Clostridium botulinum A2: CLM_1940
Help
Entry
CLM_1940 CDS
T00883
Name
(GenBank) leucine rich repeat protein
Organism
cby
Clostridium botulinum A2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
DUF5050
LRR_8
Big_4
LRR_1
LRR_9
Bact_surface_Ig-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACO85250
UniProt:
C1FNS4
LinkDB
All DBs
Position
1996435..2000502
Genome browser
AA seq
1355 aa
AA seq
DB search
MNKKVLIPVVMGAYLCLSPLSVKAEDYYKWDSKVTADKNKIWTIKLSKKLNNNISGIKDK
VYIKDSKGNKLDCNVKIKLNEKILEVLPPKDGYREKEDYYLYIDKSIPSDKNKNLKETVK
MNFYIDGYIEFEDKNLEEEVRKAANPKDRPKGPLTYMDVSGIKELNVHNKNIKSLKGIEY
LKNITKLDISDNNIKDISYLKELDSLELLNLYNNNIEDISPINNMKKLKDINLSKNNVKD
ISYLKDLNLHHLDLRDNKIENIEVLRNKISLQHLYLANNSIKDFSPISNLKNLQILYLSH
NYSSNYDYAKDYYNNLKDRDFKLNVPIEFKDKVFEELVRKEINKPSGYIYPTDLENIKEL
DFHNAHIEKLNGIENMTALEKLNLSGTDIKDISLLKCLINLKEVNISNTSISDITALKNS
IYIRYLNLNETNVTTLQVIEKFQYIERLYVSGTKINTVPQLSSLLELDLSNCNINDISFI
NYLHNLTYLNVDKLKYKSNILGNISFVSSLEKLEYLSIANTDVVNIDVLKNLINLRKLDI
TGCAQINTQVLNHVEIIGNEIVNFGDKVLEREIRELINNYSEPIYKRQLSSITKLELSGR
GIVDLQGLESMENLTYLDLSNNEISNIDSIKKLVNLKKLVLHKNKIGSIKSIESLKYLEE
LDLSNNLIGDITALGGLSQLTRLDLSRNGIVSINSLGSLINLQYLSLYENKISEGEEYLK
KLYSLRELYLKNSGVSNFDVTLAYYNNLEKKDFTTNSDFIVFDEKLDSDLAKIIREILGK
DENTNIYKSEVDTITDLNLSEEAISRLNISSRLTNTNVINLDGIQYFSNLHSINLRGHGK
LEGLENLIPIRGLIKLDLQGREINYTSLYYIKYLTSLRYLYLNNMNLTGDLSFLENLTDL
RILDLSRTGISNISILDKLRNLSELYLGGNNIIDLSSLENLTNLVKLDLVENNDITSIYA
LRNLINLRYLTLPITNPKKIQDYSAVASYYYNLTYKNFDLEDSNAIVIKEIRPIEKEVNK
GDKFTLPDYVEATMSDDSKDKFKVHWKEKSVDTSKPGIYTYIGTVDGYTGEVKLTLRVNG
EIPYGMGNSSSNILNGGFIIKDSEYIYYINKESGNGRIYRNKINGAEDKLLSSNAAEFLN
IYGEYIYYVSNGNIYRIRKDGSEEKLIKEASASYMTVCNDFIYYFDKSKTGIYKVKIDGT
SYSSVVSGGKWRLDSQFVISGEWIYYTNYEDKSSIYKIKIDGTGKEKLNNIPCSQMSVIG
SSIYYVSNGNLYKISIDGSNNSLVYSGNVANINVYSNHIYYIDNNDNETLYKMNLDGSYR
VKLTKKSVKYISILEGEVYYIPSDNEDKISKFYEE
NT seq
4068 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaagttcttattccagtagttatgggagcttatctatgcctttcaccacta
tctgtaaaggctgaagattattacaaatgggatagtaaagtaacagcagataaaaataaa
atatggactattaagctttcaaaaaaattaaataataacattagtggtataaaagataag
gtttatataaaggattctaaaggaaacaaattagattgcaatgttaaaataaagctaaat
gaaaaaatcttagaagtattaccacctaaagatggttatagggaaaaagaagattattat
ctttatatagataaaagtattccttcagataaaaataaaaatttaaaagaaactgtaaaa
atgaatttttacatagatggttatatagaatttgaagataaaaacttagaagaagaggta
agaaaagcagcaaatcctaaagatagacctaaaggacccttaacatatatggatgtttcg
ggtataaaggaattaaatgttcataataaaaatataaaaagtcttaaagggatagagtat
ttaaaaaatattactaaattagatatatcagataataacataaaagatatatcttattta
aaagaacttgatagtttagaattattaaatttatataataataatatagaagatatatct
cctattaataatatgaaaaaattaaaggatataaatttatctaaaaataacgtaaaagac
atatcttatttaaaggatttaaacttacatcatttagatttaagagataataaaatagaa
aatatagaagttttaagaaataaaatatccttgcaacatttgtatttagctaataacagt
attaaagatttttcacctatatctaatttgaaaaatctacaaatattgtatttaagccat
aattatagttcaaattatgattatgctaaagattactataataaccttaaggatagggat
tttaaattaaatgtacctatagaatttaaggataaagtatttgaagaattagtgagaaaa
gaaataaataagccttctggttatatatatcctactgatttagaaaatattaaagaatta
gatttccataatgctcatatagaaaaactaaatggtatagaaaatatgacagctttggaa
aagttaaatttgagcggaactgatataaaagatatatctcttttaaaatgcttgataaat
ttaaaagaagtaaatatatcaaatactagtataagtgatataacagctttaaaaaattca
atttatattaggtatttaaacttaaatgaaacaaatgtaactactctacaggttatagaa
aagtttcagtatatagaaaggttatatgtatcaggtacaaagataaatactgttccacag
ttaagtagtttattagaattagatttatctaattgtaatataaatgatattagttttata
aactatttacataatctaacttatttaaatgtagataagcttaaatataaaagcaatata
ttaggtaatataagctttgttagttccttagaaaaacttgaatatttaagtatagcaaat
acagacgtggttaacatagatgtgcttaaaaatttaataaatttgagaaaactagacata
acaggctgtgcccaaataaatactcaggttttaaatcatgtagaaataataggcaatgaa
atagttaactttggagataaagttttagaaagagaaataagagaattaataaataattac
tctgagcctatatataaaagacagctttcttctataactaaattagaactttcaggaaga
ggcatagtagatttgcaagggttagagagtatggaaaacttaacttatttagatttatca
aataatgaaatttctaatatagattctataaaaaaacttgtaaacttaaaaaaattagta
cttcataaaaataaaataggatcaataaaatcaatagaaagtcttaaatatttagaggaa
ttagatttatctaataatttaattggagatataacagcgttaggaggattatcccaatta
actagattagatttatcaagaaatggaatagtaagtataaatagtttaggtagtcttata
aacttacaatacttatctttatatgaaaataaaatttcagagggagaagaatatttaaaa
aaattatatagtcttagagaactttatttaaaaaacagcggagtatcaaattttgatgta
accttagcctattataataatttagaaaagaaagattttacaactaactcagattttata
gtttttgatgaaaagcttgacagtgatttggctaaaattattagagagattttaggtaaa
gatgaaaatactaatatatataaaagtgaggtagacactataacagatttaaatttaagt
gaagaggctatctcaagattaaatataagttctagactaacaaatactaatgtaattaat
ttagatggtatacaatatttttctaatttacattccataaacctaagaggacatggtaaa
ttagaagggttagaaaatttaatcccaattagagggttaattaaattagatttacaagga
agggaaataaattatacttctttatattatattaaatatttaacaagtttaagatatcta
tatttaaataacatgaatttaactggagatttatcatttttagaaaatcttacagattta
aggatattagacttatctaggactggaatatctaatataagtatattagataagctaaga
aatttaagcgagttgtatttaggtggtaataacataatagatttatcttctttagagaac
cttacaaacttagttaaattagatttagttgagaataatgatataactagtatatatgct
ttgagaaatttaattaatttaaggtacttaactttgccaataacaaatcctaaaaaaata
caagattacagtgccgtagcatcatactattataatcttacttacaagaattttgattta
gaagatagtaatgcaatagttataaaagaaataagacctatagaaaaagaagtaaataaa
ggcgataaatttactcttccagattatgttgaagcaacaatgagtgatgactctaaggac
aagtttaaagtacattggaaagaaaagagtgtagatacatcaaagccaggaatatatact
tatataggaactgtagatgggtatacaggagaagtaaaattaaccttaagggtaaatgga
gaaataccttatggcatgggtaattcttctagtaatatattaaatggaggatttattata
aaagatagtgagtatatatattatataaataaagagagtggcaatggcagaatatataga
aataaaataaatggagcggaagataagctactttctagcaatgcagcagagtttttaaat
atatacggagaatatatatactatgtaagcaatggtaacatatatagaataagaaaagat
ggaagcgaggaaaaactaataaaagaggcatcagcttcctatatgacagtatgtaatgat
tttatttattattttgataagagtaaaactggtatatataaagttaagatagatggtaca
agctatagctctgtggtatctggtggaaagtggagattggattcacagtttgtaatatca
ggagaatggatatattatactaattatgaggataaatcatctatatataaaattaaaata
gatggaacaggaaaagaaaaattaaataatataccttgcagtcaaatgagtgtaatagga
agctcaatatattatgtttcaaatggaaatctctataaaatatctatagatggaagcaat
aatagcttagtatattcaggaaatgtagctaatataaatgtatatagtaaccacatatat
tatatagataataatgacaatgaaacattgtataagatgaacttagatggcagctatagg
gttaaattgactaaaaaatcagttaagtatataagtattttagagggggaagtttactat
attccttcagataatgaagataaaatatctaagttttatgaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
