| Entry |
|
|---|
| Symbol |
addA
|
|---|
| Name |
(GenBank) ATP-dependent nuclease subunit A
|
|---|
| KO |
| K16898 | ATP-dependent helicase/nuclease subunit A [EC:5.6.2.4 3.1.-.-] |
|
|---|
| Organism |
cbt Clostridium botulinum E3
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:cbt00001]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:cbt03400]
CLH_0025 (addA)
Enzymes [BR:cbt01000]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CLH_0025 (addA)
DNA repair and recombination proteins [BR:cbt03400]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
CLH_0025 (addA)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
24285..28019
|
|---|
| AA seq |
1244 aa
MSGTKWTEEQLSAITTRDCNLLVAAAAGSGKTAVLVERIIKIITNEENPIDIDKLLVVTF
TSAAAAEMRERIANAISKKLDETPTSKNLQKQLTLLNRSNIMTIHSFCLGVIKNNFHKID
LDPSFRICDQTEGILLKMEIIDELFDDKYDEENQEFIKFIEAFSSYKSDNALKELVLSLY
NFIMAGPWPKKWLKAASEDFDIKTLQELDESKWVSVLKESIKIELDGYIKMMQKAVELIN
ETDGLEPYFEGFSSELDLIVNAYNNVESSLNDLYNSLNLITFNRLKTIKKNTVSDENIQN
LVKQIRDQVKKKISALIEGTFIATPDKMLDNIIKSYPYINQLTELTSEFIDRFNAKKKEK
NILDFNDLEHLCLKILIEDNEENQIVPSTIAQKFKDYFEEVLVDEYQDSNNVQEAIIELV
SRKNSDNPNVFMVGDVKQSIYKFRQAKPELFIDKYNSYSLDKGINRKIQLYKNFRSREEV
INGVNYIFKSVMSKTVGELEYTDVEALNLGASYPKKKNVDDIIGGPIEVHILDRSDNKEE
NDESKLQAEEEEIGDVNLEARIIVKRINDLISKKDGSKFKVLDKDTGEYRDLKYKDIVIL
LRATKNWSEVLLDELGLAGIPVYADTGSGYFESIEIRTIMSLLKVIDNPMQDVPMLSLLI
SPIIGLSAEELTDIRLIDKEKYFYENIIKISTEKLISEELQEKCEYILSSIDKWRRKSIY
MPIDEFIWYLYMDTAYYGYVGAMPNGVLRQANLKILFQRARQFSETSFKGLFNFINFINK
LTKSSGDMGSAKILGENEDVVRIMSIHKSKGLEFPVVFLAGCGKNFNLMDLNNKILYHEE
LGLGPEYINLENRTSITTLPKEAIKKRMKLETLSEEMRVLYVAFTRAKEKLIITGAVRNA
EKSIEKWINSAVLDKDVILPYEISKGKSYLDWIGMALCKHKDGKILRKKLGFSSEMCKDD
LSMWKISIWNKYELDMYDELDENQEELDVKISILDKDVNKKVKSEVYRRLGYEYEFKEST
KLTSNISVSDLKRRNMNDNIDTLEIFDLEEEDNKNKDVITPKFLQEKKGISSAERGTAIH
FAMKKIDFSKVGTLKEIKEQLNKLYEEEFILQEEYSSINPYKILSFFKSNLGKKMLDVYN
KGGKIYREIPFHTEISSLELDESLPQKYANEKIRLQGIIDCFFKCDDEIILLDYKTDYVE
NEEEFKEKYKSQLLYYSEAVFKMTGKKVNKRYLYSFYLEKEILI |
|---|
| NT seq |
3735 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagtggaacaaaatggactgaggaacagctaagtgctattacaacaagagattgtaat
ctattagttgcagcagcagcaggttctggaaaaacagctgtattggtagaaagaattata
aaaataattacaaatgaagaaaatcctatagatattgataaacttttagttgttacattt
acaagtgcagcagctgctgagatgagagaaagaatagctaatgccatatcaaaaaaatta
gatgaaactccaacgtctaaaaaccttcaaaagcaattgactttattaaataggtctaac
attatgactattcattctttttgtttaggtgtaataaaaaataattttcataagatagac
ttagatccatcttttagaatatgtgaccaaacagaaggtatacttttaaagatggaaata
atagatgaattatttgatgacaaatatgatgaagaaaatcaggaatttataaaatttatt
gaggcatttagtagttataaaagtgataatgcattaaaagaattagttttaagtttatat
aattttataatggcagggccatggcctaaaaaatggttaaaggctgcttcagaggatttt
gatataaaaacattgcaagaattagatgaaagtaagtgggtaagtgtattaaaagaaagt
ataaaaatagaattagatggatatataaagatgatgcaaaaagcagttgaattaataaat
gaaactgatggattggaaccttattttgagggatttagcagtgaattagatttaatagtt
aatgcttataataatgttgaatctagtttaaatgacttatataattcattgaatttaata
acgtttaatagattaaagactatcaagaaaaatactgtaagtgatgaaaatatacaaaat
ctagttaagcaaattagagatcaagttaaaaagaaaatatcagcattaattgagggaact
tttatagctactccagataaaatgcttgataatataataaaatcttatccatatataaat
caattaacagagcttacgtcagaatttatagatagatttaatgctaagaagaaagaaaag
aatatattagattttaatgatttagaacatttatgtttaaagattttaattgaggataat
gaggaaaatcaaatagtaccttcaacaatagcacaaaagtttaaagattattttgaagag
gtgcttgtagatgaatatcaagattctaataatgttcaagaagcaataatagaattagta
tcaagaaaaaattctgataatcctaatgtatttatggtaggtgatgtaaaacaaagtata
tataaatttaggcaagcaaaaccagaattatttattgataaatacaatagctattcattg
gataaaggcattaatagaaaaattcaactttataagaattttagaagcagagaagaagtt
ataaatggtgtcaattatatatttaaatcagttatgtctaagactgtaggagaattggaa
tatactgatgttgaagctttaaatttaggtgcaagttatccgaaaaagaaaaatgttgat
gatataattggtggtccaattgaggttcatattttagatagaagtgataataaagaagaa
aatgatgaatctaaattacaggcggaagaagaagaaatcggtgacgtaaatttagaagca
agaattatagtaaagagaattaatgatctaatttctaaaaaagatggaagtaagtttaaa
gtgcttgataaagatacaggcgaatatagggacttaaaatataaggatatagtaattcta
ttaagagcaactaaaaactggtcagaagtgctattagatgaattaggattagcggggata
cctgtctatgcggatacaggatcaggatattttgaatcaattgaaataagaactattatg
tcattattaaaagtaatagataatcctatgcaagatgtgcctatgctttcattattgatt
tcacctattataggattaagtgcagaggaacttactgatattagacttatagataaagaa
aagtatttttatgaaaatataattaagatttctactgaaaaattaatttcagaagagtta
caagaaaaatgcgaatatatattatctagtattgataaatggagaagaaaatcaatatat
atgcctatagatgaatttatttggtatttatatatggatacagcttattatgggtatgta
ggtgctatgccaaatggagttctaagacaagcaaatttaaagatattatttcaaagagca
agacagttttcagagactagttttaaaggactatttaattttattaatttcataaataaa
ttaactaaatcatcaggcgatatggggagtgctaaaattttaggtgaaaatgaagatgtt
gttagaattatgagtattcataaaagtaaggggttagaatttccagttgtatttttggct
ggatgtggtaaaaattttaatttaatggatttaaataataagatactttatcatgaagaa
ttgggattaggtcctgagtatattaatttagaaaatagaactagtattacaactttacct
aaagaagcaattaaaaaaagaatgaaattagaaacattatctgaagaaatgagagtacta
tatgttgcatttactagggctaaagaaaagttaattataacaggagcagtaagaaatgca
gaaaaatctattgaaaagtggattaactcagcagttttagataaggatgttatattgcct
tatgaaatatcaaaaggaaaatcatatttagactggattggtatggctttatgtaagcat
aaagatggtaaaattcttagaaagaaattaggattttctagtgaaatgtgtaaagatgac
ttatcaatgtggaaaattagtatatggaataaatatgaattagacatgtatgatgaatta
gatgaaaatcaagaggaattggatgttaaaatttcaattttagataaagatgtaaataaa
aaggttaaaagtgaagtttatagaagattaggttatgagtatgaatttaaagaatcaact
aagcttacaagtaatatatccgtatctgatttaaaaagaagaaatatgaatgataatatt
gatacacttgagatatttgatttagaagaagaggataataaaaacaaagatgtaataact
cctaaatttcttcaagaaaaaaaaggaatatcgtcagcagaaagaggaactgcaattcat
tttgcaatgaaaaaaatagattttagtaaagttggaacattaaaagaaataaaagaacag
ttaaataaactgtatgaagaggaatttatattacaggaagaatatagttcaattaatcca
tataagatattaagtttctttaaaagcaatttaggaaagaaaatgcttgatgtatataat
aagggtggcaaaatttatagagaaattccatttcatactgaaataagcagtttagaatta
gatgaatctttaccacaaaagtatgctaatgaaaaaataagattacaaggtataatagat
tgcttttttaaatgtgatgatgaaataattttgttggattataaaacagattatgtagaa
aatgaagaagaatttaaagagaaatataaaagccaattattatattatagtgaggcagta
tttaaaatgacaggaaaaaaagttaataaaagatatctatattcattttatttagagaaa
gaaattttaatatag |
|---|
