Clostridium botulinum A2: CLM_0667
Help
Entry
CLM_0667 CDS
T00883
Symbol
potCD
Name
(GenBank) spermidine/putrescine transport system permease protein PotC/spermidine/putrescine-binding periplasmic protein PotD
KO
K11069
spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein
K11070
spermidine/putrescine transport system permease protein
Organism
cby
Clostridium botulinum A2
Pathway
cby02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cby00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
CLM_0667 (potCD)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cby02000
]
CLM_0667 (potCD)
Transporters [BR:
cby02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Spermidine/putrescine transporter
CLM_0667 (potCD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_8
SBP_bac_1
SBP_bac_6
BPD_transp_1
SBP_bac_11
OST3_OST6
DUF4179
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACO85641
UniProt:
C1FT35
LinkDB
All DBs
Position
723284..725128
Genome browser
AA seq
614 aa
AA seq
DB search
MMKSNKGLLSKIYATLVYVFLYLPIFVLVVFSFNKSKLNATFTGFTLDWYKNLINNVQIL
EALKNSLIIAFISTFFAVIIGTLAAIGMYRYKFKGKRAMEGLLYIPVVIPEIVMGISMLA
FFSSLNLPAGLITLILAHITFCISYVIIVVRARLDGFDAALEEAAQDLGATPWQTLTKIT
LPVISPGIISGALLAFTLSLDDVIISFFAAGPDSNTLPLKIFSMVKFGVTPEINALSTVM
MVFTLSMVVIAEGIRRNMLKNKKVKKTLSFIVILLMVTGMGFTIFGNTAKTEKQVLNIFN
WSEFLPQSVIEQFEKEYNVKVNYSTFSSNEEMLAKLMGGNVPYDLVVTSDYAIEIMTKQK
LIQPIDKNNVPNLANIDKNVLDLAFDPKNTYSLPYMWGGNNIVIDKTKITKKITSFDDLW
DSEFKNSMVILDDPRVMIGLALQKNGYSINSKNPKELQKAKEDLIKLMPNVKAFDSESPK
TLLINGEASIGYVWGTEAYLAKLENPNLEVVLTKEGVIPQYDNFVIPKKAKNKKLAEEFI
NFIYKPEISAQVSEEFPYANPNKAAYPLMDKDKLNDIAVYPPREAVEGNELIKDVGETTK
LYDDIWTEIKNSKR
NT seq
1845 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaagagcaataaaggtttattaagtaaaatatatgcaactttagtttatgttttt
ttatatttgccaatctttgttttagtagtattttcttttaataagtctaagttaaatgct
acctttacaggatttacattagattggtacaaaaatttaataaataatgttcaaatatta
gaagcattaaaaaacagcttaataatagcttttataagtactttttttgcagtaattata
ggaactttagctgctataggtatgtatagatataaatttaaggggaaaagggctatggag
ggactgctttatatcccagtagttattccagaaatagttatgggaatatctatgcttgcc
tttttctcttcccttaatttgcctgcagggcttataactttaatacttgctcacataact
ttttgtatttcctacgttattatagtagttagagctagattagatgggtttgatgctgca
ctagaagaagcagctcaagatttaggtgctacaccttggcaaactttaacgaagattaca
ctacctgtaatatcaccaggaattatatcaggagcactgcttgcctttacactatcttta
gacgatgttattataagtttttttgcggcgggaccagatagtaatactttgccacttaaa
atattttctatggttaagtttggtgtaactcctgaaataaatgcactatctactgtgatg
atggtatttactttaagtatggtagttatagctgaaggtataagaagaaatatgcttaag
aataaaaaagtaaaaaagacattatcctttatagtaatattattaatggttactgggatg
ggctttactattttcggtaatacagctaaaacagaaaagcaagtgttaaatatatttaat
tggtcagaatttttaccacagtctgttattgaacagtttgaaaaagaatacaatgtaaag
gtaaattattcgactttttcctctaatgaagaaatgcttgcaaagttaatgggaggaaat
gtgccctatgatttagtagttaccagtgattatgctattgaaataatgactaaacaaaaa
ttaattcaaccaatagacaaaaataatgttccaaacttagctaatatagataaaaatgta
cttgatttagcctttgatcctaaaaatacttatagcctaccttatatgtggggaggcaac
aatatagtaatagataagactaaaataactaaaaaaattacttcttttgatgatctgtgg
gacagtgaatttaaaaattctatggtaattttggatgatccaagggttatgataggatta
gctctacaaaagaatggatattctataaattcaaaaaatccaaaggaacttcaaaaggct
aaagaggatttaataaaattaatgccaaatgtaaaagcctttgatagtgaatctccaaag
actttacttataaatggagaagcttctataggatatgtatggggaacggaagcatatctt
gctaaacttgaaaatcctaatttagaagtagttttaacaaaagagggtgtaattcctcaa
tatgataactttgtaatacctaaaaaggctaaaaataaaaaattagcagaggaatttata
aacttcatatataaacctgaaataagtgctcaagtgtctgaggaatttccttatgcaaat
ccgaataaagcagcatatcctttaatggataaagataaattaaatgatatagctgtttat
ccaccaagagaagcggtagaaggaaatgagcttattaaggatgtaggggaaactacaaaa
ttatatgatgatatatggactgaaattaaaaatagtaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system