Clostridium botulinum E3: CLH_2284
Help
Entry
CLH_2284 CDS
T00767
Name
(GenBank) conserved repeat domain protein
Organism
cbt
Clostridium botulinum E3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD52502
LinkDB
All DBs
Position
complement(2439767..2447866)
Genome browser
AA seq
2699 aa
AA seq
DB search
MSLTARFSTIDKAVLVSTGNSLVVCGSNSDININTSDMIKPNGSTTRDWATAGSTAKINI
LSNSTILYAELIWYSTVASYSSGAVDVRSIQDDPITFTAPNGDIIYVTPQNTDSYTASTQ
SVNRFRSAEVTSTIKKYLGGNYTVSNVPTSIPSTGLSDTVAGWTLVVVYRNDLFKPQRVG
FQSGIVVASNNQPYQATVTGFTTESNPDYLKGSLYLVCANGEPLSGTDTISIGPSFANLT
TIGNPIGSPNINPLTAPNNPYNNFFSGQINVCNPLSDSMGLIDISGTNGTKNNDAFVPTQ
VIGARNKWDITNVDISNTLIPNQTLLAGQLNSNGVSSIQLLGVGTQVKAIGPDITANLLF
YDPDGDSEYNVEVGEKIVYAVKIKNNGDELANNVILSMNINQYCSFVPDSIYINNSLQQG
ANITNGINVGSIDSHGVTNVIFTVKVNSLPPLDITSGYHLMYATANYNYQFISGVNTIVN
YATTNTLPVIVESGQVNLVKSVSKTAAFVGDNLVYTTIITNTGTAIAKNLFFQDKIQNNC
SFIERSVEIDDSSMVEFNPNIGFILPDLSPQESIKVVFSVKIDSLSPSTVINNISNLTFG
YMFNQQLALIEKTVFSNITSVQIEYADIIAKRCNNNSYPKIGDTVTYTLNLTNVGNISAN
NVQVLEPPVSGATFKTGSVKINNQAQAELNPFVGFNLSNPINPNQTTTVSYDMLINTIKP
GDTIDNTAQVPFKYQITPEQGQISTQKDSNTVETVANFVCMSINESVDKAYATINDDLYY
TAIIENNGNIDAYNTIFLSNIQTETSFIANSVFINGVAYPGYNPNIGFSVGTVCAGDSVE
VKYKVKVLTRPNPNIVYNQSDLVYNYLPDPNGSQISNTIYSNRVQTIINVASYTVTKMVN
KYYAVLGENLVYTTQIVNTGTVNLTDIKFADNIPTFVTFYPGTVYIDGTNYSNYNPISGF
SIDDLHPGDTTTITFAVTITESPDFGYVLNTSQLALTYIVNPNTPIITKTVYSNEVKTYV
ITGNLSINKITNKSYAKVGDTINYSFNVSNIGNTPLTNVNFVDIVPNGGEFISGSVSVNG
VVKSSYNPNLGFIIGTLNVGQVCNISFNIIVKSIPTPNVIVNTATSSYAFTIDPNEQPET
QTKTSNSVTTVINKGDATLTKSVDKMYATIGETLTYTITAHNTGTVQLENIILTDIIQPG
ATFVEDSVVIDGVSKPGYNPNNSFNLNNIMSGGSSTVIFKSKVTSLPTTPQISNTASMTY
KYYIDPNGVSVSDNRTSNTVTTNITTSTVTNTKSVDKMYATIGDVLTYTSVISNSGNVDI
TNTNFTDIISSNTSFMTGSVTIDGEPYVDYNPNIGFTLGTIQPTKSVTVVFKASVSSVPD
LGYVVNQSNVSYNYKLHLDKPDIIVGNALSNLVTTYINVGTVNITKAADRAYARINDVVN
YTFNIVNTGNTLLKNISFKDIIQTESTFNPNSVYVNGVQKTEFDPNTGFSLDNIPVGEYA
TIAFSVTINSIPQPDGKLNNKGSVTYSYNVDPSATPITKTTDSNTTTVNIKDTIVTTTKS
VDKSIAKLLDTLNFTVTIKNAGNVPVQHINFKDILDSNLLFTPQSVYINETQYSNYNPNN
GFSLSDIQPGDTTTIKFAATIETRPTGNIVYNNATVSYDYTVGQQVITGTMTTNTTQTYV
ATGELTVTKSVDKMYATVNDILGYTIVVKNTGSVSATNISLKDIIQSNASLVPQSVVIDG
ISQPTDDPNVGFSLTDLPLNASHTITFSAQVNSIPSTGEIDDTANVTFTYKLTPSDTPVT
TTTPSNTVKTYINLGKLAINKVVDKMYATIGDTINYTLTITNIGNTKCTNNFFRDIIQSD
ATFVSNSVVIDTTSQTAYDPNTGFNLPDIPGKGSVTVKFAITVKTLPSDYILYNTGSVSY
SYYIDPNGNPVSSLATSNTVATTINKGSLSVTKEVDKAYATIGDKISYTVSIINTGNVNA
SAINFRDVIPNGLTFVTNSVKINGVNYQGYNPYQSFSLGLLLPGDSVIVKFDATVTLLPN
PSLVYNTANVVFSYYIDPTGSVLVTQVNSNTVTTQINLGALNITKSVNKGYATHGDVLTY
SFTLNNTGNVDLSNVIFLDNLQSDINFNSGSVIVNGKTQSDYDPTVGFNLGTISTLGIVT
VSFTVTIIQNPTHQSVINFATGTFSYKIDPNGQIYTSSNTSNSVSTIIIMPSLAGTKVVD
LAYATIQDTLNYSIVFKNTGNTMLTSLFFEDTLSNGAVFKPGTVKIDGVSYSNYDPTLGF
NLPDLIAGNTTNINFQATVTLLPTPPQVTNYAVSNGLYKIDPAGSTYSISATTNTVTTNI
NLGNLTNVKSVDKMYAKVGDTLTYTSVITNTGNITASNIQFLDTLQAELTYISGTVTIGG
VLYPSLDPTVGFPLSNLAPNQSVTVTFEASINALPVPPQVNNKSQAQFSYKIDPNGITLT
STAFSNLVTTQVVKGILNATKIVDKPIATVGDILTYTVTLINAGNVIDNNVFFQDTPSTG
ATFKSGTVTVNGQIQGSYDPTVGFSLGDIGIGQVVTVVFQATVVSVPPSNNVTNQATINF
KFVVDPKEQPYSQTSYSNTVTTNIALGKLDVTKAVDKKFATIGDKLTYTVTIVNIGNINA
TNVLFIDPTPANSVFVPGTVTINGLAHIGYNPSAGFTLDTMTPGQIVTVVYQVQVVNMC
NT seq
8100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgagtttaacagcacgatttagcacaattgacaaagcagtattggtatctactgggaat
agtctagttgtatgtggaagtaatagtgatattaatattaatacttctgatatgattaaa
ccaaatggtagtacgacaagagattgggctacagcaggtagcacagctaaaataaatatt
ttatctaatagcacaatattatatgctgaattaatttggtattctacagtggcaagttat
tcaagtggagcagtagatgttagaagtattcaagatgatccaataacatttactgcacct
aatggagatattatatatgttacacctcaaaatacagacagttatacagcatctactcaa
agtgtaaatagatttagatctgctgaagttacctcaacaattaaaaagtatttaggagga
aactatacagtatctaatgttccaacaagtataccttcaactggattaagtgatactgtg
gcaggatggactttagtagtcgtttatagaaatgatttatttaaacctcaaagagttggt
tttcaatcaggaatagttgtagcaagtaataatcaaccatatcaagcaacggttacagga
tttacaactgaatcaaatcctgattatctaaagggtagtttatatttagtttgtgcaaat
ggagagccgctttcaggaacagacactataagtattggaccatcatttgctaatttaaca
acaataggtaatcccataggaagtccaaatataaatccattaactgcacctaataatcca
tataataatttcttttcaggacaaataaatgtttgtaatccattaagtgatagcatggga
ttaatagatataagtggcactaatggaactaaaaataatgatgcttttgttcctactcaa
gtaataggtgcaagaaataagtgggatattacaaatgtggatataagtaatactctaata
ccaaatcaaacattattagcagggcaattaaattcaaatggagtatcctcaatacaattg
cttggtgttggaactcaagttaaggctatagggccagatataacagcaaatttattattc
tatgatccagatggagatagcgaatacaatgtagaagtgggagaaaaaatagtatatgct
gttaagattaaaaataatggtgatgaattagctaataatgtgatattatctatgaatatt
aatcaatattgttcatttgttcctgattcaatttatataaataattcactacaacaaggt
gcaaatataactaatggtattaatgttggttcaattgattctcatggagtaacaaatgta
atatttacagttaaggttaattcattaccaccccttgatattacaagtggatatcattta
atgtatgctactgcaaattataattatcaatttatttctggagtaaatacaatcgttaat
tatgcaacaaccaatacacttcctgttattgttgaaagtgggcaagtaaatcttgtaaag
agcgtttctaaaactgcagcatttgtaggagataatttagtttatacaacaattataact
aatactggtactgcaatagctaagaatttgttcttccaagacaaaattcaaaataattgt
tcatttatagaacgaagtgttgaaattgatgattctagcatggttgaatttaatcctaat
attggatttatattgccagatttatcaccacaagaatctataaaagtagttttttctgtg
aagatagattcattgtcaccatcaacagttataaataatatatctaatttgacttttgga
tatatgtttaatcaacagctagcattaatagaaaaaacagtatttagtaatattacttct
gttcaaattgaatatgctgatataatcgcaaaaaggtgtaataataacagctatcctaaa
attggtgatactgtaacctatactttgaatcttactaatgtaggaaatatatcagctaac
aatgtacaagttttagaaccaccagtatcaggagctacttttaaaaccggaagtgttaaa
ataaataatcaagctcaagcagaattaaatccatttgtaggtttcaatctttctaatcca
ataaatccaaatcaaacaactacagtatcgtatgatatgctaataaatacaataaaacca
ggggatacaatagataatactgcacaagtaccatttaaatatcaaataacaccagaacaa
gggcagatttcaacacaaaaagactctaatactgttgaaacagtagcaaattttgtatgt
atgtctataaatgaaagtgtagataaagcatatgcaacaataaatgatgacttatattat
actgctattatagaaaacaacggtaatatagatgcgtataatacaatatttttatctaat
atacaaacagagacttcatttattgcaaatagcgtttttataaatggggtagcatatcca
ggatataatcctaatattggatttagtgtaggaactgtctgcgcaggtgattcagtagaa
gttaagtataaagttaaggttttaacacgtccaaatcctaatatagtttataatcaatca
gatttggtttataattatttaccagatccaaatggatcgcaaataagtaatacaatttat
agtaatagagttcaaactattataaatgtagcaagttatactgttactaaaatggttaat
aaatattatgcagtgcttggtgaaaatttagtttatacaacacaaatagtaaatacaggt
actgtaaatttaactgatataaaatttgcagataatattcctacttttgtaacattttat
ccaggaacagtatatatagatggaacaaattattctaattataatcctataagtggtttt
tctatagatgatttacacccaggagacacaactacaataacatttgcggtgactataact
gaatcacctgattttggatatgtactaaatacgtctcaattagcattaacttatatagta
aatccgaatactccgattataactaaaacagtatattctaatgaagttaagacttatgta
attacaggaaacttatctataaataaaataactaataagtcttatgcaaaagtaggagat
acaataaattattcatttaatgtatcgaatataggcaatacacctttaaccaatgttaac
tttgttgatatagtaccaaatggtggagaatttatatctggtagtgtaagtgtaaatgga
gttgttaaatcttcttataatcctaatttaggttttattattggaactttgaatgtaggg
caggtttgtaatataagttttaatattattgtaaagagtattccaacgcctaatgttatt
gtaaatactgcaacatcatcatatgcttttactattgatccaaatgaacaaccagaaaca
caaacaaagacaagtaatagtgttacaactgtgataaataaaggtgatgcaacattaact
aaatcagtagataaaatgtatgcaacaataggagaaacattaacttatacaattacagca
cacaatacaggaactgtgcaattagaaaatattattttaactgacattattcaaccagga
gctacctttgtagaagattcagtagttatagatggagtaagtaaaccaggatataatcct
aataatagttttaatttaaataatattatgtctggtggatcttcaacagttatattcaaa
tcaaaggtaaccagtttgccaaccacacctcaaatttctaacactgcaagtatgacttat
aaatattatatagatccaaatggagtatcagttagtgataatagaacaagtaatactgta
actacgaatataacaacaagtactgttacaaatactaagagtgtagataagatgtatgca
acaattggagatgtgttaacttatacttcagttatttctaatagtggaaatgttgatata
acaaatacaaactttactgatataatttcatctaatacaagctttatgacaggaagtgta
acaatagatggagagccatatgtagattacaatcctaatataggatttactttagggaca
atacagcctactaagtctgtaacagttgtatttaaagcaagtgtaagtagtgtacctgat
ttagggtatgtagtaaatcaatctaatgtaagttataattacaagctacatctagataaa
ccagatataatagtaggtaatgccttaagtaatttggtaactacctatataaatgtaggt
acagttaatataactaaggcagcagatagagcttatgctagaataaatgatgtcgtaaat
tatactttcaatattgttaatactggaaatacgttattaaaaaatatatcatttaaagat
ataattcaaacagaatcaacatttaatcctaattctgtttatgtaaatggagtacaaaag
acagaatttgatcctaacacaggattctcattggataatattccagttggagaatatgca
acaattgcatttagtgtaacaataaattcaattccacaaccagatggtaaattaaacaat
aaaggtagtgtgacttactcatataatgttgatccaagtgcaactcctataactaagaca
acagattctaatacaactactgtaaatattaaggatactatagttacaacaactaaatct
gtagataaatcaatagctaaactattagatactttaaactttactgttactataaagaat
gcaggaaatgtaccagttcagcatataaattttaaggatatactagatagtaatctattg
tttacaccacaatctgtttatattaatgaaacacaatatagtaactataatcctaataat
ggattctcattatctgatatacaacctggggatacaactacaattaaatttgcagctact
attgaaactagacctactggaaatatagtatacaataatgctacggtatcttatgattat
actgtaggacaacaagttataacaggtacaatgactactaacacaacacaaacctatgtt
gcaactggtgaacttacagttactaaatcagtagataaaatgtatgcaacagttaatgat
atattaggatatacaatagttgttaaaaatacaggttcagtaagtgcaactaacattagt
ttaaaggatattattcaatctaatgcgtcattagttccacaatcagttgtaatagatgga
ataagtcaaccaacagatgatccaaatgtaggattttcgttaactgatttacctttaaat
gcatcacacacaataacatttagtgctcaagttaattctattccatcaactggagaaata
gatgatacagcaaatgtaacattcacttataagttaacaccaagtgatactcctgttaca
acaactactccttcaaatacagttaagacctatattaatttaggtaaattagcaataaat
aaagttgtagataaaatgtatgcaacaataggagatacaataaattataccttaacaata
actaatataggaaatacaaaatgcactaataatttctttagagatataattcaatcagat
gcaacttttgtaagtaattcagtagtaatagatactacaagtcagacagcatatgatccg
aatacaggatttaatttaccggatattccaggaaaaggtagtgttactgttaaatttgca
ataacagtaaaaacattgccatcagattatatattatataatactggtagtgtaagttat
agctattatatagatccaaatggaaatccagtttcatctttggcaacaagcaatactgta
gcaactacaataaataaaggatcattaagtgttactaaagaggttgataaagcatatgca
actataggggataagattagttatacagtttctattattaatacaggaaacgttaatgct
agtgctataaactttagagatgttataccaaatggtttaacttttgttacaaattcagtt
aaaataaatggagtaaattatcagggatataacccatatcaaagtttttcacttggatta
ttattgccaggtgattctgtaatagttaaatttgatgcaactgtaactttgttaccaaat
ccatcactagtttataatactgctaatgtagtattttcatattatatagatccaactgga
agtgttttggtaactcaagttaatagtaacacagttacaactcaaataaatttaggtgca
ttgaatattactaaatcagtaaataaaggttatgcaactcatggagatgtgttaacttat
agttttactttaaacaatacaggaaatgtagatttaagtaatgtaatattcttagataat
ttacaatcagatattaattttaatagtggctctgtaattgtaaatggtaagacacaatca
gattatgatccaacagtaggatttaatttaggaacaatttcaacattaggaattgtaaca
gtatcatttactgttacaattattcaaaatcctacacatcaatctgtaataaattttgca
acaggaacattttcatataagattgatccaaatggacaaatctatactagttcaaacacg
tctaattcagtaagtacaattataataatgccaagtttagcaggtactaaagtagttgat
ttagcttatgcaacaattcaggatacactaaattattcaatagtatttaaaaatacagga
aatactatgttaacatcattattttttgaagatactttatcaaatggcgcagtatttaaa
cctggaactgttaaaattgatggagtaagttattcaaattatgatccaacattaggattt
aatttgccagaccttattgcaggaaatacaactaatataaatttccaagctactgtaaca
ttacttccaacaccaccacaagtaacaaactatgctgtatcaaatggattatataagata
gatccagcaggaagcacttattctatatcagcaacaactaatactgtaacaactaatatt
aatttaggaaacctaacaaatgtaaaatcagtagataagatgtatgctaaagttggagat
actttaacttacacttctgtaataactaatactggaaatataactgcaagtaatatacag
tttttagataccttacaagcagaattaacctatattagtggtactgttactataggtgga
gtattatatccatcattagatccaacagtaggatttcctctatctaatttagcaccaaat
caaagtgtaactgtcacatttgaagcaagtataaatgcattaccagttccgccacaagtt
aataataaatctcaagcacaatttagctataagatagatccaaatggaataactttaact
agtacagcatttagtaatttagtaacaactcaagttgtaaaaggtattttaaatgcaaca
aagatcgttgacaaaccaatagctaccgttggagatatattgacttatacagttacacta
ataaatgcaggaaatgttatagacaataatgttttcttccaagatacaccatcaactgga
gcaacatttaagtcaggtactgtaactgtaaatgggcaaattcaaggatcttacgatcca
acagttggatttagtcttggagatataggaataggtcaagtcgttacggttgtattccaa
gctacagtagtgtctgtaccaccaagtaataatgtaactaatcaggctactataaacttt
aagtttgtagtagatccaaaggagcaaccatattctcaaacaagttattctaacacagta
acaactaatatagcattaggtaagttagatgttactaaagctgtagataaaaaatttgca
acaataggtgataagttgacctatacagtaactatagttaatattggaaatataaatgct
acaaatgtattatttatagatccaacaccagctaattctgtatttgtaccaggaacagta
acaataaatggattagcgcatataggatataatccatcagctggatttactctagatact
atgactccaggtcaaattgtaacagttgtttatcaagtacaagttgttaatatgtgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
