgagagtacgctgagt
acgaccagtgaagttggcgtgacaaagttgttcactccggcagtcgtctcggcggatgag
ccatcgcgtctacggattgaattcttcaatggtaacgcggcggcgcttaccgatttttcc
ttgactgacagttacccggcaggtctcgagaacgcagcagatccaaaccctatcagtagc
tgtggtggcttggcgacgatcagctttccggataccgccagcgtgagtatcagtaacggc
tctatcggtgccgcatcgggctctacggcagccagctgttttctggaagtcaacgtagtg
tcgtcgaccctgggcacctacgacaacgttatccctcagaactctttgactgttcgcgga
gtgcctgtgccgcatcctccggctaccagcactttgcaggtgcgtgagcgtatcgttgtt
aataaagcttttgatgatttgacccttgatgctggagaccctaacgggttcaccacgggt
gaagcggtgcgtttgccaggtgtgagcgcccctttgactattcgcattgagaaccccaac
gatatcccgcttacggaggttcggtttactgatgcccttccggatggagtgaccctggcg
attcccgccaatgtcgcgacgacctgtaccgatggtgtcgtgacggggcaagctaacggc
caaactctagctctcaccggtgcgagtcttggcgccgctggcgacgcagatgcgatatgt
attgtgacggccgatgtgttcagtaacgtccccggcgtttacaccaatgaaatccccgtg
ggcgatgtcaccagttttgaaggtatcgacaacgatccggggacgcagtcccagttggtg
gtgagcgaaccaccaaccatcggcaagacctttgagccgccggttattgcaccgggcaca
tcgtcaaccttgcgattgactctcgggaacggcaacgacgtagcggcgaccctcaccagt
gatctggtggacagcttgcccgcgacacccggtgccatgatcgttgctacccctagcaac
atcacaacagactgccccggaggtacgggaattatcaccgcggcgactggtgccagtacg
gtgcgtattgatagcggtacggtgattccaccgggtggctgtgttgtgtccattgacgta
acagcaaatgacgccggggactatttgaacagtatttctgttggcgccctgcaaactgac
ctggggcctaacgacatgcccaccgaggcacccttgaagctgagtaccttgggctacatc
gccggtaaggtcttcctggatccgcagacggtacccaatggtgtttttataccgggtgac
tccatgccgatcaccgggaataccattgagcttcgcagcggtggaagctgcagtggggta
ttgcttgagtcaagcagcacggacgctcagggcaactatctgtttgacgaattgcccgca
gggacttactcggtgtgtcagccaacgcagccccccagtaccttcaatagtgtaactacc
gaaggcacgattgttccctttggcgcgagcactggtagcgctggtactgccgccaatccc
acggataccagtagtgaaataaccggtattgttctaggcgataacgctggaactgcgact
gaggtcagcggttcccccgataacaatttctcagaggtgcttcccgcctctttgagcgga
aacgtttacttcgatcagaacaatgacggcttcttcgattctgatgagtcgggtattggt
ggtgtagaaataaccctaactggccccgtgacgttaacgacaaccacagctgcggatggc
agttggagctttactaatttgcctcccggcgattacaccgtaaccgaggtccagcccggt
ggttgggtagatggcttggacgcagtgggcactgtgggcggttcgtcggttggtgtgaat
gccaatgatgtaaattcggccatcacgctgggtcccggtgatgcgggtattaactataat
ttcggtgaaatagcgcctgcgcttctgtcacttagcgttaatgccgtatgtgtcaacgat
gtgccctatgtggattacagcattaatggcttcgcgggtgtatcggcgcccaacgtgaca
gttcgatgggtgaccccgggagccagaatcgctgaagagcgtgttaatcagcctggatcc
ggtcgattgctgtggcctggtgcgagcgtggatgccagcggcaatggcacaggctggcca
ggttgggcgttcacagatgggcagtgggttgaagttcctgatgatcgccgtccgactatg
acactcgaggttgagttcaacccgacaggaaccgccacagtgagttatcctccggcgacg
ccagcttgtgctgcacagccgcctggaaccttccgagtgcagagcgtcccagtgagtcct
cgttgggtgttgctacttcttgctctcatgctcatggccgtggcttcgcccaagttggcg
cctgcccgagtatag
DBGET
integrated database retrieval system