Clostridium butyricum: ATN24_09000
Help
Entry
ATN24_09000 CDS
T04197
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
cbut
Clostridium butyricum
Pathway
cbut03420
Nucleotide excision repair
cbut03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbut00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
ATN24_09000
03430 Mismatch repair
ATN24_09000
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
cbut03400
]
ATN24_09000
Enzymes [BR:
cbut01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
ATN24_09000
DNA repair and recombination proteins [BR:
cbut03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
ATN24_09000
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
ATN24_09000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
AAA_19
AAA_11
Peptidase_S49
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALP90269
LinkDB
All DBs
Position
1:1984138..1986198
Genome browser
AA seq
686 aa
AA seq
DB search
MVLKNISPLKKTKEDDILKSIYKAIDVKMNTIFNSGAGSGKTYALIECLRYIVNQYNDNL
KYHNQKIICITYTNIAAYEVKRRLGNSSTVIISTIHERIWDFIKNYKKELVEIHKENLLN
QIEILKEQICKANEYKKYNELNDEQRDNFNKLINENRELYYKYYSCSAKQFKEKLNCFES
KFPGILSNVANFKKIVNTIFKINKYSICIDNIKSKRTNFTSIKYDPMYNNDQLNKMRISH
DTLLEYGLKIIEKYDLLKQIIVDKYPYILIDEYQDTDEKVIKIINCLHQYSIKIGHEIFV
GYFGDSAQNIYKKGVGKRIFNIHKNLLKINKIYNRRSTKEIIDIANNVRSDEIIQESIYE
DSSGGSMKFFYGDKNDISRFIEKYLVEWNITKENPLHCLALTNKSVAKYSGFENLYDTLS
NTQIYSGIGREQLNTELLSNDLSKLGEIPSVLYRIIKFIVDIENSKTQLKEILPLEIYGI
SIEELKELIELLKTINGNTLEEYIKVIYKIYSEDRIGNYRILVKKIFDLNDITMDNFYNY
LLEKLYPNLIDGEEDDAKNMIKSILEINIDEYKRWYKYILNEFDDRIIYHTYHGTKGLEF
NNVIIVMENSFGKTSHYFDFFFKVCKGTNTLSDNERLKFEEIKNLLYVSVSRAIINLRVL
YVDDISEFKDGIKYIFNEIYPYNNAN
NT seq
2061 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcttaaaaaatatatctccattaaaaaaaacaaaagaagatgacatattaaagtca
atttataaagccattgatgtaaaaatgaatacaatttttaattctggtgctggttcaggt
aaaacatatgcacttattgaatgcttaagatatattgttaaccaatataatgataattta
aaatatcataatcaaaaaattatatgtataacatatacaaatattgcagcttatgaagtg
aaaagaagattgggaaattcaagtactgtaataatttcaactatacatgaaagaatatgg
gattttataaagaattataaaaaagaattagttgaaatacataaagaaaatttgttaaat
caaattgaaatattaaaagaacaaatatgtaaagctaatgaatataagaaatataatgaa
ttgaatgacgaacaaagagataattttaataagctaattaatgagaacagagaattatat
tataaatattatagttgtagtgcaaaacagtttaaagaaaaattaaattgctttgaaagt
aagtttcctggaatattaagtaatgttgctaactttaaaaaaattgtaaatactattttt
aaaataaataaatattcaatatgtatagataatattaaatctaaaagaactaattttact
tcaataaaatacgatcctatgtataataatgatcaattgaataaaatgcgaataagtcat
gatacattattagaatatggccttaagattattgaaaaatatgatttacttaagcaaata
attgttgacaaatacccatatatactaattgatgaatatcaggatactgatgaaaaagta
ataaagattataaattgtttgcatcagtattctataaagataggacatgaaatttttgtt
gggtattttggtgattctgcacaaaatatttataaaaaaggtgtaggtaaaagaattttt
aacatccataaaaatttattgaagattaataaaatatataatagaaggtcaacaaaagaa
ataattgatattgccaacaatgtaagaagtgatgaaattattcaagaatctatatatgaa
gatagctctggtggcagtatgaaatttttttatggagataaaaacgatattagcagattt
atagaaaaatatttagttgaatggaatataacgaaagaaaatccattacattgtcttgcg
ttaactaataagagtgttgctaaatatagcggatttgaaaatttatatgatacattaagt
aacacgcaaatatatagtggtattggtagagaacaacttaatacagaactattaagtaat
gatttatcaaaactaggcgaaattcccagtgtgctttatagaataattaaatttattgta
gatatagaaaatagtaaaactcagttaaaggaaattttaccattagaaatatatgggata
agcattgaggaattaaaagaattaattgagttattaaaaacaattaatggaaatacctta
gaagaatatataaaagttatatataaaatttatagtgaagatagaattggtaattataga
atattagttaagaaaatttttgatttgaatgatattacaatggataatttctataattat
ttgcttgaaaaattatatcctaatttaattgatggagaagaagatgatgctaaaaatatg
ataaaatcaattttagaaattaatatagatgaatacaagcgatggtataagtatatttta
aatgaatttgatgatagaataatttatcatacatatcatggaacaaaaggattagaattt
aataatgttataatagtaatggaaaattcatttggaaagacatcgcattattttgatttt
ttctttaaagtatgtaaaggaaccaatacattaagtgataatgaaaggctaaaatttgaa
gaaataaaaaatttattatatgtttcagtttcaagagcaattataaacctaagagtatta
tatgtagatgatatatcagaatttaaagacggaattaaatatatttttaatgaaatatat
ccatataataatgcaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
