Clostridium butyricum: ATN24_16105
Help
Entry
ATN24_16105 CDS
T04197
Name
(GenBank) alpha-amlyase
KO
K01176
alpha-amylase [EC:
3.2.1.1
]
Organism
cbut
Clostridium butyricum
Pathway
cbut00500
Starch and sucrose metabolism
cbut01100
Metabolic pathways
cbut01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cbut00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
ATN24_16105
Enzymes [BR:
cbut01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.1 alpha-amylase
ATN24_16105
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM26
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALP91612
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3585781..3589281)
Genome browser
AA seq
1166 aa
AA seq
DB search
MKGKKLRNIISAAIVCASVLTLTPVEASIGKTGNGTEKPFSWDNATVYFALTDRFNNGDS
SNDYSYGRGLDQNGKVQDGYKGNPGAFQGGDLKGLTEKIEEGYFDDLGVNAIWITAPYEQ
IHGFTSGNDAGGNATSNGKGFPYYSYHGYWALDYSNIDANMGTKDDLKKFVDTAHAHGIR
VVMDIVLNHVGYTTMKDADEYGFGGLKNGWKDYYYGPLTNLVGGGTEDTTYYDKTSPNWK
NNWWGPDFVRSSAGYDGYPQTPQGDGWTSSLCGLPDVKTESTKEVELPPLLENKWKAEGR
YDEEMASLNKFFSERNLPKTPRNYIIKWLTDYIRDYGIDGFRCDTANQVDLDSWAALNKE
ARVAFDEYKEKNQDKVLDENAEFWTVGESWGHGVKKDAFFTEGGFSAMINFGFKGAKISN
LKGIYDNLSSVNNDDDFNVLSYISSHDDSLYDRKSLKDGGTALLLAPGAVQIFYGDESGR
PLKWTDRFTSDYKDQCFRSFMNWDDINNPNSDAAKTLEHWQKVGDFRNNHLAVGAGQNIT
LNESPYTFGRVYSKNGIMDKVVCVVGASGETSVNVNGVFNDGAKVKDAYTGNVSVVKDGK
VNFKADENGVILIEKGDNAPDVSISKISSEYYSDTLDLTLSVSGADTGSYSIDGKEPVKF
KNGDVITIGKDTSYDVKTTVSVYASNSDGEASQTYTYTKRNPNFTTKVYVQKPDSWSGLN
AYVYNKDGSTTNEVKAWPGVPMTKESDGLYSYSLPTGFRDAKIILNDGKHQDPGVGQDGY
SLKNGSKMLYENGVWSEYVESDKPQASVSKENCEFKDSLTLTLGSKNGTKSTYSINDSNE
VEYKDGDKITIGQDAKPGDTIKVTLKVSDGTDTDVKSYTYTKAAEVAESKIYCKIPNGWS
NVKAYIYNENVTPKKELASWPGVAMTKESDGLYSYTLKDWEEDAYVIFTDGKNQTPAVGQ
KGFKLTNGSNMIYDNGSWSKYEEKINPCASISKEDCEFDDSLTLTLGSKNGTKSTYSING
SEEIEYKDGDKITIGENAQPGEAIKLTLKVSNGTNTDVKNYTYTKAAKIAESKIYCKAPD
GWSSVKVYIYNEDVSPKKELASWPGVTMTKESNGLYSYTLKDWEQDAYVIFTDGKNQNPG
VGQKGFKLTNGNKMIYENGSWTQYNN
NT seq
3501 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaggtaaaaaattgagaaacattatttcagcagctatagtttgtgctagtgtattg
actttaacaccagtagaagcttctattgggaaaactggtaacggtaccgaaaaaccattt
tcttgggataatgcaactgtatattttgcattaacagacagatttaataatggtgattca
tctaatgattactcttatggaagaggtcttgatcaaaacggaaaggtacaagatggttat
aaaggcaatccaggtgcgtttcaaggtggagacttaaaaggtcttactgaaaagattgaa
gaaggatatttcgatgacttgggtgttaatgcaatatggattactgcaccatatgaacag
atacatggatttacatcaggtaatgatgcagggggaaatgcaacaagtaatggtaaaggt
tttccttattattcataccatggttactgggcattggattattctaatattgatgcaaat
atggggacgaaagatgatttgaaaaaatttgtagatactgctcatgctcatggaataaga
gttgttatggatatagtattaaaccatgttggatatacaactatgaaggatgctgatgaa
tatggatttggagggcttaaaaatggatggaaagattattattatggtcctctaacaaat
ttagttggaggtggcacagaggatacaacttattatgataaaacatctccaaactggaag
aataattggtggggtcctgactttgtaagaagttcagcaggatatgacggatatcctcag
acaccacagggagatggatggacatcatccctttgtggtttaccagacgtaaagacagaa
agcactaaagaagtagaactacctccattacttgaaaataagtggaaagcagaaggcaga
tacgatgaagaaatggcaagtttaaataaattctttagtgaaagaaatcttccaaaaact
cctagaaactatattattaaatggttaacagactatataagagattatggaattgatgga
tttagatgtgatactgcaaatcaagtagatttagattcatgggctgctttaaataaagaa
gcacgtgttgcatttgatgaatacaaagaaaagaatcaagacaaagttttagatgaaaat
gctgaattttggacagtaggtgaatcttggggacatggagtaaagaaggatgcatttttt
actgaaggtggatttagcgcaatgattaactttggatttaagggtgcaaagatatctaac
cttaaaggaatttatgataacttaagtagtgtaaataatgatgatgattttaatgtttta
agttatatatcttctcacgatgactcattatatgacagaaaaagcttaaaagatggtgga
actgctttattacttgcaccaggtgctgtacaaatcttctatggtgatgaatcaggaaga
cctcttaaatggacagatagatttacaagtgattataaagatcagtgtttccgtagtttt
atgaactgggatgatattaataatccaaatagtgatgcagctaagacattagaacactgg
cagaaagttggagattttagaaataatcaccttgctgtaggtgcaggacaaaatattact
ttaaatgaaagtccatatacatttggaagagtgtatagtaaaaatggaattatggataag
gttgtctgcgtagttggggcatctggagagacaagcgtaaatgtaaatggtgtatttaat
gatggagcaaaagttaaagatgcatatactggtaacgtttccgtagttaaagatggtaag
gttaactttaaagctgatgaaaatggagttatattaatcgaaaaaggtgataatgctcca
gatgtttcaataagcaaaattagcagtgagtattattctgatactttagatttaacttta
agtgttagtggagctgatactggtagttattctattgatggaaaagaacctgtaaaattt
aaaaatggagatgtaataacaattggaaaagacacatcatatgatgtgaaaactacagtt
tcagtttatgcatccaattctgatggggaagcatctcagacatatacttatacaaagaga
aatcctaattttacaacaaaggtttatgtacaaaagccagatagctggagtggcttaaat
gcttatgtgtacaataaagatggaagtactacaaatgaggtaaaggcttggccaggggtt
cctatgactaaggaaagtgatggtctttatagttatagtttaccaacaggatttagagat
gcaaaaataattttaaatgatggaaaacatcaagatccaggagttggacaagatggatat
tcattaaaaaatggaagtaagatgttatatgaaaatggggtttggagtgaatatgttgaa
tcagataaaccacaagcgtcagtttcaaaagaaaattgtgaattcaaagattcattaaca
ttaacacttggaagcaaaaatggaacaaaatcaacttattcaataaatgatagtaacgaa
gttgaatataaagatggagataaaattacaataggtcaagatgcaaagccaggagataca
attaaagttacattaaaagttagtgatggaacagatacagatgtaaagagctatacttat
acaaaagcagctgaagttgcagaatcaaaaatatactgcaagatacctaatggatggagt
aatgttaaggcatatatctataatgaaaatgtaactcctaagaaagaactagcatcatgg
ccaggtgttgcaatgactaaagaaagcgatggcttatatagttatacacttaaggactgg
gaagaagatgcttatgtaatatttactgatggtaaaaatcaaacaccagcagttggacaa
aaaggatttaaattaacaaatggtagtaatatgatttatgataatggaagttggagtaaa
tacgaagaaaaaataaatccttgtgcatcaatttcaaaagaagactgtgaatttgatgat
tcattaacattgacacttggaagtaaaaatggaacaaaatcaacttattcaataaatggt
agtgaagaaattgaatataaagatggagataagatcacaataggagaaaatgcacaacca
ggagaggcaattaaattaacattaaaggttagcaatggaacaaacacagatgtgaaaaat
tacacttatactaaggcagctaaaatagcagagtcaaaaatatattgtaaagcaccagat
ggttggagcagcgtaaaagtatatatttataatgaagatgtaagtcctaaaaaagaacta
gcatcatggccaggtgttacaatgactaaagaaagtaatggtctatatagctatacactt
aaagattgggaacaagatgcttatgtgattttcacagatggtaagaatcaaaatccagga
gttggacaaaaaggatttaaacttacaaatggaaataagatgatttatgaaaatggttca
tggactcaatataataactaa
DBGET
integrated database retrieval system