Clostridium botulinum E3: CLH_2740
Help
Entry
CLH_2740 CDS
T00767
Symbol
sbcC
Name
(GenBank) exonuclease SbcCD, C subunit
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
cbt
Clostridium botulinum E3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cbt03400
]
CLH_2740 (sbcC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
cbt03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
CLH_2740 (sbcC)
Archaeal homologous recombinant proteins
CLH_2740 (sbcC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SbcC_Walker_B
AAA_29
AAA_27
SMC_N
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD53228
LinkDB
All DBs
Position
complement(2902201..2905743)
Genome browser
AA seq
1180 aa
AA seq
DB search
MRPIELRVKGLNSFIEEQKIDFNKLTERGFFGIFGPTGSGKSTILDGITLALYGQVSRKS
SNYINTNCDSLNVSFKFQISGVEKKIYIVSREFKRDNKTGNPRTSRAKIIDTTNGIEEIL
ADKAQKVTEKCEEIIGLGLEDFTRTVVLPQGKFSEFLKLEGKSRREMLERLFNLQKYGNI
LSIKLSREIGKEKTESNLLTGELKGYDEVSSEKFNLKNEELECARNQLSNANNELKEIEK
KYKSSEEIWNLQFELNSYKEQEKVLNYKSSEIEEDKIKLKLAEAALKVNPYVLAYENTLN
EGNEIQKEKESLEINFKKLKVERESSEKKLLEITEKKDKEIPELKLREQKVSDVIEEKNK
LDILDKEIEEITSKVQVLREKYKKEKNNSVIIEDSIRNTTINIKELEEKFESLKIDDELK
AKIQNGLLITEKYNLFKKNISNNKNKLTNINKEIENLKVNFDELQKIYKVKSNSLNKNKD
ELENLIKHCPGNQEDLLILQKNLTNCNEKWEKFNQYSDEIKKSKLLIKELEELLKKGKDK
KFSIDNELLDLKEKYKKCEIENLAFKIRMNLKNGEACPVCGSLEHDTKSKDKLIDDIDDD
IVNQLNNKINEYEINLKVLEQDITIYNTKINSEEDKIREKNLQIENLGEEFKNIVPKDLE
SQFNRLKKDLENYDLKKEILENTLIQLKDENHKLENDSEIISTLIKEKETQVNLINEELA
IDIEELNNTKEKLNIIIRETKVSDFNKKSQEIVNIEKEREILSKKIKEFRINIETLIKEK
DQVQENLNLITEEGTHARTSLNEKNKNREEKIKIIKDKLEKEFNLIDDSNNIDENKLFML
LDSIKKEIECIEKEFKSIHELKDIICIKYESCNEKFISIVAKENQIIKRCEIEKENLNKS
LKSENFESIEEVKANIIGFNDIEILKAKIEKYKEDLSKIKGAIESSVKKLNNREVTEQQW
INIQNSVKEKKLEFESLNEMKIKLEEECKFIDNKLKELKDLLIKKEKIDHKLALLDDLDK
LFKGKKFVEFVAITQLKYISMEASKKLKDITNGIYGLEVDENGKFIIRDYKNGGAERDAS
TLSGGETFLTSLALALALSSQIQLKGTAPLELFFLDEGFGTLDDDLLEVVMSSLEKLHND
KLKIGIISHVESIKNRVPVKLILTPAESGKGGSKVRLERS
NT seq
3543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaccaattgagcttagagttaaaggattaaatagttttatagaagagcaaaagata
gattttaataagctgactgaaagaggattttttgggatttttggacctacaggtagtggg
aaatcaaccattttagatggaataacattagctttgtatggacaggtttcaagaaaaagt
tctaattatataaatactaattgtgattcattaaatgtaagttttaaatttcaaatatca
ggtgtagaaaagaaaatatacattgtaagtagagagtttaaacgtgataacaagactgga
aatccaagaacttcaagggctaaaataattgatacaactaatggaatagaagaaatttta
gctgataaagctcaaaaggtaactgaaaaatgtgaagaaataataggtcttggattagag
gattttactagaacagttgtattaccacaaggtaaatttagtgaatttttaaagcttgaa
ggaaaaagtagaagagagatgcttgaaagattgtttaatcttcaaaagtatggaaatatt
ctttcgataaaattatctagagaaataggtaaagaaaaaacagagagtaatcttctaact
ggagaattaaaaggttatgatgaagttagtagtgaaaaattcaatttaaaaaatgaagaa
ctagaatgtgctagaaatcaattaagtaatgcaaataatgaattaaaagagatagagaaa
aaatataaatctagtgaggaaatttggaatttacaatttgaattaaattcttataaagaa
caagaaaaagttttaaattataaatctagtgaaatagaagaagataaaattaagcttaaa
cttgcggaagctgcattaaaggttaatccatatgtattagcatatgaaaatactttaaat
gaaggcaatgagattcaaaaagaaaaagagagcttagaaataaattttaaaaaactgaag
gttgaaagagaaagttcagaaaaaaaattattagaaattacagaaaaaaaagataaagaa
ataccagaattaaaattaagagaacaaaaagtcagtgatgtaatagaagaaaaaaataag
ttggatattttagataaagaaatagaagaaattacttcaaaggttcaagtattaagagaa
aaatataagaaagaaaagaataatagtgtaattatagaggatagtattagaaatacaact
attaatatcaaggaattggaagaaaaatttgaaagcttaaaaatagatgatgagttaaaa
gctaagattcaaaatggtcttctaatcactgaaaaatataatttatttaaaaaaaatatt
agcaataataaaaataaattaactaatataaataaagaaatagaaaatttaaaagtgaat
tttgatgagttacaaaaaatatataaagtaaagtctaattcattaaataaaaataaggat
gaattagaaaatttgattaaacactgtccaggtaatcaggaagatttattaatacttcaa
aaaaatttaactaactgtaatgaaaagtgggaaaaattcaatcaatattctgatgaaata
aaaaaatctaaattattaattaaagaattagaagaattgttaaaaaaaggtaaagataaa
aaatttagtattgataatgaattactagatttaaaagaaaaatacaaaaaatgtgaaata
gaaaatctagcttttaagataagaatgaatttaaaaaatggagaagcgtgcccggtatgt
ggatcattagaacatgatacaaaaagcaaagacaagttaatagatgacatagatgatgat
atagtaaatcaattaaataataaaattaatgagtatgaaattaacttaaaagtattggaa
caagatataacaatatataatactaaaataaactctgaggaagataaaattagagagaaa
aatcttcaaatagaaaatttaggagaagagtttaaaaatatagtacctaaagacttagaa
agtcaatttaataggttgaaaaaggatttagaaaactatgatttaaaaaaagaaatatta
gaaaatacacttatacaactaaaagatgagaatcataaattagaaaatgatagtgaaata
atatcaactctaataaaggaaaaagaaacacaagtaaatttgataaatgaggaattagct
attgatatagaagaacttaataatacaaaggaaaaattaaatattattataagagaaact
aaggtaagtgattttaataaaaagagtcaagagatagttaatatagaaaaagaaagagaa
attttatcaaagaagataaaagaattcagaataaatattgaaaccttaattaaagaaaag
gatcaagtgcaagaaaatttaaatttaattactgaagaaggaacgcatgcacgtacatca
ttaaatgaaaaaaataaaaatagagaagaaaaaataaaaataataaaagataagttagaa
aaagaatttaatttaattgatgattcaaacaatattgatgaaaacaagttatttatgtta
ttagattctataaaaaaagaaatagagtgtatagaaaaagaatttaaatcaattcatgaa
ttgaaagacataatttgtattaaatatgaaagttgtaatgaaaaatttatttcaatagta
gctaaggaaaatcagattataaagagatgtgaaatagaaaaagaaaatttaaataaaagt
ttaaaaagtgagaattttgaatctatagaagaagtaaaagcaaatattattggatttaat
gatattgagatattaaaggcaaagatagaaaaatataaagaagatttatctaaaatcaaa
ggagcgatagagagctcagttaaaaaattaaataatagagaagttacagaacaacaatgg
ataaatattcaaaatagtgtaaaagaaaagaaactagaatttgaatcattaaatgaaatg
aaaattaaattagaagaagaatgtaaatttatagacaataaacttaaagaacttaaggat
ttattaattaaaaaagaaaagattgatcataaattagctttgctagatgatttagataaa
ttatttaaaggcaagaagtttgtagagtttgttgcaattactcaattaaaatatatttca
atggaagcatctaaaaaattaaaggatataactaatggaatttatggactggaagtagat
gaaaatggaaaatttataataagagattataaaaatggcggtgctgaaagagatgcatct
actttatcagggggagaaacatttttaacatcactagctttagcattagcgttatcatca
caaatacagcttaaggggacagcaccattagaattgtttttcctagatgaaggatttgga
acattagatgatgatttattagaagtagtaatgagctcactagaaaaattgcataatgat
aaattaaaaataggtataatcagtcatgttgagtctattaaaaatagagtgcctgtaaag
ttaatacttactccagcagaatcaggaaaagggggcagtaaggtaaggcttgaacgaagt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
