Clostridium botulinum E3: CLH_3186
Help
Entry
CLH_3186 CDS
T00767
Name
(GenBank) OB-fold nucleic acid binding domain protein
Organism
cbt
Clostridium botulinum E3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3604
tRNA_anti-codon
Big_13
PHP
HYR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACD51407
LinkDB
All DBs
Position
complement(3441468..3445979)
Genome browser
AA seq
1503 aa
AA seq
DB search
MIKKNKRLLALLVSVSVVTTSVILPSQRTFALGDMIESMLNDSSETKAYENDAKIEDNVT
EKEKVKEEINESKTDEEKTDVSKGDASEGEINKDKDETSSDDKNKVDNKSENDSKDELDT
DKDVTDNIKPEDKLDNDDKDKEVIDKENNEKDKEIVDKDKEVVEKDKESEDVIEDSKEVT
DVISIEEALKLQNGESAIVEGVVSFNDRGQTIYIQDETGGIALSNKISKIPFKDIKKGNK
VKVSGTKDTFKNLDQLQATKIDVVKESADLTSEIVSIKDLNSGNYESKYVKVENAIIDTS
KKTLKQGEDILNIYFIPKDINVKTGDTVNVEGTMGVYDKTIQIYGGSCIFTKVDEVAKLN
INHEAIKQADINSDLKIDAEITGTEVSNVELNYKVTGAEKFEKLEMTKGEGNKYSATIGK
EKLNLKGLEYYISAKDKNGDSNTDTYSVRVTNGIAPEIYDMFPAENSRVKVDEFSNIKAS
IKSEKEINTDSIKVYLDNNDVTSNAKIAKESIEYTPSNKLNIGSHVVKIEVKDSAGNLTT
KEWSFRIFKDGDLKHLFGQLHAHTNISDGSGSLDEAYQWVKDHKADYYAVTDHSNWFDND
TEANLGDGSKSEKWTKAHETADKYNDPGKFTAIYGYEMTWSGSTGGWGHINTFNTPGFET
RTNKAMDLQNYYKTIQTQPQSISQLNHPGKTFGDFADFGFYSEGADKNVNLIEVGNGEGP
IRGSGYFPSYEYYTRALDKGWHVAPTNSQDNHKGNWFTSNNARTIVIADDNSRDSIYDAL
REKRVYASEDTDMTIDYTVNDEVMGTSLGNVDGKLNFKINATDPTDKIKKISIIANGGVE
VESKTFNDNNANWELTLDPEYSYYYVKVVQEDKDISVTSPVWVGDALNVGLSNAKVDTDM
TLPGENVELNVGFFNNGEKEVKDVKFEFFKNNINADSKIGEKVVESVASTKTENVKFNWK
ADKEGEYTLYAKATVKLDKGEKSFTTSAKVKIVNPDKVKKILVDGSHYNQYVTGDYAGKY
TAFKSLLTEKDGLTIINKDKITDEILKDVKILVLTNPQSTENTTAGLKASKFDDDEIKTI
KRYVEKGGNVIVSTRADYKDGKGEYSNGAQMNSVLEAIGTKLRVNDDEVIDTTKNGGQEY
RLYLTNYDSPNYNLLNGVENGKDEYSFYNGASVVLADGASPEGVDFLVKGFETTETKDAD
GDKDNVEVPKGNVNMLGVEQLSNGGKVVVSGNTFFSDFEIDGTNGDKYSNVKITNNIVNW
MMPSKEIKTIKLGDIRKDSNNDGTPDLYGQKVTVEGYVTSQSEAVEPKNSFFEVVYITDE
TGGACVFGVSSTKLKVGQKVRITGVVDAYQGELEISLADRDSGPVSGNIESKNVQILDEN
IVDVKPVELSTKDSMLPMNGGKLVKVQGKVIRMDKQNLYIDDGSGESRVYVEGYIWDGIN
KEESLGKWDKNIEVGDNVSAIGLASWDPENGRLRVRNTGEIKFQENVTSKHWENKNLTRN
RVN
NT seq
4512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaagaaaaataaaagactacttgctttgttagtttctgtatcagttgtaactact
tctgttatattaccaagtcaaagaacatttgcattaggtgatatgattgaatcaatgtta
aatgatagctcagaaaccaaagcttatgagaatgatgctaagattgaggataatgtaaca
gagaaggaaaaagttaaagaagaaattaatgagagtaaaactgatgaggaaaaaactgat
gtaagcaaaggggatgcttcagaaggagaaattaataaagataaagatgagacttcaagt
gatgataaaaataaggtagataataaatcagaaaatgattcaaaagatgaacttgatact
gataaagatgtaaccgataacataaaaccggaagataaattagataatgatgataaagac
aaagaagtaattgataaagaaaataatgaaaaagataaagaaattgttgataaggataaa
gaggtagttgaaaaagataaagaaagtgaagatgtaatagaggattctaaagaagttact
gatgttattagcattgaagaggctttgaaattgcaaaatggagaatcagcaattgtagaa
ggtgttgtttcttttaatgatagaggtcaaacaatttatatacaagatgaaaccggtggc
atagctttatctaataaaattagcaaaatacctttcaaagatataaagaaggggaataag
gttaaggtttcaggtactaaagatacttttaaaaatttagatcaattacaagcaactaag
atagatgtagttaaagaaagtgcagatttaacttctgaaattgtatcaataaaggactta
aattcaggaaattatgaatctaaatatgtaaaagtagaaaatgcaattatagatacttct
aaaaagacattaaaacaaggtgaagatattttaaatatttactttattccaaaggacatt
aatgtaaaaactggtgatactgtaaatgtagaaggtactatgggagtatatgataaaact
attcaaatttatggtggatcttgtattttcactaaagttgatgaggtagctaaattaaat
ataaatcatgaggctattaaacaagctgatattaatagtgatttaaagatagatgcagag
ataacagggactgaagtaagcaatgtagagttaaattataaagttactggagctgaaaag
tttgaaaaattagaaatgactaagggtgaaggtaataaatatagcgcaactataggaaag
gaaaagcttaatttaaagggcctagagtattatatatctgctaaagataaaaatggagat
agtaataccgatacttattctgtaagagttacaaatggtattgctcctgaaatatatgat
atgtttccagctgaaaattctagagttaaagtagatgaattttctaatataaaagcttca
attaagtctgaaaaagagataaatacagactcaattaaagtgtacttagacaataatgat
gttacatcaaatgctaaaattgcgaaagaatctattgagtatacacctagtaataaactt
aatatagggtcacatgtagtaaaaatagaggttaaagatagtgctggaaatttaactact
aaagaatggtcatttagaatatttaaagatggtgatttaaaacatttatttggacaactt
catgcacatactaatatttcagatggaagtggttctttagatgaagcttatcaatgggta
aaggatcataaggctgattattatgcagtaactgatcattcaaattggtttgataatgat
actgaagctaatttaggtgatggatcaaaaagtgaaaaatggacaaaagctcatgaaaca
gctgataaatataatgatccaggaaagtttactgctatttatggatatgaaatgacatgg
tcaggatctactggaggatggggtcatataaatactttcaatacaccaggatttgaaaca
agaactaataaagctatggatttacaaaattattacaaaaccattcaaactcagcctcaa
tcaatatctcaattgaatcatccaggtaagacttttggtgattttgctgattttggattc
tatagtgaaggtgcagataaaaatgtaaatctaattgaagttggaaatggtgaaggtcca
ataaggggctcaggatatttcccaagttatgagtattatacaagagctttagataaagga
tggcatgttgctccaactaacagccaagataaccataagggtaattggtttacatctaat
aatgctagaacaatagtaattgcagatgataattcaagagattctatatatgatgctctt
agagaaaagagagtatatgcttcagaagatactgatatgacaatagattatacagtaaat
gatgaagttatgggtacttcattaggaaatgtagatggtaagcttaattttaagataaat
gcaactgatcctactgataagataaagaagatctcaataatagctaatggtggagttgaa
gttgaatctaaaacatttaatgataacaatgctaattgggaattaactttagatccagaa
tacagttattattatgttaaagttgtacaagaagacaaggatatatcagtaacttctcct
gtttgggttggagatgctttaaatgttggattatcaaatgcaaaagttgatactgacatg
acattaccaggtgaaaatgtagaacttaatgttggattctttaataatggtgaaaaggaa
gttaaagacgttaagtttgaattctttaaaaataatataaatgctgatagtaaaattggt
gaaaaagtagttgaaagtgtagcaagcactaagactgaaaatgttaaatttaattggaaa
gctgataaggaaggagaatatactttatacgctaaagcaactgttaagttagataaggga
gaaaaatcatttactactagtgctaaagtaaaaattgtaaatcctgataaggttaaaaag
atattagttgatggatctcactataatcaatatgtaacaggcgattatgctggaaagtat
actgcatttaagagtttacttacagaaaaagatgggctaacaataataaataaagataag
ataactgatgaaattttaaaagatgttaagatattagttcttaccaatccacaaagcact
gaaaatactactgctggattaaaagcaagtaaatttgatgatgatgaaataaaaactata
aaaagatatgttgaaaagggtggaaatgtaatagtatcaactagagctgactacaaagat
ggaaaaggtgaatatagcaatggagctcaaatgaattctgttttagaagctataggaact
aagttaagagtaaatgatgatgaagttatagatacaactaagaatggtggacaagaatat
agattgtatttaactaattatgattcaccaaattataacttgcttaatggagttgaaaat
ggaaaagatgaatacagtttctataatggtgcatcagtagttttagctgatggtgcaagt
ccggagggtgttgatttcttagtaaagggatttgaaactactgagacaaaagatgctgat
ggagataaagacaatgtagaagttcctaaaggtaatgtaaatatgctaggcgtagaacaa
ttaagtaatggtggtaaagttgttgtttcaggaaatacgttcttctctgattttgagatt
gatggtactaatggagataaatattctaatgtaaaaattacaaataatattgttaattgg
atgatgccatctaaggaaattaagacaattaaattaggtgatattagaaaagatagtaat
aatgatggaacaccagatttatatggtcaaaaggttactgtagagggatatgttacttca
caatctgaagctgtagaacctaagaattcattctttgaagttgtttatattacagatgaa
actggtggagcttgcgtatttggagtatctagcactaaattaaaagttggtcaaaaagtt
agaattacaggggtagtggatgcgtatcaaggcgaacttgaaatttcattagcagataga
gattctggtcctgtatcaggaaatattgaatctaaaaatgttcaaatattagatgaaaat
atagttgatgtaaaacctgtagaactttcaactaaagatagtatgctacctatgaatggc
ggaaagcttgttaaggtacaaggtaaagttattagaatggacaagcaaaacttatatatt
gatgatggatcaggtgaatcaagagtatatgttgaaggatatatttgggacggaataaat
aaagaagaatctttaggtaaatgggacaagaatattgaagttggtgacaatgtttcagca
attggtttagcatcatgggatcctgagaatggaagattaagagtaagaaatactggtgaa
attaaattccaagaaaatgttacaagtaaacattgggaaaacaaaaacttaacaagaaat
agagttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system